Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JJQ7

Protein Details
Accession C4JJQ7    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-59RDDRRDRGDRGDRRERERRRSRSPHHGSRGSRREHEBasic
83-110DRDWDRDRGERRREPRREEEERPPRRERBasic
114-146DDRPRRDRGDRGGRDRRRSQSPAQRKKEPTPDLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-56RRDRGDRGDRRERERRRSRSPHHGSRGSRR
88-140RDRGERRREPRREEEERPPRRERELFDDRPRRDRGDRGGRDRRRSQSPAQRKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR006529  U2AF_lg  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG ure:UREG_01864  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12231  RRM2_U2AF65  
cd12232  RRM3_U2AF65  
Amino Acid Sequences MNGEAYGSRDTGRSRDYYGSRSERDDRRDRGDRGDRRERERRRSRSPHHGSRGSRREHELDSYSSSRDYRAREREDRYSRRDDRDWDRDRGERRREPRREEEERPPRRERELFDDRPRRDRGDRGGRDRRRSQSPAQRKKEPTPDLTDIVPIMERKRRLTQWDIKPPGYENVTAEQAKLSGMFPLPGAPRQQTVDPSRLQAFMNQPAGNANSTLLKPSNSRQAKRLFVHNLPPSVSEDTLAQFFNLQLNGLNVISGVDPCISAQVSSDGKFALLEFKTASDATVALALDGISLEHDDANGTSSAPGQGLSLKRPKDYIVPSEADDSNRQDGVVSNEVPDSPNKICVTNIPPFIQEEQVTMLLVSFGELKSFVLVKDSGTDESRGIAFCEYVDPSSTNIAVEGLNGMELGDKRLKVTRASIGATQAAGLDMGVNAMSMFAKTTSQDLETGRVLQLLNMVTAEELMDSDEYEEICDDVREECSKYGQVLDLKIPRPTGGSRQAAGVGKIYVKFDSYDSASKAMKALAGRKFQDRTVVTTFFSEIQSKSPPGPSQRGPVPRIRLFHIMQGLMQFEKCLHAHWKSMYTGLSDSMTCADALHFRLQGACPRNRHQPTGLPGKVENP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.35
3 0.38
4 0.4
5 0.47
6 0.51
7 0.5
8 0.54
9 0.58
10 0.58
11 0.63
12 0.68
13 0.65
14 0.66
15 0.73
16 0.69
17 0.7
18 0.73
19 0.72
20 0.73
21 0.77
22 0.75
23 0.75
24 0.83
25 0.82
26 0.83
27 0.85
28 0.85
29 0.85
30 0.89
31 0.88
32 0.89
33 0.89
34 0.89
35 0.88
36 0.88
37 0.85
38 0.85
39 0.85
40 0.81
41 0.76
42 0.71
43 0.66
44 0.61
45 0.59
46 0.52
47 0.46
48 0.45
49 0.42
50 0.37
51 0.34
52 0.32
53 0.29
54 0.3
55 0.33
56 0.36
57 0.44
58 0.51
59 0.57
60 0.63
61 0.7
62 0.76
63 0.78
64 0.76
65 0.77
66 0.75
67 0.75
68 0.74
69 0.71
70 0.7
71 0.72
72 0.72
73 0.67
74 0.65
75 0.64
76 0.67
77 0.69
78 0.69
79 0.68
80 0.7
81 0.75
82 0.79
83 0.81
84 0.83
85 0.82
86 0.81
87 0.78
88 0.81
89 0.81
90 0.81
91 0.8
92 0.77
93 0.71
94 0.71
95 0.69
96 0.63
97 0.61
98 0.62
99 0.63
100 0.67
101 0.72
102 0.68
103 0.7
104 0.7
105 0.66
106 0.61
107 0.59
108 0.59
109 0.6
110 0.66
111 0.68
112 0.75
113 0.77
114 0.81
115 0.82
116 0.78
117 0.76
118 0.73
119 0.73
120 0.73
121 0.76
122 0.78
123 0.78
124 0.81
125 0.79
126 0.81
127 0.82
128 0.77
129 0.71
130 0.68
131 0.65
132 0.57
133 0.51
134 0.44
135 0.33
136 0.27
137 0.23
138 0.17
139 0.16
140 0.2
141 0.22
142 0.26
143 0.33
144 0.37
145 0.41
146 0.49
147 0.55
148 0.6
149 0.68
150 0.7
151 0.64
152 0.61
153 0.56
154 0.51
155 0.44
156 0.35
157 0.26
158 0.23
159 0.26
160 0.25
161 0.23
162 0.18
163 0.16
164 0.14
165 0.13
166 0.11
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.12
172 0.13
173 0.15
174 0.17
175 0.17
176 0.18
177 0.2
178 0.22
179 0.25
180 0.27
181 0.3
182 0.28
183 0.3
184 0.3
185 0.29
186 0.27
187 0.25
188 0.25
189 0.26
190 0.3
191 0.27
192 0.25
193 0.25
194 0.26
195 0.22
196 0.18
197 0.13
198 0.11
199 0.11
200 0.13
201 0.12
202 0.13
203 0.14
204 0.17
205 0.27
206 0.31
207 0.33
208 0.37
209 0.43
210 0.49
211 0.5
212 0.55
213 0.51
214 0.47
215 0.54
216 0.51
217 0.46
218 0.39
219 0.38
220 0.33
221 0.29
222 0.26
223 0.17
224 0.14
225 0.14
226 0.14
227 0.13
228 0.1
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.08
233 0.07
234 0.06
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.09
252 0.1
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.12
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.12
265 0.12
266 0.12
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.02
279 0.03
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.05
294 0.08
295 0.09
296 0.13
297 0.18
298 0.19
299 0.19
300 0.2
301 0.21
302 0.23
303 0.26
304 0.25
305 0.24
306 0.24
307 0.24
308 0.27
309 0.27
310 0.22
311 0.21
312 0.2
313 0.17
314 0.16
315 0.15
316 0.11
317 0.12
318 0.14
319 0.15
320 0.13
321 0.12
322 0.13
323 0.13
324 0.13
325 0.13
326 0.13
327 0.1
328 0.15
329 0.15
330 0.15
331 0.15
332 0.18
333 0.23
334 0.24
335 0.26
336 0.22
337 0.22
338 0.23
339 0.24
340 0.22
341 0.18
342 0.13
343 0.12
344 0.12
345 0.11
346 0.09
347 0.08
348 0.06
349 0.06
350 0.05
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.05
355 0.05
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.07
360 0.08
361 0.08
362 0.1
363 0.11
364 0.12
365 0.13
366 0.14
367 0.11
368 0.12
369 0.13
370 0.11
371 0.1
372 0.09
373 0.08
374 0.07
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.09
379 0.09
380 0.1
381 0.11
382 0.11
383 0.09
384 0.08
385 0.09
386 0.07
387 0.07
388 0.06
389 0.05
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.05
394 0.05
395 0.09
396 0.11
397 0.11
398 0.12
399 0.17
400 0.19
401 0.18
402 0.22
403 0.24
404 0.24
405 0.26
406 0.27
407 0.24
408 0.23
409 0.22
410 0.18
411 0.13
412 0.1
413 0.08
414 0.06
415 0.04
416 0.03
417 0.03
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.03
424 0.04
425 0.04
426 0.05
427 0.06
428 0.08
429 0.09
430 0.1
431 0.13
432 0.13
433 0.16
434 0.16
435 0.18
436 0.16
437 0.16
438 0.15
439 0.13
440 0.15
441 0.12
442 0.11
443 0.1
444 0.1
445 0.08
446 0.08
447 0.07
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.05
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.07
463 0.09
464 0.11
465 0.13
466 0.14
467 0.16
468 0.17
469 0.17
470 0.17
471 0.19
472 0.2
473 0.2
474 0.26
475 0.3
476 0.31
477 0.33
478 0.32
479 0.28
480 0.28
481 0.29
482 0.3
483 0.32
484 0.34
485 0.33
486 0.33
487 0.38
488 0.36
489 0.34
490 0.28
491 0.21
492 0.19
493 0.2
494 0.2
495 0.16
496 0.15
497 0.15
498 0.14
499 0.17
500 0.18
501 0.21
502 0.21
503 0.25
504 0.24
505 0.24
506 0.24
507 0.21
508 0.2
509 0.19
510 0.25
511 0.28
512 0.35
513 0.37
514 0.43
515 0.45
516 0.43
517 0.48
518 0.43
519 0.42
520 0.41
521 0.4
522 0.34
523 0.33
524 0.34
525 0.27
526 0.27
527 0.24
528 0.18
529 0.2
530 0.24
531 0.24
532 0.25
533 0.29
534 0.32
535 0.36
536 0.43
537 0.43
538 0.46
539 0.53
540 0.58
541 0.57
542 0.6
543 0.62
544 0.6
545 0.59
546 0.57
547 0.55
548 0.49
549 0.5
550 0.47
551 0.39
552 0.34
553 0.33
554 0.3
555 0.25
556 0.23
557 0.17
558 0.13
559 0.16
560 0.16
561 0.18
562 0.22
563 0.24
564 0.3
565 0.33
566 0.37
567 0.35
568 0.38
569 0.35
570 0.31
571 0.29
572 0.26
573 0.24
574 0.19
575 0.18
576 0.17
577 0.16
578 0.13
579 0.12
580 0.11
581 0.13
582 0.17
583 0.2
584 0.19
585 0.19
586 0.22
587 0.24
588 0.32
589 0.36
590 0.4
591 0.43
592 0.48
593 0.59
594 0.61
595 0.64
596 0.61
597 0.62
598 0.63
599 0.67
600 0.63
601 0.56