FuNGI

A0A060SU89

Protein Details

Accession

A0A060SU89

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
154-175	ARECRLRPCSGQRFNRNSCHDQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 10, cyto_nucl 10, cyto 8, extr 5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2 PF00665 rve PF07727 RVT_2 PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MSQRESKATGPAVVTTLAETFQETGPIGIIEARQKLFHAQCPEGGDIEEHLRKLRAYRSELHALGQADADSDFAMIILTSLPDSWNPFIRAIDPSDLLSPGFSQAAKLTSVKLIARILQEDHRGKRDDDQDTALKTTDKLTITCHLCGRRGHYARECRLRPCSGQRFNRNSCHDQDNDRWRDSCHYSRDNNSRANIADDHVTVSDSDSNSDSDARTPARQVLGTIWLADEDPDVALAARSPDAYYLDSGATVHVARDRIQFREYTDTPGRTIQGVGGHDVAQLGQGTIKLLSHVDQRSPLPITLQHVAHIPSATHNLILVSRITETGAHVSFKGNTVEIRSAEGQLLLTGTKSGRLYKLNVSTDYNTAFAARDAPRTWDDWHRVYGHINYDYLRLLARKGLVTGMTVDETAPATEQCRACIEAKQRVCPFPKMSFSQVGHIGDLVVCDMWGPARYRGAHSEYYFMLITDVKTRYAMRYFSSDKKHQLDAIRAYRSFLKTQKNIRLKMIRVDNGKEFVNRPIKQFLRSHSICLKLTAPHSSAQNGIAERSFLTVLNAARAMLFESNLPIKLWPEAVNYTVYLKNHAPTRALPNKTPFEAFWGCKPDVSHLCEFGATCWVLRQDTGVHKLMRKSRPCCFIGFSEESRAYRLYDPATGQIITSRNVIFERTCSHLEGETPSLPPLAVEGEQPTPEQPPVVSKSLNAPTVSAPAPVTPAPKPSNSAAVPGAPTKPSPSQIPMYTRALRHTGANVDYRRLNNPDARKPAARFQAPTSSAPTPDNPAADSPATVELAQDDQDFIFIANTSDDPQSLAEAQARSDWPEWKATMDREIAQLQRLGTYTLTACPPARKPIGCKWVFRIKRDAAGHIIKYKARLVAQGFSQIPGVDYIETFAPVVRLKTLRILLAIATLLDLDVHVVDIVGAYLNGRLREEIYMRQPPLYENGHADVCRLHRTLYGLKQSGREWNLELDAAFKKLRFTRLISDQCVYIRTAANALCIVAVHVDDMTTLTSSAEATAALKRELAAHFEISDLGPIHQVVGLEVTRDRSAGTLTLRQSQYIDRILARFGMTEANPVDTPLDPHVRLRAHDGPENPELRALYQAIVGSLKYAALGMRPDIAHAVQQLSQYSSNPAPVHLTAAKRVLRYLKGTRDLGITYHRNQDNTQTPEPIGYSDADWGNDLDDRCSISGQVFLLAGGPITWSSRKQRTVAKSSMEAEYMAASTATSEIAWLRTFLSELGFPLSGPTPLYVDNQSAIASANAQVSHARTKHIDIHYHFVRKRITSNEVRACSDTQVLRRTWILRRGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.17
3	0.16
4	0.12
5	0.11
6	0.11
7	0.12
8	0.11
9	0.13
10	0.12
11	0.11
12	0.12
13	0.11
14	0.1
15	0.1
16	0.13
17	0.16
18	0.21
19	0.21
20	0.21
21	0.23
22	0.31
23	0.33
24	0.38
25	0.4
26	0.37
27	0.4
28	0.43
29	0.44
30	0.36
31	0.33
32	0.26
33	0.22
34	0.27
35	0.26
36	0.23
37	0.24
38	0.24
39	0.25
40	0.29
41	0.34
42	0.35
43	0.38
44	0.44
45	0.49
46	0.55
47	0.55
48	0.52
49	0.49
50	0.42
51	0.37
52	0.31
53	0.23
54	0.16
55	0.15
56	0.13
57	0.08
58	0.07
59	0.06
60	0.05
61	0.05
62	0.04
63	0.04
64	0.04
65	0.05
66	0.05
67	0.06
68	0.07
69	0.08
70	0.13
71	0.16
72	0.22
73	0.24
74	0.25
75	0.26
76	0.27
77	0.29
78	0.28
79	0.29
80	0.24
81	0.24
82	0.24
83	0.23
84	0.21
85	0.18
86	0.15
87	0.13
88	0.13
89	0.12
90	0.11
91	0.12
92	0.14
93	0.16
94	0.16
95	0.16
96	0.17
97	0.21
98	0.2
99	0.22
100	0.22
101	0.24
102	0.26
103	0.26
104	0.28
105	0.29
106	0.38
107	0.42
108	0.45
109	0.48
110	0.48
111	0.47
112	0.52
113	0.55
114	0.51
115	0.47
116	0.47
117	0.46
118	0.45
119	0.45
120	0.38
121	0.3
122	0.26
123	0.25
124	0.25
125	0.22
126	0.2
127	0.22
128	0.29
129	0.32
130	0.35
131	0.39
132	0.37
133	0.4
134	0.42
135	0.45
136	0.48
137	0.49
138	0.53
139	0.57
140	0.63
141	0.68
142	0.75
143	0.72
144	0.67
145	0.69
146	0.66
147	0.64
148	0.65
149	0.66
150	0.66
151	0.72
152	0.77
153	0.8
154	0.82
155	0.84
156	0.81
157	0.75
158	0.71
159	0.67
160	0.6
161	0.57
162	0.59
163	0.61
164	0.59
165	0.57
166	0.53
167	0.48
168	0.51
169	0.52
170	0.5
171	0.48
172	0.5
173	0.53
174	0.61
175	0.68
176	0.68
177	0.66
178	0.6
179	0.55
180	0.48
181	0.46
182	0.38
183	0.3
184	0.26
185	0.21
186	0.21
187	0.18
188	0.17
189	0.13
190	0.14
191	0.16
192	0.13
193	0.15
194	0.14
195	0.14
196	0.15
197	0.16
198	0.15
199	0.13
200	0.17
201	0.18
202	0.19
203	0.2
204	0.23
205	0.25
206	0.24
207	0.23
208	0.21
209	0.24
210	0.22
211	0.2
212	0.17
213	0.14
214	0.14
215	0.13
216	0.11
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.06
221	0.05
222	0.05
223	0.06
224	0.07
225	0.07
226	0.07
227	0.07
228	0.09
229	0.1
230	0.12
231	0.12
232	0.12
233	0.12
234	0.11
235	0.11
236	0.1
237	0.1
238	0.08
239	0.09
240	0.1
241	0.11
242	0.13
243	0.21
244	0.23
245	0.25
246	0.27
247	0.27
248	0.27
249	0.35
250	0.34
251	0.34
252	0.38
253	0.37
254	0.37
255	0.38
256	0.36
257	0.28
258	0.27
259	0.21
260	0.19
261	0.18
262	0.18
263	0.17
264	0.16
265	0.15
266	0.15
267	0.13
268	0.09
269	0.08
270	0.07
271	0.06
272	0.06
273	0.07
274	0.07
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.09
279	0.16
280	0.18
281	0.18
282	0.21
283	0.22
284	0.25
285	0.27
286	0.26
287	0.21
288	0.21
289	0.24
290	0.25
291	0.25
292	0.21
293	0.22
294	0.23
295	0.22
296	0.2
297	0.16
298	0.14
299	0.17
300	0.17
301	0.15
302	0.13
303	0.12
304	0.12
305	0.13
306	0.11
307	0.08
308	0.08
309	0.09
310	0.09
311	0.09
312	0.1
313	0.13
314	0.13
315	0.13
316	0.13
317	0.15
318	0.15
319	0.17
320	0.17
321	0.13
322	0.13
323	0.16
324	0.18
325	0.17
326	0.2
327	0.19
328	0.19
329	0.18
330	0.17
331	0.14
332	0.11
333	0.11
334	0.07
335	0.06
336	0.07
337	0.06
338	0.1
339	0.11
340	0.13
341	0.16
342	0.19
343	0.22
344	0.28
345	0.36
346	0.36
347	0.37
348	0.39
349	0.37
350	0.37
351	0.35
352	0.28
353	0.2
354	0.17
355	0.15
356	0.11
357	0.15
358	0.14
359	0.17
360	0.17
361	0.21
362	0.21
363	0.24
364	0.27
365	0.29
366	0.33
367	0.31
368	0.34
369	0.32
370	0.32
371	0.32
372	0.33
373	0.3
374	0.26
375	0.25
376	0.22
377	0.21
378	0.2
379	0.18
380	0.16
381	0.11
382	0.1
383	0.12
384	0.13
385	0.12
386	0.12
387	0.13
388	0.12
389	0.12
390	0.12
391	0.11
392	0.1
393	0.09
394	0.09
395	0.08
396	0.08
397	0.08
398	0.07
399	0.06
400	0.07
401	0.12
402	0.12
403	0.13
404	0.14
405	0.17
406	0.18
407	0.23
408	0.28
409	0.32
410	0.35
411	0.41
412	0.43
413	0.46
414	0.49
415	0.48
416	0.47
417	0.42
418	0.45
419	0.41
420	0.41
421	0.42
422	0.4
423	0.38
424	0.37
425	0.33
426	0.28
427	0.25
428	0.21
429	0.14
430	0.13
431	0.09
432	0.05
433	0.04
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.07
438	0.09
439	0.1
440	0.14
441	0.16
442	0.18
443	0.22
444	0.26
445	0.28
446	0.27
447	0.28
448	0.24
449	0.25
450	0.23
451	0.19
452	0.15
453	0.11
454	0.11
455	0.14
456	0.15
457	0.13
458	0.14
459	0.15
460	0.17
461	0.19
462	0.2
463	0.17
464	0.22
465	0.27
466	0.32
467	0.39
468	0.41
469	0.44
470	0.46
471	0.46
472	0.44
473	0.43
474	0.42
475	0.43
476	0.44
477	0.42
478	0.38
479	0.38
480	0.39
481	0.38
482	0.36
483	0.34
484	0.36
485	0.38
486	0.46
487	0.55
488	0.58
489	0.58
490	0.61
491	0.62
492	0.55
493	0.56
494	0.54
495	0.49
496	0.45
497	0.45
498	0.4
499	0.36
500	0.35
501	0.29
502	0.24
503	0.27
504	0.32
505	0.31
506	0.31
507	0.37
508	0.38
509	0.41
510	0.43
511	0.39
512	0.39
513	0.38
514	0.4
515	0.36
516	0.39
517	0.35
518	0.34
519	0.31
520	0.25
521	0.26
522	0.25
523	0.22
524	0.19
525	0.2
526	0.19
527	0.18
528	0.17
529	0.17
530	0.14
531	0.13
532	0.11
533	0.11
534	0.1
535	0.1
536	0.09
537	0.07
538	0.07
539	0.1
540	0.1
541	0.1
542	0.1
543	0.09
544	0.08
545	0.08
546	0.09
547	0.06
548	0.06
549	0.05
550	0.07
551	0.08
552	0.08
553	0.08
554	0.08
555	0.08
556	0.08
557	0.1
558	0.09
559	0.11
560	0.11
561	0.12
562	0.13
563	0.12
564	0.14
565	0.15
566	0.14
567	0.15
568	0.15
569	0.16
570	0.19
571	0.2
572	0.19
573	0.19
574	0.28
575	0.33
576	0.35
577	0.35
578	0.38
579	0.39
580	0.39
581	0.38
582	0.28
583	0.27
584	0.28
585	0.26
586	0.24
587	0.27
588	0.26
589	0.26
590	0.26
591	0.25
592	0.25
593	0.29
594	0.26
595	0.22
596	0.22
597	0.21
598	0.2
599	0.16
600	0.14
601	0.09
602	0.08
603	0.08
604	0.09
605	0.08
606	0.08
607	0.09
608	0.1
609	0.13
610	0.17
611	0.2
612	0.21
613	0.23
614	0.28
615	0.35
616	0.4
617	0.44
618	0.44
619	0.46
620	0.51
621	0.5
622	0.47
623	0.42
624	0.36
625	0.34
626	0.34
627	0.28
628	0.26
629	0.26
630	0.24
631	0.23
632	0.22
633	0.17
634	0.15
635	0.15
636	0.12
637	0.13
638	0.13
639	0.13
640	0.14
641	0.12
642	0.11
643	0.13
644	0.13
645	0.12
646	0.13
647	0.12
648	0.11
649	0.11
650	0.13
651	0.1
652	0.1
653	0.11
654	0.13
655	0.14
656	0.15
657	0.15
658	0.14
659	0.15
660	0.16
661	0.16
662	0.13
663	0.12
664	0.12
665	0.11
666	0.1
667	0.09
668	0.08
669	0.06
670	0.06
671	0.06
672	0.08
673	0.08
674	0.09
675	0.09
676	0.1
677	0.09
678	0.09
679	0.09
680	0.07
681	0.1
682	0.13
683	0.15
684	0.15
685	0.14
686	0.2
687	0.23
688	0.25
689	0.21
690	0.19
691	0.17
692	0.2
693	0.2
694	0.15
695	0.11
696	0.09
697	0.11
698	0.11
699	0.13
700	0.11
701	0.16
702	0.17
703	0.18
704	0.2
705	0.2
706	0.25
707	0.23
708	0.24
709	0.19
710	0.18
711	0.19
712	0.17
713	0.18
714	0.12
715	0.12
716	0.13
717	0.14
718	0.15
719	0.16
720	0.18
721	0.2
722	0.23
723	0.27
724	0.28
725	0.32
726	0.33
727	0.32
728	0.31
729	0.3
730	0.27
731	0.24
732	0.22
733	0.19
734	0.18
735	0.24
736	0.22
737	0.22
738	0.24
739	0.25
740	0.26
741	0.26
742	0.27
743	0.26
744	0.33
745	0.38
746	0.4
747	0.43
748	0.43
749	0.42
750	0.46
751	0.47
752	0.43
753	0.37
754	0.35
755	0.4
756	0.38
757	0.38
758	0.35
759	0.29
760	0.28
761	0.28
762	0.25
763	0.21
764	0.2
765	0.19
766	0.15
767	0.15
768	0.15
769	0.14
770	0.13
771	0.1
772	0.1
773	0.1
774	0.09
775	0.09
776	0.07
777	0.07
778	0.08
779	0.07
780	0.06
781	0.05
782	0.06
783	0.06
784	0.05
785	0.05
786	0.04
787	0.05
788	0.05
789	0.06
790	0.07
791	0.08
792	0.07
793	0.08
794	0.08
795	0.08
796	0.08
797	0.09
798	0.1
799	0.1
800	0.1
801	0.12
802	0.12
803	0.14
804	0.16
805	0.17
806	0.16
807	0.18
808	0.18
809	0.18
810	0.21
811	0.2
812	0.22
813	0.21
814	0.21
815	0.2
816	0.23
817	0.21
818	0.19
819	0.2
820	0.16
821	0.15
822	0.15
823	0.13
824	0.1
825	0.11
826	0.1
827	0.1
828	0.11
829	0.11
830	0.12
831	0.15
832	0.17
833	0.22
834	0.26
835	0.26
836	0.3
837	0.38
838	0.47
839	0.47
840	0.47
841	0.47
842	0.53
843	0.56
844	0.53
845	0.53
846	0.45
847	0.49
848	0.49
849	0.45
850	0.41
851	0.41
852	0.4
853	0.35
854	0.36
855	0.29
856	0.29
857	0.29
858	0.25
859	0.21
860	0.24
861	0.23
862	0.22
863	0.22
864	0.27
865	0.25
866	0.22
867	0.22
868	0.17
869	0.15
870	0.13
871	0.13
872	0.07
873	0.07
874	0.07
875	0.07
876	0.07
877	0.07
878	0.06
879	0.07
880	0.08
881	0.09
882	0.11
883	0.11
884	0.12
885	0.17
886	0.18
887	0.17
888	0.17
889	0.17
890	0.14
891	0.14
892	0.13
893	0.08
894	0.06
895	0.05
896	0.05
897	0.04
898	0.04
899	0.03
900	0.03
901	0.03
902	0.03
903	0.03
904	0.03
905	0.03
906	0.03
907	0.03
908	0.03
909	0.03
910	0.05
911	0.07
912	0.08
913	0.08
914	0.09
915	0.1
916	0.13
917	0.15
918	0.17
919	0.23
920	0.29
921	0.29
922	0.3
923	0.29
924	0.28
925	0.31
926	0.29
927	0.24
928	0.2
929	0.22
930	0.23
931	0.22
932	0.22
933	0.2
934	0.19
935	0.21
936	0.2
937	0.18
938	0.17
939	0.22
940	0.28
941	0.32
942	0.38
943	0.37
944	0.39
945	0.41
946	0.41
947	0.44
948	0.4
949	0.35
950	0.28
951	0.26
952	0.25
953	0.22
954	0.2
955	0.16
956	0.15
957	0.16
958	0.15
959	0.14
960	0.17
961	0.2
962	0.26
963	0.25
964	0.28
965	0.33
966	0.42
967	0.48
968	0.46
969	0.44
970	0.41
971	0.38
972	0.36
973	0.29
974	0.22
975	0.17
976	0.14
977	0.16
978	0.15
979	0.15
980	0.14
981	0.13
982	0.11
983	0.09
984	0.09
985	0.06
986	0.06
987	0.05
988	0.05
989	0.04
990	0.04
991	0.05
992	0.05
993	0.05
994	0.05
995	0.05
996	0.06
997	0.06
998	0.06
999	0.06
1000	0.05
1001	0.06
1002	0.09
1003	0.1
1004	0.1
1005	0.11
1006	0.11
1007	0.14
1008	0.15
1009	0.17
1010	0.17
1011	0.16
1012	0.16
1013	0.16
1014	0.17
1015	0.13
1016	0.14
1017	0.11
1018	0.1
1019	0.1
1020	0.1
1021	0.1
1022	0.1
1023	0.1
1024	0.08
1025	0.1
1026	0.09
1027	0.1
1028	0.11
1029	0.13
1030	0.12
1031	0.12
1032	0.12
1033	0.1
1034	0.11
1035	0.13
1036	0.16
1037	0.19
1038	0.21
1039	0.29
1040	0.3
1041	0.3
1042	0.3
1043	0.3
1044	0.31
1045	0.28
1046	0.29
1047	0.22
1048	0.23
1049	0.23
1050	0.23
1051	0.21
1052	0.16
1053	0.13
1054	0.15
1055	0.14
1056	0.17
1057	0.17
1058	0.18
1059	0.18
1060	0.18
1061	0.18
1062	0.14
1063	0.17
1064	0.17
1065	0.22
1066	0.2
1067	0.22
1068	0.28
1069	0.28
1070	0.29
1071	0.34
1072	0.37
1073	0.36
1074	0.4
1075	0.41
1076	0.41
1077	0.46
1078	0.46
1079	0.38
1080	0.33
1081	0.29
1082	0.25
1083	0.25
1084	0.2
1085	0.14
1086	0.14
1087	0.14
1088	0.13
1089	0.13
1090	0.12
1091	0.1
1092	0.09
1093	0.08
1094	0.07
1095	0.07
1096	0.06
1097	0.08
1098	0.09
1099	0.09
1100	0.13
1101	0.13
1102	0.13
1103	0.15
1104	0.15
1105	0.15
1106	0.15
1107	0.17
1108	0.16
1109	0.17
1110	0.18
1111	0.19
1112	0.2
1113	0.19
1114	0.22
1115	0.21
1116	0.24
1117	0.23
1118	0.23
1119	0.23
1120	0.22
1121	0.27
1122	0.27
1123	0.28
1124	0.26
1125	0.33
1126	0.36
1127	0.32
1128	0.36
1129	0.37
1130	0.37
1131	0.42
1132	0.46
1133	0.48
1134	0.52
1135	0.52
1136	0.5
1137	0.47
1138	0.43
1139	0.38
1140	0.38
1141	0.35
1142	0.31
1143	0.39
1144	0.4
1145	0.39
1146	0.4
1147	0.46
1148	0.47
1149	0.49
1150	0.49
1151	0.42
1152	0.4
1153	0.4
1154	0.39
1155	0.32
1156	0.24
1157	0.17
1158	0.15
1159	0.16
1160	0.17
1161	0.16
1162	0.16
1163	0.15
1164	0.15
1165	0.17
1166	0.17
1167	0.14
1168	0.14
1169	0.15
1170	0.15
1171	0.16
1172	0.15
1173	0.12
1174	0.14
1175	0.13
1176	0.13
1177	0.11
1178	0.1
1179	0.11
1180	0.1
1181	0.09
1182	0.06
1183	0.07
1184	0.06
1185	0.09
1186	0.12
1187	0.16
1188	0.25
1189	0.33
1190	0.38
1191	0.43
1192	0.51
1193	0.58
1194	0.64
1195	0.66
1196	0.63
1197	0.6
1198	0.58
1199	0.56
1200	0.47
1201	0.38
1202	0.3
1203	0.24
1204	0.19
1205	0.13
1206	0.1
1207	0.07
1208	0.07
1209	0.07
1210	0.07
1211	0.06
1212	0.06
1213	0.07
1214	0.1
1215	0.1
1216	0.1
1217	0.11
1218	0.11
1219	0.12
1220	0.12
1221	0.13
1222	0.12
1223	0.13
1224	0.16
1225	0.15
1226	0.14
1227	0.16
1228	0.17
1229	0.15
1230	0.15
1231	0.15
1232	0.13
1233	0.15
1234	0.19
1235	0.18
1236	0.19
1237	0.19
1238	0.19
1239	0.18
1240	0.16
1241	0.15
1242	0.12
1243	0.11
1244	0.11
1245	0.13
1246	0.12
1247	0.13
1248	0.15
1249	0.17
1250	0.26
1251	0.25
1252	0.28
1253	0.27
1254	0.32
1255	0.4
1256	0.44
1257	0.5
1258	0.45
1259	0.54
1260	0.57
1261	0.64
1262	0.61
1263	0.59
1264	0.59
1265	0.54
1266	0.56
1267	0.54
1268	0.55
1269	0.55
1270	0.64
1271	0.67
1272	0.65
1273	0.65
1274	0.62
1275	0.57
1276	0.51
1277	0.47
1278	0.42
1279	0.39
1280	0.42
1281	0.39
1282	0.39
1283	0.42
1284	0.45
1285	0.47

A0A060SU89

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer