Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A060SHD8

Protein Details
Accession A0A060SHD8    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
248-268EFTVEKRSRMRKKQAHSYQTKHydrophilic
332-358AAEKDTALKRKRKQIRKLEAKENSECKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
236-260RRRTKKARGKRGEFTVEKRSRMRKK
340-348KRKRKQIRK
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 6.5, cyto_mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MPYTSSAHRLSSSASSGLIALPSSSSSGDQVYSSPSRVAYTPLARTLAAPWSPAPDPELDDEELNVEIHGLHYDDDLEVEVDSDDFEVVGVVYASTDDEFGSDAGERPQQDEGVLDSPSHPDHELDRGVVSTTKAEVSKVEMDLDVQSEVETLDQTCGSTRCTNKEVIVLPDIKVEVTVPQRRLRPRALKAQATVPFAPGPAGKRRRTNTISDVASREEDEASHAGDDSDDEEGSRRRTKKARGKRGEFTVEKRSRMRKKQAHSYQTKSKVDAVCGIEGCEATVFRNGGWKTHLDDAHYALPPSATDKNPGLATKPMAVASPSSSRGCNHAAAEKDTALKRKRKQIRKLEAKENSECKKILCRHDDCTEKKEYSTLDILYRHIRTQHWQWTTDCPVCKRSFGRVSTMTRHFKAQHPSDQLPIADSECSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.19
3 0.19
4 0.18
5 0.15
6 0.11
7 0.08
8 0.08
9 0.08
10 0.09
11 0.1
12 0.1
13 0.11
14 0.12
15 0.12
16 0.12
17 0.12
18 0.17
19 0.19
20 0.2
21 0.2
22 0.19
23 0.2
24 0.2
25 0.24
26 0.25
27 0.28
28 0.31
29 0.33
30 0.34
31 0.32
32 0.32
33 0.3
34 0.3
35 0.25
36 0.23
37 0.2
38 0.23
39 0.24
40 0.23
41 0.23
42 0.17
43 0.19
44 0.21
45 0.24
46 0.2
47 0.2
48 0.19
49 0.19
50 0.18
51 0.15
52 0.12
53 0.08
54 0.06
55 0.07
56 0.07
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.08
64 0.07
65 0.06
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.05
72 0.04
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.03
79 0.03
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.05
84 0.04
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.06
89 0.06
90 0.07
91 0.09
92 0.12
93 0.12
94 0.14
95 0.15
96 0.14
97 0.14
98 0.13
99 0.14
100 0.13
101 0.13
102 0.12
103 0.11
104 0.13
105 0.13
106 0.14
107 0.12
108 0.11
109 0.12
110 0.16
111 0.17
112 0.15
113 0.15
114 0.14
115 0.14
116 0.14
117 0.13
118 0.1
119 0.1
120 0.11
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.14
125 0.16
126 0.16
127 0.16
128 0.13
129 0.14
130 0.14
131 0.14
132 0.1
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.07
144 0.08
145 0.11
146 0.16
147 0.18
148 0.22
149 0.24
150 0.26
151 0.25
152 0.29
153 0.27
154 0.25
155 0.26
156 0.23
157 0.21
158 0.2
159 0.19
160 0.15
161 0.13
162 0.1
163 0.1
164 0.16
165 0.21
166 0.23
167 0.27
168 0.33
169 0.38
170 0.42
171 0.47
172 0.49
173 0.5
174 0.57
175 0.59
176 0.57
177 0.54
178 0.56
179 0.52
180 0.47
181 0.42
182 0.32
183 0.26
184 0.23
185 0.22
186 0.16
187 0.14
188 0.19
189 0.27
190 0.29
191 0.36
192 0.39
193 0.46
194 0.48
195 0.5
196 0.46
197 0.46
198 0.44
199 0.39
200 0.38
201 0.3
202 0.28
203 0.23
204 0.18
205 0.12
206 0.1
207 0.09
208 0.09
209 0.08
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.08
221 0.12
222 0.18
223 0.19
224 0.24
225 0.31
226 0.41
227 0.51
228 0.6
229 0.68
230 0.72
231 0.77
232 0.77
233 0.78
234 0.76
235 0.68
236 0.62
237 0.62
238 0.56
239 0.53
240 0.53
241 0.56
242 0.57
243 0.63
244 0.69
245 0.65
246 0.69
247 0.76
248 0.8
249 0.81
250 0.79
251 0.77
252 0.76
253 0.77
254 0.71
255 0.62
256 0.58
257 0.5
258 0.43
259 0.42
260 0.35
261 0.27
262 0.25
263 0.24
264 0.19
265 0.17
266 0.15
267 0.1
268 0.08
269 0.06
270 0.09
271 0.08
272 0.08
273 0.15
274 0.15
275 0.16
276 0.18
277 0.19
278 0.19
279 0.26
280 0.27
281 0.22
282 0.23
283 0.25
284 0.28
285 0.27
286 0.24
287 0.18
288 0.17
289 0.14
290 0.17
291 0.19
292 0.15
293 0.18
294 0.19
295 0.21
296 0.23
297 0.24
298 0.22
299 0.2
300 0.21
301 0.2
302 0.2
303 0.18
304 0.16
305 0.16
306 0.15
307 0.15
308 0.17
309 0.19
310 0.19
311 0.2
312 0.2
313 0.24
314 0.25
315 0.25
316 0.23
317 0.25
318 0.26
319 0.28
320 0.3
321 0.27
322 0.29
323 0.3
324 0.36
325 0.39
326 0.45
327 0.49
328 0.57
329 0.66
330 0.71
331 0.79
332 0.82
333 0.85
334 0.88
335 0.89
336 0.89
337 0.88
338 0.84
339 0.82
340 0.79
341 0.72
342 0.65
343 0.58
344 0.49
345 0.5
346 0.5
347 0.52
348 0.53
349 0.53
350 0.55
351 0.62
352 0.69
353 0.64
354 0.62
355 0.6
356 0.51
357 0.47
358 0.45
359 0.38
360 0.34
361 0.33
362 0.3
363 0.28
364 0.28
365 0.3
366 0.34
367 0.34
368 0.32
369 0.31
370 0.32
371 0.34
372 0.41
373 0.48
374 0.46
375 0.48
376 0.48
377 0.52
378 0.58
379 0.57
380 0.55
381 0.49
382 0.52
383 0.51
384 0.56
385 0.51
386 0.53
387 0.55
388 0.52
389 0.56
390 0.56
391 0.61
392 0.62
393 0.68
394 0.66
395 0.59
396 0.63
397 0.58
398 0.57
399 0.61
400 0.6
401 0.6
402 0.6
403 0.61
404 0.59
405 0.59
406 0.52
407 0.44
408 0.38
409 0.3