FuNGI

A0A060S9J2

Protein Details

Accession

A0A060S9J2

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
4-29	TGAPRPPGEKWHKRFLKRHPGIQLGK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-20	KWHKRFLK
681-706	SKTKPKPGGKGKGKGKEKDKDKGKGK

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto 5, pero 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004875 DDE_SF_endonuclease_dom IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF03184 DDE_1 PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2 PF00665 rve
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MHITGAPRPPGEKWHKRFLKRHPGIQLGKPYGLDPERARAFNRHTVDDHFKKLKAVIDEYNIPWSHVYNMDEKGIQRGGGKRLQRIKYFVPRSRRVNYKLRSSNLELVTILECDSADGHALAPGFIFAGSQLPSDNFRDIDPRVVIAHSPNGWTEGFLCTEWFRKCFLPQANARRESEAPLLLILDGHNSHISPELRQLAIKNNVHLFLLPPHTTHRLQPLDVGIFSHIQNAWVKRCNQYYSKSLGREMSRSQLIRQYLAMRRHVLKSHLIRRAWYNSGITSGTWSADFFSEADFALSYSTSAVAHVPPSYPIDGVMGDPDAEPLALDSEEEVDATLDQSSESSSDSLFDCSGLPHLYDWEERVDRHRRPGLSTYSECDEFPCPHRYDQPGNPSGRSWAEYPDESQESALYPLPPESVFDLFSSPTPVVVSRSPSPQAPLQFMPATPSISLNFSDDFRDSPQFLLFTMGDIKPDTIPLLTSASQYSDWVAKIKGVMLFTGCWGPVLNASPPEGEKAEDWKKKDDQAKGLIWMRTATNYHYLLETKEEEVDGVKKRIAASYSAKDMWDVLKKEFGTPDTAEAIGLLMSFSNLPPITDTRPLRDQLGTYITRIRDASNGGMHFTESQQAVFILMKLPPSYSTLSTSLTSSHPLKDWTIEWIQGKVLAEESLRSSTSQSVTRISKTKPKPGGKGKGKGKEKDKDKGKGKDNSNNHAHTAAPAVNVLVAESSSNMHASFYSAAHAAGVRHTHWLMDSGASQHITFDINDFAEYKAYDTPIVFRTAASGEGSSVKALGKGLVRGETFIDGVKWSIDLPKVCYIPMASSRLFSTGSIEKNGYSIFQGGQKMSIFDKLPSGAVTHGSTIKIEGRKILEGVFNPVNNLYDFVLEIKSGPHVHLSKTDYKTWHRRFGHAGKEALRHLPKNVKGVDHVDPADDEPCEGCAFGKSHRLPFPPSEKRATEPLELVHTDLDGPMRTASVGSGFLYFASFIDDFSGLGIAYFLKRKSDAMKAFDNFKAWAETQTGKKIKRVRSDRGGEYLSNEFTQHLLDLGIEHQKSMPDSPQQNGRAERWNRTIIEKAMSMLHHAGLSHGFWQIAVEAAVHIYNHQPM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.61
2	0.69
3	0.77
4	0.84
5	0.85
6	0.85
7	0.83
8	0.84
9	0.82
10	0.83
11	0.79
12	0.78
13	0.77
14	0.7
15	0.64
16	0.56
17	0.48
18	0.45
19	0.41
20	0.39
21	0.31
22	0.36
23	0.39
24	0.41
25	0.43
26	0.43
27	0.48
28	0.51
29	0.53
30	0.48
31	0.46
32	0.51
33	0.58
34	0.57
35	0.59
36	0.55
37	0.52
38	0.5
39	0.5
40	0.49
41	0.44
42	0.43
43	0.39
44	0.4
45	0.44
46	0.43
47	0.47
48	0.41
49	0.36
50	0.32
51	0.28
52	0.25
53	0.24
54	0.25
55	0.23
56	0.25
57	0.26
58	0.29
59	0.28
60	0.3
61	0.27
62	0.26
63	0.26
64	0.3
65	0.33
66	0.38
67	0.42
68	0.46
69	0.54
70	0.61
71	0.61
72	0.61
73	0.64
74	0.68
75	0.73
76	0.72
77	0.73
78	0.74
79	0.76
80	0.78
81	0.78
82	0.75
83	0.75
84	0.74
85	0.75
86	0.75
87	0.72
88	0.71
89	0.68
90	0.7
91	0.61
92	0.55
93	0.44
94	0.37
95	0.34
96	0.27
97	0.2
98	0.12
99	0.1
100	0.09
101	0.09
102	0.08
103	0.08
104	0.07
105	0.07
106	0.09
107	0.09
108	0.08
109	0.08
110	0.07
111	0.07
112	0.06
113	0.06
114	0.04
115	0.07
116	0.08
117	0.08
118	0.09
119	0.1
120	0.14
121	0.17
122	0.19
123	0.17
124	0.17
125	0.22
126	0.22
127	0.27
128	0.24
129	0.23
130	0.22
131	0.22
132	0.22
133	0.2
134	0.24
135	0.19
136	0.2
137	0.19
138	0.2
139	0.19
140	0.18
141	0.17
142	0.14
143	0.14
144	0.13
145	0.15
146	0.14
147	0.2
148	0.23
149	0.23
150	0.24
151	0.24
152	0.27
153	0.33
154	0.38
155	0.41
156	0.47
157	0.56
158	0.63
159	0.66
160	0.65
161	0.61
162	0.55
163	0.51
164	0.46
165	0.37
166	0.27
167	0.23
168	0.21
169	0.17
170	0.16
171	0.11
172	0.1
173	0.09
174	0.1
175	0.1
176	0.1
177	0.1
178	0.16
179	0.17
180	0.16
181	0.21
182	0.23
183	0.23
184	0.25
185	0.26
186	0.29
187	0.37
188	0.38
189	0.36
190	0.35
191	0.35
192	0.34
193	0.32
194	0.25
195	0.21
196	0.25
197	0.22
198	0.2
199	0.24
200	0.29
201	0.3
202	0.32
203	0.36
204	0.33
205	0.33
206	0.35
207	0.34
208	0.31
209	0.3
210	0.28
211	0.2
212	0.18
213	0.18
214	0.18
215	0.14
216	0.14
217	0.19
218	0.22
219	0.25
220	0.3
221	0.32
222	0.35
223	0.4
224	0.44
225	0.44
226	0.46
227	0.46
228	0.47
229	0.51
230	0.47
231	0.45
232	0.46
233	0.43
234	0.42
235	0.39
236	0.39
237	0.38
238	0.37
239	0.36
240	0.36
241	0.35
242	0.32
243	0.31
244	0.32
245	0.33
246	0.38
247	0.4
248	0.39
249	0.41
250	0.44
251	0.44
252	0.4
253	0.42
254	0.46
255	0.5
256	0.54
257	0.51
258	0.49
259	0.52
260	0.54
261	0.49
262	0.42
263	0.35
264	0.28
265	0.29
266	0.28
267	0.22
268	0.19
269	0.16
270	0.14
271	0.12
272	0.11
273	0.1
274	0.1
275	0.1
276	0.08
277	0.08
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.07
282	0.07
283	0.07
284	0.06
285	0.05
286	0.05
287	0.06
288	0.05
289	0.06
290	0.07
291	0.07
292	0.08
293	0.09
294	0.09
295	0.1
296	0.12
297	0.13
298	0.12
299	0.11
300	0.11
301	0.11
302	0.1
303	0.1
304	0.08
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.06
309	0.05
310	0.05
311	0.04
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.06
320	0.05
321	0.05
322	0.06
323	0.06
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.05
328	0.05
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.07
333	0.08
334	0.09
335	0.09
336	0.09
337	0.08
338	0.08
339	0.1
340	0.09
341	0.09
342	0.08
343	0.09
344	0.1
345	0.11
346	0.12
347	0.15
348	0.16
349	0.16
350	0.23
351	0.3
352	0.31
353	0.38
354	0.43
355	0.39
356	0.43
357	0.48
358	0.48
359	0.46
360	0.45
361	0.41
362	0.38
363	0.38
364	0.33
365	0.29
366	0.25
367	0.2
368	0.23
369	0.26
370	0.25
371	0.26
372	0.31
373	0.35
374	0.38
375	0.42
376	0.47
377	0.47
378	0.47
379	0.46
380	0.41
381	0.39
382	0.34
383	0.29
384	0.21
385	0.18
386	0.19
387	0.19
388	0.2
389	0.21
390	0.21
391	0.19
392	0.18
393	0.15
394	0.13
395	0.13
396	0.13
397	0.09
398	0.08
399	0.09
400	0.09
401	0.09
402	0.09
403	0.1
404	0.1
405	0.1
406	0.1
407	0.11
408	0.11
409	0.11
410	0.12
411	0.1
412	0.09
413	0.09
414	0.09
415	0.11
416	0.12
417	0.16
418	0.15
419	0.19
420	0.2
421	0.2
422	0.22
423	0.23
424	0.23
425	0.23
426	0.21
427	0.21
428	0.21
429	0.2
430	0.21
431	0.18
432	0.17
433	0.14
434	0.14
435	0.11
436	0.12
437	0.13
438	0.11
439	0.11
440	0.11
441	0.12
442	0.11
443	0.12
444	0.13
445	0.14
446	0.14
447	0.13
448	0.14
449	0.12
450	0.12
451	0.14
452	0.11
453	0.1
454	0.13
455	0.12
456	0.12
457	0.12
458	0.12
459	0.09
460	0.1
461	0.09
462	0.06
463	0.06
464	0.06
465	0.09
466	0.09
467	0.1
468	0.1
469	0.11
470	0.11
471	0.11
472	0.11
473	0.09
474	0.09
475	0.1
476	0.1
477	0.09
478	0.09
479	0.11
480	0.12
481	0.1
482	0.1
483	0.09
484	0.09
485	0.1
486	0.1
487	0.08
488	0.06
489	0.06
490	0.06
491	0.07
492	0.08
493	0.09
494	0.09
495	0.1
496	0.1
497	0.1
498	0.11
499	0.1
500	0.09
501	0.09
502	0.15
503	0.23
504	0.27
505	0.28
506	0.32
507	0.33
508	0.39
509	0.45
510	0.42
511	0.39
512	0.41
513	0.4
514	0.4
515	0.42
516	0.37
517	0.31
518	0.27
519	0.22
520	0.18
521	0.17
522	0.14
523	0.14
524	0.15
525	0.15
526	0.15
527	0.15
528	0.14
529	0.15
530	0.15
531	0.11
532	0.1
533	0.1
534	0.09
535	0.09
536	0.13
537	0.12
538	0.12
539	0.12
540	0.13
541	0.14
542	0.15
543	0.15
544	0.15
545	0.17
546	0.19
547	0.22
548	0.21
549	0.21
550	0.19
551	0.19
552	0.18
553	0.19
554	0.18
555	0.15
556	0.19
557	0.19
558	0.2
559	0.2
560	0.19
561	0.17
562	0.15
563	0.16
564	0.14
565	0.13
566	0.12
567	0.11
568	0.1
569	0.06
570	0.06
571	0.04
572	0.02
573	0.03
574	0.03
575	0.03
576	0.05
577	0.05
578	0.05
579	0.07
580	0.09
581	0.12
582	0.19
583	0.2
584	0.21
585	0.25
586	0.25
587	0.26
588	0.25
589	0.23
590	0.18
591	0.23
592	0.2
593	0.17
594	0.2
595	0.18
596	0.19
597	0.19
598	0.18
599	0.14
600	0.15
601	0.16
602	0.15
603	0.15
604	0.14
605	0.14
606	0.14
607	0.13
608	0.11
609	0.12
610	0.09
611	0.09
612	0.08
613	0.08
614	0.08
615	0.08
616	0.08
617	0.06
618	0.07
619	0.07
620	0.07
621	0.08
622	0.08
623	0.11
624	0.12
625	0.12
626	0.15
627	0.15
628	0.17
629	0.17
630	0.17
631	0.16
632	0.15
633	0.17
634	0.16
635	0.15
636	0.14
637	0.15
638	0.16
639	0.16
640	0.15
641	0.16
642	0.16
643	0.18
644	0.18
645	0.17
646	0.17
647	0.17
648	0.17
649	0.12
650	0.12
651	0.09
652	0.08
653	0.08
654	0.1
655	0.09
656	0.1
657	0.1
658	0.1
659	0.12
660	0.14
661	0.17
662	0.16
663	0.2
664	0.22
665	0.25
666	0.28
667	0.29
668	0.36
669	0.38
670	0.47
671	0.51
672	0.55
673	0.61
674	0.67
675	0.75
676	0.74
677	0.78
678	0.77
679	0.77
680	0.78
681	0.76
682	0.75
683	0.73
684	0.7
685	0.7
686	0.7
687	0.7
688	0.71
689	0.73
690	0.73
691	0.73
692	0.73
693	0.73
694	0.7
695	0.69
696	0.66
697	0.59
698	0.52
699	0.44
700	0.38
701	0.29
702	0.26
703	0.19
704	0.12
705	0.11
706	0.09
707	0.09
708	0.08
709	0.08
710	0.05
711	0.04
712	0.04
713	0.04
714	0.05
715	0.05
716	0.06
717	0.06
718	0.06
719	0.06
720	0.07
721	0.08
722	0.08
723	0.09
724	0.09
725	0.08
726	0.08
727	0.09
728	0.08
729	0.09
730	0.1
731	0.1
732	0.12
733	0.12
734	0.12
735	0.11
736	0.13
737	0.12
738	0.11
739	0.11
740	0.11
741	0.12
742	0.13
743	0.12
744	0.1
745	0.1
746	0.1
747	0.09
748	0.09
749	0.09
750	0.08
751	0.09
752	0.1
753	0.09
754	0.1
755	0.1
756	0.1
757	0.1
758	0.1
759	0.11
760	0.1
761	0.13
762	0.14
763	0.17
764	0.15
765	0.14
766	0.15
767	0.14
768	0.15
769	0.13
770	0.12
771	0.09
772	0.11
773	0.12
774	0.1
775	0.1
776	0.09
777	0.09
778	0.09
779	0.11
780	0.1
781	0.12
782	0.13
783	0.16
784	0.16
785	0.16
786	0.17
787	0.15
788	0.14
789	0.12
790	0.11
791	0.08
792	0.09
793	0.08
794	0.07
795	0.07
796	0.09
797	0.13
798	0.14
799	0.17
800	0.22
801	0.22
802	0.22
803	0.23
804	0.2
805	0.2
806	0.24
807	0.24
808	0.19
809	0.2
810	0.21
811	0.22
812	0.22
813	0.18
814	0.18
815	0.18
816	0.2
817	0.21
818	0.21
819	0.2
820	0.2
821	0.2
822	0.16
823	0.12
824	0.11
825	0.1
826	0.14
827	0.16
828	0.15
829	0.18
830	0.17
831	0.18
832	0.18
833	0.21
834	0.17
835	0.16
836	0.18
837	0.16
838	0.16
839	0.15
840	0.15
841	0.12
842	0.13
843	0.13
844	0.13
845	0.14
846	0.14
847	0.14
848	0.15
849	0.2
850	0.2
851	0.2
852	0.22
853	0.23
854	0.24
855	0.25
856	0.25
857	0.22
858	0.2
859	0.26
860	0.25
861	0.23
862	0.22
863	0.22
864	0.21
865	0.18
866	0.19
867	0.13
868	0.1
869	0.1
870	0.11
871	0.11
872	0.09
873	0.09
874	0.08
875	0.11
876	0.12
877	0.12
878	0.17
879	0.18
880	0.2
881	0.26
882	0.31
883	0.37
884	0.4
885	0.45
886	0.44
887	0.51
888	0.61
889	0.62
890	0.66
891	0.6
892	0.61
893	0.65
894	0.67
895	0.68
896	0.63
897	0.61
898	0.55
899	0.57
900	0.55
901	0.54
902	0.51
903	0.43
904	0.42
905	0.46
906	0.46
907	0.49
908	0.49
909	0.43
910	0.41
911	0.44
912	0.44
913	0.4
914	0.36
915	0.29
916	0.28
917	0.27
918	0.25
919	0.2
920	0.15
921	0.11
922	0.11
923	0.11
924	0.1
925	0.09
926	0.11
927	0.12
928	0.14
929	0.24
930	0.26
931	0.33
932	0.39
933	0.42
934	0.43
935	0.5
936	0.58
937	0.58
938	0.59
939	0.6
940	0.56
941	0.56
942	0.59
943	0.56
944	0.48
945	0.41
946	0.37
947	0.35
948	0.33
949	0.31
950	0.23
951	0.19
952	0.16
953	0.14
954	0.14
955	0.1
956	0.1
957	0.1
958	0.1
959	0.09
960	0.09
961	0.09
962	0.09
963	0.1
964	0.09
965	0.1
966	0.1
967	0.1
968	0.1
969	0.1
970	0.08
971	0.11
972	0.1
973	0.1
974	0.12
975	0.12
976	0.11
977	0.11
978	0.12
979	0.07
980	0.07
981	0.07
982	0.06
983	0.08
984	0.13
985	0.13
986	0.16
987	0.17
988	0.2
989	0.25
990	0.34
991	0.38
992	0.4
993	0.48
994	0.48
995	0.52
996	0.51
997	0.49
998	0.4
999	0.35
1000	0.34
1001	0.26
1002	0.26
1003	0.25
1004	0.28
1005	0.31
1006	0.4
1007	0.46
1008	0.44
1009	0.5
1010	0.56
1011	0.6
1012	0.66
1013	0.69
1014	0.69
1015	0.72
1016	0.78
1017	0.76
1018	0.74
1019	0.69
1020	0.59
1021	0.54
1022	0.49
1023	0.41
1024	0.33
1025	0.28
1026	0.22
1027	0.19
1028	0.19
1029	0.15
1030	0.11
1031	0.09
1032	0.08
1033	0.08
1034	0.11
1035	0.18
1036	0.17
1037	0.17
1038	0.18
1039	0.2
1040	0.22
1041	0.24
1042	0.27
1043	0.28
1044	0.32
1045	0.36
1046	0.44
1047	0.47
1048	0.51
1049	0.53
1050	0.52
1051	0.53
1052	0.55
1053	0.59
1054	0.56
1055	0.58
1056	0.54
1057	0.54
1058	0.56
1059	0.49
1060	0.48
1061	0.41
1062	0.36
1063	0.33
1064	0.31
1065	0.3
1066	0.25
1067	0.23
1068	0.19
1069	0.18
1070	0.18
1071	0.16
1072	0.17
1073	0.15
1074	0.14
1075	0.13
1076	0.12
1077	0.13
1078	0.12
1079	0.11
1080	0.1
1081	0.09
1082	0.07
1083	0.09
1084	0.1
1085	0.09
1086	0.1

A0A060S9J2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer