FuNGI

A0A060SQL1

Protein Details

Accession

A0A060SQL1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
233-256	HESTCWKKHPDQRPKRGGKGKGKG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
240-265	KHPDQRPKRGGKGKGKGKEKDKGKGK

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 11.333, cyto 7, cyto_mito 5.333, mito 2.5

Family & Domain DBs

Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2

Amino Acid Sequences

MGDIKPDTIPLLTSASQYSDWVAKIKGVMLFTGCWGPVLNASPPEGEKAEDWKKKDDQAKGLIWMRTATNYHYLLETKEEEVDGVKKRIAASYSAKDMWDVLKKEFGTPDTAEAIGLLMSFSNLPPMTDTRPLRDQLGTYITRIRDASNGGMHFTESQQAVFILMKLPPSYSTLSTSLTSSHPLKDWTIEWIQGKVLAEESLRSSTSQSVTRISKTKPKPSGPCDFCGSGTHHESTCWKKHPDQRPKRGGKGKGKGKEKDKGKGKDNSNNHAHTAAPAVNVLVAESSSNMHASFYSAAHAAGVRHTHWLMDSGASQHITFDINDFAEYKAYDTPIVFRTAASGEGSSVKALGEGLVRDETFIDGVKWSIDLPKVCYIPMVSSRLFSTGSIEKNGYSIFQGGQKMSIFDKLPSGAVTHGSTIKSRVERFSKGCSILSTISMTSF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.19
3	0.19
4	0.19
5	0.2
6	0.18
7	0.18
8	0.2
9	0.19
10	0.18
11	0.19
12	0.21
13	0.22
14	0.19
15	0.19
16	0.18
17	0.18
18	0.18
19	0.2
20	0.16
21	0.13
22	0.13
23	0.13
24	0.14
25	0.17
26	0.18
27	0.18
28	0.19
29	0.21
30	0.21
31	0.24
32	0.21
33	0.19
34	0.18
35	0.25
36	0.34
37	0.38
38	0.4
39	0.44
40	0.48
41	0.54
42	0.6
43	0.59
44	0.57
45	0.58
46	0.58
47	0.59
48	0.61
49	0.54
50	0.47
51	0.41
52	0.34
53	0.3
54	0.29
55	0.24
56	0.24
57	0.24
58	0.24
59	0.24
60	0.24
61	0.22
62	0.25
63	0.24
64	0.18
65	0.18
66	0.17
67	0.15
68	0.16
69	0.21
70	0.21
71	0.21
72	0.21
73	0.22
74	0.22
75	0.25
76	0.25
77	0.25
78	0.27
79	0.3
80	0.34
81	0.33
82	0.33
83	0.3
84	0.29
85	0.28
86	0.29
87	0.27
88	0.23
89	0.27
90	0.28
91	0.3
92	0.31
93	0.28
94	0.25
95	0.23
96	0.24
97	0.21
98	0.2
99	0.18
100	0.15
101	0.14
102	0.09
103	0.08
104	0.05
105	0.03
106	0.04
107	0.04
108	0.04
109	0.08
110	0.08
111	0.08
112	0.1
113	0.13
114	0.16
115	0.24
116	0.26
117	0.27
118	0.31
119	0.33
120	0.33
121	0.32
122	0.29
123	0.24
124	0.29
125	0.25
126	0.22
127	0.25
128	0.23
129	0.24
130	0.24
131	0.21
132	0.17
133	0.18
134	0.19
135	0.19
136	0.19
137	0.18
138	0.17
139	0.17
140	0.16
141	0.14
142	0.15
143	0.11
144	0.1
145	0.09
146	0.09
147	0.1
148	0.09
149	0.09
150	0.07
151	0.07
152	0.08
153	0.08
154	0.09
155	0.09
156	0.11
157	0.13
158	0.13
159	0.16
160	0.16
161	0.18
162	0.18
163	0.18
164	0.17
165	0.15
166	0.18
167	0.16
168	0.16
169	0.15
170	0.16
171	0.16
172	0.16
173	0.16
174	0.16
175	0.16
176	0.18
177	0.18
178	0.17
179	0.17
180	0.17
181	0.17
182	0.12
183	0.11
184	0.09
185	0.08
186	0.08
187	0.1
188	0.09
189	0.09
190	0.09
191	0.09
192	0.11
193	0.13
194	0.15
195	0.15
196	0.18
197	0.2
198	0.22
199	0.26
200	0.26
201	0.33
202	0.37
203	0.44
204	0.47
205	0.53
206	0.57
207	0.59
208	0.67
209	0.6
210	0.57
211	0.51
212	0.45
213	0.38
214	0.33
215	0.3
216	0.24
217	0.23
218	0.21
219	0.18
220	0.18
221	0.21
222	0.25
223	0.28
224	0.3
225	0.3
226	0.36
227	0.45
228	0.55
229	0.62
230	0.67
231	0.72
232	0.78
233	0.81
234	0.83
235	0.83
236	0.82
237	0.8
238	0.79
239	0.77
240	0.75
241	0.77
242	0.74
243	0.72
244	0.71
245	0.67
246	0.66
247	0.67
248	0.66
249	0.64
250	0.66
251	0.66
252	0.67
253	0.67
254	0.65
255	0.62
256	0.57
257	0.51
258	0.43
259	0.37
260	0.28
261	0.25
262	0.18
263	0.12
264	0.1
265	0.09
266	0.08
267	0.08
268	0.08
269	0.05
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.05
274	0.05
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.06
279	0.07
280	0.08
281	0.08
282	0.09
283	0.09
284	0.08
285	0.09
286	0.09
287	0.08
288	0.09
289	0.1
290	0.1
291	0.12
292	0.12
293	0.12
294	0.12
295	0.14
296	0.12
297	0.12
298	0.12
299	0.11
300	0.13
301	0.13
302	0.13
303	0.11
304	0.11
305	0.11
306	0.1
307	0.09
308	0.09
309	0.09
310	0.1
311	0.1
312	0.1
313	0.1
314	0.1
315	0.11
316	0.11
317	0.11
318	0.12
319	0.11
320	0.14
321	0.15
322	0.18
323	0.17
324	0.15
325	0.16
326	0.16
327	0.17
328	0.14
329	0.13
330	0.1
331	0.12
332	0.13
333	0.11
334	0.1
335	0.09
336	0.08
337	0.08
338	0.08
339	0.07
340	0.07
341	0.1
342	0.11
343	0.11
344	0.11
345	0.12
346	0.11
347	0.1
348	0.1
349	0.09
350	0.07
351	0.08
352	0.08
353	0.08
354	0.08
355	0.11
356	0.15
357	0.16
358	0.2
359	0.26
360	0.26
361	0.26
362	0.27
363	0.24
364	0.24
365	0.28
366	0.29
367	0.23
368	0.24
369	0.25
370	0.26
371	0.26
372	0.21
373	0.2
374	0.21
375	0.23
376	0.25
377	0.25
378	0.23
379	0.24
380	0.24
381	0.2
382	0.16
383	0.15
384	0.13
385	0.17
386	0.2
387	0.19
388	0.22
389	0.22
390	0.23
391	0.22
392	0.26
393	0.22
394	0.2
395	0.23
396	0.21
397	0.21
398	0.2
399	0.2
400	0.16
401	0.18
402	0.18
403	0.18
404	0.2
405	0.2
406	0.21
407	0.23
408	0.29
409	0.32
410	0.35
411	0.4
412	0.43
413	0.5
414	0.52
415	0.58
416	0.58
417	0.55
418	0.53
419	0.47
420	0.45
421	0.39
422	0.37
423	0.31

A0A060SQL1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer