FuNGI

A0A060SPD4

Protein Details

Accession

A0A060SPD4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
136-171	SASDQNNSKRKSKKNVECYNCKKHRHYKSECWAPGG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
177-184	GPKGKAKA

Subcellular Location(s)

mito 13, cyto 10.5, cyto_nucl 7, nucl 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2 PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MKIRTQPTTRAIWNALAQEFERKSRMVSVDLRRRLQEQRCSERDDVRVHFAKLRTMREDLAAMGQSPSDDDFFAIIMGSMPSSYEPYLSAISATSRVTGSVLSPDELMEALTEEYERRTLRMKSAKRNDPADVAMSASDQNNSKRKSKKNVECYNCKKHRHYKSECWAPGGGKEGEGPKGKAKAKETAAAATEKKDEAWYTSGADEDGAPAMLAQDPVPADEVIVFDSGATRHMSCYRERFIRYEEISPRLIQAADNHTFKAVGKGDMYVHLPNGTENTTRVLLQDVLHAPSMGVTLISIARVTAAGASVVFKNSECCILRSDGTCIAIIPLINGLYRLHISHSETAAAAVDSAKGITRAVTRTELHRELGHIAPEAAREMVTKGHVEGLVLSELDGPVADCESCAAGKMTRKPIAAERVRPRATEVGGEVHADVWGPSPVETLGRRRYYILYTDDYSRYCSLYLMRTKDEAIETYRKVRAFYSTQKGARICCLHSDRGGEFLSTEFSKLLAEDGTIRKFTAHDTPEYNGVAERGNRTVMERVRAMLHDARLPQMLWGEAALHAVYLKNRTATRSLEGRTPYEAFWGKKPNLAHLHVWGCRVWVHSPGGSKLSPRADDARWVGFDTESDAHRIYWPKRRSVTVERSIFFPETDSDVEVRLEGENEGVSTHLDERVTSPSLSNSSVRPIPPEISDPPTPIVEERAPEPVGRATSQGEVRQSTRVRKESAYVRRLKAGEGTVSGRTGGPVLPRGLQEGTARIEEVNEDEQVEIVAMVQETEEDVVELAMAAAMGDAECVEPSYAEAKKRPDWPKWQEAIKAELDSLVANGTWRIVPRPSSGNVVDSKWVLRVKKNAAGEIDKYKARLVARGFTQVYGVDYYDTFAPVAKLSSIRLLLAIAARNGWAADSFDFNSAYLNSKLDEDVYLEQPPDHAFADRKAFVLKLEKALYGLKQGGRKWYETLCAALGRLGFTRVEADWGVFYKHEGEHLIVLAVHVDDCLLTGSSRRLLDDTKSKIGTVYKITDLGPVSWLLGIKISCDLEAGTLSLSQHAYIEALLARFNFTDLKPVSMPMDPHQLLSKTQCPESPAEVARMRRVPYREAIGALMYAALGTRPDIAFAVSTLAQFAQNPGQPHWDAVKRIFRYLLGTRTLSLIYGGQQRELEGYVNADGATQEHRRAITGYVFLVDGGAVSWASKKQELVTLSTAESEYVAATHAAKEAIWLRRLIGEVFGPLSNATMLYSDNQAAIALTKDGSYHARTKHIDVRYHFIRYYIDAGSIRLLYCPSNDMTADVLTKALPSFKVKHFAAALGLAQA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.38
3	0.34
4	0.31
5	0.34
6	0.34
7	0.33
8	0.32
9	0.28
10	0.29
11	0.33
12	0.35
13	0.33
14	0.39
15	0.46
16	0.54
17	0.61
18	0.64
19	0.6
20	0.62
21	0.65
22	0.65
23	0.64
24	0.64
25	0.67
26	0.67
27	0.72
28	0.71
29	0.69
30	0.66
31	0.63
32	0.57
33	0.56
34	0.55
35	0.51
36	0.52
37	0.47
38	0.5
39	0.49
40	0.51
41	0.47
42	0.46
43	0.45
44	0.41
45	0.41
46	0.33
47	0.31
48	0.25
49	0.21
50	0.18
51	0.16
52	0.14
53	0.14
54	0.14
55	0.11
56	0.1
57	0.1
58	0.1
59	0.09
60	0.09
61	0.08
62	0.07
63	0.06
64	0.06
65	0.06
66	0.05
67	0.06
68	0.07
69	0.1
70	0.1
71	0.1
72	0.1
73	0.13
74	0.14
75	0.14
76	0.13
77	0.11
78	0.13
79	0.15
80	0.14
81	0.13
82	0.12
83	0.12
84	0.12
85	0.12
86	0.12
87	0.15
88	0.16
89	0.15
90	0.16
91	0.15
92	0.15
93	0.15
94	0.14
95	0.08
96	0.07
97	0.07
98	0.07
99	0.07
100	0.07
101	0.09
102	0.14
103	0.14
104	0.15
105	0.21
106	0.24
107	0.33
108	0.43
109	0.5
110	0.57
111	0.67
112	0.74
113	0.76
114	0.77
115	0.71
116	0.65
117	0.58
118	0.5
119	0.4
120	0.31
121	0.24
122	0.2
123	0.19
124	0.15
125	0.16
126	0.17
127	0.23
128	0.31
129	0.35
130	0.42
131	0.5
132	0.58
133	0.66
134	0.74
135	0.77
136	0.8
137	0.87
138	0.88
139	0.9
140	0.9
141	0.9
142	0.88
143	0.86
144	0.85
145	0.84
146	0.86
147	0.85
148	0.85
149	0.85
150	0.87
151	0.89
152	0.82
153	0.75
154	0.67
155	0.58
156	0.51
157	0.45
158	0.35
159	0.24
160	0.26
161	0.24
162	0.27
163	0.3
164	0.3
165	0.29
166	0.37
167	0.41
168	0.44
169	0.46
170	0.48
171	0.48
172	0.52
173	0.48
174	0.44
175	0.41
176	0.4
177	0.37
178	0.31
179	0.3
180	0.25
181	0.23
182	0.22
183	0.2
184	0.19
185	0.2
186	0.19
187	0.18
188	0.18
189	0.18
190	0.16
191	0.15
192	0.12
193	0.1
194	0.09
195	0.07
196	0.06
197	0.05
198	0.06
199	0.07
200	0.07
201	0.06
202	0.08
203	0.08
204	0.09
205	0.11
206	0.1
207	0.09
208	0.09
209	0.1
210	0.09
211	0.09
212	0.08
213	0.06
214	0.08
215	0.08
216	0.09
217	0.1
218	0.09
219	0.12
220	0.17
221	0.19
222	0.23
223	0.3
224	0.35
225	0.4
226	0.42
227	0.43
228	0.43
229	0.5
230	0.48
231	0.49
232	0.47
233	0.44
234	0.44
235	0.41
236	0.37
237	0.29
238	0.26
239	0.2
240	0.2
241	0.23
242	0.27
243	0.27
244	0.27
245	0.26
246	0.26
247	0.25
248	0.27
249	0.22
250	0.18
251	0.17
252	0.19
253	0.2
254	0.21
255	0.24
256	0.18
257	0.16
258	0.15
259	0.15
260	0.14
261	0.15
262	0.15
263	0.13
264	0.13
265	0.16
266	0.16
267	0.16
268	0.16
269	0.16
270	0.15
271	0.14
272	0.2
273	0.18
274	0.19
275	0.19
276	0.18
277	0.16
278	0.14
279	0.14
280	0.08
281	0.06
282	0.04
283	0.05
284	0.05
285	0.06
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.04
292	0.04
293	0.04
294	0.05
295	0.06
296	0.07
297	0.08
298	0.08
299	0.08
300	0.1
301	0.1
302	0.17
303	0.17
304	0.17
305	0.2
306	0.22
307	0.24
308	0.23
309	0.26
310	0.22
311	0.22
312	0.2
313	0.18
314	0.15
315	0.14
316	0.12
317	0.09
318	0.08
319	0.07
320	0.07
321	0.08
322	0.07
323	0.08
324	0.09
325	0.09
326	0.1
327	0.13
328	0.16
329	0.19
330	0.2
331	0.19
332	0.18
333	0.18
334	0.16
335	0.13
336	0.1
337	0.07
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.07
345	0.1
346	0.11
347	0.14
348	0.18
349	0.19
350	0.24
351	0.31
352	0.31
353	0.3
354	0.29
355	0.28
356	0.27
357	0.28
358	0.25
359	0.18
360	0.16
361	0.15
362	0.15
363	0.14
364	0.1
365	0.09
366	0.08
367	0.08
368	0.09
369	0.1
370	0.1
371	0.09
372	0.11
373	0.11
374	0.11
375	0.1
376	0.1
377	0.1
378	0.09
379	0.09
380	0.07
381	0.07
382	0.07
383	0.06
384	0.05
385	0.04
386	0.05
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.05
391	0.05
392	0.06
393	0.07
394	0.09
395	0.14
396	0.21
397	0.28
398	0.32
399	0.33
400	0.34
401	0.39
402	0.46
403	0.47
404	0.5
405	0.5
406	0.56
407	0.56
408	0.54
409	0.52
410	0.45
411	0.4
412	0.32
413	0.26
414	0.19
415	0.19
416	0.19
417	0.15
418	0.12
419	0.11
420	0.09
421	0.08
422	0.06
423	0.06
424	0.06
425	0.06
426	0.06
427	0.07
428	0.1
429	0.12
430	0.17
431	0.24
432	0.26
433	0.27
434	0.28
435	0.3
436	0.29
437	0.32
438	0.3
439	0.26
440	0.25
441	0.28
442	0.28
443	0.27
444	0.28
445	0.24
446	0.2
447	0.17
448	0.16
449	0.14
450	0.19
451	0.25
452	0.25
453	0.26
454	0.26
455	0.26
456	0.27
457	0.26
458	0.21
459	0.2
460	0.22
461	0.22
462	0.25
463	0.28
464	0.27
465	0.27
466	0.26
467	0.26
468	0.27
469	0.33
470	0.37
471	0.4
472	0.42
473	0.45
474	0.46
475	0.41
476	0.41
477	0.36
478	0.29
479	0.29
480	0.31
481	0.28
482	0.29
483	0.31
484	0.25
485	0.26
486	0.26
487	0.18
488	0.15
489	0.13
490	0.14
491	0.11
492	0.11
493	0.08
494	0.07
495	0.07
496	0.07
497	0.08
498	0.05
499	0.05
500	0.09
501	0.12
502	0.13
503	0.13
504	0.14
505	0.13
506	0.13
507	0.15
508	0.19
509	0.18
510	0.19
511	0.21
512	0.22
513	0.25
514	0.25
515	0.23
516	0.15
517	0.14
518	0.13
519	0.12
520	0.13
521	0.11
522	0.12
523	0.12
524	0.13
525	0.18
526	0.18
527	0.2
528	0.18
529	0.18
530	0.19
531	0.19
532	0.21
533	0.18
534	0.17
535	0.17
536	0.17
537	0.17
538	0.17
539	0.17
540	0.14
541	0.11
542	0.1
543	0.07
544	0.07
545	0.06
546	0.06
547	0.06
548	0.05
549	0.04
550	0.04
551	0.05
552	0.06
553	0.08
554	0.08
555	0.11
556	0.12
557	0.14
558	0.17
559	0.18
560	0.21
561	0.24
562	0.25
563	0.26
564	0.27
565	0.27
566	0.26
567	0.26
568	0.22
569	0.22
570	0.24
571	0.21
572	0.23
573	0.29
574	0.27
575	0.29
576	0.29
577	0.32
578	0.33
579	0.35
580	0.32
581	0.3
582	0.34
583	0.32
584	0.33
585	0.26
586	0.21
587	0.19
588	0.19
589	0.15
590	0.14
591	0.14
592	0.15
593	0.16
594	0.17
595	0.19
596	0.17
597	0.17
598	0.18
599	0.19
600	0.18
601	0.19
602	0.21
603	0.19
604	0.23
605	0.24
606	0.22
607	0.19
608	0.19
609	0.17
610	0.13
611	0.13
612	0.12
613	0.11
614	0.1
615	0.11
616	0.11
617	0.11
618	0.13
619	0.19
620	0.2
621	0.27
622	0.3
623	0.34
624	0.36
625	0.39
626	0.43
627	0.47
628	0.52
629	0.51
630	0.53
631	0.48
632	0.47
633	0.47
634	0.4
635	0.31
636	0.23
637	0.15
638	0.12
639	0.12
640	0.11
641	0.1
642	0.1
643	0.1
644	0.09
645	0.08
646	0.06
647	0.06
648	0.05
649	0.05
650	0.04
651	0.04
652	0.04
653	0.04
654	0.04
655	0.04
656	0.05
657	0.06
658	0.06
659	0.06
660	0.08
661	0.11
662	0.12
663	0.11
664	0.11
665	0.11
666	0.13
667	0.14
668	0.14
669	0.11
670	0.13
671	0.15
672	0.15
673	0.16
674	0.16
675	0.16
676	0.16
677	0.19
678	0.18
679	0.21
680	0.21
681	0.2
682	0.2
683	0.19
684	0.18
685	0.15
686	0.15
687	0.11
688	0.11
689	0.11
690	0.13
691	0.14
692	0.13
693	0.14
694	0.13
695	0.13
696	0.13
697	0.13
698	0.11
699	0.13
700	0.15
701	0.16
702	0.16
703	0.16
704	0.17
705	0.22
706	0.24
707	0.28
708	0.33
709	0.34
710	0.35
711	0.34
712	0.38
713	0.41
714	0.47
715	0.49
716	0.49
717	0.46
718	0.49
719	0.48
720	0.44
721	0.38
722	0.3
723	0.22
724	0.18
725	0.19
726	0.15
727	0.15
728	0.15
729	0.11
730	0.1
731	0.09
732	0.09
733	0.08
734	0.1
735	0.11
736	0.12
737	0.12
738	0.14
739	0.14
740	0.14
741	0.14
742	0.14
743	0.14
744	0.13
745	0.13
746	0.11
747	0.1
748	0.09
749	0.11
750	0.09
751	0.08
752	0.08
753	0.08
754	0.08
755	0.07
756	0.07
757	0.05
758	0.03
759	0.04
760	0.03
761	0.03
762	0.03
763	0.03
764	0.03
765	0.03
766	0.03
767	0.03
768	0.03
769	0.03
770	0.03
771	0.03
772	0.03
773	0.02
774	0.02
775	0.02
776	0.02
777	0.02
778	0.02
779	0.02
780	0.02
781	0.02
782	0.02
783	0.03
784	0.03
785	0.03
786	0.04
787	0.08
788	0.1
789	0.13
790	0.17
791	0.21
792	0.26
793	0.35
794	0.41
795	0.44
796	0.53
797	0.58
798	0.64
799	0.64
800	0.63
801	0.58
802	0.54
803	0.51
804	0.42
805	0.35
806	0.26
807	0.21
808	0.17
809	0.13
810	0.11
811	0.07
812	0.05
813	0.04
814	0.04
815	0.05
816	0.06
817	0.06
818	0.08
819	0.09
820	0.12
821	0.14
822	0.18
823	0.19
824	0.23
825	0.23
826	0.25
827	0.25
828	0.24
829	0.22
830	0.19
831	0.18
832	0.18
833	0.21
834	0.19
835	0.22
836	0.28
837	0.31
838	0.36
839	0.37
840	0.36
841	0.36
842	0.36
843	0.35
844	0.33
845	0.32
846	0.26
847	0.26
848	0.23
849	0.24
850	0.21
851	0.23
852	0.21
853	0.22
854	0.24
855	0.29
856	0.29
857	0.26
858	0.26
859	0.21
860	0.2
861	0.16
862	0.14
863	0.09
864	0.08
865	0.09
866	0.08
867	0.09
868	0.07
869	0.07
870	0.07
871	0.07
872	0.07
873	0.07
874	0.08
875	0.08
876	0.11
877	0.11
878	0.1
879	0.1
880	0.1
881	0.1
882	0.11
883	0.12
884	0.09
885	0.09
886	0.09
887	0.08
888	0.08
889	0.07
890	0.06
891	0.06
892	0.07
893	0.09
894	0.1
895	0.11
896	0.11
897	0.11
898	0.12
899	0.11
900	0.14
901	0.12
902	0.12
903	0.11
904	0.12
905	0.12
906	0.12
907	0.11
908	0.11
909	0.12
910	0.14
911	0.14
912	0.13
913	0.13
914	0.13
915	0.14
916	0.13
917	0.11
918	0.11
919	0.12
920	0.15
921	0.21
922	0.21
923	0.21
924	0.2
925	0.19
926	0.19
927	0.26
928	0.24
929	0.23
930	0.24
931	0.24
932	0.24
933	0.26
934	0.24
935	0.2
936	0.22
937	0.21
938	0.24
939	0.25
940	0.32
941	0.33
942	0.34
943	0.34
944	0.32
945	0.32
946	0.28
947	0.28
948	0.21
949	0.19
950	0.18
951	0.16
952	0.14
953	0.12
954	0.11
955	0.11
956	0.1
957	0.09
958	0.11
959	0.1
960	0.12
961	0.11
962	0.11
963	0.11
964	0.12
965	0.12
966	0.1
967	0.11
968	0.11
969	0.11
970	0.12
971	0.12
972	0.12
973	0.12
974	0.13
975	0.12
976	0.1
977	0.09
978	0.08
979	0.07
980	0.06
981	0.05
982	0.04
983	0.03
984	0.04
985	0.05
986	0.05
987	0.05
988	0.07
989	0.09
990	0.13
991	0.14
992	0.14
993	0.15
994	0.17
995	0.23
996	0.3
997	0.34
998	0.35
999	0.36
1000	0.35
1001	0.35
1002	0.36
1003	0.34
1004	0.31
1005	0.28
1006	0.24
1007	0.25
1008	0.25
1009	0.26
1010	0.25
1011	0.22
1012	0.18
1013	0.15
1014	0.13
1015	0.13
1016	0.12
1017	0.09
1018	0.11
1019	0.1
1020	0.1
1021	0.12
1022	0.12
1023	0.11
1024	0.11
1025	0.11
1026	0.09
1027	0.09
1028	0.09
1029	0.07
1030	0.07
1031	0.08
1032	0.09
1033	0.09
1034	0.09
1035	0.09
1036	0.08
1037	0.08
1038	0.07
1039	0.08
1040	0.08
1041	0.08
1042	0.09
1043	0.08
1044	0.09
1045	0.09
1046	0.1
1047	0.12
1048	0.11
1049	0.19
1050	0.19
1051	0.23
1052	0.22
1053	0.23
1054	0.25
1055	0.24
1056	0.26
1057	0.21
1058	0.3
1059	0.26
1060	0.27
1061	0.3
1062	0.29
1063	0.29
1064	0.32
1065	0.36
1066	0.29
1067	0.3
1068	0.31
1069	0.3
1070	0.32
1071	0.33
1072	0.34
1073	0.29
1074	0.32
1075	0.35
1076	0.36
1077	0.39
1078	0.4
1079	0.39
1080	0.39
1081	0.41
1082	0.39
1083	0.39
1084	0.42
1085	0.37
1086	0.34
1087	0.33
1088	0.27
1089	0.24
1090	0.19
1091	0.14
1092	0.08
1093	0.06
1094	0.05
1095	0.04
1096	0.04
1097	0.04
1098	0.07
1099	0.07
1100	0.08
1101	0.08
1102	0.09
1103	0.09
1104	0.09
1105	0.12
1106	0.1
1107	0.1
1108	0.1
1109	0.1
1110	0.1
1111	0.1
1112	0.13
1113	0.15
1114	0.18
1115	0.21
1116	0.21
1117	0.26
1118	0.26
1119	0.29
1120	0.33
1121	0.32
1122	0.33
1123	0.37
1124	0.45
1125	0.41
1126	0.44
1127	0.42
1128	0.37
1129	0.38
1130	0.4
1131	0.39
1132	0.34
1133	0.33
1134	0.31
1135	0.32
1136	0.31
1137	0.24
1138	0.2
1139	0.15
1140	0.15
1141	0.21
1142	0.21
1143	0.21
1144	0.21
1145	0.21
1146	0.22
1147	0.22
1148	0.19
1149	0.12
1150	0.13
1151	0.12
1152	0.12
1153	0.12
1154	0.1
1155	0.09
1156	0.09
1157	0.14
1158	0.14
1159	0.16
1160	0.18
1161	0.19
1162	0.2
1163	0.21
1164	0.23
1165	0.22
1166	0.21
1167	0.2
1168	0.18
1169	0.18
1170	0.16
1171	0.15
1172	0.12
1173	0.08
1174	0.05
1175	0.05
1176	0.04
1177	0.05
1178	0.07
1179	0.1
1180	0.13
1181	0.15
1182	0.16
1183	0.17
1184	0.23
1185	0.25
1186	0.28
1187	0.29
1188	0.28
1189	0.27
1190	0.27
1191	0.25
1192	0.2
1193	0.18
1194	0.13
1195	0.09
1196	0.07
1197	0.08
1198	0.07
1199	0.08
1200	0.09
1201	0.1
1202	0.1
1203	0.09
1204	0.13
1205	0.19
1206	0.24
1207	0.26
1208	0.26
1209	0.25
1210	0.28
1211	0.3
1212	0.27
1213	0.22
1214	0.18
1215	0.17
1216	0.19
1217	0.18
1218	0.15
1219	0.13
1220	0.14
1221	0.11
1222	0.1
1223	0.09
1224	0.07
1225	0.08
1226	0.1
1227	0.12
1228	0.12
1229	0.12
1230	0.12
1231	0.12
1232	0.11
1233	0.11
1234	0.11
1235	0.09
1236	0.09
1237	0.09
1238	0.09
1239	0.11
1240	0.15
1241	0.19
1242	0.24
1243	0.27
1244	0.35
1245	0.38
1246	0.44
1247	0.5
1248	0.54
1249	0.57
1250	0.54
1251	0.6
1252	0.57
1253	0.59
1254	0.53
1255	0.46
1256	0.41
1257	0.37
1258	0.36
1259	0.29
1260	0.28
1261	0.23
1262	0.24
1263	0.25
1264	0.24
1265	0.21
1266	0.18
1267	0.18
1268	0.15
1269	0.15
1270	0.18
1271	0.16
1272	0.18
1273	0.18
1274	0.18
1275	0.18
1276	0.19
1277	0.19
1278	0.16
1279	0.15
1280	0.12
1281	0.13
1282	0.13
1283	0.14
1284	0.15
1285	0.2
1286	0.26
1287	0.31
1288	0.4
1289	0.39
1290	0.44
1291	0.43
1292	0.41
1293	0.37
1294	0.33

A0A060SPD4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer