FuNGI

C4JMF6

Protein Details

Accession

C4JMF6

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
155-182	KTAFSRAKYTLRKRKKFLKRFTPLPLDV	Hydrophilic
388-415	LNEWKPSKRGGYHRKRRRWTRVQTVVEE	Hydrophilic
561-580	KKVEARGIPGRKKRKVATES	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
166-171	RKRKKF
393-405	PSKRGGYHRKRRR
560-575	GKKVEARGIPGRKKRK

Subcellular Location(s)

cyto 13, nucl 6, mito 6, mito_nucl 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017423 TRM6
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0031515 C:tRNA (m1A) methyltransferase complex GO:0030488 P:tRNA methylation
KEGG	ure:UREG_04014 -
Pfam	View protein in Pfam PF04189 Gcd10p

Amino Acid Sequences

MDSRIAPDAYIALQLPSGTTKVLQILPNSNVSLGKYGSFPANQILGRPFYLTFEILDEADANGHILRVVPAAELHTEALMTECSGPGELDDGLETGDANGEDESTDARDNRNIVDDNSAQRMTMEEIENLKQGTTGAGKEIIAKLLQSHSALDQKTAFSRAKYTLRKRKKFLKRFTPLPLDVSLLTNWMLDKDGGRTMEIRDELLGLIGCYGNVHHAGEEILDPTAAQPGGRWLIVDDTGGLVVAAMAERMGILYPSSTDSDRGLDELVAEKIEPGDAPIETGATPMANIDDKPLENSDDLNPSTPHQLHHPYRAAPMSAKSTSITVIHPNFQPNLTLLKYFSYDLNDPPESHPLHTHLKTLSWIQLVDPDSDSTYANEPEVVPESVLNEWKPSKRGGYHRKRRRWTRVQTVVEETRAGGFDGLIVATLMDPASVLKHAVPLLAGSAPVVVYSPHIEPLVKLVDLYSTMRRAAYLNQKHAAQEGQRKGRSEQSETADEAKEINYDDDDFPVDPSLLLAPSIQTSRVRPWQVLPGRTHPLMTGRGGAEGYVFHAIRVIPAGKKVEARGIPGRKKRKVATESSEQTPKESEDVDMQD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.11
3	0.12
4	0.12
5	0.11
6	0.11
7	0.12
8	0.16
9	0.21
10	0.23
11	0.25
12	0.31
13	0.33
14	0.36
15	0.35
16	0.32
17	0.29
18	0.27
19	0.26
20	0.2
21	0.18
22	0.16
23	0.17
24	0.2
25	0.19
26	0.19
27	0.19
28	0.23
29	0.22
30	0.24
31	0.26
32	0.25
33	0.25
34	0.26
35	0.23
36	0.21
37	0.23
38	0.2
39	0.17
40	0.16
41	0.17
42	0.15
43	0.15
44	0.13
45	0.11
46	0.1
47	0.1
48	0.08
49	0.07
50	0.07
51	0.06
52	0.07
53	0.07
54	0.07
55	0.08
56	0.08
57	0.08
58	0.1
59	0.11
60	0.11
61	0.11
62	0.1
63	0.09
64	0.09
65	0.09
66	0.08
67	0.08
68	0.07
69	0.07
70	0.08
71	0.08
72	0.08
73	0.07
74	0.09
75	0.08
76	0.07
77	0.07
78	0.07
79	0.07
80	0.07
81	0.07
82	0.05
83	0.06
84	0.06
85	0.06
86	0.06
87	0.06
88	0.06
89	0.06
90	0.07
91	0.08
92	0.1
93	0.1
94	0.12
95	0.15
96	0.16
97	0.17
98	0.22
99	0.22
100	0.2
101	0.25
102	0.27
103	0.27
104	0.31
105	0.3
106	0.24
107	0.22
108	0.23
109	0.19
110	0.2
111	0.18
112	0.16
113	0.19
114	0.21
115	0.22
116	0.21
117	0.19
118	0.15
119	0.13
120	0.13
121	0.12
122	0.11
123	0.11
124	0.12
125	0.12
126	0.15
127	0.15
128	0.14
129	0.12
130	0.12
131	0.12
132	0.13
133	0.14
134	0.12
135	0.12
136	0.14
137	0.19
138	0.19
139	0.2
140	0.19
141	0.19
142	0.2
143	0.24
144	0.23
145	0.18
146	0.22
147	0.26
148	0.34
149	0.42
150	0.51
151	0.58
152	0.67
153	0.75
154	0.79
155	0.84
156	0.86
157	0.87
158	0.86
159	0.87
160	0.84
161	0.82
162	0.83
163	0.8
164	0.71
165	0.63
166	0.53
167	0.44
168	0.36
169	0.31
170	0.22
171	0.15
172	0.13
173	0.11
174	0.1
175	0.08
176	0.08
177	0.07
178	0.08
179	0.09
180	0.12
181	0.12
182	0.13
183	0.13
184	0.13
185	0.17
186	0.17
187	0.15
188	0.12
189	0.12
190	0.12
191	0.11
192	0.1
193	0.05
194	0.06
195	0.05
196	0.05
197	0.04
198	0.04
199	0.05
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.06
204	0.06
205	0.07
206	0.07
207	0.06
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.07
213	0.06
214	0.06
215	0.05
216	0.08
217	0.09
218	0.09
219	0.09
220	0.08
221	0.09
222	0.1
223	0.1
224	0.07
225	0.06
226	0.06
227	0.05
228	0.05
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.02
233	0.02
234	0.02
235	0.02
236	0.02
237	0.02
238	0.02
239	0.02
240	0.03
241	0.03
242	0.04
243	0.05
244	0.07
245	0.07
246	0.08
247	0.09
248	0.1
249	0.1
250	0.1
251	0.09
252	0.07
253	0.07
254	0.08
255	0.08
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.04
263	0.05
264	0.04
265	0.05
266	0.05
267	0.05
268	0.05
269	0.05
270	0.05
271	0.04
272	0.04
273	0.03
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.06
278	0.07
279	0.07
280	0.08
281	0.09
282	0.1
283	0.09
284	0.11
285	0.11
286	0.13
287	0.13
288	0.14
289	0.13
290	0.13
291	0.17
292	0.16
293	0.15
294	0.16
295	0.24
296	0.25
297	0.31
298	0.33
299	0.3
300	0.32
301	0.32
302	0.29
303	0.22
304	0.21
305	0.19
306	0.17
307	0.17
308	0.15
309	0.14
310	0.14
311	0.14
312	0.13
313	0.14
314	0.15
315	0.17
316	0.18
317	0.2
318	0.19
319	0.18
320	0.18
321	0.13
322	0.16
323	0.14
324	0.13
325	0.12
326	0.12
327	0.13
328	0.13
329	0.13
330	0.13
331	0.14
332	0.14
333	0.19
334	0.19
335	0.19
336	0.2
337	0.25
338	0.22
339	0.22
340	0.22
341	0.21
342	0.27
343	0.27
344	0.28
345	0.23
346	0.23
347	0.23
348	0.24
349	0.22
350	0.16
351	0.15
352	0.13
353	0.18
354	0.18
355	0.18
356	0.17
357	0.14
358	0.14
359	0.15
360	0.15
361	0.11
362	0.12
363	0.11
364	0.1
365	0.1
366	0.1
367	0.1
368	0.13
369	0.12
370	0.09
371	0.09
372	0.1
373	0.11
374	0.13
375	0.11
376	0.12
377	0.15
378	0.17
379	0.19
380	0.2
381	0.23
382	0.28
383	0.39
384	0.47
385	0.55
386	0.64
387	0.73
388	0.81
389	0.87
390	0.91
391	0.91
392	0.91
393	0.89
394	0.89
395	0.89
396	0.84
397	0.78
398	0.74
399	0.66
400	0.56
401	0.46
402	0.35
403	0.26
404	0.21
405	0.17
406	0.1
407	0.07
408	0.06
409	0.06
410	0.05
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.03
415	0.04
416	0.04
417	0.03
418	0.03
419	0.03
420	0.04
421	0.05
422	0.06
423	0.06
424	0.08
425	0.08
426	0.08
427	0.08
428	0.08
429	0.09
430	0.08
431	0.08
432	0.06
433	0.06
434	0.05
435	0.05
436	0.05
437	0.04
438	0.05
439	0.08
440	0.09
441	0.1
442	0.11
443	0.11
444	0.11
445	0.15
446	0.16
447	0.14
448	0.13
449	0.11
450	0.12
451	0.13
452	0.16
453	0.16
454	0.15
455	0.16
456	0.16
457	0.17
458	0.17
459	0.23
460	0.31
461	0.35
462	0.4
463	0.43
464	0.44
465	0.44
466	0.44
467	0.41
468	0.37
469	0.38
470	0.41
471	0.47
472	0.5
473	0.52
474	0.53
475	0.57
476	0.55
477	0.52
478	0.5
479	0.46
480	0.46
481	0.45
482	0.46
483	0.39
484	0.33
485	0.28
486	0.21
487	0.17
488	0.15
489	0.14
490	0.11
491	0.14
492	0.14
493	0.14
494	0.16
495	0.15
496	0.14
497	0.14
498	0.13
499	0.1
500	0.1
501	0.1
502	0.09
503	0.09
504	0.08
505	0.08
506	0.1
507	0.11
508	0.13
509	0.15
510	0.18
511	0.25
512	0.33
513	0.36
514	0.35
515	0.38
516	0.45
517	0.5
518	0.54
519	0.52
520	0.51
521	0.54
522	0.53
523	0.5
524	0.42
525	0.39
526	0.36
527	0.32
528	0.29
529	0.23
530	0.24
531	0.23
532	0.21
533	0.17
534	0.13
535	0.14
536	0.15
537	0.14
538	0.13
539	0.15
540	0.15
541	0.15
542	0.19
543	0.2
544	0.17
545	0.22
546	0.26
547	0.27
548	0.3
549	0.32
550	0.36
551	0.35
552	0.39
553	0.44
554	0.51
555	0.58
556	0.65
557	0.73
558	0.72
559	0.79
560	0.8
561	0.8
562	0.79
563	0.78
564	0.76
565	0.76
566	0.74
567	0.72
568	0.73
569	0.62
570	0.56
571	0.49
572	0.43
573	0.35
574	0.31
575	0.26

C4JMF6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer