Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JM08

Protein Details
Accession C4JM08    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
86-105GTGVGKGRKRKAKKDRDDASBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
90-101GKGRKRKAKKDR
Subcellular Location(s) mito 17.5, cyto_mito 11.833, cyto 5, cyto_nucl 4.833, nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
KEGG ure:UREG_03866  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
CDD cd08048  TAF11  
Amino Acid Sequences MSLSPPPVPLSLPVANPKKRSSLPGLASSSLPAKRPRFHPLRQTSFPTSTDTDPRVYVGTTSARSEIDGASVSGSFTGSLNGSIDGTGVGKGRKRKAKKDRDDASGSARGDAVGGKGVSAKGGVGDEEAEEEDDDLGDTELMGRDDVAVDAEAERKNLAILIDAFSAEQSERYDFFKRAKLNKPTLRKIVNQTLSQSVPPNVITTISGYTKIFIGEMVEKARTVQEHSRSI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.47
3 0.5
4 0.51
5 0.51
6 0.5
7 0.53
8 0.52
9 0.52
10 0.51
11 0.55
12 0.55
13 0.5
14 0.47
15 0.43
16 0.4
17 0.33
18 0.32
19 0.32
20 0.34
21 0.39
22 0.43
23 0.52
24 0.54
25 0.59
26 0.66
27 0.68
28 0.71
29 0.7
30 0.73
31 0.69
32 0.65
33 0.58
34 0.52
35 0.45
36 0.39
37 0.39
38 0.34
39 0.3
40 0.26
41 0.26
42 0.22
43 0.19
44 0.17
45 0.14
46 0.16
47 0.15
48 0.16
49 0.17
50 0.16
51 0.16
52 0.16
53 0.13
54 0.11
55 0.1
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.05
63 0.05
64 0.06
65 0.05
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.06
75 0.07
76 0.08
77 0.11
78 0.17
79 0.24
80 0.33
81 0.4
82 0.5
83 0.6
84 0.69
85 0.76
86 0.81
87 0.8
88 0.77
89 0.75
90 0.65
91 0.6
92 0.54
93 0.44
94 0.33
95 0.27
96 0.2
97 0.16
98 0.15
99 0.09
100 0.06
101 0.06
102 0.05
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.05
107 0.05
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.08
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.08
146 0.07
147 0.08
148 0.09
149 0.09
150 0.1
151 0.1
152 0.08
153 0.09
154 0.07
155 0.08
156 0.07
157 0.09
158 0.1
159 0.14
160 0.18
161 0.19
162 0.23
163 0.28
164 0.34
165 0.41
166 0.49
167 0.55
168 0.62
169 0.69
170 0.75
171 0.76
172 0.78
173 0.75
174 0.71
175 0.7
176 0.7
177 0.67
178 0.6
179 0.55
180 0.51
181 0.48
182 0.43
183 0.38
184 0.29
185 0.25
186 0.23
187 0.21
188 0.17
189 0.16
190 0.15
191 0.14
192 0.16
193 0.16
194 0.17
195 0.16
196 0.16
197 0.16
198 0.16
199 0.14
200 0.1
201 0.12
202 0.13
203 0.16
204 0.18
205 0.19
206 0.18
207 0.19
208 0.22
209 0.2
210 0.23
211 0.29