Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A060SHN2

Protein Details
Accession A0A060SHN2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
67-95DVNMQSQSTKRSKNKRKSKARAGESAKGKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
76-97KRSKNKRKSKARAGESAKGKKS
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10, cyto 6.5, pero 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017336  Snurportin-1  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0061015  P:snRNA import into nucleus  
Amino Acid Sequences MTLGPSDDEADDVDDTHAEPRIIDEGLSQFASMLPPSATSTVAPAHVTDSSPAQPPPNEAEQTVLPDVNMQSQSTKRSKNKRKSKARAGESAKGKKSTMPSKWADKCMYAELLEMKEGFDASGDLRDGIPHDIETGFLAVTPVPVGKRCLAVTHQTSGIAGVVPNTTIRSRMLGKPLMKPFPSTLPPQTVLDCILDEHWRDNGILHILDVVTWKGQDLADCETPFRFWWRDTRLSELPSFPPPPNAAPPDQHSTTYQFPHPTTFAPVPYHTDTTLSHFLTTLIPLTRSTRTIPVSVPVLAGSSSLGEEGTTMDLDGMPIVQLRTIHAEVRSDGMLLYVAQATYEPGTSPLSSWVPLHAYETHEERIRREAAGGPGGVAESPLDVFER
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.12
4 0.14
5 0.12
6 0.12
7 0.13
8 0.15
9 0.15
10 0.14
11 0.15
12 0.14
13 0.17
14 0.17
15 0.15
16 0.12
17 0.12
18 0.14
19 0.11
20 0.11
21 0.08
22 0.09
23 0.12
24 0.13
25 0.13
26 0.12
27 0.14
28 0.15
29 0.16
30 0.15
31 0.13
32 0.15
33 0.15
34 0.16
35 0.14
36 0.16
37 0.17
38 0.2
39 0.21
40 0.22
41 0.22
42 0.25
43 0.29
44 0.32
45 0.31
46 0.28
47 0.3
48 0.27
49 0.31
50 0.29
51 0.23
52 0.17
53 0.18
54 0.18
55 0.2
56 0.2
57 0.16
58 0.18
59 0.21
60 0.29
61 0.33
62 0.42
63 0.46
64 0.57
65 0.67
66 0.74
67 0.83
68 0.86
69 0.9
70 0.91
71 0.93
72 0.93
73 0.88
74 0.87
75 0.84
76 0.81
77 0.79
78 0.78
79 0.71
80 0.63
81 0.57
82 0.51
83 0.51
84 0.52
85 0.48
86 0.47
87 0.47
88 0.55
89 0.6
90 0.62
91 0.56
92 0.49
93 0.46
94 0.41
95 0.38
96 0.28
97 0.24
98 0.2
99 0.18
100 0.17
101 0.15
102 0.12
103 0.1
104 0.1
105 0.08
106 0.06
107 0.06
108 0.05
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.09
115 0.1
116 0.1
117 0.08
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.06
124 0.05
125 0.06
126 0.04
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.07
132 0.09
133 0.1
134 0.12
135 0.12
136 0.14
137 0.16
138 0.22
139 0.23
140 0.23
141 0.22
142 0.2
143 0.2
144 0.18
145 0.16
146 0.1
147 0.07
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.1
157 0.13
158 0.16
159 0.21
160 0.26
161 0.28
162 0.34
163 0.39
164 0.41
165 0.38
166 0.37
167 0.33
168 0.32
169 0.32
170 0.28
171 0.26
172 0.25
173 0.26
174 0.25
175 0.24
176 0.2
177 0.18
178 0.15
179 0.12
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.09
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.07
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.08
205 0.12
206 0.15
207 0.15
208 0.16
209 0.15
210 0.15
211 0.15
212 0.17
213 0.15
214 0.13
215 0.21
216 0.26
217 0.34
218 0.35
219 0.41
220 0.41
221 0.42
222 0.42
223 0.37
224 0.33
225 0.3
226 0.31
227 0.25
228 0.24
229 0.23
230 0.24
231 0.27
232 0.28
233 0.25
234 0.25
235 0.29
236 0.32
237 0.32
238 0.31
239 0.27
240 0.28
241 0.29
242 0.3
243 0.28
244 0.26
245 0.25
246 0.27
247 0.26
248 0.23
249 0.25
250 0.24
251 0.24
252 0.23
253 0.24
254 0.26
255 0.28
256 0.29
257 0.23
258 0.24
259 0.21
260 0.25
261 0.29
262 0.24
263 0.21
264 0.2
265 0.2
266 0.19
267 0.19
268 0.15
269 0.11
270 0.11
271 0.12
272 0.16
273 0.17
274 0.18
275 0.2
276 0.23
277 0.25
278 0.26
279 0.25
280 0.25
281 0.26
282 0.24
283 0.22
284 0.16
285 0.14
286 0.12
287 0.11
288 0.08
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.05
304 0.04
305 0.05
306 0.06
307 0.07
308 0.07
309 0.09
310 0.15
311 0.16
312 0.19
313 0.19
314 0.21
315 0.2
316 0.23
317 0.21
318 0.16
319 0.14
320 0.12
321 0.11
322 0.09
323 0.09
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.08
332 0.09
333 0.12
334 0.12
335 0.13
336 0.16
337 0.17
338 0.18
339 0.18
340 0.2
341 0.19
342 0.2
343 0.22
344 0.2
345 0.22
346 0.24
347 0.28
348 0.3
349 0.34
350 0.35
351 0.34
352 0.38
353 0.37
354 0.33
355 0.31
356 0.32
357 0.31
358 0.34
359 0.32
360 0.26
361 0.24
362 0.23
363 0.21
364 0.15
365 0.1
366 0.06
367 0.07