Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A060SHK2

Protein Details
Accession A0A060SHK2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
473-499SRTASTRPPTRPPTRPPSRAPPPDDNIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
464-474RARSRSRATSR
479-484RPPTRP
Subcellular Location(s) nucl 9cyto 9cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046522  DUF6699  
Pfam View protein in Pfam  
PF20415  DUF6699  
Amino Acid Sequences MAGYTPVVPPYPSPGGGNSPPLNPPPPVIPQGSPNHLPVNPAWGQAQFPQQTPYMMSANLAGVGSPGSYYVPPAHLPPMGMPPGQTPAMQTQGLSADYIGFPPQGFGGGPAATPYGRTSSMPPSTPYVPPGSQTGYSTFQQPLPGYGFPPMGMQPPMATPYVPAMMGGMSGMPAMGGMGGMMPPGMPPGFPMGYPAFTPGMYPGAGPVPGGPAAPPMQPSLSGNRRSFAGPPKDKGPWDQLDKFLEGSDYGPVLKPLLVQKLGIRLEINPLIQPQSESADRDYLKWNMSFQSNSCQRSSDKLGRSWHKGRDEPATWPRVTSLRIVSRSFPWAIDVPATDLVKGVTCGDVIEAIATAMYMRLTQAQYDNATRHQKRLLSESYYHNRSTADGVPGGRLPPTLLRFDWLGQETWFGGITDDPAVVQTVCQCALPCTFVLNCVKRYQVTDADVRVEDERGRTDDERHRARSRSRATSRTASTRPPTRPPTRPPSRAPPPDDNISTTSSAY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.31
3 0.33
4 0.4
5 0.35
6 0.33
7 0.36
8 0.38
9 0.39
10 0.33
11 0.32
12 0.29
13 0.33
14 0.34
15 0.35
16 0.32
17 0.37
18 0.42
19 0.47
20 0.45
21 0.42
22 0.43
23 0.39
24 0.4
25 0.33
26 0.34
27 0.29
28 0.27
29 0.26
30 0.22
31 0.23
32 0.24
33 0.33
34 0.28
35 0.28
36 0.29
37 0.28
38 0.29
39 0.28
40 0.28
41 0.21
42 0.19
43 0.18
44 0.16
45 0.15
46 0.15
47 0.13
48 0.09
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.08
57 0.1
58 0.13
59 0.14
60 0.16
61 0.18
62 0.18
63 0.19
64 0.19
65 0.23
66 0.24
67 0.23
68 0.21
69 0.2
70 0.23
71 0.24
72 0.21
73 0.18
74 0.18
75 0.22
76 0.21
77 0.2
78 0.17
79 0.18
80 0.18
81 0.16
82 0.13
83 0.1
84 0.1
85 0.11
86 0.1
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.08
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.1
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.11
103 0.12
104 0.13
105 0.16
106 0.23
107 0.27
108 0.28
109 0.29
110 0.3
111 0.33
112 0.33
113 0.32
114 0.29
115 0.26
116 0.25
117 0.26
118 0.25
119 0.23
120 0.23
121 0.24
122 0.23
123 0.23
124 0.24
125 0.23
126 0.21
127 0.23
128 0.22
129 0.21
130 0.21
131 0.21
132 0.19
133 0.19
134 0.18
135 0.15
136 0.16
137 0.14
138 0.13
139 0.13
140 0.12
141 0.11
142 0.11
143 0.13
144 0.12
145 0.11
146 0.09
147 0.1
148 0.11
149 0.1
150 0.09
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.06
155 0.04
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.02
160 0.02
161 0.02
162 0.02
163 0.02
164 0.02
165 0.02
166 0.02
167 0.02
168 0.02
169 0.02
170 0.02
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.04
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.12
179 0.12
180 0.13
181 0.13
182 0.15
183 0.12
184 0.11
185 0.12
186 0.09
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.07
200 0.08
201 0.09
202 0.1
203 0.09
204 0.09
205 0.1
206 0.11
207 0.17
208 0.22
209 0.28
210 0.28
211 0.28
212 0.29
213 0.29
214 0.32
215 0.33
216 0.36
217 0.34
218 0.35
219 0.38
220 0.4
221 0.4
222 0.39
223 0.37
224 0.32
225 0.35
226 0.35
227 0.35
228 0.34
229 0.34
230 0.31
231 0.24
232 0.19
233 0.13
234 0.11
235 0.08
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.09
244 0.12
245 0.12
246 0.12
247 0.13
248 0.19
249 0.2
250 0.19
251 0.17
252 0.14
253 0.17
254 0.18
255 0.17
256 0.11
257 0.11
258 0.12
259 0.11
260 0.11
261 0.09
262 0.1
263 0.11
264 0.12
265 0.12
266 0.16
267 0.16
268 0.18
269 0.2
270 0.19
271 0.2
272 0.2
273 0.2
274 0.17
275 0.18
276 0.18
277 0.15
278 0.23
279 0.27
280 0.29
281 0.28
282 0.28
283 0.27
284 0.31
285 0.38
286 0.37
287 0.35
288 0.38
289 0.45
290 0.48
291 0.55
292 0.56
293 0.56
294 0.54
295 0.52
296 0.5
297 0.5
298 0.46
299 0.46
300 0.46
301 0.45
302 0.39
303 0.36
304 0.35
305 0.29
306 0.29
307 0.25
308 0.25
309 0.26
310 0.3
311 0.31
312 0.31
313 0.31
314 0.33
315 0.31
316 0.24
317 0.2
318 0.18
319 0.17
320 0.16
321 0.14
322 0.13
323 0.16
324 0.16
325 0.13
326 0.12
327 0.12
328 0.11
329 0.11
330 0.09
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.05
337 0.05
338 0.04
339 0.04
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.04
347 0.08
348 0.08
349 0.1
350 0.12
351 0.14
352 0.17
353 0.2
354 0.21
355 0.24
356 0.35
357 0.34
358 0.36
359 0.39
360 0.4
361 0.39
362 0.44
363 0.43
364 0.38
365 0.41
366 0.46
367 0.5
368 0.5
369 0.48
370 0.42
371 0.37
372 0.32
373 0.32
374 0.27
375 0.22
376 0.21
377 0.21
378 0.22
379 0.22
380 0.22
381 0.18
382 0.14
383 0.12
384 0.16
385 0.18
386 0.2
387 0.19
388 0.21
389 0.22
390 0.23
391 0.27
392 0.23
393 0.21
394 0.18
395 0.19
396 0.17
397 0.16
398 0.16
399 0.1
400 0.09
401 0.08
402 0.09
403 0.09
404 0.08
405 0.07
406 0.07
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.09
411 0.1
412 0.11
413 0.12
414 0.12
415 0.13
416 0.14
417 0.16
418 0.14
419 0.15
420 0.15
421 0.19
422 0.28
423 0.3
424 0.31
425 0.32
426 0.35
427 0.34
428 0.37
429 0.38
430 0.35
431 0.35
432 0.38
433 0.37
434 0.38
435 0.36
436 0.35
437 0.3
438 0.26
439 0.24
440 0.21
441 0.22
442 0.21
443 0.26
444 0.25
445 0.32
446 0.39
447 0.47
448 0.53
449 0.57
450 0.61
451 0.63
452 0.69
453 0.71
454 0.71
455 0.73
456 0.73
457 0.72
458 0.72
459 0.74
460 0.74
461 0.72
462 0.68
463 0.65
464 0.65
465 0.68
466 0.67
467 0.68
468 0.71
469 0.71
470 0.76
471 0.77
472 0.79
473 0.81
474 0.83
475 0.81
476 0.82
477 0.83
478 0.84
479 0.82
480 0.81
481 0.76
482 0.77
483 0.71
484 0.64
485 0.56
486 0.51