Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JTC2

Protein Details
Accession C4JTC2    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
69-95ILRAVPKKKTSHMKKRHRQMAGKALKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
74-90PKKKTSHMKKRHRQMAG
Subcellular Location(s) extr 19, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024977  Apc4-like_WD40_dom  
IPR002677  Ribosomal_L32p  
IPR011332  Ribosomal_zn-bd  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0015934  C:large ribosomal subunit  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG ure:UREG_05711  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12894  ANAPC4_WD40  
PF01783  Ribosomal_L32p  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MAAIGVLRVLPFPSFSARALPSFAAFQSPTSSRLLQFLSQPLHISSNAFIPGTVVLGLPSILSGLWESILRAVPKKKTSHMKKRHRQMAGKALKDVKNITNCPGCGQPKRAHLLCPSCVSAHLADIFCLAVTPTQFLSASGASSLKVHSTTEAEFPIAQSIEKAHNIGCHHIVASENGSRAASVGFAGEVKLWAYKDGTWSEDTSYNGKVGDVWAIRLSNDGQYLAGTTHDGHIKVWDLESGAEQIRDFETKGSFGMCIDISSDGRYTASGHQSGNVYIFDNGTGRMPYSLSGLVDPVRAVAFSPGGKLLAAAGDSKIIVLYETSSGEQVANLTGHSAWIMSLDWSHTGEYLLSG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.24
4 0.25
5 0.26
6 0.28
7 0.27
8 0.23
9 0.22
10 0.22
11 0.2
12 0.18
13 0.18
14 0.21
15 0.21
16 0.22
17 0.24
18 0.26
19 0.23
20 0.26
21 0.28
22 0.25
23 0.27
24 0.32
25 0.3
26 0.29
27 0.3
28 0.28
29 0.28
30 0.26
31 0.23
32 0.18
33 0.18
34 0.18
35 0.17
36 0.15
37 0.13
38 0.13
39 0.12
40 0.11
41 0.08
42 0.06
43 0.06
44 0.06
45 0.05
46 0.05
47 0.04
48 0.04
49 0.04
50 0.05
51 0.05
52 0.05
53 0.06
54 0.06
55 0.08
56 0.12
57 0.13
58 0.19
59 0.24
60 0.31
61 0.37
62 0.41
63 0.47
64 0.55
65 0.64
66 0.7
67 0.75
68 0.8
69 0.83
70 0.9
71 0.91
72 0.89
73 0.86
74 0.83
75 0.83
76 0.81
77 0.73
78 0.67
79 0.65
80 0.59
81 0.54
82 0.49
83 0.43
84 0.42
85 0.41
86 0.41
87 0.38
88 0.35
89 0.35
90 0.38
91 0.38
92 0.35
93 0.39
94 0.4
95 0.42
96 0.48
97 0.47
98 0.44
99 0.45
100 0.46
101 0.44
102 0.41
103 0.36
104 0.3
105 0.29
106 0.27
107 0.21
108 0.16
109 0.16
110 0.13
111 0.12
112 0.12
113 0.11
114 0.09
115 0.08
116 0.07
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.1
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.09
137 0.1
138 0.11
139 0.12
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.1
145 0.08
146 0.06
147 0.08
148 0.09
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.12
153 0.13
154 0.15
155 0.14
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.09
161 0.11
162 0.1
163 0.09
164 0.1
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.1
184 0.11
185 0.13
186 0.13
187 0.14
188 0.15
189 0.17
190 0.18
191 0.17
192 0.16
193 0.15
194 0.14
195 0.13
196 0.11
197 0.09
198 0.12
199 0.1
200 0.1
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.12
205 0.13
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.08
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.08
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.11
221 0.13
222 0.12
223 0.12
224 0.11
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.11
229 0.1
230 0.1
231 0.09
232 0.1
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.1
237 0.11
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.09
243 0.1
244 0.09
245 0.08
246 0.08
247 0.1
248 0.1
249 0.11
250 0.11
251 0.09
252 0.1
253 0.1
254 0.11
255 0.15
256 0.19
257 0.2
258 0.2
259 0.22
260 0.23
261 0.23
262 0.23
263 0.18
264 0.15
265 0.13
266 0.13
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.1
271 0.1
272 0.09
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.12
277 0.13
278 0.12
279 0.12
280 0.13
281 0.13
282 0.13
283 0.13
284 0.11
285 0.09
286 0.08
287 0.09
288 0.09
289 0.11
290 0.1
291 0.12
292 0.12
293 0.12
294 0.12
295 0.11
296 0.1
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.07
309 0.08
310 0.1
311 0.11
312 0.11
313 0.12
314 0.12
315 0.12
316 0.11
317 0.11
318 0.1
319 0.09
320 0.1
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.06
326 0.07
327 0.08
328 0.07
329 0.08
330 0.1
331 0.12
332 0.13
333 0.14
334 0.13
335 0.13