Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A060S1L5

Protein Details
Accession A0A060S1L5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-45QAAPARPKGKQKDSTPPKSKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-64PARPKGKQKDSTPPKSKEVRRLEKLRDDLRKSSGREK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 10, cyto_nucl 8, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MHHTAWTKKGSSVPSDWIAPKSQPQAAPARPKGKQKDSTPPKSKEVRRLEKLRDDLRKSSGREKDPKGGCFCQARLHPLSPYTPICRACGLILCELNLPNFACPHCGAGLLTTATLDSLVQTLDDRIADTIAREEEERQRAAQEARSAEGAFPTLSVAASRVSCPDAQSSHPVNQTHKVLSLDSKTRKVKVSTFTPPAVSRNTSTEKLSKEVEPEHKRVPPPPAEVVCASAPSSQRPWANMRGLDVSYVRPSRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.42
3 0.41
4 0.38
5 0.37
6 0.33
7 0.36
8 0.36
9 0.38
10 0.34
11 0.36
12 0.43
13 0.47
14 0.55
15 0.57
16 0.6
17 0.6
18 0.68
19 0.73
20 0.73
21 0.75
22 0.71
23 0.74
24 0.77
25 0.83
26 0.83
27 0.79
28 0.77
29 0.78
30 0.78
31 0.77
32 0.77
33 0.76
34 0.76
35 0.79
36 0.79
37 0.78
38 0.79
39 0.77
40 0.76
41 0.71
42 0.66
43 0.64
44 0.63
45 0.58
46 0.6
47 0.59
48 0.58
49 0.61
50 0.63
51 0.65
52 0.64
53 0.65
54 0.63
55 0.57
56 0.53
57 0.49
58 0.44
59 0.42
60 0.38
61 0.39
62 0.36
63 0.36
64 0.32
65 0.3
66 0.3
67 0.28
68 0.29
69 0.26
70 0.27
71 0.27
72 0.27
73 0.26
74 0.25
75 0.21
76 0.22
77 0.2
78 0.18
79 0.17
80 0.16
81 0.16
82 0.16
83 0.15
84 0.13
85 0.11
86 0.09
87 0.1
88 0.09
89 0.1
90 0.1
91 0.11
92 0.1
93 0.1
94 0.09
95 0.08
96 0.1
97 0.08
98 0.07
99 0.06
100 0.06
101 0.05
102 0.05
103 0.04
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.08
122 0.14
123 0.17
124 0.17
125 0.16
126 0.17
127 0.18
128 0.19
129 0.2
130 0.18
131 0.16
132 0.16
133 0.17
134 0.17
135 0.15
136 0.14
137 0.11
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.06
147 0.07
148 0.08
149 0.09
150 0.1
151 0.11
152 0.13
153 0.13
154 0.15
155 0.21
156 0.23
157 0.26
158 0.31
159 0.32
160 0.32
161 0.35
162 0.36
163 0.31
164 0.3
165 0.27
166 0.23
167 0.25
168 0.27
169 0.3
170 0.32
171 0.39
172 0.4
173 0.43
174 0.46
175 0.46
176 0.47
177 0.46
178 0.49
179 0.49
180 0.5
181 0.49
182 0.47
183 0.45
184 0.42
185 0.4
186 0.35
187 0.29
188 0.3
189 0.33
190 0.32
191 0.34
192 0.36
193 0.35
194 0.35
195 0.36
196 0.32
197 0.3
198 0.36
199 0.43
200 0.44
201 0.47
202 0.49
203 0.52
204 0.54
205 0.54
206 0.55
207 0.51
208 0.5
209 0.53
210 0.49
211 0.47
212 0.45
213 0.43
214 0.36
215 0.31
216 0.27
217 0.22
218 0.22
219 0.22
220 0.25
221 0.27
222 0.29
223 0.32
224 0.36
225 0.4
226 0.46
227 0.43
228 0.43
229 0.42
230 0.4
231 0.39
232 0.34
233 0.3
234 0.31