Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A060SHN3

Protein Details
Accession A0A060SHN3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
109-128SAPPEKEKGEKRPRRRVSLGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
114-124KEKGEKRPRRR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, mito 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008895  Vps72/YL1  
IPR046757  YL1_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0140849  F:ATP-dependent H2AZ histone chaperone activity  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF05764  YL1  
Amino Acid Sequences MEETVAARRSKRSTAGNRMEAALAEFKAEDIGVDMDEDADFALDKGMDEFEADFESTDEEGEQEEVDATAESIIRQEETRARKTARTHLERITALAHARQADTFNPQLSAPPEKEKGEKRPRRRVSLGVAVDAETGEVTSLDTGAVEEAESASAALGRRHSMRAHTVANTSATVNRVKDEERKQFSAPKRTKSKTKMLTQEELIARALAMEEGNIEEHKNYLTVEEEKRRKARLVRTSVQGPLLRWISKPEEITVVVEPAPPPPPPAPPTNPWAQSSIGYPAPSSSAPPPTGAPGYSYTPTTSTYIPPPQSPPYTQTSPFQQWPPPLPPPAVYHAPSPQPPPPPPPREPIIRTEKVAKQYVVHELEQSDKAPRPSWNSTMTAMFGDHADWEHMRVYTTKGRPLSGGPMLIICRNVY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.7
3 0.7
4 0.67
5 0.63
6 0.57
7 0.47
8 0.4
9 0.32
10 0.22
11 0.17
12 0.15
13 0.13
14 0.13
15 0.12
16 0.09
17 0.07
18 0.08
19 0.07
20 0.08
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.06
26 0.05
27 0.05
28 0.05
29 0.06
30 0.05
31 0.06
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.1
39 0.1
40 0.09
41 0.09
42 0.11
43 0.1
44 0.1
45 0.09
46 0.07
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.07
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.07
60 0.07
61 0.08
62 0.08
63 0.12
64 0.19
65 0.25
66 0.31
67 0.36
68 0.38
69 0.42
70 0.48
71 0.54
72 0.57
73 0.58
74 0.58
75 0.57
76 0.6
77 0.55
78 0.51
79 0.43
80 0.34
81 0.28
82 0.24
83 0.22
84 0.17
85 0.17
86 0.16
87 0.17
88 0.16
89 0.19
90 0.2
91 0.18
92 0.18
93 0.17
94 0.19
95 0.21
96 0.25
97 0.22
98 0.26
99 0.29
100 0.3
101 0.36
102 0.4
103 0.48
104 0.54
105 0.62
106 0.66
107 0.74
108 0.79
109 0.81
110 0.79
111 0.74
112 0.7
113 0.7
114 0.61
115 0.52
116 0.45
117 0.36
118 0.31
119 0.25
120 0.18
121 0.08
122 0.06
123 0.04
124 0.04
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.05
141 0.06
142 0.07
143 0.08
144 0.09
145 0.11
146 0.14
147 0.15
148 0.16
149 0.2
150 0.23
151 0.25
152 0.25
153 0.24
154 0.23
155 0.23
156 0.21
157 0.17
158 0.14
159 0.14
160 0.14
161 0.13
162 0.13
163 0.13
164 0.15
165 0.22
166 0.29
167 0.36
168 0.39
169 0.42
170 0.43
171 0.5
172 0.54
173 0.57
174 0.54
175 0.54
176 0.58
177 0.59
178 0.67
179 0.65
180 0.68
181 0.66
182 0.68
183 0.69
184 0.64
185 0.63
186 0.55
187 0.55
188 0.45
189 0.38
190 0.3
191 0.21
192 0.15
193 0.12
194 0.11
195 0.05
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.07
210 0.11
211 0.16
212 0.24
213 0.29
214 0.34
215 0.37
216 0.38
217 0.41
218 0.43
219 0.48
220 0.49
221 0.53
222 0.53
223 0.54
224 0.55
225 0.52
226 0.49
227 0.41
228 0.32
229 0.28
230 0.26
231 0.23
232 0.2
233 0.23
234 0.22
235 0.23
236 0.24
237 0.2
238 0.2
239 0.19
240 0.21
241 0.18
242 0.15
243 0.12
244 0.12
245 0.11
246 0.11
247 0.12
248 0.1
249 0.13
250 0.13
251 0.17
252 0.19
253 0.25
254 0.28
255 0.29
256 0.33
257 0.37
258 0.39
259 0.36
260 0.35
261 0.3
262 0.26
263 0.25
264 0.24
265 0.2
266 0.17
267 0.15
268 0.13
269 0.14
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.17
274 0.17
275 0.18
276 0.19
277 0.19
278 0.2
279 0.18
280 0.17
281 0.16
282 0.19
283 0.19
284 0.19
285 0.17
286 0.17
287 0.19
288 0.19
289 0.17
290 0.16
291 0.21
292 0.27
293 0.28
294 0.29
295 0.32
296 0.35
297 0.38
298 0.38
299 0.36
300 0.36
301 0.39
302 0.38
303 0.37
304 0.39
305 0.41
306 0.43
307 0.43
308 0.4
309 0.4
310 0.44
311 0.47
312 0.45
313 0.42
314 0.39
315 0.38
316 0.38
317 0.39
318 0.38
319 0.34
320 0.32
321 0.33
322 0.37
323 0.37
324 0.38
325 0.37
326 0.39
327 0.41
328 0.47
329 0.52
330 0.56
331 0.57
332 0.58
333 0.58
334 0.59
335 0.6
336 0.6
337 0.6
338 0.55
339 0.55
340 0.56
341 0.57
342 0.55
343 0.56
344 0.49
345 0.42
346 0.41
347 0.47
348 0.43
349 0.38
350 0.33
351 0.29
352 0.33
353 0.32
354 0.3
355 0.26
356 0.26
357 0.28
358 0.29
359 0.33
360 0.36
361 0.41
362 0.45
363 0.45
364 0.44
365 0.43
366 0.42
367 0.38
368 0.31
369 0.25
370 0.21
371 0.16
372 0.13
373 0.11
374 0.11
375 0.12
376 0.12
377 0.13
378 0.15
379 0.15
380 0.16
381 0.17
382 0.21
383 0.28
384 0.32
385 0.39
386 0.39
387 0.4
388 0.41
389 0.42
390 0.44
391 0.39
392 0.35
393 0.28
394 0.29
395 0.3
396 0.29