Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JEC3

Protein Details
Accession C4JEC3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-92ELSARIYSKRPARRTRADTVPSRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR033133  PUM-HD  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG ure:UREG_00739  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00806  PUF  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
PS50303  PUM_HD  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAPSARPDGHLNLGYLPTGQPRSGTSTGSSSPSELQTNSMKSAFGAANGLVTAGGSIGSARRTAGSPSHELSARIYSKRPARRTRADTVPSRFSPVGPLNGVNVQPSIISKTSRPTPSTSPFRPPGLETPRTSAPGSGALLSRLRAGSMPQRTNILGGASPFGPSVFSTNWTSSRDRASTLTSIRSSEGPTSPTQSSFSRDGLADADVKTLDYLGLAETPQQSRATLARPPSDMMMQQPQQQQQPSSLPPLLELRILNRGANRFRSYSVNAKEKYAEDEEEFGAHYSSIPSGTITPSAAATAAQLAATQAQIHQHNLAVQAFASQASASRPRARTAGVLDTPPQRSALRNYLATPSRLDNGLSAADIRIAEAGEFDELQESVQLMQLGGLGALRPGQEGADENNLEGPTRALWIGSIPVSTTVTSLDAIFSMYGKIESTRVLTHKNCGFVNFERVESAIQAKSLLNGKEIFPGAGPVRIGYAKVPVTPTSETPGQSDLQSSPTPDPHASTQPGDGPGGSGKEDGRPDSPKIPELPKLLPEMTQIVAEFGATEAECCNISQSIQRAIEFQAFNDEISATPEPNQTRTFDAPKLRDIRKRIDNGACSVQEIEETAKSMLPEVAELSSDYLGNTVVQKLFEFCSEATKEELLVPIAPYLAEIGVHKNGTWAAQKIIDVAKTHTQKQMIVECLRPYTVPLFLDQYGNYVLQCCLRFGSPYNDFIFETMLSRMWEIAQGRFGARAMRACLESHHSTKDQQRMLASAIALHSVQLATNANGALLLTWFLDTCTFPHRRTVLAPRLVPHLVHLCTHKVAYLTVLKIVNQRNEPEAREIILKALFFSPGDEILENILKDQVSGATLIFKVLTTPFFEETMRAEVVKTVAKVLIKLKTSPSQGYKRLMDEVGLSSRNGSSRDSHHARDHASGHHEKNQGRQPPRQPAANSQHPHDRQYNGQFSANMPPQSYNSPAAMTRSLSQEQGLLPYDPYLLGGINAQGGLGQFNTMNNGGFGPDPVNPLNPQFQYQAFLAAQSRGMSPQGGFYPTMPTNAFNGYATNAATMDTFRNMQNHSSPIPGPPAQLATNPMIQPPAFAAAPQFSPIATPVMGAGQLYGYPQPFYQQGQASHGSVPGGRRARR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.24
3 0.21
4 0.21
5 0.22
6 0.21
7 0.2
8 0.21
9 0.29
10 0.3
11 0.3
12 0.27
13 0.29
14 0.31
15 0.34
16 0.32
17 0.26
18 0.27
19 0.29
20 0.29
21 0.24
22 0.26
23 0.29
24 0.31
25 0.33
26 0.3
27 0.27
28 0.24
29 0.29
30 0.25
31 0.19
32 0.18
33 0.14
34 0.14
35 0.14
36 0.14
37 0.08
38 0.08
39 0.07
40 0.04
41 0.04
42 0.03
43 0.04
44 0.06
45 0.08
46 0.08
47 0.09
48 0.11
49 0.12
50 0.16
51 0.21
52 0.25
53 0.29
54 0.31
55 0.34
56 0.34
57 0.34
58 0.34
59 0.37
60 0.36
61 0.34
62 0.35
63 0.39
64 0.46
65 0.55
66 0.63
67 0.64
68 0.69
69 0.76
70 0.8
71 0.81
72 0.82
73 0.8
74 0.79
75 0.76
76 0.74
77 0.65
78 0.64
79 0.56
80 0.47
81 0.46
82 0.42
83 0.39
84 0.33
85 0.33
86 0.29
87 0.32
88 0.32
89 0.26
90 0.21
91 0.16
92 0.15
93 0.15
94 0.17
95 0.16
96 0.18
97 0.18
98 0.25
99 0.33
100 0.39
101 0.4
102 0.4
103 0.46
104 0.54
105 0.62
106 0.6
107 0.6
108 0.59
109 0.6
110 0.57
111 0.53
112 0.53
113 0.53
114 0.54
115 0.48
116 0.49
117 0.49
118 0.5
119 0.46
120 0.37
121 0.3
122 0.28
123 0.26
124 0.23
125 0.19
126 0.19
127 0.2
128 0.19
129 0.2
130 0.16
131 0.15
132 0.14
133 0.17
134 0.23
135 0.31
136 0.34
137 0.33
138 0.36
139 0.36
140 0.36
141 0.33
142 0.26
143 0.18
144 0.15
145 0.16
146 0.13
147 0.14
148 0.13
149 0.12
150 0.1
151 0.1
152 0.13
153 0.11
154 0.15
155 0.18
156 0.21
157 0.25
158 0.28
159 0.3
160 0.29
161 0.35
162 0.33
163 0.32
164 0.31
165 0.32
166 0.34
167 0.34
168 0.37
169 0.32
170 0.32
171 0.31
172 0.3
173 0.28
174 0.26
175 0.25
176 0.22
177 0.23
178 0.27
179 0.27
180 0.26
181 0.27
182 0.25
183 0.27
184 0.28
185 0.27
186 0.24
187 0.23
188 0.23
189 0.21
190 0.21
191 0.18
192 0.15
193 0.15
194 0.12
195 0.12
196 0.11
197 0.1
198 0.08
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.09
205 0.12
206 0.13
207 0.16
208 0.16
209 0.16
210 0.17
211 0.2
212 0.2
213 0.21
214 0.26
215 0.27
216 0.28
217 0.29
218 0.28
219 0.28
220 0.26
221 0.25
222 0.29
223 0.27
224 0.32
225 0.36
226 0.38
227 0.41
228 0.43
229 0.4
230 0.36
231 0.39
232 0.35
233 0.35
234 0.32
235 0.27
236 0.26
237 0.28
238 0.25
239 0.23
240 0.21
241 0.18
242 0.22
243 0.23
244 0.23
245 0.23
246 0.29
247 0.31
248 0.37
249 0.38
250 0.33
251 0.35
252 0.38
253 0.39
254 0.42
255 0.45
256 0.47
257 0.45
258 0.45
259 0.45
260 0.41
261 0.42
262 0.36
263 0.31
264 0.23
265 0.25
266 0.23
267 0.21
268 0.2
269 0.15
270 0.12
271 0.1
272 0.09
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.09
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.08
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.1
298 0.12
299 0.13
300 0.14
301 0.14
302 0.15
303 0.17
304 0.17
305 0.13
306 0.11
307 0.11
308 0.1
309 0.09
310 0.08
311 0.06
312 0.06
313 0.09
314 0.15
315 0.17
316 0.25
317 0.26
318 0.28
319 0.29
320 0.3
321 0.3
322 0.28
323 0.32
324 0.26
325 0.26
326 0.28
327 0.31
328 0.32
329 0.29
330 0.27
331 0.21
332 0.22
333 0.26
334 0.3
335 0.29
336 0.28
337 0.3
338 0.34
339 0.36
340 0.34
341 0.31
342 0.25
343 0.23
344 0.22
345 0.21
346 0.14
347 0.14
348 0.13
349 0.11
350 0.09
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.05
358 0.05
359 0.06
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.05
376 0.05
377 0.04
378 0.04
379 0.05
380 0.05
381 0.04
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.06
386 0.09
387 0.12
388 0.12
389 0.12
390 0.15
391 0.15
392 0.14
393 0.13
394 0.11
395 0.07
396 0.08
397 0.08
398 0.05
399 0.05
400 0.06
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.06
405 0.07
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.07
410 0.07
411 0.08
412 0.07
413 0.07
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.06
423 0.06
424 0.07
425 0.08
426 0.11
427 0.13
428 0.19
429 0.19
430 0.25
431 0.27
432 0.29
433 0.28
434 0.26
435 0.29
436 0.24
437 0.31
438 0.25
439 0.23
440 0.2
441 0.2
442 0.19
443 0.15
444 0.17
445 0.1
446 0.09
447 0.1
448 0.09
449 0.11
450 0.15
451 0.15
452 0.14
453 0.15
454 0.15
455 0.17
456 0.17
457 0.15
458 0.11
459 0.13
460 0.12
461 0.12
462 0.11
463 0.08
464 0.09
465 0.09
466 0.1
467 0.08
468 0.11
469 0.1
470 0.12
471 0.13
472 0.13
473 0.16
474 0.17
475 0.17
476 0.17
477 0.19
478 0.19
479 0.18
480 0.19
481 0.17
482 0.16
483 0.16
484 0.13
485 0.14
486 0.14
487 0.14
488 0.14
489 0.14
490 0.16
491 0.15
492 0.16
493 0.16
494 0.19
495 0.19
496 0.19
497 0.19
498 0.18
499 0.19
500 0.17
501 0.14
502 0.11
503 0.1
504 0.1
505 0.09
506 0.08
507 0.07
508 0.1
509 0.11
510 0.12
511 0.14
512 0.17
513 0.18
514 0.22
515 0.23
516 0.22
517 0.25
518 0.26
519 0.27
520 0.28
521 0.27
522 0.24
523 0.26
524 0.24
525 0.21
526 0.2
527 0.17
528 0.14
529 0.13
530 0.1
531 0.08
532 0.08
533 0.07
534 0.06
535 0.04
536 0.04
537 0.03
538 0.04
539 0.03
540 0.04
541 0.05
542 0.04
543 0.05
544 0.05
545 0.05
546 0.08
547 0.1
548 0.14
549 0.15
550 0.15
551 0.16
552 0.17
553 0.21
554 0.19
555 0.17
556 0.16
557 0.15
558 0.15
559 0.14
560 0.13
561 0.08
562 0.11
563 0.12
564 0.08
565 0.09
566 0.13
567 0.13
568 0.16
569 0.17
570 0.15
571 0.18
572 0.21
573 0.23
574 0.24
575 0.29
576 0.28
577 0.33
578 0.38
579 0.4
580 0.42
581 0.43
582 0.46
583 0.47
584 0.49
585 0.5
586 0.48
587 0.45
588 0.42
589 0.43
590 0.35
591 0.28
592 0.25
593 0.19
594 0.14
595 0.12
596 0.1
597 0.06
598 0.07
599 0.07
600 0.08
601 0.07
602 0.08
603 0.08
604 0.07
605 0.07
606 0.06
607 0.06
608 0.06
609 0.06
610 0.06
611 0.06
612 0.06
613 0.06
614 0.05
615 0.05
616 0.05
617 0.06
618 0.06
619 0.07
620 0.07
621 0.07
622 0.08
623 0.09
624 0.09
625 0.1
626 0.08
627 0.13
628 0.14
629 0.15
630 0.14
631 0.14
632 0.14
633 0.13
634 0.13
635 0.09
636 0.08
637 0.08
638 0.07
639 0.06
640 0.06
641 0.05
642 0.05
643 0.04
644 0.04
645 0.04
646 0.07
647 0.08
648 0.09
649 0.09
650 0.09
651 0.09
652 0.11
653 0.13
654 0.11
655 0.11
656 0.12
657 0.12
658 0.14
659 0.15
660 0.15
661 0.13
662 0.15
663 0.21
664 0.22
665 0.25
666 0.27
667 0.26
668 0.26
669 0.29
670 0.3
671 0.28
672 0.28
673 0.28
674 0.26
675 0.25
676 0.24
677 0.21
678 0.17
679 0.13
680 0.14
681 0.12
682 0.12
683 0.14
684 0.14
685 0.15
686 0.14
687 0.14
688 0.13
689 0.13
690 0.12
691 0.1
692 0.09
693 0.12
694 0.12
695 0.11
696 0.11
697 0.11
698 0.12
699 0.14
700 0.21
701 0.2
702 0.23
703 0.24
704 0.25
705 0.24
706 0.23
707 0.22
708 0.15
709 0.14
710 0.11
711 0.1
712 0.09
713 0.09
714 0.09
715 0.08
716 0.11
717 0.11
718 0.11
719 0.12
720 0.13
721 0.13
722 0.13
723 0.13
724 0.12
725 0.12
726 0.14
727 0.14
728 0.15
729 0.15
730 0.15
731 0.16
732 0.21
733 0.23
734 0.23
735 0.25
736 0.25
737 0.29
738 0.35
739 0.41
740 0.37
741 0.35
742 0.33
743 0.31
744 0.31
745 0.28
746 0.22
747 0.15
748 0.13
749 0.12
750 0.11
751 0.09
752 0.08
753 0.06
754 0.06
755 0.06
756 0.07
757 0.07
758 0.08
759 0.08
760 0.07
761 0.07
762 0.07
763 0.06
764 0.05
765 0.05
766 0.04
767 0.04
768 0.04
769 0.05
770 0.06
771 0.06
772 0.07
773 0.14
774 0.17
775 0.18
776 0.24
777 0.25
778 0.26
779 0.31
780 0.39
781 0.41
782 0.44
783 0.45
784 0.4
785 0.44
786 0.43
787 0.38
788 0.31
789 0.28
790 0.22
791 0.22
792 0.23
793 0.21
794 0.21
795 0.21
796 0.2
797 0.15
798 0.14
799 0.16
800 0.18
801 0.16
802 0.19
803 0.19
804 0.19
805 0.25
806 0.3
807 0.32
808 0.3
809 0.32
810 0.32
811 0.35
812 0.36
813 0.34
814 0.3
815 0.26
816 0.25
817 0.23
818 0.21
819 0.19
820 0.17
821 0.14
822 0.13
823 0.13
824 0.11
825 0.12
826 0.1
827 0.1
828 0.11
829 0.1
830 0.09
831 0.11
832 0.13
833 0.12
834 0.11
835 0.12
836 0.1
837 0.1
838 0.1
839 0.09
840 0.07
841 0.08
842 0.07
843 0.08
844 0.08
845 0.09
846 0.08
847 0.08
848 0.08
849 0.09
850 0.1
851 0.1
852 0.13
853 0.15
854 0.16
855 0.16
856 0.16
857 0.17
858 0.2
859 0.18
860 0.15
861 0.14
862 0.14
863 0.16
864 0.17
865 0.15
866 0.13
867 0.15
868 0.15
869 0.18
870 0.21
871 0.25
872 0.24
873 0.26
874 0.29
875 0.33
876 0.37
877 0.4
878 0.43
879 0.46
880 0.5
881 0.54
882 0.52
883 0.49
884 0.48
885 0.42
886 0.35
887 0.29
888 0.26
889 0.24
890 0.22
891 0.19
892 0.17
893 0.18
894 0.19
895 0.19
896 0.17
897 0.17
898 0.21
899 0.3
900 0.34
901 0.37
902 0.41
903 0.44
904 0.45
905 0.46
906 0.44
907 0.38
908 0.41
909 0.43
910 0.41
911 0.46
912 0.49
913 0.46
914 0.52
915 0.56
916 0.57
917 0.56
918 0.61
919 0.62
920 0.67
921 0.69
922 0.68
923 0.63
924 0.64
925 0.67
926 0.68
927 0.62
928 0.55
929 0.61
930 0.56
931 0.59
932 0.53
933 0.47
934 0.45
935 0.52
936 0.54
937 0.47
938 0.47
939 0.43
940 0.4
941 0.46
942 0.44
943 0.36
944 0.3
945 0.29
946 0.29
947 0.31
948 0.33
949 0.27
950 0.22
951 0.23
952 0.23
953 0.24
954 0.24
955 0.23
956 0.21
957 0.24
958 0.25
959 0.24
960 0.23
961 0.22
962 0.2
963 0.22
964 0.21
965 0.17
966 0.16
967 0.16
968 0.16
969 0.13
970 0.13
971 0.1
972 0.08
973 0.07
974 0.08
975 0.07
976 0.07
977 0.07
978 0.06
979 0.07
980 0.07
981 0.07
982 0.06
983 0.07
984 0.07
985 0.07
986 0.11
987 0.11
988 0.11
989 0.11
990 0.11
991 0.11
992 0.11
993 0.11
994 0.1
995 0.11
996 0.15
997 0.16
998 0.18
999 0.19
1000 0.22
1001 0.28
1002 0.27
1003 0.28
1004 0.27
1005 0.27
1006 0.27
1007 0.26
1008 0.28
1009 0.21
1010 0.22
1011 0.21
1012 0.2
1013 0.2
1014 0.18
1015 0.19
1016 0.15
1017 0.16
1018 0.15
1019 0.13
1020 0.17
1021 0.18
1022 0.19
1023 0.19
1024 0.18
1025 0.24
1026 0.23
1027 0.27
1028 0.23
1029 0.22
1030 0.22
1031 0.24
1032 0.24
1033 0.17
1034 0.18
1035 0.16
1036 0.17
1037 0.15
1038 0.14
1039 0.12
1040 0.11
1041 0.11
1042 0.11
1043 0.12
1044 0.13
1045 0.15
1046 0.16
1047 0.2
1048 0.22
1049 0.26
1050 0.29
1051 0.31
1052 0.31
1053 0.33
1054 0.32
1055 0.31
1056 0.36
1057 0.33
1058 0.29
1059 0.27
1060 0.29
1061 0.26
1062 0.27
1063 0.28
1064 0.25
1065 0.29
1066 0.28
1067 0.26
1068 0.26
1069 0.24
1070 0.23
1071 0.21
1072 0.22
1073 0.16
1074 0.15
1075 0.17
1076 0.17
1077 0.18
1078 0.19
1079 0.17
1080 0.13
1081 0.14
1082 0.15
1083 0.15
1084 0.12
1085 0.11
1086 0.1
1087 0.11
1088 0.12
1089 0.11
1090 0.1
1091 0.07
1092 0.08
1093 0.09
1094 0.12
1095 0.12
1096 0.13
1097 0.13
1098 0.16
1099 0.18
1100 0.21
1101 0.26
1102 0.29
1103 0.31
1104 0.35
1105 0.39
1106 0.37
1107 0.36
1108 0.33
1109 0.28
1110 0.25
1111 0.25
1112 0.28