Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A060SJM0

Protein Details
Accession A0A060SJM0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-51TYAEETKRQIRREERKKKKTEEFEKAKESYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-41RQIRREERKKKKT
143-205RTVRGWKPRRLGGGLGGRPKPEPPAAFAGPPSRGGFRGGFRGGDRGGGGFRGGRGGFRGGRGG
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034143  snRNP70_RRM  
Gene Ontology GO:0030619  F:U1 snRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12236  RRM_snRNP70  
Amino Acid Sequences MESGNTGGERDGMEEGEEPNFTYAEETKRQIRREERKKKKTEEFEKAKESYKPSEDPEAIGDPYKTLFIARLHKNATENDLRREFESYGNIERVRVVRDKNGRSRGYAFIVFERERDMKAAYKESDRLQIMGKRVLVDVERGRTVRGWKPRRLGGGLGGRPKPEPPAAFAGPPSRGGFRGGFRGGDRGGGGFRGGRGGFRGGRGGFGGDRFGGPRDDFGGGGGGRGGFGGGYSSYGDRTAAELGRSPNGRSGVVPVGPGTRSGFGFPRAPYGTGSGTGPDGPSDGSGRTTGPGTDVPGRVGPGTRGPGTDGYGRTGPVRGYGSGPGWDRRWVTSGPSVGGWGFGGGGGGGFRGDLKREGGPDGYDDRDSKRPRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.14
4 0.14
5 0.13
6 0.12
7 0.12
8 0.11
9 0.13
10 0.15
11 0.2
12 0.25
13 0.28
14 0.36
15 0.43
16 0.47
17 0.53
18 0.6
19 0.65
20 0.72
21 0.79
22 0.82
23 0.86
24 0.91
25 0.92
26 0.92
27 0.92
28 0.91
29 0.91
30 0.89
31 0.86
32 0.84
33 0.77
34 0.71
35 0.65
36 0.6
37 0.56
38 0.52
39 0.47
40 0.44
41 0.49
42 0.45
43 0.41
44 0.4
45 0.36
46 0.31
47 0.29
48 0.25
49 0.17
50 0.17
51 0.16
52 0.12
53 0.09
54 0.12
55 0.16
56 0.25
57 0.29
58 0.35
59 0.37
60 0.4
61 0.43
62 0.4
63 0.42
64 0.43
65 0.41
66 0.42
67 0.44
68 0.42
69 0.4
70 0.42
71 0.37
72 0.3
73 0.31
74 0.27
75 0.26
76 0.29
77 0.28
78 0.25
79 0.26
80 0.25
81 0.25
82 0.26
83 0.25
84 0.29
85 0.38
86 0.46
87 0.52
88 0.6
89 0.57
90 0.56
91 0.57
92 0.53
93 0.48
94 0.43
95 0.35
96 0.28
97 0.33
98 0.29
99 0.25
100 0.26
101 0.23
102 0.21
103 0.21
104 0.2
105 0.19
106 0.22
107 0.27
108 0.24
109 0.26
110 0.29
111 0.29
112 0.34
113 0.3
114 0.28
115 0.27
116 0.28
117 0.28
118 0.29
119 0.27
120 0.22
121 0.21
122 0.21
123 0.18
124 0.19
125 0.19
126 0.18
127 0.19
128 0.18
129 0.19
130 0.2
131 0.24
132 0.26
133 0.34
134 0.39
135 0.43
136 0.48
137 0.51
138 0.53
139 0.5
140 0.45
141 0.41
142 0.42
143 0.4
144 0.41
145 0.38
146 0.35
147 0.33
148 0.33
149 0.28
150 0.23
151 0.2
152 0.17
153 0.22
154 0.22
155 0.22
156 0.23
157 0.22
158 0.2
159 0.21
160 0.19
161 0.14
162 0.13
163 0.15
164 0.16
165 0.14
166 0.18
167 0.17
168 0.17
169 0.16
170 0.18
171 0.16
172 0.14
173 0.13
174 0.09
175 0.08
176 0.07
177 0.07
178 0.05
179 0.05
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.11
185 0.11
186 0.12
187 0.15
188 0.13
189 0.13
190 0.13
191 0.13
192 0.11
193 0.1
194 0.1
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.11
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.06
225 0.08
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.13
230 0.14
231 0.18
232 0.19
233 0.18
234 0.2
235 0.21
236 0.21
237 0.18
238 0.2
239 0.19
240 0.19
241 0.18
242 0.15
243 0.15
244 0.15
245 0.16
246 0.14
247 0.12
248 0.12
249 0.13
250 0.15
251 0.16
252 0.2
253 0.19
254 0.24
255 0.24
256 0.24
257 0.23
258 0.24
259 0.23
260 0.2
261 0.2
262 0.14
263 0.13
264 0.13
265 0.12
266 0.09
267 0.08
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.1
274 0.1
275 0.11
276 0.12
277 0.11
278 0.12
279 0.12
280 0.15
281 0.19
282 0.2
283 0.2
284 0.21
285 0.22
286 0.2
287 0.2
288 0.18
289 0.18
290 0.22
291 0.21
292 0.2
293 0.22
294 0.23
295 0.24
296 0.28
297 0.24
298 0.24
299 0.24
300 0.24
301 0.23
302 0.23
303 0.2
304 0.19
305 0.21
306 0.18
307 0.19
308 0.22
309 0.22
310 0.25
311 0.28
312 0.28
313 0.28
314 0.32
315 0.31
316 0.31
317 0.33
318 0.29
319 0.31
320 0.33
321 0.33
322 0.3
323 0.28
324 0.27
325 0.23
326 0.23
327 0.18
328 0.11
329 0.08
330 0.06
331 0.06
332 0.05
333 0.05
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.06
339 0.07
340 0.1
341 0.12
342 0.15
343 0.19
344 0.21
345 0.24
346 0.25
347 0.24
348 0.26
349 0.28
350 0.28
351 0.28
352 0.28
353 0.31
354 0.38