FuNGI

A0A060S2N0

Protein Details

Accession

A0A060S2N0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
444-466	NGPSIARDRPRRENRQRPACYRE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
436-446	PRPAHRRNRHQ
458-463	RDRPRR

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 9.5, cyto 5.5, pero 5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR013103 RVT_2
Pfam	View protein in Pfam PF07727 RVT_2
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MSSEPEGVWPGFSARRIRVPIVDPTTPTRPAGSQPLLDVSTQSPLAESNAGTPEAGPSRLPGAPLLGFPQPTSVNPPIDPSGNPRTSPNNPFVTPSRQSPQPAAPVPEARDLPPHLPDPAPASTSDPQRDLAQAMLLLAQTLRLTQAASAAPSGTPSSSSERHNVREPDQFDGSDPSKLRSFFTQLELVFKARPRTFDTDEKKVTYAISYLKGMALAWFEPYLLERDLGNPLEFLYSYAVFQXXXXXXXXVEAAVHIYNRQPMRRLKWRCPITAWDGTVPDVSYFRVFGCKAFVHVQKAKREGKLDKKAVEMIFVGYEPGTKGYKFWNPATRSIVVSRDVIFDEESFPARSIPGYRRVTPSDNPFPEHEGRSDDVSNSDSGDLPSIPIPLPPDPSEDRPPSPPPAPPAPVEDEPPQPPLQPPQPPPEPNHPAVPPPRPAHRRNRHQPVGGSNGPSIARDRPRRENRQRPACYREDNVYGDRDPVDVERQSIEDGDELEAQAIRFVLASQYKTGLPNSHRDAMKSPDADKWRAAEKVEYDSLMENKTWVLVPRPKDRQVVANRWVYDIKHDGRYKARLVAKGFTQVWGEDYHETFSPVARFESIRYLLAHAALEDWDIESMDVKTAFLNGDLEEEIYMEQPEGWVVRGKEDYVCLLKKAIYGLKPASRQWNLKIHKSLLDLGFTRTYSDAGVYVYRRQGGDKVMIVVLYVDDLLLLGDDRKHIKQIKDALKKQYKMTDLGAVKRFLGLRISCDRTIHRIEIDQEEYIQSVIERFDMADCKPARTPLPAGAVLESSKQPEPASDSFRQRYQSLIGSLLYAALGTRPDIDFAVNKLSKYNSNPSEAHWHYAKYVLRYLQGTKQLRLRYDGASNDGLLSYSDSDWAEDRDDRKSITGFVFLMAGGAISWASRRQHTISLSSTEAEYKAASDTCRQISWLRTFGDELGDDMSRPTPMCLDNQGSIFLGVNPVVDRRTKHIDVRHHYIREQIELGKVEVFFVATEDQLANPLTKNVPFSIVECFRDRVGLVDPTA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.37
3	0.41
4	0.44
5	0.46
6	0.46
7	0.51
8	0.51
9	0.5
10	0.45
11	0.47
12	0.5
13	0.46
14	0.43
15	0.36
16	0.31
17	0.33
18	0.39
19	0.37
20	0.33
21	0.32
22	0.36
23	0.34
24	0.32
25	0.3
26	0.22
27	0.21
28	0.2
29	0.18
30	0.14
31	0.13
32	0.15
33	0.15
34	0.14
35	0.14
36	0.17
37	0.17
38	0.17
39	0.16
40	0.19
41	0.19
42	0.2
43	0.17
44	0.15
45	0.19
46	0.2
47	0.21
48	0.17
49	0.18
50	0.18
51	0.19
52	0.21
53	0.2
54	0.19
55	0.18
56	0.22
57	0.2
58	0.2
59	0.27
60	0.29
61	0.29
62	0.28
63	0.33
64	0.31
65	0.32
66	0.32
67	0.31
68	0.36
69	0.36
70	0.37
71	0.37
72	0.42
73	0.47
74	0.52
75	0.52
76	0.48
77	0.46
78	0.49
79	0.51
80	0.51
81	0.47
82	0.48
83	0.46
84	0.45
85	0.47
86	0.47
87	0.48
88	0.49
89	0.49
90	0.48
91	0.47
92	0.47
93	0.47
94	0.48
95	0.44
96	0.36
97	0.37
98	0.36
99	0.34
100	0.33
101	0.32
102	0.28
103	0.27
104	0.27
105	0.27
106	0.26
107	0.24
108	0.21
109	0.25
110	0.27
111	0.34
112	0.36
113	0.33
114	0.32
115	0.32
116	0.33
117	0.28
118	0.24
119	0.18
120	0.14
121	0.13
122	0.12
123	0.1
124	0.09
125	0.08
126	0.08
127	0.06
128	0.06
129	0.07
130	0.06
131	0.07
132	0.07
133	0.11
134	0.11
135	0.12
136	0.12
137	0.12
138	0.11
139	0.13
140	0.14
141	0.1
142	0.1
143	0.12
144	0.18
145	0.21
146	0.24
147	0.3
148	0.35
149	0.39
150	0.46
151	0.48
152	0.46
153	0.51
154	0.49
155	0.48
156	0.45
157	0.41
158	0.34
159	0.36
160	0.33
161	0.3
162	0.29
163	0.27
164	0.28
165	0.28
166	0.29
167	0.27
168	0.31
169	0.28
170	0.31
171	0.33
172	0.3
173	0.33
174	0.33
175	0.3
176	0.28
177	0.28
178	0.33
179	0.29
180	0.32
181	0.34
182	0.4
183	0.44
184	0.51
185	0.55
186	0.56
187	0.58
188	0.57
189	0.52
190	0.45
191	0.39
192	0.3
193	0.26
194	0.21
195	0.19
196	0.18
197	0.18
198	0.17
199	0.17
200	0.16
201	0.14
202	0.12
203	0.09
204	0.1
205	0.09
206	0.09
207	0.09
208	0.1
209	0.12
210	0.11
211	0.11
212	0.1
213	0.12
214	0.16
215	0.17
216	0.16
217	0.13
218	0.13
219	0.13
220	0.13
221	0.12
222	0.11
223	0.1
224	0.1
225	0.1
226	0.1
227	0.09
228	0.09
229	0.09
230	0.06
231	0.06
232	0.08
233	0.08
234	0.07
235	0.1
236	0.11
237	0.16
238	0.19
239	0.21
240	0.26
241	0.33
242	0.42
243	0.5
244	0.57
245	0.6
246	0.67
247	0.72
248	0.68
249	0.65
250	0.63
251	0.6
252	0.58
253	0.5
254	0.42
255	0.36
256	0.34
257	0.3
258	0.25
259	0.18
260	0.12
261	0.12
262	0.1
263	0.1
264	0.09
265	0.13
266	0.12
267	0.12
268	0.16
269	0.15
270	0.18
271	0.24
272	0.27
273	0.31
274	0.37
275	0.43
276	0.45
277	0.53
278	0.55
279	0.53
280	0.56
281	0.56
282	0.61
283	0.65
284	0.64
285	0.58
286	0.55
287	0.57
288	0.5
289	0.44
290	0.33
291	0.24
292	0.18
293	0.16
294	0.14
295	0.08
296	0.08
297	0.07
298	0.09
299	0.09
300	0.09
301	0.1
302	0.14
303	0.2
304	0.24
305	0.29
306	0.36
307	0.38
308	0.43
309	0.47
310	0.43
311	0.4
312	0.38
313	0.35
314	0.28
315	0.26
316	0.22
317	0.19
318	0.17
319	0.16
320	0.14
321	0.12
322	0.12
323	0.12
324	0.13
325	0.12
326	0.12
327	0.11
328	0.1
329	0.11
330	0.13
331	0.16
332	0.24
333	0.28
334	0.31
335	0.35
336	0.39
337	0.43
338	0.43
339	0.48
340	0.48
341	0.45
342	0.45
343	0.41
344	0.43
345	0.41
346	0.38
347	0.31
348	0.25
349	0.24
350	0.24
351	0.24
352	0.19
353	0.17
354	0.16
355	0.15
356	0.12
357	0.12
358	0.09
359	0.09
360	0.09
361	0.08
362	0.08
363	0.08
364	0.09
365	0.08
366	0.08
367	0.11
368	0.11
369	0.14
370	0.14
371	0.18
372	0.2
373	0.25
374	0.31
375	0.32
376	0.33
377	0.34
378	0.36
379	0.36
380	0.35
381	0.33
382	0.31
383	0.33
384	0.33
385	0.3
386	0.3
387	0.31
388	0.3
389	0.31
390	0.29
391	0.27
392	0.26
393	0.28
394	0.25
395	0.2
396	0.2
397	0.21
398	0.24
399	0.28
400	0.3
401	0.34
402	0.4
403	0.42
404	0.46
405	0.5
406	0.5
407	0.45
408	0.46
409	0.4
410	0.38
411	0.41
412	0.41
413	0.38
414	0.35
415	0.42
416	0.45
417	0.51
418	0.57
419	0.62
420	0.69
421	0.72
422	0.8
423	0.77
424	0.74
425	0.7
426	0.64
427	0.61
428	0.52
429	0.44
430	0.33
431	0.29
432	0.25
433	0.23
434	0.2
435	0.17
436	0.23
437	0.29
438	0.34
439	0.43
440	0.52
441	0.63
442	0.72
443	0.78
444	0.8
445	0.83
446	0.85
447	0.8
448	0.77
449	0.71
450	0.64
451	0.56
452	0.49
453	0.42
454	0.38
455	0.33
456	0.29
457	0.24
458	0.21
459	0.19
460	0.16
461	0.12
462	0.11
463	0.12
464	0.1
465	0.1
466	0.1
467	0.1
468	0.1
469	0.1
470	0.09
471	0.07
472	0.07
473	0.07
474	0.07
475	0.06
476	0.06
477	0.07
478	0.06
479	0.06
480	0.05
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.06
485	0.07
486	0.08
487	0.09
488	0.1
489	0.11
490	0.12
491	0.13
492	0.15
493	0.15
494	0.21
495	0.24
496	0.29
497	0.28
498	0.28
499	0.3
500	0.29
501	0.32
502	0.27
503	0.25
504	0.25
505	0.28
506	0.28
507	0.27
508	0.24
509	0.23
510	0.23
511	0.22
512	0.18
513	0.16
514	0.19
515	0.18
516	0.17
517	0.14
518	0.14
519	0.15
520	0.14
521	0.12
522	0.08
523	0.07
524	0.08
525	0.08
526	0.07
527	0.12
528	0.16
529	0.21
530	0.29
531	0.35
532	0.38
533	0.41
534	0.41
535	0.44
536	0.47
537	0.49
538	0.47
539	0.46
540	0.43
541	0.42
542	0.42
543	0.33
544	0.29
545	0.27
546	0.24
547	0.26
548	0.27
549	0.29
550	0.32
551	0.35
552	0.34
553	0.35
554	0.37
555	0.33
556	0.34
557	0.34
558	0.3
559	0.33
560	0.31
561	0.25
562	0.22
563	0.17
564	0.16
565	0.15
566	0.15
567	0.11
568	0.11
569	0.11
570	0.11
571	0.12
572	0.11
573	0.11
574	0.1
575	0.1
576	0.1
577	0.1
578	0.1
579	0.1
580	0.15
581	0.15
582	0.16
583	0.15
584	0.16
585	0.15
586	0.16
587	0.15
588	0.09
589	0.08
590	0.07
591	0.07
592	0.05
593	0.05
594	0.04
595	0.04
596	0.04
597	0.05
598	0.05
599	0.06
600	0.06
601	0.06
602	0.06
603	0.06
604	0.06
605	0.06
606	0.07
607	0.06
608	0.07
609	0.07
610	0.07
611	0.06
612	0.06
613	0.06
614	0.06
615	0.06
616	0.05
617	0.04
618	0.04
619	0.05
620	0.05
621	0.05
622	0.08
623	0.08
624	0.11
625	0.12
626	0.13
627	0.13
628	0.14
629	0.15
630	0.16
631	0.17
632	0.15
633	0.15
634	0.15
635	0.15
636	0.17
637	0.19
638	0.16
639	0.19
640	0.23
641	0.27
642	0.29
643	0.3
644	0.36
645	0.37
646	0.38
647	0.4
648	0.46
649	0.45
650	0.49
651	0.51
652	0.45
653	0.44
654	0.43
655	0.42
656	0.33
657	0.32
658	0.26
659	0.24
660	0.24
661	0.2
662	0.19
663	0.15
664	0.14
665	0.11
666	0.11
667	0.09
668	0.08
669	0.11
670	0.11
671	0.14
672	0.15
673	0.17
674	0.17
675	0.17
676	0.19
677	0.19
678	0.21
679	0.19
680	0.18
681	0.17
682	0.16
683	0.15
684	0.13
685	0.1
686	0.06
687	0.05
688	0.03
689	0.03
690	0.03
691	0.03
692	0.03
693	0.03
694	0.03
695	0.04
696	0.07
697	0.1
698	0.11
699	0.17
700	0.23
701	0.25
702	0.31
703	0.4
704	0.49
705	0.56
706	0.62
707	0.66
708	0.69
709	0.7
710	0.67
711	0.64
712	0.56
713	0.49
714	0.45
715	0.42
716	0.37
717	0.41
718	0.41
719	0.35
720	0.32
721	0.31
722	0.3
723	0.22
724	0.25
725	0.19
726	0.2
727	0.26
728	0.32
729	0.3
730	0.32
731	0.33
732	0.33
733	0.37
734	0.34
735	0.28
736	0.26
737	0.28
738	0.31
739	0.31
740	0.26
741	0.22
742	0.2
743	0.19
744	0.16
745	0.13
746	0.08
747	0.06
748	0.06
749	0.06
750	0.06
751	0.06
752	0.08
753	0.1
754	0.11
755	0.18
756	0.18
757	0.21
758	0.22
759	0.25
760	0.25
761	0.26
762	0.28
763	0.26
764	0.3
765	0.28
766	0.28
767	0.26
768	0.25
769	0.22
770	0.21
771	0.17
772	0.15
773	0.15
774	0.15
775	0.14
776	0.15
777	0.21
778	0.23
779	0.29
780	0.32
781	0.39
782	0.41
783	0.45
784	0.47
785	0.4
786	0.39
787	0.35
788	0.33
789	0.27
790	0.26
791	0.22
792	0.19
793	0.19
794	0.17
795	0.13
796	0.08
797	0.06
798	0.05
799	0.05
800	0.05
801	0.07
802	0.07
803	0.08
804	0.09
805	0.11
806	0.11
807	0.13
808	0.22
809	0.22
810	0.22
811	0.23
812	0.25
813	0.28
814	0.32
815	0.4
816	0.34
817	0.39
818	0.39
819	0.4
820	0.48
821	0.45
822	0.44
823	0.36
824	0.34
825	0.29
826	0.35
827	0.34
828	0.28
829	0.31
830	0.29
831	0.31
832	0.32
833	0.35
834	0.36
835	0.42
836	0.43
837	0.41
838	0.46
839	0.47
840	0.46
841	0.48
842	0.44
843	0.38
844	0.39
845	0.37
846	0.35
847	0.32
848	0.3
849	0.25
850	0.22
851	0.19
852	0.14
853	0.13
854	0.11
855	0.09
856	0.11
857	0.11
858	0.12
859	0.13
860	0.14
861	0.16
862	0.18
863	0.2
864	0.22
865	0.24
866	0.24
867	0.25
868	0.25
869	0.25
870	0.22
871	0.24
872	0.2
873	0.18
874	0.18
875	0.15
876	0.14
877	0.1
878	0.08
879	0.05
880	0.05
881	0.04
882	0.04
883	0.05
884	0.1
885	0.12
886	0.15
887	0.19
888	0.22
889	0.29
890	0.32
891	0.36
892	0.36
893	0.37
894	0.37
895	0.33
896	0.31
897	0.26
898	0.24
899	0.19
900	0.15
901	0.12
902	0.13
903	0.14
904	0.15
905	0.18
906	0.23
907	0.26
908	0.26
909	0.27
910	0.29
911	0.34
912	0.39
913	0.39
914	0.35
915	0.34
916	0.35
917	0.34
918	0.33
919	0.26
920	0.2
921	0.18
922	0.16
923	0.15
924	0.15
925	0.15
926	0.13
927	0.13
928	0.13
929	0.14
930	0.15
931	0.18
932	0.23
933	0.26
934	0.28
935	0.28
936	0.29
937	0.26
938	0.25
939	0.22
940	0.17
941	0.14
942	0.11
943	0.12
944	0.11
945	0.12
946	0.14
947	0.17
948	0.19
949	0.23
950	0.32
951	0.36
952	0.42
953	0.48
954	0.57
955	0.61
956	0.68
957	0.71
958	0.66
959	0.62
960	0.62
961	0.57
962	0.51
963	0.46
964	0.39
965	0.35
966	0.33
967	0.34
968	0.29
969	0.26
970	0.22
971	0.19
972	0.17
973	0.12
974	0.12
975	0.12
976	0.09
977	0.1
978	0.1
979	0.1
980	0.12
981	0.13
982	0.13
983	0.12
984	0.16
985	0.17
986	0.19
987	0.22
988	0.21
989	0.24
990	0.24
991	0.24
992	0.3
993	0.33
994	0.35
995	0.35
996	0.36
997	0.32
998	0.33
999	0.32
1000	0.25
1001	0.25

A0A060S2N0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer