Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A060SP27

Protein Details
Accession A0A060SP27    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
238-266SSQQQQQKGKARRGKRKSRKSLDNDHAHLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
202-219SRKIGEAKKLSAIKRKGK
245-257KGKARRGKRKSRK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.333, cyto 6, cyto_mito 4.833, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025314  DUF4219  
Pfam View protein in Pfam  
PF13961  DUF4219  
PF14223  Retrotran_gag_2  
Amino Acid Sequences MSNSLQNLIPILDGSNYQRWAELMKAYLQQQEVWFVVNLPAGITAPTLAEDGSNRNNVITWNQMQSKAMGSIRLRLNDEVAKLVKDKTTAKEVWEELKSLYSTTSALGAYSFYKAAANTRIPANEHPGPAIAKIQGNLDQLASAGIDVPMNLRALIILDAAPPRYETAIQLVLNDNELNDLSTSAVREALVASWEASVTRGSRKIGEAKKLSAIKRKGKEPTFKQQQQQQRRQNGDGSSQQQQQKGKARRGKRKSRKSLDNDHAHLVSTATISDGPTSTVDPRALLRKPVRVNGPEGESKYPTLKRAFNLAHDLDVTPTPERIRALEGVVKSVDKGENASRIVKVSWDTGSADSHSSKRTRLTLAERIDWTEQDDDAESIVSLGDEGDDVDMDIAQAAGLYEQYDGQVRSVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.21
3 0.23
4 0.23
5 0.23
6 0.22
7 0.24
8 0.24
9 0.22
10 0.19
11 0.21
12 0.25
13 0.27
14 0.31
15 0.3
16 0.3
17 0.28
18 0.3
19 0.26
20 0.24
21 0.21
22 0.17
23 0.18
24 0.16
25 0.15
26 0.11
27 0.12
28 0.1
29 0.1
30 0.09
31 0.08
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.09
38 0.13
39 0.18
40 0.2
41 0.19
42 0.19
43 0.2
44 0.21
45 0.22
46 0.24
47 0.23
48 0.27
49 0.3
50 0.32
51 0.32
52 0.31
53 0.3
54 0.28
55 0.26
56 0.25
57 0.23
58 0.29
59 0.33
60 0.35
61 0.36
62 0.32
63 0.35
64 0.32
65 0.32
66 0.29
67 0.26
68 0.24
69 0.22
70 0.23
71 0.21
72 0.22
73 0.25
74 0.25
75 0.31
76 0.31
77 0.32
78 0.36
79 0.36
80 0.38
81 0.35
82 0.32
83 0.25
84 0.27
85 0.25
86 0.19
87 0.18
88 0.13
89 0.12
90 0.11
91 0.12
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.1
98 0.09
99 0.08
100 0.09
101 0.09
102 0.12
103 0.17
104 0.18
105 0.18
106 0.21
107 0.22
108 0.24
109 0.25
110 0.3
111 0.28
112 0.26
113 0.25
114 0.24
115 0.23
116 0.21
117 0.21
118 0.16
119 0.13
120 0.13
121 0.15
122 0.17
123 0.17
124 0.17
125 0.15
126 0.13
127 0.12
128 0.11
129 0.09
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.06
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.1
155 0.14
156 0.13
157 0.14
158 0.15
159 0.14
160 0.15
161 0.14
162 0.11
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.06
186 0.09
187 0.11
188 0.11
189 0.13
190 0.15
191 0.23
192 0.26
193 0.33
194 0.32
195 0.32
196 0.37
197 0.41
198 0.42
199 0.41
200 0.45
201 0.46
202 0.48
203 0.53
204 0.55
205 0.57
206 0.63
207 0.61
208 0.64
209 0.66
210 0.68
211 0.66
212 0.66
213 0.69
214 0.71
215 0.75
216 0.73
217 0.71
218 0.7
219 0.67
220 0.64
221 0.56
222 0.49
223 0.45
224 0.39
225 0.36
226 0.37
227 0.38
228 0.38
229 0.38
230 0.4
231 0.45
232 0.49
233 0.53
234 0.55
235 0.61
236 0.68
237 0.76
238 0.81
239 0.83
240 0.86
241 0.88
242 0.9
243 0.91
244 0.88
245 0.88
246 0.86
247 0.83
248 0.75
249 0.66
250 0.57
251 0.47
252 0.39
253 0.29
254 0.2
255 0.11
256 0.08
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.09
265 0.1
266 0.12
267 0.12
268 0.12
269 0.14
270 0.19
271 0.2
272 0.26
273 0.29
274 0.35
275 0.38
276 0.43
277 0.47
278 0.44
279 0.47
280 0.42
281 0.43
282 0.39
283 0.39
284 0.37
285 0.31
286 0.3
287 0.32
288 0.31
289 0.31
290 0.32
291 0.33
292 0.31
293 0.39
294 0.39
295 0.37
296 0.41
297 0.37
298 0.33
299 0.3
300 0.29
301 0.22
302 0.21
303 0.2
304 0.13
305 0.14
306 0.14
307 0.15
308 0.16
309 0.15
310 0.18
311 0.17
312 0.19
313 0.22
314 0.22
315 0.22
316 0.22
317 0.21
318 0.18
319 0.19
320 0.18
321 0.13
322 0.16
323 0.18
324 0.22
325 0.24
326 0.26
327 0.24
328 0.25
329 0.24
330 0.23
331 0.21
332 0.19
333 0.18
334 0.17
335 0.18
336 0.18
337 0.2
338 0.19
339 0.2
340 0.2
341 0.22
342 0.26
343 0.26
344 0.28
345 0.31
346 0.34
347 0.35
348 0.39
349 0.45
350 0.48
351 0.51
352 0.54
353 0.51
354 0.5
355 0.48
356 0.41
357 0.37
358 0.3
359 0.24
360 0.2
361 0.19
362 0.15
363 0.14
364 0.14
365 0.1
366 0.08
367 0.08
368 0.06
369 0.05
370 0.05
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.08
391 0.12
392 0.12