FuNGI

A0A060S6N9

Protein Details

Accession

A0A060S6N9

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
372-395	SMSPTSRRRCQKRLYMRRKRAQAA	Hydrophilic
401-425	ENATRLKPGRKPKPRPPPRKDAARA	Basic
780-805	AGETVTRTRKRKLRPRGRSKSVAAGV	Hydrophilic
823-848	GEREGTVERRVRRRKAKGIAHLNEDQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
174-181	RARKGEAR
187-196	RDREGQRRRR
388-393	RRKRAQ
402-422	NATRLKPGRKPKPRPPPRKDA
787-799	TRKRKLRPRGRSK
831-839	RRVRRRKAK

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039601 Rrn5
Gene Ontology	GO:0000500 C:RNA polymerase I upstream activating factor complex GO:0042790 P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I

Amino Acid Sequences

MPNSDDEEETAPEVDPAYLSFYSDHVDDFKAHLAGTDGHQSLPPSYFPPNAHWTATEKDAFFHALAVHSRLRPDLIAEEVKTKSVPDVCVYLALLDQASREASHQTIYVGAEHKRKDPRIARKDLPIALEVPEDWVKQEEAMAESVAASEPILEHQSLLSERDEIIQLQRKSLRARKGEARTSSNDRDREGQRRRRREFEVWLTEAKARWTAEDHWRTLDHTSLSALDRMLREDEDGHAIPVDTLGCGGEGEDKLLGSAGPPTNSLLPFAIGEELIDPQLLEISRAPSVASSRPSPESPLVHSSLNPDDTTHSVAGPSSLHKLSFQSQPSTPPFPPTSNIAEPDSVPALPQPACTTPRSVVDNAEEELDLASMSPTSRRRCQKRLYMRRKRAQAAGVAANENATRLKPGRKPKPRPPPRKDAARAESQTIQDESFMTIDQALQGPSGAPEGAEYRHPKVSGKTRPYRRQVQFAAIGIDAQRLRQEGVGLFHLQSLGKLMQTYNQLHDVPSGVASKISLETVRLLHAIVVQFVAEVMSRSIVSREQERIAKLQTKVWHFKENLNISAANVKHALALYGADSLDKRAHFAGLLAKLGLEGDDSGDSEGEADDEHAADPTSSPDAALRSLGDAGAAYAEQDAIADLEDDDGPVLQPLPALRMIFPPFSDLSSLSAHASDERDVDTPDPAAYMPWPSSLLSTDAEPPGEDELLPETVDETALVAELLDEENIDKHDRSREVEEAKALWARFEGRKPAAPALGPTAEGAPAEAATEEKPAAPLTAGETVTRTRKRKLRPRGRSKSVAAGVEDGAGFGAEGDRGAGDGGEREGTVERRVRRRKAKGIAHLNEDQLRFMEPDPNGPIKSSVYIVDSD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.1
3	0.09
4	0.13
5	0.12
6	0.13
7	0.13
8	0.13
9	0.15
10	0.15
11	0.16
12	0.13
13	0.15
14	0.15
15	0.17
16	0.2
17	0.18
18	0.18
19	0.17
20	0.17
21	0.17
22	0.19
23	0.24
24	0.21
25	0.21
26	0.23
27	0.23
28	0.23
29	0.24
30	0.22
31	0.18
32	0.22
33	0.26
34	0.27
35	0.32
36	0.37
37	0.38
38	0.38
39	0.37
40	0.37
41	0.36
42	0.39
43	0.37
44	0.3
45	0.27
46	0.28
47	0.28
48	0.24
49	0.22
50	0.17
51	0.17
52	0.18
53	0.21
54	0.24
55	0.23
56	0.24
57	0.24
58	0.24
59	0.21
60	0.22
61	0.2
62	0.22
63	0.24
64	0.24
65	0.28
66	0.27
67	0.28
68	0.26
69	0.24
70	0.23
71	0.23
72	0.23
73	0.21
74	0.23
75	0.22
76	0.23
77	0.23
78	0.19
79	0.15
80	0.13
81	0.11
82	0.09
83	0.08
84	0.08
85	0.08
86	0.08
87	0.09
88	0.11
89	0.12
90	0.13
91	0.13
92	0.12
93	0.14
94	0.14
95	0.16
96	0.18
97	0.22
98	0.28
99	0.29
100	0.36
101	0.43
102	0.46
103	0.52
104	0.58
105	0.65
106	0.68
107	0.75
108	0.72
109	0.72
110	0.75
111	0.68
112	0.61
113	0.52
114	0.43
115	0.35
116	0.31
117	0.22
118	0.2
119	0.19
120	0.16
121	0.15
122	0.16
123	0.15
124	0.14
125	0.15
126	0.12
127	0.12
128	0.13
129	0.12
130	0.1
131	0.1
132	0.1
133	0.09
134	0.07
135	0.05
136	0.04
137	0.05
138	0.06
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.08
143	0.11
144	0.12
145	0.14
146	0.13
147	0.12
148	0.12
149	0.14
150	0.15
151	0.13
152	0.19
153	0.26
154	0.26
155	0.3
156	0.33
157	0.36
158	0.43
159	0.5
160	0.52
161	0.49
162	0.55
163	0.59
164	0.65
165	0.69
166	0.67
167	0.65
168	0.62
169	0.65
170	0.67
171	0.65
172	0.58
173	0.52
174	0.53
175	0.54
176	0.58
177	0.6
178	0.62
179	0.65
180	0.74
181	0.78
182	0.78
183	0.8
184	0.76
185	0.76
186	0.75
187	0.72
188	0.65
189	0.6
190	0.54
191	0.49
192	0.43
193	0.34
194	0.28
195	0.2
196	0.18
197	0.2
198	0.23
199	0.32
200	0.36
201	0.36
202	0.35
203	0.35
204	0.36
205	0.33
206	0.32
207	0.22
208	0.17
209	0.16
210	0.16
211	0.16
212	0.16
213	0.15
214	0.14
215	0.14
216	0.15
217	0.16
218	0.14
219	0.14
220	0.13
221	0.15
222	0.16
223	0.16
224	0.15
225	0.13
226	0.13
227	0.12
228	0.11
229	0.1
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.04
234	0.04
235	0.05
236	0.07
237	0.07
238	0.08
239	0.08
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.07
244	0.04
245	0.1
246	0.1
247	0.11
248	0.12
249	0.13
250	0.16
251	0.16
252	0.17
253	0.12
254	0.11
255	0.11
256	0.11
257	0.1
258	0.07
259	0.07
260	0.06
261	0.07
262	0.06
263	0.06
264	0.05
265	0.04
266	0.06
267	0.06
268	0.07
269	0.07
270	0.09
271	0.1
272	0.1
273	0.1
274	0.09
275	0.12
276	0.14
277	0.16
278	0.16
279	0.19
280	0.22
281	0.22
282	0.25
283	0.26
284	0.25
285	0.26
286	0.28
287	0.27
288	0.25
289	0.24
290	0.24
291	0.23
292	0.23
293	0.19
294	0.16
295	0.15
296	0.16
297	0.19
298	0.16
299	0.13
300	0.11
301	0.11
302	0.11
303	0.1
304	0.1
305	0.11
306	0.11
307	0.11
308	0.12
309	0.14
310	0.17
311	0.23
312	0.24
313	0.24
314	0.24
315	0.3
316	0.34
317	0.37
318	0.33
319	0.32
320	0.32
321	0.3
322	0.31
323	0.29
324	0.31
325	0.27
326	0.29
327	0.26
328	0.24
329	0.22
330	0.22
331	0.19
332	0.13
333	0.11
334	0.09
335	0.1
336	0.09
337	0.1
338	0.1
339	0.12
340	0.15
341	0.16
342	0.18
343	0.17
344	0.21
345	0.24
346	0.22
347	0.21
348	0.2
349	0.21
350	0.19
351	0.18
352	0.14
353	0.11
354	0.1
355	0.09
356	0.06
357	0.04
358	0.04
359	0.03
360	0.04
361	0.08
362	0.13
363	0.18
364	0.25
365	0.35
366	0.43
367	0.5
368	0.58
369	0.64
370	0.71
371	0.78
372	0.82
373	0.84
374	0.86
375	0.86
376	0.86
377	0.79
378	0.72
379	0.63
380	0.55
381	0.48
382	0.41
383	0.35
384	0.28
385	0.24
386	0.2
387	0.17
388	0.14
389	0.1
390	0.06
391	0.07
392	0.09
393	0.15
394	0.21
395	0.32
396	0.42
397	0.52
398	0.62
399	0.7
400	0.79
401	0.84
402	0.89
403	0.86
404	0.86
405	0.81
406	0.83
407	0.78
408	0.76
409	0.69
410	0.66
411	0.6
412	0.52
413	0.49
414	0.39
415	0.35
416	0.27
417	0.22
418	0.14
419	0.13
420	0.11
421	0.08
422	0.07
423	0.06
424	0.05
425	0.05
426	0.05
427	0.05
428	0.05
429	0.04
430	0.04
431	0.04
432	0.04
433	0.05
434	0.04
435	0.03
436	0.04
437	0.05
438	0.06
439	0.1
440	0.12
441	0.14
442	0.17
443	0.17
444	0.18
445	0.22
446	0.31
447	0.36
448	0.43
449	0.5
450	0.58
451	0.66
452	0.71
453	0.77
454	0.7
455	0.69
456	0.62
457	0.58
458	0.51
459	0.43
460	0.38
461	0.27
462	0.24
463	0.16
464	0.17
465	0.12
466	0.09
467	0.09
468	0.08
469	0.09
470	0.09
471	0.1
472	0.08
473	0.1
474	0.11
475	0.12
476	0.11
477	0.11
478	0.11
479	0.1
480	0.09
481	0.09
482	0.08
483	0.07
484	0.08
485	0.07
486	0.1
487	0.16
488	0.17
489	0.17
490	0.19
491	0.19
492	0.19
493	0.2
494	0.17
495	0.12
496	0.12
497	0.12
498	0.08
499	0.08
500	0.08
501	0.08
502	0.07
503	0.08
504	0.07
505	0.06
506	0.08
507	0.08
508	0.09
509	0.09
510	0.08
511	0.08
512	0.1
513	0.09
514	0.08
515	0.08
516	0.06
517	0.06
518	0.06
519	0.06
520	0.04
521	0.04
522	0.04
523	0.04
524	0.05
525	0.05
526	0.06
527	0.08
528	0.1
529	0.13
530	0.16
531	0.18
532	0.22
533	0.23
534	0.25
535	0.27
536	0.31
537	0.29
538	0.31
539	0.33
540	0.37
541	0.43
542	0.44
543	0.47
544	0.43
545	0.46
546	0.5
547	0.48
548	0.43
549	0.37
550	0.34
551	0.27
552	0.31
553	0.27
554	0.2
555	0.16
556	0.14
557	0.13
558	0.13
559	0.13
560	0.07
561	0.08
562	0.06
563	0.07
564	0.07
565	0.06
566	0.07
567	0.08
568	0.11
569	0.1
570	0.11
571	0.11
572	0.11
573	0.11
574	0.12
575	0.16
576	0.14
577	0.15
578	0.13
579	0.13
580	0.12
581	0.12
582	0.11
583	0.05
584	0.04
585	0.04
586	0.05
587	0.05
588	0.06
589	0.06
590	0.05
591	0.05
592	0.05
593	0.04
594	0.04
595	0.04
596	0.04
597	0.05
598	0.05
599	0.05
600	0.05
601	0.05
602	0.06
603	0.07
604	0.08
605	0.08
606	0.08
607	0.09
608	0.1
609	0.1
610	0.11
611	0.09
612	0.09
613	0.09
614	0.09
615	0.07
616	0.06
617	0.06
618	0.05
619	0.05
620	0.04
621	0.04
622	0.04
623	0.03
624	0.04
625	0.04
626	0.03
627	0.04
628	0.04
629	0.04
630	0.05
631	0.05
632	0.05
633	0.05
634	0.05
635	0.05
636	0.05
637	0.05
638	0.04
639	0.05
640	0.05
641	0.08
642	0.1
643	0.11
644	0.11
645	0.16
646	0.18
647	0.19
648	0.19
649	0.19
650	0.18
651	0.18
652	0.19
653	0.15
654	0.15
655	0.15
656	0.16
657	0.13
658	0.13
659	0.13
660	0.13
661	0.14
662	0.12
663	0.12
664	0.13
665	0.13
666	0.14
667	0.14
668	0.14
669	0.13
670	0.12
671	0.11
672	0.09
673	0.09
674	0.09
675	0.11
676	0.1
677	0.1
678	0.12
679	0.11
680	0.13
681	0.13
682	0.15
683	0.13
684	0.14
685	0.16
686	0.16
687	0.16
688	0.15
689	0.15
690	0.14
691	0.14
692	0.12
693	0.09
694	0.11
695	0.11
696	0.11
697	0.1
698	0.09
699	0.08
700	0.08
701	0.08
702	0.05
703	0.05
704	0.05
705	0.05
706	0.04
707	0.04
708	0.04
709	0.05
710	0.04
711	0.04
712	0.05
713	0.06
714	0.08
715	0.11
716	0.11
717	0.13
718	0.2
719	0.23
720	0.27
721	0.31
722	0.37
723	0.38
724	0.4
725	0.4
726	0.34
727	0.34
728	0.34
729	0.28
730	0.22
731	0.19
732	0.22
733	0.24
734	0.28
735	0.34
736	0.34
737	0.39
738	0.43
739	0.45
740	0.43
741	0.39
742	0.36
743	0.34
744	0.31
745	0.25
746	0.22
747	0.19
748	0.16
749	0.15
750	0.14
751	0.08
752	0.07
753	0.07
754	0.07
755	0.07
756	0.07
757	0.09
758	0.09
759	0.09
760	0.1
761	0.1
762	0.11
763	0.1
764	0.1
765	0.12
766	0.17
767	0.17
768	0.16
769	0.18
770	0.22
771	0.31
772	0.39
773	0.4
774	0.43
775	0.51
776	0.61
777	0.7
778	0.77
779	0.79
780	0.82
781	0.89
782	0.92
783	0.93
784	0.9
785	0.84
786	0.83
787	0.77
788	0.69
789	0.59
790	0.5
791	0.42
792	0.34
793	0.3
794	0.19
795	0.13
796	0.1
797	0.08
798	0.05
799	0.06
800	0.04
801	0.04
802	0.05
803	0.04
804	0.05
805	0.05
806	0.05
807	0.05
808	0.06
809	0.08
810	0.08
811	0.08
812	0.1
813	0.13
814	0.15
815	0.21
816	0.27
817	0.33
818	0.43
819	0.53
820	0.62
821	0.7
822	0.78
823	0.82
824	0.86
825	0.88
826	0.88
827	0.89
828	0.85
829	0.82
830	0.76
831	0.71
832	0.66
833	0.56
834	0.47
835	0.36
836	0.32
837	0.27
838	0.24
839	0.26
840	0.21
841	0.26
842	0.31
843	0.35
844	0.34
845	0.33
846	0.35
847	0.3
848	0.31
849	0.27
850	0.23

A0A060S6N9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer