FuNGI

A0A060SBC1

Protein Details

Accession

A0A060SBC1

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
44-67	ITPSRSGRVKKTYAHKRARSYASS	Hydrophilic
259-278	SEPTAKREPGRPRPRSRGLA	Basic
484-504	LPPVPIKRPRGRPRKSAPSAF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
264-275	KREPGRPRPRSR
312-350	PPVKRGPGRPRKNPLPPPEPEAAPAGGSRPRRSSARSKS
431-444	MKRARGRPRGSKNK
490-498	KRPRGRPRK
576-595	RRGRSVSASPTKRRRSLSRA

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 12.5, cyto 7, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017956 AT_hook_DNA-bd_motif IPR000116 HMGA
Gene Ontology	GO:0000785 C:chromatin GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription

Amino Acid Sequences

MSGTSPTHGGALFPLDSRKRKERELSPVAPDPEPTPSRADAFWITPSRSGRVKKTYAHKRARSYASSAQEDLSDGAVVPSSRSPSPQSSPIKPRAQPRSTAIDVYVELPSNIRYFQTTARSASRHRAPTTIPDDPGMSGARPEPPRMDGPSTSRKKLVPYVEVPLRRTTSARKERRHISGFVSPARASDIHDVNVHVSRGRSFEQKAIAFPSPPPSEGDWTTCHHQDDQLTLSEALNRSFAAVSSYPTVSDNIPITAPSEPTAKREPGRPRPRSRGLAALGPIVSHSQSSSTRLRRTSSGNAASPAAPNSAPPVKRGPGRPRKNPLPPPEPEAAPAGGSRPRRSSARSKSGTRPTQLPSDEDEGDAAAVVDQLLYDPPSSPAGPSGSAPTDHDYAYHSVDVAPVARALERQAAEEAAMAFDADAGPPPVPMKRARGRPRGSKNKSTLAREQAACDERLARLTSSSRTRSAPAAPHVAESTVSSLPPVPIKRPRGRPRKSAPSAFSSSGFMDYTEPLKDPDDDALTAGPSTIPAKARGRSRTRRNSTSILPISSSSAASPAKSSQYYLDLDTMQWRRRGRSVSASPTKRRRSLSRATKKATEYVTSQLLCAALKTALVKAAATPKLAQDRTDDGLRVAPSGVLLFSDGKSDEPVPTLTPVFSGSWAILEDPRVTFDDGLVMKKLHEVVLGTGAFVRFGEARISRTARGRTVTVTVPCCCQSLRPVPPHTPSSRAGKRVAASPLECKGELTVSISEEAATREYAGLAKVLRTTVVVTH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.29
3	0.35
4	0.43
5	0.51
6	0.52
7	0.6
8	0.68
9	0.69
10	0.72
11	0.76
12	0.74
13	0.72
14	0.74
15	0.69
16	0.6
17	0.53
18	0.44
19	0.42
20	0.38
21	0.33
22	0.3
23	0.28
24	0.3
25	0.29
26	0.31
27	0.26
28	0.27
29	0.32
30	0.32
31	0.32
32	0.35
33	0.38
34	0.38
35	0.42
36	0.46
37	0.47
38	0.51
39	0.56
40	0.58
41	0.67
42	0.73
43	0.76
44	0.81
45	0.81
46	0.81
47	0.84
48	0.83
49	0.77
50	0.73
51	0.71
52	0.68
53	0.64
54	0.56
55	0.47
56	0.4
57	0.36
58	0.29
59	0.22
60	0.14
61	0.1
62	0.09
63	0.1
64	0.09
65	0.1
66	0.11
67	0.14
68	0.15
69	0.17
70	0.22
71	0.27
72	0.32
73	0.4
74	0.45
75	0.5
76	0.59
77	0.65
78	0.69
79	0.68
80	0.72
81	0.74
82	0.71
83	0.67
84	0.63
85	0.63
86	0.56
87	0.53
88	0.44
89	0.36
90	0.32
91	0.29
92	0.25
93	0.17
94	0.15
95	0.14
96	0.15
97	0.13
98	0.13
99	0.12
100	0.12
101	0.14
102	0.19
103	0.26
104	0.27
105	0.31
106	0.35
107	0.38
108	0.39
109	0.46
110	0.49
111	0.5
112	0.48
113	0.48
114	0.45
115	0.5
116	0.55
117	0.51
118	0.43
119	0.37
120	0.36
121	0.33
122	0.33
123	0.24
124	0.17
125	0.13
126	0.14
127	0.2
128	0.21
129	0.23
130	0.23
131	0.25
132	0.29
133	0.33
134	0.36
135	0.32
136	0.37
137	0.46
138	0.49
139	0.49
140	0.48
141	0.45
142	0.45
143	0.49
144	0.48
145	0.45
146	0.42
147	0.47
148	0.51
149	0.53
150	0.51
151	0.49
152	0.45
153	0.39
154	0.39
155	0.39
156	0.42
157	0.49
158	0.56
159	0.58
160	0.64
161	0.7
162	0.77
163	0.74
164	0.65
165	0.6
166	0.57
167	0.54
168	0.5
169	0.46
170	0.37
171	0.32
172	0.33
173	0.27
174	0.23
175	0.24
176	0.23
177	0.21
178	0.22
179	0.22
180	0.22
181	0.24
182	0.21
183	0.17
184	0.15
185	0.15
186	0.17
187	0.19
188	0.22
189	0.21
190	0.25
191	0.3
192	0.3
193	0.3
194	0.32
195	0.31
196	0.27
197	0.26
198	0.3
199	0.25
200	0.25
201	0.26
202	0.23
203	0.26
204	0.26
205	0.28
206	0.23
207	0.26
208	0.29
209	0.28
210	0.28
211	0.24
212	0.25
213	0.23
214	0.23
215	0.22
216	0.19
217	0.19
218	0.18
219	0.17
220	0.18
221	0.18
222	0.15
223	0.14
224	0.12
225	0.11
226	0.1
227	0.1
228	0.11
229	0.1
230	0.12
231	0.14
232	0.14
233	0.13
234	0.14
235	0.15
236	0.12
237	0.14
238	0.13
239	0.11
240	0.11
241	0.11
242	0.11
243	0.11
244	0.11
245	0.1
246	0.14
247	0.14
248	0.18
249	0.23
250	0.25
251	0.26
252	0.34
253	0.43
254	0.49
255	0.6
256	0.65
257	0.69
258	0.74
259	0.8
260	0.78
261	0.7
262	0.66
263	0.57
264	0.52
265	0.44
266	0.36
267	0.28
268	0.22
269	0.2
270	0.14
271	0.12
272	0.08
273	0.07
274	0.08
275	0.09
276	0.14
277	0.21
278	0.26
279	0.31
280	0.33
281	0.35
282	0.35
283	0.4
284	0.42
285	0.43
286	0.42
287	0.38
288	0.37
289	0.36
290	0.34
291	0.29
292	0.23
293	0.16
294	0.11
295	0.1
296	0.13
297	0.17
298	0.17
299	0.18
300	0.22
301	0.24
302	0.28
303	0.36
304	0.43
305	0.49
306	0.57
307	0.64
308	0.68
309	0.74
310	0.79
311	0.8
312	0.77
313	0.73
314	0.66
315	0.62
316	0.56
317	0.48
318	0.39
319	0.33
320	0.24
321	0.18
322	0.16
323	0.13
324	0.14
325	0.16
326	0.17
327	0.18
328	0.21
329	0.22
330	0.27
331	0.36
332	0.4
333	0.48
334	0.52
335	0.54
336	0.6
337	0.67
338	0.67
339	0.59
340	0.54
341	0.46
342	0.47
343	0.43
344	0.36
345	0.3
346	0.29
347	0.27
348	0.23
349	0.2
350	0.14
351	0.12
352	0.11
353	0.07
354	0.03
355	0.03
356	0.02
357	0.02
358	0.02
359	0.02
360	0.03
361	0.03
362	0.04
363	0.04
364	0.05
365	0.07
366	0.07
367	0.07
368	0.08
369	0.09
370	0.09
371	0.09
372	0.1
373	0.1
374	0.1
375	0.11
376	0.12
377	0.12
378	0.12
379	0.11
380	0.11
381	0.12
382	0.13
383	0.12
384	0.09
385	0.08
386	0.09
387	0.09
388	0.07
389	0.06
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.06
395	0.1
396	0.09
397	0.1
398	0.1
399	0.1
400	0.1
401	0.1
402	0.1
403	0.06
404	0.05
405	0.04
406	0.03
407	0.03
408	0.03
409	0.03
410	0.03
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.05
415	0.06
416	0.09
417	0.11
418	0.18
419	0.24
420	0.35
421	0.44
422	0.53
423	0.58
424	0.66
425	0.75
426	0.78
427	0.79
428	0.77
429	0.73
430	0.72
431	0.71
432	0.67
433	0.62
434	0.57
435	0.56
436	0.47
437	0.44
438	0.4
439	0.37
440	0.32
441	0.26
442	0.21
443	0.15
444	0.17
445	0.17
446	0.11
447	0.11
448	0.13
449	0.17
450	0.22
451	0.25
452	0.25
453	0.26
454	0.27
455	0.28
456	0.3
457	0.3
458	0.27
459	0.3
460	0.27
461	0.27
462	0.25
463	0.23
464	0.2
465	0.15
466	0.15
467	0.1
468	0.09
469	0.09
470	0.09
471	0.1
472	0.14
473	0.15
474	0.18
475	0.25
476	0.34
477	0.42
478	0.52
479	0.62
480	0.68
481	0.73
482	0.78
483	0.79
484	0.82
485	0.81
486	0.77
487	0.7
488	0.66
489	0.65
490	0.56
491	0.48
492	0.38
493	0.32
494	0.26
495	0.22
496	0.16
497	0.12
498	0.12
499	0.12
500	0.11
501	0.11
502	0.11
503	0.12
504	0.12
505	0.12
506	0.13
507	0.13
508	0.13
509	0.13
510	0.12
511	0.11
512	0.1
513	0.09
514	0.07
515	0.05
516	0.06
517	0.08
518	0.09
519	0.14
520	0.19
521	0.24
522	0.31
523	0.39
524	0.48
525	0.56
526	0.65
527	0.71
528	0.76
529	0.77
530	0.76
531	0.72
532	0.66
533	0.66
534	0.58
535	0.48
536	0.41
537	0.35
538	0.31
539	0.27
540	0.24
541	0.14
542	0.15
543	0.14
544	0.13
545	0.14
546	0.14
547	0.16
548	0.17
549	0.18
550	0.16
551	0.19
552	0.2
553	0.2
554	0.2
555	0.17
556	0.17
557	0.24
558	0.27
559	0.27
560	0.31
561	0.32
562	0.33
563	0.38
564	0.43
565	0.4
566	0.44
567	0.48
568	0.53
569	0.61
570	0.66
571	0.7
572	0.75
573	0.78
574	0.74
575	0.72
576	0.7
577	0.68
578	0.71
579	0.73
580	0.74
581	0.76
582	0.75
583	0.76
584	0.7
585	0.68
586	0.6
587	0.51
588	0.43
589	0.37
590	0.38
591	0.31
592	0.29
593	0.24
594	0.22
595	0.18
596	0.16
597	0.13
598	0.07
599	0.08
600	0.09
601	0.09
602	0.11
603	0.11
604	0.11
605	0.12
606	0.2
607	0.2
608	0.21
609	0.21
610	0.24
611	0.32
612	0.33
613	0.31
614	0.28
615	0.31
616	0.33
617	0.35
618	0.31
619	0.23
620	0.26
621	0.25
622	0.22
623	0.18
624	0.14
625	0.11
626	0.11
627	0.1
628	0.06
629	0.08
630	0.08
631	0.08
632	0.1
633	0.1
634	0.11
635	0.13
636	0.14
637	0.14
638	0.14
639	0.15
640	0.15
641	0.17
642	0.17
643	0.15
644	0.14
645	0.15
646	0.14
647	0.14
648	0.13
649	0.11
650	0.11
651	0.11
652	0.12
653	0.11
654	0.12
655	0.13
656	0.13
657	0.15
658	0.16
659	0.17
660	0.16
661	0.15
662	0.19
663	0.19
664	0.2
665	0.2
666	0.18
667	0.17
668	0.2
669	0.21
670	0.15
671	0.15
672	0.14
673	0.13
674	0.19
675	0.19
676	0.16
677	0.17
678	0.16
679	0.15
680	0.14
681	0.14
682	0.09
683	0.1
684	0.16
685	0.16
686	0.19
687	0.26
688	0.29
689	0.31
690	0.38
691	0.42
692	0.4
693	0.42
694	0.41
695	0.38
696	0.38
697	0.41
698	0.4
699	0.4
700	0.36
701	0.37
702	0.36
703	0.34
704	0.31
705	0.27
706	0.3
707	0.35
708	0.43
709	0.47
710	0.52
711	0.58
712	0.63
713	0.68
714	0.64
715	0.59
716	0.55
717	0.57
718	0.58
719	0.56
720	0.54
721	0.52
722	0.5
723	0.51
724	0.53
725	0.48
726	0.43
727	0.44
728	0.46
729	0.44
730	0.42
731	0.36
732	0.31
733	0.27
734	0.25
735	0.23
736	0.2
737	0.17
738	0.18
739	0.17
740	0.16
741	0.15
742	0.16
743	0.14
744	0.12
745	0.11
746	0.11
747	0.12
748	0.13
749	0.12
750	0.14
751	0.13
752	0.15
753	0.16
754	0.16
755	0.16
756	0.15

A0A060SBC1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer