FuNGI

A0A060SXX5

Protein Details

Accession

A0A060SXX5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
233-257	HESTCWKKHPDQRPKRGGKGKGKGK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
240-267	KHPDQRPKRGGKGKGKGKEKDKDKGKGK

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto_nucl 12.833, cyto 10.5, cyto_mito 6.166

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2 PF00665 rve
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MGDIKPDTIPLLTSASQYSDWVAKIKGIMLFTGCWGPVLNASPPEGEKAEDWKKKDDQAKGLIWMHTATNYHYLLETKEEEVDGVKKRIAASYSAKDMWDVLKKEFGTPDTAEAIGLLMSFSNLPPMTDTRPLRDQLGTYITRIRDASNGGMHFTESQQAVFILMKLPPSYSTLSTSLTSSHPLKDWTAEWIQGKVLAEESLRSSTSQSVTRISKTKLKPSGPCDFCGSGTHHESTCWKKHPDQRPKRGGKGKGKGKEKDKDKGKGKDNSNNHAHTAAPAVNVLVAESSSNMHASFYSAAHAAGVRHTHWLMDSGASQHITFDINDFAEYKAYDTPIVFRTAASGEGSSVKALGEGLVRYETFIDGVKWSIDLPKVCYIPMVSSRLFSTGSIEKNGYSIFQGGQKMSIFDKLPSGAVTHGSMIKIEGRKILEGVFNPVNNLYDFVLEIKSGPHVHLSKTDYKTWHRRFGHAGKEALRHLPKNVKGVDHVDPADDEPCEGCAFGKSHRLPFSPSEKCATEPLELVHTDLDGPFIDDFSGLGIAYFLKRKSDAIKAFDNFKAWAETQTGKKIKRVRSDRGGEYLSNEFTQHLLDLGIEHQKSTPDSPQQNGRAERWNRTIVEKAMSMLHHAGP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.19
3	0.19
4	0.19
5	0.2
6	0.18
7	0.18
8	0.2
9	0.19
10	0.18
11	0.19
12	0.22
13	0.22
14	0.2
15	0.2
16	0.19
17	0.19
18	0.19
19	0.2
20	0.16
21	0.14
22	0.14
23	0.13
24	0.15
25	0.18
26	0.19
27	0.18
28	0.2
29	0.22
30	0.22
31	0.25
32	0.22
33	0.2
34	0.19
35	0.26
36	0.35
37	0.39
38	0.41
39	0.45
40	0.49
41	0.56
42	0.62
43	0.6
44	0.58
45	0.6
46	0.6
47	0.6
48	0.59
49	0.52
50	0.46
51	0.39
52	0.32
53	0.26
54	0.24
55	0.19
56	0.21
57	0.2
58	0.2
59	0.2
60	0.2
61	0.19
62	0.22
63	0.22
64	0.17
65	0.18
66	0.17
67	0.17
68	0.18
69	0.22
70	0.23
71	0.23
72	0.23
73	0.23
74	0.24
75	0.27
76	0.27
77	0.27
78	0.29
79	0.32
80	0.37
81	0.36
82	0.35
83	0.32
84	0.32
85	0.31
86	0.32
87	0.29
88	0.25
89	0.29
90	0.3
91	0.32
92	0.34
93	0.3
94	0.27
95	0.26
96	0.27
97	0.23
98	0.22
99	0.2
100	0.16
101	0.15
102	0.1
103	0.09
104	0.06
105	0.04
106	0.04
107	0.05
108	0.05
109	0.09
110	0.09
111	0.09
112	0.12
113	0.15
114	0.19
115	0.27
116	0.29
117	0.3
118	0.35
119	0.36
120	0.37
121	0.35
122	0.32
123	0.27
124	0.32
125	0.28
126	0.25
127	0.29
128	0.26
129	0.27
130	0.26
131	0.24
132	0.19
133	0.21
134	0.22
135	0.22
136	0.22
137	0.21
138	0.2
139	0.2
140	0.18
141	0.17
142	0.17
143	0.12
144	0.12
145	0.11
146	0.11
147	0.11
148	0.11
149	0.1
150	0.08
151	0.09
152	0.1
153	0.1
154	0.11
155	0.11
156	0.13
157	0.16
158	0.15
159	0.18
160	0.19
161	0.21
162	0.21
163	0.2
164	0.19
165	0.18
166	0.2
167	0.18
168	0.18
169	0.18
170	0.19
171	0.19
172	0.19
173	0.19
174	0.2
175	0.2
176	0.22
177	0.22
178	0.21
179	0.2
180	0.2
181	0.2
182	0.15
183	0.14
184	0.11
185	0.1
186	0.1
187	0.12
188	0.11
189	0.11
190	0.11
191	0.12
192	0.14
193	0.16
194	0.19
195	0.18
196	0.22
197	0.24
198	0.27
199	0.31
200	0.32
201	0.38
202	0.39
203	0.47
204	0.49
205	0.53
206	0.56
207	0.57
208	0.64
209	0.57
210	0.55
211	0.5
212	0.43
213	0.38
214	0.34
215	0.32
216	0.26
217	0.27
218	0.27
219	0.22
220	0.21
221	0.25
222	0.29
223	0.32
224	0.34
225	0.34
226	0.4
227	0.49
228	0.59
229	0.66
230	0.7
231	0.75
232	0.79
233	0.83
234	0.85
235	0.84
236	0.83
237	0.82
238	0.81
239	0.79
240	0.76
241	0.78
242	0.75
243	0.75
244	0.74
245	0.7
246	0.69
247	0.68
248	0.7
249	0.7
250	0.72
251	0.71
252	0.71
253	0.71
254	0.71
255	0.68
256	0.66
257	0.64
258	0.57
259	0.49
260	0.42
261	0.35
262	0.27
263	0.24
264	0.17
265	0.11
266	0.09
267	0.08
268	0.08
269	0.07
270	0.07
271	0.04
272	0.03
273	0.03
274	0.03
275	0.04
276	0.04
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.06
282	0.07
283	0.07
284	0.07
285	0.07
286	0.07
287	0.07
288	0.08
289	0.07
290	0.07
291	0.08
292	0.07
293	0.09
294	0.09
295	0.09
296	0.08
297	0.1
298	0.09
299	0.09
300	0.09
301	0.08
302	0.09
303	0.1
304	0.09
305	0.08
306	0.08
307	0.08
308	0.07
309	0.07
310	0.07
311	0.06
312	0.07
313	0.08
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.08
318	0.07
319	0.08
320	0.08
321	0.08
322	0.1
323	0.11
324	0.13
325	0.12
326	0.11
327	0.12
328	0.12
329	0.12
330	0.1
331	0.09
332	0.07
333	0.09
334	0.09
335	0.08
336	0.07
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.05
342	0.05
343	0.06
344	0.07
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.06
352	0.06
353	0.07
354	0.07
355	0.06
356	0.07
357	0.09
358	0.11
359	0.11
360	0.14
361	0.18
362	0.18
363	0.18
364	0.18
365	0.16
366	0.16
367	0.19
368	0.2
369	0.16
370	0.16
371	0.17
372	0.18
373	0.18
374	0.15
375	0.15
376	0.16
377	0.17
378	0.18
379	0.18
380	0.17
381	0.17
382	0.17
383	0.13
384	0.1
385	0.09
386	0.08
387	0.12
388	0.13
389	0.13
390	0.15
391	0.14
392	0.15
393	0.15
394	0.17
395	0.14
396	0.13
397	0.15
398	0.13
399	0.14
400	0.13
401	0.13
402	0.1
403	0.1
404	0.1
405	0.1
406	0.11
407	0.1
408	0.1
409	0.1
410	0.14
411	0.15
412	0.15
413	0.17
414	0.17
415	0.17
416	0.18
417	0.19
418	0.17
419	0.16
420	0.21
421	0.2
422	0.19
423	0.19
424	0.19
425	0.18
426	0.15
427	0.16
428	0.11
429	0.09
430	0.09
431	0.09
432	0.09
433	0.08
434	0.08
435	0.07
436	0.1
437	0.1
438	0.1
439	0.15
440	0.16
441	0.17
442	0.23
443	0.28
444	0.34
445	0.37
446	0.41
447	0.4
448	0.47
449	0.57
450	0.58
451	0.63
452	0.57
453	0.58
454	0.62
455	0.64
456	0.66
457	0.6
458	0.58
459	0.52
460	0.54
461	0.51
462	0.5
463	0.47
464	0.39
465	0.38
466	0.42
467	0.42
468	0.45
469	0.45
470	0.39
471	0.38
472	0.41
473	0.41
474	0.37
475	0.33
476	0.27
477	0.25
478	0.25
479	0.23
480	0.18
481	0.14
482	0.09
483	0.1
484	0.1
485	0.09
486	0.08
487	0.1
488	0.11
489	0.13
490	0.23
491	0.25
492	0.31
493	0.36
494	0.37
495	0.38
496	0.43
497	0.51
498	0.47
499	0.46
500	0.45
501	0.41
502	0.41
503	0.41
504	0.38
505	0.3
506	0.25
507	0.24
508	0.23
509	0.22
510	0.21
511	0.17
512	0.14
513	0.13
514	0.11
515	0.11
516	0.07
517	0.09
518	0.08
519	0.08
520	0.08
521	0.07
522	0.07
523	0.07
524	0.07
525	0.05
526	0.05
527	0.05
528	0.06
529	0.08
530	0.12
531	0.12
532	0.15
533	0.16
534	0.19
535	0.23
536	0.32
537	0.37
538	0.39
539	0.47
540	0.46
541	0.51
542	0.5
543	0.47
544	0.39
545	0.34
546	0.33
547	0.25
548	0.25
549	0.24
550	0.27
551	0.3
552	0.39
553	0.45
554	0.43
555	0.49
556	0.55
557	0.59
558	0.65
559	0.69
560	0.68
561	0.72
562	0.77
563	0.75
564	0.73
565	0.69
566	0.58
567	0.54
568	0.48
569	0.4
570	0.33
571	0.28
572	0.22
573	0.18
574	0.18
575	0.14
576	0.11
577	0.08
578	0.08
579	0.08
580	0.11
581	0.18
582	0.17
583	0.17
584	0.18
585	0.2
586	0.23
587	0.27
588	0.31
589	0.34
590	0.39
591	0.44
592	0.52
593	0.57
594	0.62
595	0.63
596	0.6
597	0.6
598	0.61
599	0.64
600	0.61
601	0.6
602	0.54
603	0.54
604	0.57
605	0.5
606	0.49
607	0.41
608	0.36
609	0.34
610	0.32
611	0.31

A0A060SXX5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer