FuNGI

A0A060SV79

Protein Details

Accession

A0A060SV79

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
81-115	MSASDQNGKKKSKKNIECFNCKKRGHYKSECWAPG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
120-130	GQGPKGKPKPK

Subcellular Location(s)

cyto 14.5, cyto_nucl 8.5, mito 4, plas 3, E.R. 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MREDLAAMGQSPSDDDFFAIIMGSMPSSYEPYLSAISATSRVTGAVLSPDELMEALADEYERRTLRAKSAKRSTDSADIAMSASDQNGKKKSKKNIECFNCKKRGHYKSECWAPGGGKEGQGPKGKPKPKETAAAAAEMKDESWFTHVAGLDSDSDMPDLQSVTESVSEPNKADRLCADFPDEAYSDGDLDDLYLDAELLDSKSSAMLARDLSVKDEVILFDSGATRHMSSYRDKFINYVEISPRSIQAADDHVFKAVGKGDMYVDLPNGTGSTRVLLRDVLYAPTMGVTLVSISRITAAVQAAGPVRAVTREELHRELGHITPEAARNMVAHGAVKGLVLSSTDGPVEDCESCAAGKTTRKAIATERVRPRASSVGEEVHADVWGPSPVRTLGGRQYYAMYTDDYSRYSSLHLMRTKDETLSSFRKVRGFYLMQKGAWIRCLHSDRGGKFLSADFSKLLDEDGTVRKLTAHDTPEYNGVAERGNRTVMEKSSMFVRRTTLGGVYPPTGFDEESDAHRVYWPKRHTVTVERSVVFPSMDSDVEVQLEGESQTMQPLVSTHLDERAPSPTSSLPDPPTTLQPSIPTEDSRPKKTEMVAREPEQRSEGEPRRSSCVRKESDYVRQLRAGEGTVSGHAGEPALPTGVQEGTAKIKEVQEGKEAEMAAMARTVEDEVELAMAAAAGDADLVANKTWRIVPRPSTGNIVDSKWVLRVKNNSAGEIDKYKARLVARGFTQIYGVDYYDTFAPVAKLSSICLLLAIAARNGWAADSFDFNSVYLNSKLDEDVYLKQPPDHAFADRKAFVLKLEKALYGLKQGGQKWYKTLCAALRKLGFTRAEADWGVFYKHEGKHFIVLAVHVDDCLVTGSSQRLLDENKAKIGALYKLTDLGPVSWLLGIKISRDLTAGTLSLSQHAYIDALLARFNFTDLKPVSTPMDPHQLLSKTQCPESPAEVARMRRVPYREAISALMYAALGTRPDIAFAVSTLAQFAQKPGQPHWDAVKRVFRYLLGTRMLSLVYGGQKRELEGFVDADGATQEHCRPITGYVFLVDGGAVSLASKKQELVTLSTAESEYIATTHTAKEPVWLRQLIGEVFGPLADPTTLYNDNQAAIALMKDGSYHARTKHIDIHYHFIRYSIDAGSI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.1
3	0.1
4	0.1
5	0.1
6	0.09
7	0.07
8	0.07
9	0.07
10	0.06
11	0.06
12	0.06
13	0.07
14	0.1
15	0.11
16	0.11
17	0.11
18	0.14
19	0.15
20	0.15
21	0.14
22	0.12
23	0.14
24	0.16
25	0.15
26	0.13
27	0.12
28	0.12
29	0.12
30	0.11
31	0.11
32	0.13
33	0.13
34	0.13
35	0.13
36	0.13
37	0.13
38	0.13
39	0.12
40	0.07
41	0.07
42	0.06
43	0.06
44	0.06
45	0.06
46	0.08
47	0.14
48	0.14
49	0.16
50	0.2
51	0.23
52	0.33
53	0.43
54	0.5
55	0.54
56	0.64
57	0.71
58	0.71
59	0.72
60	0.67
61	0.66
62	0.6
63	0.51
64	0.41
65	0.33
66	0.29
67	0.24
68	0.2
69	0.11
70	0.1
71	0.15
72	0.17
73	0.24
74	0.31
75	0.39
76	0.47
77	0.56
78	0.66
79	0.7
80	0.78
81	0.81
82	0.85
83	0.87
84	0.89
85	0.91
86	0.9
87	0.89
88	0.8
89	0.79
90	0.78
91	0.78
92	0.77
93	0.77
94	0.76
95	0.76
96	0.85
97	0.78
98	0.69
99	0.63
100	0.54
101	0.46
102	0.42
103	0.33
104	0.25
105	0.28
106	0.3
107	0.34
108	0.4
109	0.39
110	0.44
111	0.53
112	0.58
113	0.6
114	0.64
115	0.67
116	0.65
117	0.72
118	0.65
119	0.65
120	0.59
121	0.57
122	0.5
123	0.41
124	0.36
125	0.28
126	0.24
127	0.15
128	0.14
129	0.09
130	0.11
131	0.11
132	0.1
133	0.14
134	0.15
135	0.15
136	0.15
137	0.16
138	0.14
139	0.15
140	0.15
141	0.11
142	0.11
143	0.1
144	0.1
145	0.09
146	0.08
147	0.07
148	0.07
149	0.07
150	0.08
151	0.1
152	0.1
153	0.12
154	0.15
155	0.16
156	0.16
157	0.2
158	0.23
159	0.21
160	0.22
161	0.22
162	0.27
163	0.27
164	0.28
165	0.29
166	0.25
167	0.26
168	0.29
169	0.26
170	0.21
171	0.19
172	0.18
173	0.13
174	0.12
175	0.12
176	0.07
177	0.07
178	0.06
179	0.05
180	0.04
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.04
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.06
190	0.06
191	0.06
192	0.08
193	0.08
194	0.1
195	0.1
196	0.12
197	0.15
198	0.15
199	0.18
200	0.17
201	0.16
202	0.15
203	0.15
204	0.14
205	0.13
206	0.13
207	0.1
208	0.1
209	0.11
210	0.11
211	0.11
212	0.12
213	0.1
214	0.11
215	0.14
216	0.16
217	0.22
218	0.28
219	0.34
220	0.34
221	0.34
222	0.34
223	0.35
224	0.4
225	0.34
226	0.33
227	0.3
228	0.3
229	0.32
230	0.32
231	0.3
232	0.23
233	0.22
234	0.18
235	0.15
236	0.19
237	0.18
238	0.2
239	0.19
240	0.18
241	0.18
242	0.17
243	0.17
244	0.14
245	0.14
246	0.12
247	0.12
248	0.12
249	0.14
250	0.15
251	0.13
252	0.11
253	0.1
254	0.1
255	0.09
256	0.08
257	0.07
258	0.07
259	0.06
260	0.08
261	0.09
262	0.1
263	0.1
264	0.11
265	0.12
266	0.14
267	0.15
268	0.14
269	0.13
270	0.13
271	0.12
272	0.11
273	0.1
274	0.07
275	0.06
276	0.04
277	0.05
278	0.05
279	0.06
280	0.05
281	0.05
282	0.06
283	0.06
284	0.07
285	0.08
286	0.08
287	0.09
288	0.09
289	0.1
290	0.1
291	0.1
292	0.1
293	0.08
294	0.08
295	0.08
296	0.09
297	0.09
298	0.13
299	0.17
300	0.22
301	0.24
302	0.26
303	0.25
304	0.25
305	0.26
306	0.23
307	0.2
308	0.16
309	0.15
310	0.15
311	0.17
312	0.17
313	0.15
314	0.14
315	0.12
316	0.13
317	0.13
318	0.1
319	0.08
320	0.07
321	0.08
322	0.08
323	0.07
324	0.06
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.06
329	0.06
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.08
335	0.1
336	0.09
337	0.08
338	0.08
339	0.09
340	0.08
341	0.09
342	0.1
343	0.11
344	0.15
345	0.18
346	0.22
347	0.26
348	0.27
349	0.28
350	0.31
351	0.38
352	0.4
353	0.47
354	0.5
355	0.53
356	0.53
357	0.52
358	0.5
359	0.47
360	0.42
361	0.35
362	0.29
363	0.24
364	0.24
365	0.25
366	0.22
367	0.16
368	0.14
369	0.11
370	0.08
371	0.07
372	0.08
373	0.08
374	0.07
375	0.09
376	0.09
377	0.11
378	0.11
379	0.13
380	0.18
381	0.22
382	0.22
383	0.21
384	0.23
385	0.21
386	0.22
387	0.21
388	0.15
389	0.11
390	0.14
391	0.14
392	0.14
393	0.15
394	0.13
395	0.13
396	0.13
397	0.17
398	0.17
399	0.23
400	0.26
401	0.27
402	0.28
403	0.32
404	0.32
405	0.28
406	0.26
407	0.21
408	0.23
409	0.25
410	0.27
411	0.27
412	0.28
413	0.31
414	0.31
415	0.3
416	0.31
417	0.3
418	0.32
419	0.38
420	0.38
421	0.34
422	0.36
423	0.36
424	0.29
425	0.3
426	0.25
427	0.17
428	0.21
429	0.25
430	0.24
431	0.3
432	0.35
433	0.31
434	0.36
435	0.35
436	0.28
437	0.25
438	0.25
439	0.21
440	0.16
441	0.16
442	0.12
443	0.12
444	0.12
445	0.11
446	0.1
447	0.07
448	0.07
449	0.09
450	0.11
451	0.12
452	0.11
453	0.11
454	0.12
455	0.12
456	0.14
457	0.16
458	0.16
459	0.17
460	0.18
461	0.19
462	0.21
463	0.21
464	0.18
465	0.14
466	0.12
467	0.11
468	0.11
469	0.12
470	0.11
471	0.11
472	0.11
473	0.13
474	0.15
475	0.14
476	0.16
477	0.14
478	0.14
479	0.2
480	0.25
481	0.24
482	0.23
483	0.23
484	0.21
485	0.22
486	0.22
487	0.16
488	0.11
489	0.12
490	0.13
491	0.12
492	0.11
493	0.1
494	0.11
495	0.1
496	0.1
497	0.09
498	0.1
499	0.1
500	0.12
501	0.15
502	0.14
503	0.14
504	0.16
505	0.19
506	0.19
507	0.26
508	0.26
509	0.29
510	0.31
511	0.33
512	0.34
513	0.39
514	0.44
515	0.43
516	0.45
517	0.39
518	0.38
519	0.36
520	0.33
521	0.25
522	0.18
523	0.11
524	0.09
525	0.08
526	0.08
527	0.08
528	0.08
529	0.08
530	0.08
531	0.06
532	0.05
533	0.05
534	0.05
535	0.04
536	0.04
537	0.04
538	0.04
539	0.04
540	0.04
541	0.04
542	0.04
543	0.07
544	0.07
545	0.08
546	0.08
547	0.11
548	0.12
549	0.12
550	0.13
551	0.14
552	0.14
553	0.13
554	0.15
555	0.13
556	0.15
557	0.16
558	0.17
559	0.16
560	0.15
561	0.17
562	0.16
563	0.18
564	0.2
565	0.19
566	0.17
567	0.17
568	0.18
569	0.19
570	0.19
571	0.16
572	0.16
573	0.24
574	0.28
575	0.3
576	0.31
577	0.31
578	0.31
579	0.34
580	0.37
581	0.34
582	0.38
583	0.38
584	0.39
585	0.46
586	0.45
587	0.42
588	0.38
589	0.33
590	0.26
591	0.31
592	0.34
593	0.33
594	0.35
595	0.36
596	0.41
597	0.43
598	0.43
599	0.41
600	0.43
601	0.38
602	0.38
603	0.41
604	0.4
605	0.46
606	0.5
607	0.48
608	0.4
609	0.4
610	0.37
611	0.34
612	0.3
613	0.21
614	0.15
615	0.11
616	0.1
617	0.08
618	0.08
619	0.07
620	0.06
621	0.06
622	0.05
623	0.05
624	0.04
625	0.05
626	0.05
627	0.04
628	0.04
629	0.05
630	0.05
631	0.06
632	0.06
633	0.07
634	0.1
635	0.1
636	0.11
637	0.11
638	0.12
639	0.15
640	0.17
641	0.18
642	0.19
643	0.2
644	0.21
645	0.21
646	0.2
647	0.17
648	0.15
649	0.13
650	0.09
651	0.08
652	0.07
653	0.05
654	0.05
655	0.05
656	0.04
657	0.04
658	0.04
659	0.03
660	0.03
661	0.03
662	0.03
663	0.03
664	0.03
665	0.02
666	0.02
667	0.02
668	0.02
669	0.02
670	0.02
671	0.02
672	0.02
673	0.03
674	0.03
675	0.04
676	0.04
677	0.05
678	0.08
679	0.11
680	0.15
681	0.2
682	0.25
683	0.29
684	0.33
685	0.34
686	0.36
687	0.34
688	0.33
689	0.3
690	0.26
691	0.22
692	0.19
693	0.18
694	0.17
695	0.19
696	0.17
697	0.19
698	0.25
699	0.28
700	0.36
701	0.36
702	0.33
703	0.32
704	0.32
705	0.3
706	0.27
707	0.23
708	0.17
709	0.17
710	0.17
711	0.19
712	0.18
713	0.2
714	0.2
715	0.24
716	0.23
717	0.28
718	0.28
719	0.25
720	0.25
721	0.2
722	0.19
723	0.16
724	0.14
725	0.08
726	0.08
727	0.09
728	0.08
729	0.08
730	0.07
731	0.06
732	0.07
733	0.06
734	0.07
735	0.07
736	0.07
737	0.07
738	0.09
739	0.09
740	0.08
741	0.08
742	0.07
743	0.07
744	0.08
745	0.08
746	0.06
747	0.06
748	0.06
749	0.06
750	0.06
751	0.06
752	0.05
753	0.05
754	0.06
755	0.09
756	0.1
757	0.11
758	0.11
759	0.11
760	0.11
761	0.11
762	0.14
763	0.12
764	0.12
765	0.11
766	0.12
767	0.12
768	0.11
769	0.12
770	0.11
771	0.14
772	0.17
773	0.19
774	0.19
775	0.19
776	0.23
777	0.23
778	0.25
779	0.24
780	0.24
781	0.26
782	0.28
783	0.34
784	0.3
785	0.29
786	0.25
787	0.24
788	0.22
789	0.25
790	0.24
791	0.23
792	0.24
793	0.23
794	0.24
795	0.25
796	0.24
797	0.2
798	0.2
799	0.18
800	0.21
801	0.22
802	0.3
803	0.32
804	0.32
805	0.33
806	0.34
807	0.34
808	0.3
809	0.33
810	0.3
811	0.35
812	0.36
813	0.37
814	0.38
815	0.37
816	0.38
817	0.39
818	0.34
819	0.26
820	0.28
821	0.23
822	0.23
823	0.21
824	0.2
825	0.15
826	0.15
827	0.15
828	0.11
829	0.12
830	0.16
831	0.19
832	0.22
833	0.24
834	0.25
835	0.28
836	0.29
837	0.29
838	0.23
839	0.2
840	0.19
841	0.16
842	0.15
843	0.1
844	0.09
845	0.08
846	0.07
847	0.08
848	0.06
849	0.05
850	0.06
851	0.08
852	0.11
853	0.11
854	0.11
855	0.13
856	0.15
857	0.22
858	0.27
859	0.28
860	0.27
861	0.27
862	0.27
863	0.26
864	0.26
865	0.23
866	0.19
867	0.19
868	0.17
869	0.19
870	0.19
871	0.2
872	0.17
873	0.14
874	0.12
875	0.11
876	0.11
877	0.1
878	0.1
879	0.09
880	0.11
881	0.11
882	0.11
883	0.15
884	0.16
885	0.15
886	0.15
887	0.16
888	0.14
889	0.15
890	0.14
891	0.1
892	0.12
893	0.11
894	0.13
895	0.13
896	0.12
897	0.11
898	0.11
899	0.1
900	0.08
901	0.09
902	0.08
903	0.08
904	0.09
905	0.08
906	0.1
907	0.09
908	0.1
909	0.12
910	0.11
911	0.19
912	0.19
913	0.24
914	0.23
915	0.25
916	0.27
917	0.26
918	0.29
919	0.25
920	0.34
921	0.29
922	0.29
923	0.34
924	0.33
925	0.33
926	0.36
927	0.39
928	0.32
929	0.34
930	0.34
931	0.31
932	0.32
933	0.33
934	0.34
935	0.29
936	0.32
937	0.35
938	0.36
939	0.4
940	0.41
941	0.39
942	0.39
943	0.41
944	0.39
945	0.41
946	0.45
947	0.4
948	0.38
949	0.37
950	0.32
951	0.29
952	0.25
953	0.18
954	0.12
955	0.1
956	0.08
957	0.07
958	0.06
959	0.06
960	0.09
961	0.08
962	0.09
963	0.1
964	0.1
965	0.09
966	0.09
967	0.12
968	0.1
969	0.1
970	0.1
971	0.11
972	0.11
973	0.11
974	0.13
975	0.17
976	0.19
977	0.22
978	0.24
979	0.33
980	0.34
981	0.37
982	0.44
983	0.45
984	0.46
985	0.5
986	0.57
987	0.49
988	0.5
989	0.48
990	0.4
991	0.39
992	0.39
993	0.39
994	0.33
995	0.31
996	0.29
997	0.29
998	0.28
999	0.21
1000	0.17
1001	0.15
1002	0.18
1003	0.21
1004	0.21
1005	0.24
1006	0.24
1007	0.26
1008	0.28
1009	0.25
1010	0.2
1011	0.19
1012	0.19
1013	0.15
1014	0.16
1015	0.14
1016	0.12
1017	0.11
1018	0.09
1019	0.08
1020	0.1
1021	0.11
1022	0.13
1023	0.14
1024	0.15
1025	0.16
1026	0.19
1027	0.22
1028	0.22
1029	0.21
1030	0.18
1031	0.18
1032	0.17
1033	0.16
1034	0.12
1035	0.08
1036	0.06
1037	0.06
1038	0.04
1039	0.04
1040	0.07
1041	0.08
1042	0.1
1043	0.11
1044	0.12
1045	0.13
1046	0.17
1047	0.19
1048	0.22
1049	0.25
1050	0.25
1051	0.25
1052	0.26
1053	0.24
1054	0.2
1055	0.18
1056	0.13
1057	0.1
1058	0.08
1059	0.09
1060	0.08
1061	0.1
1062	0.12
1063	0.15
1064	0.17
1065	0.16
1066	0.23
1067	0.27
1068	0.32
1069	0.38
1070	0.37
1071	0.34
1072	0.35
1073	0.39
1074	0.32
1075	0.29
1076	0.24
1077	0.17
1078	0.16
1079	0.15
1080	0.13
1081	0.09
1082	0.1
1083	0.07
1084	0.07
1085	0.08
1086	0.15
1087	0.17
1088	0.17
1089	0.21
1090	0.21
1091	0.21
1092	0.21
1093	0.2
1094	0.14
1095	0.12
1096	0.12
1097	0.09
1098	0.08
1099	0.07
1100	0.08
1101	0.09
1102	0.14
1103	0.17
1104	0.22
1105	0.23
1106	0.31
1107	0.35
1108	0.39
1109	0.47
1110	0.48
1111	0.53
1112	0.52
1113	0.59
1114	0.55
1115	0.56
1116	0.51
1117	0.43
1118	0.39
1119	0.32
1120	0.31

A0A060SV79

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer