FuNGI

A0A060SS58

Protein Details

Accession

A0A060SS58

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
115-141	VDAARNKLKSTIRKRRRQHMDEWIRCV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
124-130	STIRKRR

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto 8, cysk 5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR002156 RNaseH_domain IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity
Pfam	View protein in Pfam PF00075 RNase_H PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50879 RNASE_H_1 PS50878 RT_POL
CDD	cd09276 Rnase_HI_RT_non_LTR cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MGEPTHFPHRDNFHATVIDLVWVPDDRDPGLYQIRVAPEERGLSDHAVIHAHIPAGEWSYRGAPSIAPKSEAEEHFIAAILASIRTSFPALPPLEVEEDIQCARPELVPAARAAVDAARNKLKSTIRKRRRQHMDEWIRCVAEQQPRIWDLMSWVGPRALPMYRSLVHDGQPLQSLPDLWQALDHTFHAAATRAVDRTILDSLRPREPRQCHSISKAEIRDALKRVATASTPGWDQLLLAAESDFLDLLRHLYNGILRLGIWPTQFKHAVSVVIPKPYKDDYTRVKSYRPIVLLSTLGKLFEKVLSERLHYECQRYGILHPNQFGDTKAHSTIDTATALVTHVRAGWHKGLVTSCLAFDVAQFFPSMNHDLLSTSPWFELPAVGAGQGSALSPILTNIYISPAIHCLCPVGPNPSISSLQFYVDDGLWIVTSPSVEMNCQVLTTQYQHTTVELARLGLFTETEKNGLMHFICTHLARTQQPLALRLHDGTEIQPSQIWRYLGFRLDPCLTFKAHISFFAERAFTTVHAMLMLGNSIRGLSPKQKRTLYISCVLPLLTYGAQVWYRSKGVKTLMEPLLAAQNRALQWITGAFRTTPIGAMLAFAGIMPLQVHCKKLQDRYFLRIFTLPRSHPLRAAFPHIFKRSRYSPYVRFTMDKVPPMPSIPLSEALPRKHPLITEKFDPLDPKCEPGQRLCDLFEDRITTFLEHPKKRNDEALKHWIREDLRPRIDNAHANDDALVFFTDGSAVYSDHDRHLGGAAGYRAYHSGHLLRARAVYTGYTLSYDCELMALSMAFGFAYLKSYHTVHVFSDCEGALTSIFDTSTGRPAARNACRILRDWFECDNRNRLVLHYCPSHSGVDENEAVDADSYLYIRSLTTTNAIYEWKELADKNPSAYWGRFHYRHAAFRTLRHTGQYPLRRLGTGPQLTARYIRCITAHAPTGHYRDRFQRRHNEMTMCYCGCPSYHTREHVLFECDKYTRKYRYSSIEDLLQSLDPFYDIEQFLRDNPTAFTFEDAPSA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.43
3	0.37
4	0.31
5	0.25
6	0.19
7	0.16
8	0.13
9	0.13
10	0.14
11	0.14
12	0.15
13	0.14
14	0.17
15	0.18
16	0.21
17	0.26
18	0.25
19	0.24
20	0.27
21	0.29
22	0.29
23	0.3
24	0.27
25	0.25
26	0.27
27	0.27
28	0.25
29	0.23
30	0.23
31	0.24
32	0.23
33	0.2
34	0.19
35	0.18
36	0.17
37	0.16
38	0.15
39	0.13
40	0.12
41	0.12
42	0.15
43	0.15
44	0.14
45	0.14
46	0.17
47	0.17
48	0.17
49	0.16
50	0.15
51	0.23
52	0.31
53	0.31
54	0.31
55	0.31
56	0.35
57	0.42
58	0.41
59	0.38
60	0.31
61	0.3
62	0.27
63	0.27
64	0.21
65	0.13
66	0.13
67	0.08
68	0.07
69	0.07
70	0.07
71	0.07
72	0.09
73	0.11
74	0.1
75	0.11
76	0.19
77	0.2
78	0.2
79	0.21
80	0.23
81	0.24
82	0.24
83	0.24
84	0.17
85	0.19
86	0.19
87	0.2
88	0.16
89	0.15
90	0.15
91	0.15
92	0.16
93	0.17
94	0.19
95	0.18
96	0.19
97	0.2
98	0.19
99	0.18
100	0.17
101	0.15
102	0.18
103	0.2
104	0.25
105	0.29
106	0.3
107	0.31
108	0.37
109	0.42
110	0.47
111	0.55
112	0.61
113	0.65
114	0.75
115	0.83
116	0.87
117	0.9
118	0.86
119	0.84
120	0.84
121	0.85
122	0.81
123	0.79
124	0.72
125	0.61
126	0.54
127	0.47
128	0.42
129	0.4
130	0.37
131	0.32
132	0.35
133	0.35
134	0.36
135	0.35
136	0.28
137	0.22
138	0.25
139	0.26
140	0.21
141	0.21
142	0.21
143	0.21
144	0.21
145	0.21
146	0.17
147	0.14
148	0.16
149	0.2
150	0.22
151	0.26
152	0.3
153	0.3
154	0.3
155	0.33
156	0.32
157	0.28
158	0.29
159	0.25
160	0.21
161	0.19
162	0.18
163	0.15
164	0.2
165	0.19
166	0.16
167	0.17
168	0.17
169	0.18
170	0.19
171	0.17
172	0.13
173	0.12
174	0.13
175	0.12
176	0.12
177	0.11
178	0.12
179	0.14
180	0.13
181	0.13
182	0.13
183	0.13
184	0.15
185	0.17
186	0.15
187	0.15
188	0.21
189	0.25
190	0.33
191	0.37
192	0.38
193	0.44
194	0.49
195	0.53
196	0.55
197	0.57
198	0.54
199	0.56
200	0.6
201	0.56
202	0.58
203	0.54
204	0.48
205	0.47
206	0.45
207	0.45
208	0.4
209	0.38
210	0.31
211	0.29
212	0.28
213	0.24
214	0.22
215	0.19
216	0.17
217	0.16
218	0.16
219	0.16
220	0.15
221	0.13
222	0.12
223	0.1
224	0.12
225	0.09
226	0.09
227	0.09
228	0.08
229	0.09
230	0.09
231	0.07
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.07
239	0.08
240	0.1
241	0.11
242	0.12
243	0.1
244	0.09
245	0.11
246	0.13
247	0.14
248	0.14
249	0.15
250	0.16
251	0.21
252	0.23
253	0.22
254	0.24
255	0.22
256	0.23
257	0.21
258	0.28
259	0.24
260	0.3
261	0.31
262	0.27
263	0.3
264	0.31
265	0.34
266	0.29
267	0.34
268	0.35
269	0.43
270	0.51
271	0.5
272	0.5
273	0.51
274	0.52
275	0.51
276	0.44
277	0.37
278	0.3
279	0.3
280	0.29
281	0.25
282	0.23
283	0.17
284	0.16
285	0.14
286	0.13
287	0.12
288	0.11
289	0.12
290	0.11
291	0.17
292	0.18
293	0.2
294	0.23
295	0.25
296	0.3
297	0.3
298	0.32
299	0.29
300	0.29
301	0.29
302	0.27
303	0.26
304	0.29
305	0.34
306	0.33
307	0.32
308	0.32
309	0.32
310	0.31
311	0.29
312	0.22
313	0.19
314	0.18
315	0.18
316	0.18
317	0.16
318	0.17
319	0.17
320	0.16
321	0.14
322	0.11
323	0.09
324	0.09
325	0.09
326	0.08
327	0.07
328	0.05
329	0.06
330	0.07
331	0.08
332	0.12
333	0.13
334	0.14
335	0.14
336	0.16
337	0.16
338	0.16
339	0.17
340	0.14
341	0.12
342	0.11
343	0.11
344	0.09
345	0.08
346	0.1
347	0.08
348	0.08
349	0.09
350	0.08
351	0.09
352	0.11
353	0.14
354	0.1
355	0.1
356	0.1
357	0.11
358	0.11
359	0.13
360	0.11
361	0.09
362	0.09
363	0.09
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.06
371	0.06
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.04
377	0.03
378	0.03
379	0.03
380	0.04
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.07
386	0.07
387	0.07
388	0.08
389	0.1
390	0.1
391	0.1
392	0.1
393	0.09
394	0.09
395	0.11
396	0.12
397	0.14
398	0.14
399	0.15
400	0.16
401	0.18
402	0.19
403	0.17
404	0.18
405	0.15
406	0.14
407	0.14
408	0.13
409	0.12
410	0.1
411	0.1
412	0.07
413	0.07
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.04
418	0.04
419	0.04
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.06
424	0.07
425	0.07
426	0.07
427	0.07
428	0.06
429	0.08
430	0.1
431	0.11
432	0.12
433	0.13
434	0.13
435	0.13
436	0.14
437	0.13
438	0.12
439	0.1
440	0.09
441	0.09
442	0.08
443	0.09
444	0.07
445	0.07
446	0.06
447	0.08
448	0.08
449	0.08
450	0.09
451	0.09
452	0.09
453	0.1
454	0.09
455	0.08
456	0.07
457	0.08
458	0.09
459	0.09
460	0.1
461	0.1
462	0.13
463	0.13
464	0.16
465	0.17
466	0.17
467	0.18
468	0.2
469	0.2
470	0.18
471	0.18
472	0.15
473	0.14
474	0.13
475	0.12
476	0.1
477	0.12
478	0.11
479	0.1
480	0.11
481	0.11
482	0.12
483	0.14
484	0.14
485	0.11
486	0.13
487	0.15
488	0.15
489	0.16
490	0.15
491	0.16
492	0.17
493	0.17
494	0.17
495	0.17
496	0.15
497	0.15
498	0.15
499	0.15
500	0.14
501	0.14
502	0.16
503	0.15
504	0.16
505	0.16
506	0.16
507	0.12
508	0.13
509	0.12
510	0.09
511	0.1
512	0.09
513	0.08
514	0.08
515	0.08
516	0.06
517	0.06
518	0.06
519	0.04
520	0.03
521	0.03
522	0.03
523	0.03
524	0.04
525	0.06
526	0.14
527	0.22
528	0.28
529	0.34
530	0.36
531	0.38
532	0.45
533	0.49
534	0.45
535	0.42
536	0.37
537	0.32
538	0.31
539	0.29
540	0.21
541	0.15
542	0.13
543	0.07
544	0.06
545	0.06
546	0.07
547	0.08
548	0.09
549	0.1
550	0.1
551	0.12
552	0.13
553	0.13
554	0.15
555	0.18
556	0.2
557	0.21
558	0.26
559	0.26
560	0.25
561	0.24
562	0.21
563	0.25
564	0.21
565	0.2
566	0.13
567	0.15
568	0.14
569	0.15
570	0.15
571	0.08
572	0.08
573	0.11
574	0.12
575	0.09
576	0.1
577	0.09
578	0.1
579	0.11
580	0.1
581	0.08
582	0.07
583	0.07
584	0.06
585	0.06
586	0.06
587	0.05
588	0.04
589	0.04
590	0.03
591	0.03
592	0.03
593	0.03
594	0.03
595	0.08
596	0.1
597	0.12
598	0.13
599	0.19
600	0.23
601	0.31
602	0.37
603	0.42
604	0.44
605	0.48
606	0.51
607	0.46
608	0.44
609	0.39
610	0.34
611	0.3
612	0.33
613	0.28
614	0.3
615	0.35
616	0.34
617	0.34
618	0.35
619	0.34
620	0.3
621	0.37
622	0.34
623	0.32
624	0.39
625	0.42
626	0.42
627	0.38
628	0.42
629	0.41
630	0.43
631	0.45
632	0.45
633	0.47
634	0.49
635	0.52
636	0.48
637	0.44
638	0.41
639	0.43
640	0.4
641	0.36
642	0.32
643	0.3
644	0.29
645	0.29
646	0.28
647	0.2
648	0.19
649	0.17
650	0.17
651	0.15
652	0.2
653	0.23
654	0.24
655	0.27
656	0.26
657	0.26
658	0.26
659	0.27
660	0.28
661	0.32
662	0.35
663	0.34
664	0.36
665	0.35
666	0.35
667	0.37
668	0.31
669	0.3
670	0.25
671	0.25
672	0.25
673	0.29
674	0.29
675	0.3
676	0.35
677	0.31
678	0.32
679	0.3
680	0.31
681	0.29
682	0.28
683	0.25
684	0.22
685	0.19
686	0.19
687	0.18
688	0.16
689	0.16
690	0.22
691	0.3
692	0.32
693	0.37
694	0.44
695	0.48
696	0.49
697	0.56
698	0.56
699	0.54
700	0.57
701	0.63
702	0.6
703	0.55
704	0.54
705	0.5
706	0.44
707	0.45
708	0.45
709	0.44
710	0.45
711	0.45
712	0.46
713	0.46
714	0.48
715	0.46
716	0.41
717	0.39
718	0.33
719	0.32
720	0.3
721	0.26
722	0.22
723	0.17
724	0.13
725	0.06
726	0.06
727	0.06
728	0.05
729	0.05
730	0.06
731	0.06
732	0.06
733	0.07
734	0.1
735	0.11
736	0.12
737	0.13
738	0.12
739	0.12
740	0.12
741	0.13
742	0.1
743	0.12
744	0.12
745	0.11
746	0.11
747	0.11
748	0.11
749	0.11
750	0.11
751	0.11
752	0.13
753	0.17
754	0.2
755	0.21
756	0.21
757	0.22
758	0.22
759	0.2
760	0.18
761	0.14
762	0.12
763	0.13
764	0.12
765	0.11
766	0.11
767	0.11
768	0.12
769	0.11
770	0.09
771	0.08
772	0.08
773	0.06
774	0.07
775	0.06
776	0.04
777	0.04
778	0.04
779	0.04
780	0.04
781	0.04
782	0.04
783	0.07
784	0.07
785	0.09
786	0.11
787	0.12
788	0.15
789	0.16
790	0.17
791	0.16
792	0.2
793	0.2
794	0.18
795	0.19
796	0.17
797	0.15
798	0.14
799	0.14
800	0.09
801	0.09
802	0.08
803	0.07
804	0.07
805	0.06
806	0.08
807	0.09
808	0.14
809	0.15
810	0.15
811	0.15
812	0.2
813	0.29
814	0.34
815	0.38
816	0.37
817	0.41
818	0.43
819	0.45
820	0.46
821	0.43
822	0.4
823	0.4
824	0.42
825	0.42
826	0.47
827	0.49
828	0.5
829	0.45
830	0.44
831	0.4
832	0.36
833	0.36
834	0.32
835	0.34
836	0.32
837	0.32
838	0.33
839	0.35
840	0.33
841	0.28
842	0.26
843	0.21
844	0.21
845	0.21
846	0.18
847	0.15
848	0.14
849	0.14
850	0.12
851	0.11
852	0.07
853	0.06
854	0.06
855	0.06
856	0.06
857	0.07
858	0.06
859	0.08
860	0.08
861	0.09
862	0.12
863	0.13
864	0.14
865	0.15
866	0.17
867	0.16
868	0.17
869	0.16
870	0.14
871	0.16
872	0.16
873	0.19
874	0.25
875	0.26
876	0.27
877	0.27
878	0.29
879	0.31
880	0.31
881	0.31
882	0.3
883	0.37
884	0.37
885	0.39
886	0.45
887	0.47
888	0.53
889	0.54
890	0.57
891	0.51
892	0.55
893	0.59
894	0.55
895	0.51
896	0.47
897	0.45
898	0.42
899	0.49
900	0.52
901	0.51
902	0.51
903	0.52
904	0.48
905	0.47
906	0.47
907	0.47
908	0.42
909	0.38
910	0.37
911	0.37
912	0.38
913	0.42
914	0.37
915	0.33
916	0.3
917	0.3
918	0.26
919	0.28
920	0.29
921	0.3
922	0.35
923	0.3
924	0.33
925	0.37
926	0.43
927	0.46
928	0.46
929	0.44
930	0.47
931	0.57
932	0.61
933	0.65
934	0.69
935	0.7
936	0.77
937	0.8
938	0.76
939	0.7
940	0.68
941	0.67
942	0.57
943	0.49
944	0.4
945	0.34
946	0.28
947	0.28
948	0.27
949	0.29
950	0.34
951	0.38
952	0.43
953	0.46
954	0.51
955	0.5
956	0.5
957	0.44
958	0.39
959	0.4
960	0.37
961	0.38
962	0.39
963	0.44
964	0.47
965	0.49
966	0.53
967	0.56
968	0.63
969	0.66
970	0.66
971	0.62
972	0.6
973	0.55
974	0.5
975	0.45
976	0.36
977	0.28
978	0.22
979	0.18
980	0.11
981	0.11
982	0.11
983	0.15
984	0.14
985	0.15
986	0.17
987	0.18
988	0.2
989	0.25
990	0.25
991	0.2
992	0.22
993	0.24
994	0.25
995	0.24
996	0.25
997	0.22

A0A060SS58

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer