Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A060SK40

Protein Details
Accession A0A060SK40    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-56RPGPEIPKSPPKKMRKLPPLPGYLLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-47IPKSPPKKMRK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14, nucl 13.5, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MKRPIGLVDYAGSEEDSDSDASDAVQNVSPPRPGPEIPKSPPKKMRKLPPLPGYLLPQVQVDNPALHQGRRRTTPHVEGQFAAYVYVPLLVERRSRLYKLLLRVFEAAKRLVPSLYPIGFSECELSSKDTGSADVSEGAAVELHLSLTRPTYLRAHQRADFKKAVQDAAKATRRFSASFATFSELTNDEKTRTFLTLEVGAGHEEFKALSEHLTPILKSLRQKEFYQDPRFHASIAWALLDGARAGPRQGPVDATDDGPERATTPTLEGRVVDSGDGFPTIPCFPRTLVPALCAEFARELVESKVGAFDAEEVRVRIGKEVSQWRLRDQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.1
3 0.11
4 0.09
5 0.09
6 0.09
7 0.09
8 0.09
9 0.11
10 0.11
11 0.11
12 0.13
13 0.14
14 0.17
15 0.19
16 0.21
17 0.2
18 0.23
19 0.26
20 0.27
21 0.33
22 0.39
23 0.46
24 0.5
25 0.6
26 0.62
27 0.67
28 0.75
29 0.76
30 0.77
31 0.78
32 0.83
33 0.83
34 0.87
35 0.87
36 0.86
37 0.82
38 0.75
39 0.69
40 0.63
41 0.55
42 0.47
43 0.37
44 0.3
45 0.24
46 0.21
47 0.21
48 0.17
49 0.14
50 0.13
51 0.2
52 0.2
53 0.21
54 0.27
55 0.31
56 0.35
57 0.41
58 0.45
59 0.44
60 0.5
61 0.55
62 0.58
63 0.56
64 0.52
65 0.46
66 0.45
67 0.4
68 0.33
69 0.26
70 0.17
71 0.11
72 0.09
73 0.1
74 0.07
75 0.06
76 0.08
77 0.09
78 0.12
79 0.13
80 0.19
81 0.21
82 0.23
83 0.25
84 0.31
85 0.34
86 0.4
87 0.45
88 0.41
89 0.4
90 0.41
91 0.4
92 0.34
93 0.32
94 0.24
95 0.19
96 0.19
97 0.17
98 0.15
99 0.14
100 0.14
101 0.17
102 0.16
103 0.16
104 0.15
105 0.17
106 0.17
107 0.17
108 0.16
109 0.12
110 0.12
111 0.13
112 0.15
113 0.12
114 0.12
115 0.13
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.1
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.04
128 0.04
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.04
133 0.04
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.08
138 0.11
139 0.16
140 0.25
141 0.3
142 0.33
143 0.36
144 0.45
145 0.46
146 0.5
147 0.47
148 0.38
149 0.37
150 0.34
151 0.33
152 0.24
153 0.23
154 0.19
155 0.25
156 0.31
157 0.28
158 0.28
159 0.29
160 0.3
161 0.28
162 0.27
163 0.25
164 0.2
165 0.21
166 0.21
167 0.2
168 0.19
169 0.18
170 0.19
171 0.15
172 0.15
173 0.16
174 0.16
175 0.14
176 0.15
177 0.16
178 0.15
179 0.15
180 0.13
181 0.12
182 0.13
183 0.13
184 0.12
185 0.11
186 0.11
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.07
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.08
199 0.1
200 0.11
201 0.1
202 0.12
203 0.15
204 0.17
205 0.2
206 0.27
207 0.33
208 0.36
209 0.37
210 0.41
211 0.47
212 0.54
213 0.59
214 0.55
215 0.51
216 0.54
217 0.54
218 0.48
219 0.38
220 0.3
221 0.25
222 0.21
223 0.17
224 0.1
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.08
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.1
234 0.12
235 0.14
236 0.14
237 0.15
238 0.15
239 0.19
240 0.19
241 0.18
242 0.18
243 0.17
244 0.17
245 0.17
246 0.15
247 0.12
248 0.12
249 0.13
250 0.11
251 0.13
252 0.17
253 0.18
254 0.18
255 0.18
256 0.18
257 0.19
258 0.19
259 0.15
260 0.12
261 0.11
262 0.11
263 0.11
264 0.09
265 0.08
266 0.1
267 0.12
268 0.13
269 0.14
270 0.15
271 0.16
272 0.19
273 0.23
274 0.27
275 0.26
276 0.26
277 0.28
278 0.28
279 0.28
280 0.25
281 0.23
282 0.18
283 0.17
284 0.16
285 0.13
286 0.13
287 0.13
288 0.14
289 0.13
290 0.12
291 0.13
292 0.12
293 0.11
294 0.1
295 0.12
296 0.12
297 0.15
298 0.16
299 0.16
300 0.18
301 0.2
302 0.2
303 0.21
304 0.21
305 0.21
306 0.28
307 0.37
308 0.43
309 0.48