Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A060SEN0

Protein Details
Accession A0A060SEN0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-254RSSAQPVPRPNLKRRRRQRQPSSSCGNEWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
237-242LKRRRR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 11.5, mito 6, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001356  Homeobox_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00046  Homeodomain  
CDD cd00086  homeodomain  
Amino Acid Sequences MTSDMPSSPRKSRSSSRLASAAYDEDSLGASPATPYGVSSVPVMKASSMEPVRGRPAGDGKRSRHKMTDLQLQRLEELYQADTHPSRAAKEALAAEIGIQLLLSECRPVVSLDSAHVRQTSGETPARIARSPSSSLESVSSDDAATPHALWKFIISSPPPPPPVPNAALHAPHRARQPFGDVQGSRQHKPDLEWACANSAARRKHGYYVYRDEDDSEGESSELEGRSSAQPVPRPNLKRRRRQRQPSSSCGNEWASAVPEEYEKLFPPDLVLGANLLLTLKHSAGPARL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.66
3 0.64
4 0.62
5 0.59
6 0.53
7 0.47
8 0.4
9 0.31
10 0.26
11 0.2
12 0.15
13 0.14
14 0.12
15 0.1
16 0.08
17 0.06
18 0.06
19 0.06
20 0.07
21 0.06
22 0.06
23 0.09
24 0.1
25 0.1
26 0.12
27 0.14
28 0.14
29 0.16
30 0.16
31 0.13
32 0.14
33 0.13
34 0.2
35 0.18
36 0.21
37 0.22
38 0.24
39 0.29
40 0.29
41 0.29
42 0.24
43 0.32
44 0.36
45 0.43
46 0.48
47 0.5
48 0.59
49 0.65
50 0.65
51 0.6
52 0.58
53 0.56
54 0.55
55 0.6
56 0.54
57 0.56
58 0.55
59 0.51
60 0.47
61 0.4
62 0.33
63 0.24
64 0.2
65 0.14
66 0.12
67 0.12
68 0.14
69 0.14
70 0.14
71 0.16
72 0.15
73 0.15
74 0.17
75 0.18
76 0.15
77 0.17
78 0.17
79 0.15
80 0.14
81 0.13
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.05
86 0.04
87 0.03
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.05
94 0.06
95 0.06
96 0.07
97 0.08
98 0.09
99 0.1
100 0.15
101 0.15
102 0.16
103 0.16
104 0.14
105 0.13
106 0.15
107 0.14
108 0.15
109 0.16
110 0.15
111 0.16
112 0.19
113 0.21
114 0.19
115 0.19
116 0.16
117 0.18
118 0.2
119 0.2
120 0.2
121 0.18
122 0.18
123 0.18
124 0.17
125 0.15
126 0.13
127 0.12
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.05
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.09
140 0.09
141 0.12
142 0.11
143 0.15
144 0.18
145 0.22
146 0.24
147 0.23
148 0.24
149 0.24
150 0.27
151 0.26
152 0.24
153 0.23
154 0.23
155 0.25
156 0.25
157 0.3
158 0.26
159 0.27
160 0.31
161 0.3
162 0.29
163 0.27
164 0.32
165 0.27
166 0.29
167 0.33
168 0.27
169 0.28
170 0.35
171 0.39
172 0.34
173 0.33
174 0.32
175 0.26
176 0.28
177 0.34
178 0.29
179 0.29
180 0.3
181 0.28
182 0.28
183 0.28
184 0.26
185 0.22
186 0.25
187 0.24
188 0.26
189 0.29
190 0.3
191 0.34
192 0.41
193 0.43
194 0.43
195 0.49
196 0.5
197 0.48
198 0.46
199 0.42
200 0.36
201 0.31
202 0.26
203 0.18
204 0.13
205 0.11
206 0.11
207 0.1
208 0.12
209 0.11
210 0.09
211 0.08
212 0.1
213 0.12
214 0.14
215 0.16
216 0.17
217 0.22
218 0.27
219 0.34
220 0.4
221 0.46
222 0.54
223 0.63
224 0.68
225 0.74
226 0.81
227 0.85
228 0.88
229 0.92
230 0.93
231 0.94
232 0.93
233 0.91
234 0.88
235 0.81
236 0.71
237 0.65
238 0.56
239 0.45
240 0.38
241 0.3
242 0.24
243 0.2
244 0.19
245 0.15
246 0.13
247 0.14
248 0.15
249 0.15
250 0.14
251 0.18
252 0.18
253 0.17
254 0.18
255 0.18
256 0.16
257 0.15
258 0.14
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.08
263 0.07
264 0.06
265 0.07
266 0.09
267 0.09
268 0.11
269 0.12