Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JXM0

Protein Details
Accession C4JXM0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MPEKSKSRKGRPRMPTGGSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-12KSRKGRP
Subcellular Location(s) mito 16, nucl 8, cyto_nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016180  Ribosomal_L10e/L16  
IPR036920  Ribosomal_L10e/L16_sf  
IPR000114  Ribosomal_L16  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG ure:UREG_06393  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00252  Ribosomal_L16  
CDD cd01433  Ribosomal_L16_L10e  
Amino Acid Sequences MPEKSKSRKGRPRMPTGGSTRGTTVVWGDYGLRMKDHDRRISASQLKIGMETINRRLRGMDFKLYTRVSANIGVYTSGNEQRMGKGKGLYEFVKKGDPPVVGITKLTDGITLDSLKRARREITPTVITEQPSVSSASVTP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.78
3 0.74
4 0.72
5 0.64
6 0.56
7 0.47
8 0.4
9 0.35
10 0.27
11 0.21
12 0.14
13 0.12
14 0.11
15 0.1
16 0.11
17 0.15
18 0.15
19 0.14
20 0.15
21 0.19
22 0.26
23 0.33
24 0.36
25 0.35
26 0.39
27 0.42
28 0.49
29 0.5
30 0.44
31 0.4
32 0.36
33 0.33
34 0.29
35 0.26
36 0.19
37 0.15
38 0.17
39 0.22
40 0.25
41 0.25
42 0.25
43 0.25
44 0.26
45 0.31
46 0.31
47 0.3
48 0.27
49 0.27
50 0.32
51 0.31
52 0.3
53 0.24
54 0.21
55 0.16
56 0.16
57 0.15
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.09
62 0.09
63 0.1
64 0.1
65 0.11
66 0.11
67 0.12
68 0.14
69 0.2
70 0.21
71 0.2
72 0.2
73 0.21
74 0.22
75 0.25
76 0.25
77 0.23
78 0.23
79 0.23
80 0.24
81 0.23
82 0.23
83 0.23
84 0.21
85 0.19
86 0.22
87 0.23
88 0.2
89 0.2
90 0.19
91 0.16
92 0.17
93 0.15
94 0.1
95 0.09
96 0.1
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.15
101 0.19
102 0.22
103 0.25
104 0.26
105 0.27
106 0.32
107 0.39
108 0.4
109 0.45
110 0.45
111 0.45
112 0.46
113 0.46
114 0.41
115 0.36
116 0.3
117 0.24
118 0.2
119 0.2
120 0.16