Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A060SHD5

Protein Details
Accession A0A060SHD5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-77AGRNAIPKPNTRPRRRGAPTPPPSLHydrophilic
545-568WDLPGWKDSRRRPVKYQSIVNMKFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
64-68RPRRR
Subcellular Location(s) cyto 11, mito 6, nucl 5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR011063  TilS/TtcA_N  
IPR012094  tRNA_Ile_lys_synt  
IPR012795  tRNA_Ile_lys_synt_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016879  F:ligase activity, forming carbon-nitrogen bonds  
GO:0006400  P:tRNA modification  
Pfam View protein in Pfam  
PF01171  ATP_bind_3  
CDD cd01992  PP-ATPase  
Amino Acid Sequences MPPSIIPPITPAEFFQYLQRCIPPTGWSSKIVVANSGGPDSTALLFLLNAVIAGRNAIPKPNTRPRRRGAPTPPPSLPEQLVSVHVNHSLQAAATDMERVATAMALRYKLSFHTERIPWGEHPFPARDAVDEKVAREARYSRLFNAMGRVQSDVIAFAHHADDQVETAIMRMSQGSSARGLAAMRPVRRWGMGKKDNEYFAFGADGMRRWIVRPLLHVSKDRLMATCEANKLDYIHDPTNFQPDLTFRNQVRRHLLLADESSPPASQQLSRDIEPFISRMRAEVRHVHPPEQLREAVRLYGIRLEEVDSQVTNILAHSRMPSPPSTLLLKSHELAEATEEEVRIALIRRCLRYVSHGPWGAVWAEANGGRDTLRRVSEELWPSTPRTPLLEMPIDPITETHVDPRKTFAAGAGVLVTPVVIKLKKGEVRYRGRKLDDEDEVEGWIFSRSPPYHKSPSHPGDKTVVDVTNGIKAARAAGQETYRVLYDYRFDMAFKATANLPKDVEEHIFVRNGRIVIEPDTKWVLPSIMMRGGYMSNRCIGKYLWDLPGWKDSRRRPVKYQSIVNMKFIRSLDAI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.32
3 0.33
4 0.34
5 0.37
6 0.39
7 0.35
8 0.35
9 0.37
10 0.33
11 0.32
12 0.36
13 0.36
14 0.35
15 0.35
16 0.38
17 0.41
18 0.37
19 0.33
20 0.28
21 0.29
22 0.28
23 0.26
24 0.2
25 0.16
26 0.16
27 0.15
28 0.14
29 0.11
30 0.09
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.06
36 0.05
37 0.05
38 0.06
39 0.05
40 0.07
41 0.08
42 0.12
43 0.13
44 0.19
45 0.22
46 0.28
47 0.38
48 0.48
49 0.58
50 0.63
51 0.71
52 0.73
53 0.81
54 0.81
55 0.81
56 0.81
57 0.82
58 0.8
59 0.79
60 0.74
61 0.65
62 0.62
63 0.56
64 0.47
65 0.37
66 0.31
67 0.24
68 0.26
69 0.25
70 0.22
71 0.19
72 0.2
73 0.18
74 0.16
75 0.16
76 0.12
77 0.1
78 0.1
79 0.09
80 0.07
81 0.07
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.09
91 0.11
92 0.12
93 0.13
94 0.13
95 0.14
96 0.16
97 0.22
98 0.22
99 0.22
100 0.29
101 0.31
102 0.35
103 0.38
104 0.39
105 0.35
106 0.37
107 0.37
108 0.31
109 0.33
110 0.31
111 0.28
112 0.28
113 0.26
114 0.22
115 0.22
116 0.21
117 0.25
118 0.24
119 0.23
120 0.28
121 0.3
122 0.28
123 0.29
124 0.3
125 0.29
126 0.36
127 0.38
128 0.31
129 0.36
130 0.36
131 0.34
132 0.37
133 0.34
134 0.27
135 0.26
136 0.26
137 0.2
138 0.2
139 0.19
140 0.14
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.09
146 0.08
147 0.08
148 0.07
149 0.08
150 0.07
151 0.08
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.08
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.09
169 0.16
170 0.2
171 0.2
172 0.21
173 0.23
174 0.24
175 0.26
176 0.29
177 0.28
178 0.34
179 0.4
180 0.43
181 0.46
182 0.48
183 0.49
184 0.45
185 0.43
186 0.32
187 0.25
188 0.21
189 0.16
190 0.14
191 0.12
192 0.12
193 0.09
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.14
198 0.16
199 0.16
200 0.19
201 0.24
202 0.3
203 0.33
204 0.35
205 0.34
206 0.35
207 0.36
208 0.33
209 0.28
210 0.23
211 0.23
212 0.23
213 0.23
214 0.21
215 0.18
216 0.18
217 0.17
218 0.16
219 0.16
220 0.16
221 0.17
222 0.18
223 0.18
224 0.19
225 0.2
226 0.25
227 0.24
228 0.21
229 0.16
230 0.15
231 0.2
232 0.21
233 0.26
234 0.21
235 0.31
236 0.33
237 0.37
238 0.41
239 0.38
240 0.36
241 0.31
242 0.31
243 0.24
244 0.23
245 0.2
246 0.15
247 0.14
248 0.13
249 0.12
250 0.11
251 0.1
252 0.09
253 0.08
254 0.09
255 0.16
256 0.18
257 0.19
258 0.2
259 0.2
260 0.2
261 0.19
262 0.18
263 0.12
264 0.11
265 0.1
266 0.1
267 0.13
268 0.14
269 0.16
270 0.23
271 0.25
272 0.33
273 0.34
274 0.35
275 0.35
276 0.37
277 0.36
278 0.31
279 0.3
280 0.21
281 0.22
282 0.21
283 0.18
284 0.15
285 0.13
286 0.11
287 0.12
288 0.11
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.11
293 0.11
294 0.12
295 0.08
296 0.09
297 0.09
298 0.08
299 0.06
300 0.05
301 0.06
302 0.05
303 0.06
304 0.07
305 0.09
306 0.1
307 0.12
308 0.12
309 0.15
310 0.15
311 0.17
312 0.18
313 0.18
314 0.19
315 0.21
316 0.22
317 0.19
318 0.19
319 0.17
320 0.15
321 0.14
322 0.13
323 0.1
324 0.09
325 0.1
326 0.09
327 0.08
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.08
332 0.08
333 0.14
334 0.18
335 0.19
336 0.2
337 0.22
338 0.22
339 0.27
340 0.32
341 0.3
342 0.33
343 0.34
344 0.33
345 0.32
346 0.32
347 0.25
348 0.19
349 0.15
350 0.07
351 0.07
352 0.08
353 0.1
354 0.08
355 0.08
356 0.09
357 0.1
358 0.12
359 0.14
360 0.15
361 0.14
362 0.16
363 0.18
364 0.24
365 0.28
366 0.28
367 0.28
368 0.28
369 0.29
370 0.3
371 0.3
372 0.23
373 0.22
374 0.22
375 0.21
376 0.24
377 0.24
378 0.22
379 0.24
380 0.24
381 0.21
382 0.18
383 0.16
384 0.14
385 0.13
386 0.13
387 0.17
388 0.23
389 0.24
390 0.25
391 0.28
392 0.27
393 0.26
394 0.26
395 0.2
396 0.17
397 0.16
398 0.16
399 0.13
400 0.11
401 0.1
402 0.1
403 0.08
404 0.04
405 0.05
406 0.08
407 0.07
408 0.07
409 0.1
410 0.18
411 0.22
412 0.28
413 0.36
414 0.42
415 0.53
416 0.62
417 0.68
418 0.68
419 0.67
420 0.66
421 0.64
422 0.61
423 0.55
424 0.49
425 0.43
426 0.36
427 0.33
428 0.29
429 0.23
430 0.17
431 0.12
432 0.08
433 0.06
434 0.14
435 0.15
436 0.2
437 0.26
438 0.33
439 0.41
440 0.44
441 0.51
442 0.53
443 0.59
444 0.64
445 0.6
446 0.56
447 0.52
448 0.5
449 0.46
450 0.39
451 0.32
452 0.23
453 0.23
454 0.21
455 0.2
456 0.2
457 0.17
458 0.14
459 0.13
460 0.14
461 0.16
462 0.16
463 0.13
464 0.16
465 0.18
466 0.19
467 0.2
468 0.2
469 0.17
470 0.17
471 0.16
472 0.14
473 0.15
474 0.15
475 0.16
476 0.15
477 0.15
478 0.16
479 0.18
480 0.18
481 0.15
482 0.16
483 0.17
484 0.22
485 0.25
486 0.26
487 0.24
488 0.24
489 0.26
490 0.26
491 0.25
492 0.23
493 0.22
494 0.21
495 0.25
496 0.23
497 0.25
498 0.26
499 0.23
500 0.21
501 0.23
502 0.23
503 0.25
504 0.31
505 0.28
506 0.28
507 0.32
508 0.31
509 0.29
510 0.28
511 0.22
512 0.18
513 0.21
514 0.22
515 0.22
516 0.22
517 0.22
518 0.22
519 0.24
520 0.26
521 0.26
522 0.23
523 0.24
524 0.25
525 0.25
526 0.26
527 0.24
528 0.26
529 0.3
530 0.34
531 0.33
532 0.35
533 0.37
534 0.38
535 0.47
536 0.44
537 0.42
538 0.46
539 0.5
540 0.58
541 0.66
542 0.7
543 0.7
544 0.78
545 0.83
546 0.83
547 0.83
548 0.81
549 0.82
550 0.77
551 0.76
552 0.7
553 0.6
554 0.57
555 0.48