FuNGI

A0A060SSR5

Protein Details

Accession

A0A060SSR5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
106-129	SRPTGSSSKVEKRRRTLPRDVDGF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
409-416	ERKQAAKR

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR003395 RecF/RecN/SMC_N IPR027131 SMC5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030915 C:Smc5-Smc6 complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination
Pfam	View protein in Pfam PF02463 SMC_N

Amino Acid Sequences

MARRAASHGSEDSLKENNDVASKTRSSKATNDQGARGKRAAMGEHVDAEDDLVQRDEADEDAPGDAEDQDDDAQADEDGNVEDDEDEDEGDSARRKRARVNTEGDSRPTGSSSKVEKRRRTLPRDVDGFIPGSIVRIQLENFLTYDWVEFRPGPQLNMIFGPNGTGKSSIACAICIGLNFPLKLLNRAADIPAYVKNEKESGYVEIELKGAIGQPNLVIRRMLTRKSKTTHYTLNGKPATGKEVDARMAELNVQVGNLCTFLPQDRVAEFARMSPQELLRETQRAAGNENLTSWHDTLISAGQELKQVQERANSDREQLKTMVERNANLERDVRRYEERRALENKIELLEFIVPIKEYYEAREKYRIMKPKHHEAVRNLQRLQKRHKPYLDMDKALEQELKDRERQREERKQAAKRKFSQMSAKWEENERLESRAEDIKNRLDNIKKGERERLTTIKRLEKSIAEAEQRLANPPELENLEDLNRQLKELAQQNNANRQRQQELQEQQRANIEKSSRCRQEIDQISRNLQQLDNQSHQKLEMLKRFDSDCGEVVEWLRQNKHRFRMEVFEPAFLCVTVPNKAFADAVESCFGGTQLRTFVAQCEEDYQLLNRLCVDTPEAIGRKARINTWYKARDESRLLPPPLPREDLLQLGFDGYAVDFIDCPDGLRWFLCSDVRLHRTAIALNPNAVDPNRAMDMAARAGGANYIIGRNTTRELQNARSLTVATVDPQVKRNFHIRLDEARERLRIVEQEEKELGEVDKQIHAEHRAFKEAHDSITARKQAVMEEQRKLQSLQLRVGECLPINAYVNGEGERLFVDEHKKKLAKLQNAPPADVERNQLKQELLTLAHRRVQIVRDYVGLMRSAIKEQEKATRAGLEYIQVCANKAALEALCKEQMDEIKEVEAATLRIHAEYKALKEDSKRRLEISRAKFNEVSDEAKEEFNKLEERGEIEAKSADEWEAELQQSREELELNTNTNGNVIDQYNKRKAEIETLTATIEDHEKRIIKIEQNIKTARDNWQPELEKLVNSIGRKFSAAFDRIGCAGEIRIREEEDYEKWAIDIMVKFRDDEKLQLLTGERQSGGERSLTTILYLMSLTEEARAPFSLVDEINQGMDQRAERAVHNSLVEVTCKPDSGQYFLITPKLLPDLNYHERMKILCVNNGEWLPEERGLGNMMGLIDNALRARQNRGNAAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.25
3	0.25
4	0.24
5	0.25
6	0.25
7	0.26
8	0.27
9	0.3
10	0.34
11	0.38
12	0.4
13	0.41
14	0.47
15	0.53
16	0.57
17	0.62
18	0.62
19	0.63
20	0.67
21	0.68
22	0.66
23	0.57
24	0.48
25	0.43
26	0.42
27	0.37
28	0.33
29	0.33
30	0.29
31	0.31
32	0.29
33	0.26
34	0.23
35	0.21
36	0.19
37	0.15
38	0.14
39	0.12
40	0.12
41	0.11
42	0.12
43	0.12
44	0.1
45	0.09
46	0.09
47	0.09
48	0.09
49	0.09
50	0.09
51	0.09
52	0.08
53	0.08
54	0.08
55	0.08
56	0.09
57	0.09
58	0.09
59	0.09
60	0.09
61	0.09
62	0.09
63	0.07
64	0.07
65	0.07
66	0.08
67	0.08
68	0.07
69	0.07
70	0.07
71	0.09
72	0.08
73	0.08
74	0.07
75	0.07
76	0.08
77	0.1
78	0.15
79	0.17
80	0.25
81	0.29
82	0.3
83	0.4
84	0.49
85	0.56
86	0.59
87	0.63
88	0.64
89	0.69
90	0.71
91	0.65
92	0.59
93	0.52
94	0.44
95	0.39
96	0.32
97	0.26
98	0.28
99	0.33
100	0.4
101	0.48
102	0.57
103	0.64
104	0.7
105	0.78
106	0.81
107	0.81
108	0.82
109	0.81
110	0.81
111	0.77
112	0.71
113	0.63
114	0.55
115	0.48
116	0.37
117	0.28
118	0.18
119	0.15
120	0.14
121	0.13
122	0.11
123	0.11
124	0.12
125	0.16
126	0.17
127	0.16
128	0.16
129	0.15
130	0.15
131	0.14
132	0.15
133	0.13
134	0.12
135	0.14
136	0.14
137	0.15
138	0.23
139	0.23
140	0.23
141	0.26
142	0.26
143	0.25
144	0.27
145	0.27
146	0.19
147	0.17
148	0.19
149	0.16
150	0.16
151	0.15
152	0.14
153	0.13
154	0.14
155	0.15
156	0.16
157	0.15
158	0.14
159	0.13
160	0.13
161	0.14
162	0.13
163	0.13
164	0.12
165	0.15
166	0.15
167	0.14
168	0.19
169	0.19
170	0.22
171	0.23
172	0.21
173	0.2
174	0.22
175	0.23
176	0.18
177	0.18
178	0.16
179	0.19
180	0.23
181	0.22
182	0.21
183	0.22
184	0.24
185	0.24
186	0.24
187	0.21
188	0.19
189	0.21
190	0.22
191	0.21
192	0.2
193	0.19
194	0.17
195	0.15
196	0.11
197	0.11
198	0.1
199	0.09
200	0.09
201	0.1
202	0.16
203	0.17
204	0.18
205	0.16
206	0.15
207	0.24
208	0.29
209	0.35
210	0.39
211	0.44
212	0.51
213	0.55
214	0.63
215	0.59
216	0.61
217	0.62
218	0.59
219	0.62
220	0.57
221	0.63
222	0.56
223	0.51
224	0.47
225	0.39
226	0.37
227	0.29
228	0.27
229	0.21
230	0.23
231	0.25
232	0.23
233	0.23
234	0.19
235	0.18
236	0.17
237	0.14
238	0.12
239	0.09
240	0.09
241	0.08
242	0.07
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.06
247	0.07
248	0.08
249	0.11
250	0.12
251	0.14
252	0.13
253	0.17
254	0.17
255	0.19
256	0.18
257	0.17
258	0.21
259	0.2
260	0.22
261	0.21
262	0.22
263	0.24
264	0.25
265	0.26
266	0.23
267	0.26
268	0.24
269	0.28
270	0.29
271	0.26
272	0.28
273	0.29
274	0.28
275	0.25
276	0.25
277	0.21
278	0.19
279	0.21
280	0.18
281	0.14
282	0.13
283	0.12
284	0.13
285	0.13
286	0.12
287	0.09
288	0.1
289	0.1
290	0.13
291	0.13
292	0.14
293	0.17
294	0.18
295	0.2
296	0.25
297	0.27
298	0.29
299	0.34
300	0.33
301	0.32
302	0.36
303	0.36
304	0.33
305	0.31
306	0.29
307	0.29
308	0.31
309	0.34
310	0.3
311	0.29
312	0.31
313	0.37
314	0.35
315	0.32
316	0.33
317	0.28
318	0.32
319	0.33
320	0.32
321	0.33
322	0.35
323	0.41
324	0.44
325	0.44
326	0.46
327	0.49
328	0.49
329	0.46
330	0.44
331	0.39
332	0.32
333	0.29
334	0.22
335	0.19
336	0.15
337	0.11
338	0.09
339	0.08
340	0.07
341	0.07
342	0.08
343	0.09
344	0.08
345	0.12
346	0.21
347	0.23
348	0.26
349	0.32
350	0.33
351	0.38
352	0.45
353	0.51
354	0.47
355	0.55
356	0.58
357	0.63
358	0.7
359	0.68
360	0.67
361	0.63
362	0.69
363	0.68
364	0.69
365	0.6
366	0.57
367	0.57
368	0.57
369	0.61
370	0.59
371	0.58
372	0.6
373	0.62
374	0.62
375	0.64
376	0.68
377	0.66
378	0.58
379	0.51
380	0.46
381	0.42
382	0.38
383	0.33
384	0.22
385	0.21
386	0.23
387	0.24
388	0.28
389	0.32
390	0.37
391	0.44
392	0.53
393	0.57
394	0.63
395	0.67
396	0.71
397	0.75
398	0.78
399	0.79
400	0.8
401	0.79
402	0.74
403	0.77
404	0.71
405	0.67
406	0.68
407	0.64
408	0.64
409	0.61
410	0.57
411	0.49
412	0.48
413	0.46
414	0.38
415	0.37
416	0.28
417	0.24
418	0.22
419	0.21
420	0.21
421	0.24
422	0.23
423	0.21
424	0.23
425	0.27
426	0.29
427	0.3
428	0.32
429	0.3
430	0.33
431	0.37
432	0.42
433	0.41
434	0.41
435	0.49
436	0.47
437	0.47
438	0.49
439	0.5
440	0.46
441	0.48
442	0.5
443	0.5
444	0.48
445	0.46
446	0.43
447	0.35
448	0.35
449	0.32
450	0.31
451	0.25
452	0.24
453	0.23
454	0.24
455	0.23
456	0.22
457	0.19
458	0.16
459	0.14
460	0.14
461	0.15
462	0.13
463	0.13
464	0.11
465	0.11
466	0.12
467	0.12
468	0.12
469	0.13
470	0.13
471	0.12
472	0.12
473	0.12
474	0.15
475	0.21
476	0.26
477	0.27
478	0.31
479	0.34
480	0.44
481	0.49
482	0.47
483	0.42
484	0.4
485	0.39
486	0.39
487	0.41
488	0.39
489	0.41
490	0.46
491	0.51
492	0.49
493	0.46
494	0.47
495	0.44
496	0.36
497	0.33
498	0.28
499	0.25
500	0.31
501	0.39
502	0.37
503	0.37
504	0.39
505	0.37
506	0.43
507	0.48
508	0.5
509	0.48
510	0.45
511	0.46
512	0.47
513	0.47
514	0.38
515	0.29
516	0.25
517	0.24
518	0.27
519	0.28
520	0.28
521	0.27
522	0.26
523	0.26
524	0.24
525	0.24
526	0.26
527	0.27
528	0.28
529	0.28
530	0.29
531	0.3
532	0.29
533	0.26
534	0.21
535	0.16
536	0.14
537	0.14
538	0.12
539	0.12
540	0.14
541	0.14
542	0.14
543	0.16
544	0.19
545	0.26
546	0.32
547	0.39
548	0.41
549	0.41
550	0.42
551	0.45
552	0.42
553	0.44
554	0.39
555	0.33
556	0.28
557	0.27
558	0.25
559	0.18
560	0.16
561	0.08
562	0.09
563	0.1
564	0.1
565	0.11
566	0.11
567	0.12
568	0.12
569	0.1
570	0.14
571	0.11
572	0.13
573	0.12
574	0.11
575	0.11
576	0.11
577	0.11
578	0.06
579	0.06
580	0.05
581	0.05
582	0.06
583	0.06
584	0.07
585	0.08
586	0.09
587	0.1
588	0.09
589	0.11
590	0.11
591	0.11
592	0.11
593	0.11
594	0.14
595	0.14
596	0.14
597	0.11
598	0.11
599	0.11
600	0.11
601	0.13
602	0.07
603	0.08
604	0.12
605	0.12
606	0.12
607	0.13
608	0.14
609	0.16
610	0.17
611	0.18
612	0.21
613	0.25
614	0.28
615	0.36
616	0.39
617	0.37
618	0.41
619	0.41
620	0.38
621	0.37
622	0.38
623	0.37
624	0.4
625	0.39
626	0.37
627	0.38
628	0.38
629	0.37
630	0.35
631	0.27
632	0.23
633	0.23
634	0.22
635	0.21
636	0.16
637	0.14
638	0.12
639	0.11
640	0.08
641	0.07
642	0.04
643	0.04
644	0.04
645	0.04
646	0.04
647	0.04
648	0.05
649	0.05
650	0.05
651	0.06
652	0.06
653	0.07
654	0.07
655	0.08
656	0.07
657	0.08
658	0.09
659	0.09
660	0.11
661	0.18
662	0.21
663	0.21
664	0.21
665	0.21
666	0.21
667	0.22
668	0.22
669	0.21
670	0.18
671	0.17
672	0.17
673	0.16
674	0.16
675	0.15
676	0.13
677	0.07
678	0.09
679	0.09
680	0.09
681	0.08
682	0.08
683	0.1
684	0.09
685	0.09
686	0.07
687	0.06
688	0.06
689	0.07
690	0.06
691	0.04
692	0.04
693	0.04
694	0.04
695	0.05
696	0.06
697	0.07
698	0.09
699	0.12
700	0.13
701	0.16
702	0.19
703	0.22
704	0.28
705	0.27
706	0.26
707	0.23
708	0.22
709	0.18
710	0.17
711	0.14
712	0.09
713	0.13
714	0.15
715	0.16
716	0.2
717	0.24
718	0.23
719	0.25
720	0.31
721	0.29
722	0.3
723	0.33
724	0.31
725	0.35
726	0.42
727	0.44
728	0.4
729	0.39
730	0.37
731	0.33
732	0.31
733	0.26
734	0.2
735	0.2
736	0.26
737	0.24
738	0.27
739	0.27
740	0.26
741	0.24
742	0.23
743	0.19
744	0.11
745	0.12
746	0.1
747	0.11
748	0.12
749	0.12
750	0.13
751	0.16
752	0.18
753	0.23
754	0.23
755	0.26
756	0.26
757	0.26
758	0.31
759	0.29
760	0.27
761	0.24
762	0.22
763	0.21
764	0.28
765	0.3
766	0.22
767	0.23
768	0.22
769	0.2
770	0.28
771	0.34
772	0.32
773	0.33
774	0.36
775	0.37
776	0.38
777	0.37
778	0.32
779	0.29
780	0.27
781	0.29
782	0.3
783	0.3
784	0.29
785	0.29
786	0.27
787	0.21
788	0.19
789	0.15
790	0.11
791	0.11
792	0.11
793	0.1
794	0.1
795	0.1
796	0.1
797	0.1
798	0.09
799	0.08
800	0.08
801	0.08
802	0.07
803	0.08
804	0.17
805	0.21
806	0.23
807	0.3
808	0.31
809	0.31
810	0.4
811	0.46
812	0.47
813	0.51
814	0.58
815	0.59
816	0.59
817	0.59
818	0.51
819	0.48
820	0.41
821	0.34
822	0.29
823	0.25
824	0.27
825	0.27
826	0.28
827	0.24
828	0.21
829	0.22
830	0.2
831	0.17
832	0.2
833	0.23
834	0.23
835	0.28
836	0.28
837	0.27
838	0.28
839	0.29
840	0.28
841	0.27
842	0.26
843	0.23
844	0.23
845	0.23
846	0.21
847	0.18
848	0.13
849	0.13
850	0.13
851	0.14
852	0.16
853	0.17
854	0.19
855	0.2
856	0.28
857	0.28
858	0.29
859	0.28
860	0.28
861	0.27
862	0.26
863	0.25
864	0.2
865	0.18
866	0.18
867	0.2
868	0.16
869	0.16
870	0.14
871	0.14
872	0.1
873	0.1
874	0.11
875	0.08
876	0.1
877	0.12
878	0.14
879	0.16
880	0.16
881	0.16
882	0.16
883	0.19
884	0.2
885	0.2
886	0.18
887	0.16
888	0.17
889	0.16
890	0.14
891	0.12
892	0.09
893	0.08
894	0.1
895	0.09
896	0.1
897	0.11
898	0.1
899	0.13
900	0.15
901	0.17
902	0.21
903	0.22
904	0.24
905	0.3
906	0.39
907	0.45
908	0.5
909	0.5
910	0.47
911	0.5
912	0.57
913	0.59
914	0.59
915	0.61
916	0.55
917	0.58
918	0.57
919	0.52
920	0.5
921	0.43
922	0.38
923	0.28
924	0.29
925	0.25
926	0.26
927	0.26
928	0.21
929	0.19
930	0.18
931	0.19
932	0.17
933	0.17
934	0.16
935	0.18
936	0.2
937	0.22
938	0.2
939	0.18
940	0.19
941	0.17
942	0.17
943	0.15
944	0.12
945	0.09
946	0.1
947	0.1
948	0.1
949	0.11
950	0.13
951	0.13
952	0.13
953	0.13
954	0.13
955	0.12
956	0.12
957	0.12
958	0.15
959	0.17
960	0.19
961	0.2
962	0.2
963	0.19
964	0.19
965	0.18
966	0.13
967	0.13
968	0.12
969	0.17
970	0.22
971	0.31
972	0.37
973	0.38
974	0.39
975	0.4
976	0.4
977	0.43
978	0.41
979	0.38
980	0.33
981	0.33
982	0.32
983	0.28
984	0.27
985	0.19
986	0.2
987	0.16
988	0.14
989	0.18
990	0.2
991	0.2
992	0.26
993	0.3
994	0.31
995	0.38
996	0.47
997	0.49
998	0.54
999	0.56
1000	0.53
1001	0.52
1002	0.5
1003	0.49
1004	0.49
1005	0.47
1006	0.44
1007	0.5
1008	0.5
1009	0.47
1010	0.52
1011	0.46
1012	0.37
1013	0.33
1014	0.34
1015	0.29
1016	0.27
1017	0.31
1018	0.26
1019	0.25
1020	0.26
1021	0.26
1022	0.25
1023	0.29
1024	0.3
1025	0.28
1026	0.26
1027	0.27
1028	0.27
1029	0.27
1030	0.22
1031	0.15
1032	0.15
1033	0.16
1034	0.17
1035	0.18
1036	0.19
1037	0.2
1038	0.2
1039	0.22
1040	0.24
1041	0.22
1042	0.26
1043	0.23
1044	0.21
1045	0.19
1046	0.2
1047	0.17
1048	0.18
1049	0.19
1050	0.18
1051	0.23
1052	0.23
1053	0.24
1054	0.25
1055	0.31
1056	0.27
1057	0.28
1058	0.29
1059	0.26
1060	0.26
1061	0.27
1062	0.28
1063	0.28
1064	0.29
1065	0.28
1066	0.24
1067	0.23
1068	0.25
1069	0.24
1070	0.23
1071	0.2
1072	0.17
1073	0.18
1074	0.2
1075	0.19
1076	0.17
1077	0.16
1078	0.15
1079	0.13
1080	0.12
1081	0.09
1082	0.08
1083	0.08
1084	0.08
1085	0.09
1086	0.11
1087	0.11
1088	0.13
1089	0.13
1090	0.13
1091	0.12
1092	0.14
1093	0.16
1094	0.14
1095	0.15
1096	0.15
1097	0.15
1098	0.15
1099	0.15
1100	0.14
1101	0.11
1102	0.14
1103	0.13
1104	0.13
1105	0.17
1106	0.17
1107	0.18
1108	0.22
1109	0.25
1110	0.26
1111	0.25
1112	0.24
1113	0.24
1114	0.24
1115	0.24
1116	0.2
1117	0.22
1118	0.2
1119	0.2
1120	0.19
1121	0.22
1122	0.23
1123	0.26
1124	0.29
1125	0.26
1126	0.28
1127	0.29
1128	0.31
1129	0.26
1130	0.23
1131	0.2
1132	0.22
1133	0.21
1134	0.19
1135	0.23
1136	0.3
1137	0.36
1138	0.44
1139	0.42
1140	0.39
1141	0.41
1142	0.4
1143	0.4
1144	0.39
1145	0.36
1146	0.34
1147	0.36
1148	0.36
1149	0.4
1150	0.4
1151	0.36
1152	0.3
1153	0.3
1154	0.28
1155	0.26
1156	0.26
1157	0.2
1158	0.2
1159	0.21
1160	0.19
1161	0.15
1162	0.12
1163	0.11
1164	0.1
1165	0.1
1166	0.09
1167	0.08
1168	0.09
1169	0.1
1170	0.1
1171	0.14
1172	0.15
1173	0.23
1174	0.28
1175	0.35

A0A060SSR5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer