Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A060SMN5

Protein Details
Accession A0A060SMN5    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-54RLPSLYRKSAPRRVRFPWRQRKRHKYIRRSRAEKRELQQRRDAKBasic
497-533GTGIVVPKRPRKERSDKNTKKGPRKKRSANGNDSAPGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-56RKSAPRRVRFPWRQRKRHKYIRRSRAEKRELQQRRDAKKE
503-524PKRPRKERSDKNTKKGPRKKRS
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MPSRDPDVFVRLPSLYRKSAPRRVRFPWRQRKRHKYIRRSRAEKRELQQRRDAKKEKLMNALMEARAAMWEFAVQMHKEFPGHSAKYYYYAIMQRSRLHENPRKISPWNAFVSQEIKKHNEALGEDSRQRVSSDIIKELSARWKNMTPKERAAAVGDGVEKLTERRENYKEGVHNVAIAAFNDIRANLASISKELENLNARTGADVLLFVVRTDPDQYNPPYIMYTNERIPQFITSLTPKKESIKRFALRLEAACIGGINEVIQSQRSELKDLKMRTAALIVEKLKQACVRGEIGRMSYVNFDYHITLQHGIVLEGWPPGIKFAAPGKFNSIVELQALYTAWDTGAARFRALTNAEWREWATQYHKQHDNDATSREGKDDDNEHDNEGARQSRRPQSQPREASPQSPCDPSTSSTASGTNAALDGTPAPSPAVPPSLDAAASSSRSSATPSSQPPQTTCAPPVPPTADDPSRVAGRKRPRAGTTSIQFLNAVSNTEGTGIVVPKRPRKERSDKNTKKGPRKKRSANGNDSAPGTSSAAANSPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.34
3 0.38
4 0.47
5 0.53
6 0.62
7 0.69
8 0.71
9 0.74
10 0.78
11 0.84
12 0.85
13 0.87
14 0.88
15 0.89
16 0.9
17 0.93
18 0.96
19 0.95
20 0.95
21 0.95
22 0.95
23 0.95
24 0.95
25 0.94
26 0.92
27 0.92
28 0.92
29 0.9
30 0.88
31 0.85
32 0.85
33 0.83
34 0.81
35 0.8
36 0.79
37 0.78
38 0.8
39 0.79
40 0.76
41 0.76
42 0.79
43 0.75
44 0.74
45 0.69
46 0.6
47 0.58
48 0.55
49 0.45
50 0.36
51 0.3
52 0.21
53 0.18
54 0.16
55 0.11
56 0.06
57 0.07
58 0.07
59 0.09
60 0.13
61 0.12
62 0.13
63 0.15
64 0.16
65 0.16
66 0.16
67 0.18
68 0.23
69 0.25
70 0.25
71 0.27
72 0.26
73 0.3
74 0.31
75 0.27
76 0.23
77 0.26
78 0.29
79 0.32
80 0.35
81 0.35
82 0.39
83 0.46
84 0.46
85 0.52
86 0.56
87 0.59
88 0.63
89 0.64
90 0.63
91 0.58
92 0.61
93 0.56
94 0.54
95 0.49
96 0.44
97 0.39
98 0.37
99 0.4
100 0.37
101 0.36
102 0.34
103 0.33
104 0.33
105 0.34
106 0.34
107 0.32
108 0.29
109 0.3
110 0.31
111 0.32
112 0.32
113 0.32
114 0.31
115 0.29
116 0.28
117 0.22
118 0.19
119 0.22
120 0.23
121 0.25
122 0.25
123 0.24
124 0.25
125 0.26
126 0.33
127 0.3
128 0.28
129 0.28
130 0.33
131 0.4
132 0.49
133 0.54
134 0.5
135 0.51
136 0.52
137 0.5
138 0.46
139 0.41
140 0.33
141 0.25
142 0.21
143 0.17
144 0.14
145 0.12
146 0.11
147 0.09
148 0.08
149 0.12
150 0.14
151 0.16
152 0.23
153 0.26
154 0.3
155 0.32
156 0.38
157 0.38
158 0.37
159 0.39
160 0.32
161 0.29
162 0.24
163 0.23
164 0.17
165 0.14
166 0.13
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.06
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.1
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.14
183 0.17
184 0.17
185 0.18
186 0.17
187 0.17
188 0.16
189 0.16
190 0.12
191 0.08
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.06
198 0.05
199 0.06
200 0.09
201 0.1
202 0.1
203 0.15
204 0.17
205 0.19
206 0.19
207 0.19
208 0.17
209 0.16
210 0.18
211 0.17
212 0.18
213 0.18
214 0.23
215 0.22
216 0.22
217 0.22
218 0.2
219 0.17
220 0.15
221 0.14
222 0.15
223 0.2
224 0.21
225 0.23
226 0.23
227 0.29
228 0.35
229 0.37
230 0.39
231 0.43
232 0.44
233 0.44
234 0.44
235 0.41
236 0.36
237 0.33
238 0.29
239 0.2
240 0.17
241 0.15
242 0.13
243 0.09
244 0.08
245 0.07
246 0.04
247 0.03
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.1
254 0.1
255 0.13
256 0.15
257 0.18
258 0.24
259 0.25
260 0.26
261 0.24
262 0.23
263 0.21
264 0.2
265 0.17
266 0.12
267 0.15
268 0.13
269 0.14
270 0.15
271 0.15
272 0.15
273 0.15
274 0.15
275 0.13
276 0.14
277 0.15
278 0.14
279 0.16
280 0.16
281 0.16
282 0.16
283 0.15
284 0.13
285 0.12
286 0.12
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.11
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.11
297 0.11
298 0.1
299 0.1
300 0.08
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.11
311 0.17
312 0.18
313 0.18
314 0.23
315 0.25
316 0.25
317 0.25
318 0.21
319 0.16
320 0.15
321 0.15
322 0.1
323 0.08
324 0.08
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.08
332 0.14
333 0.14
334 0.14
335 0.14
336 0.15
337 0.16
338 0.18
339 0.18
340 0.2
341 0.23
342 0.23
343 0.24
344 0.25
345 0.24
346 0.23
347 0.24
348 0.22
349 0.27
350 0.32
351 0.38
352 0.44
353 0.43
354 0.48
355 0.5
356 0.5
357 0.45
358 0.43
359 0.39
360 0.34
361 0.34
362 0.29
363 0.25
364 0.2
365 0.2
366 0.21
367 0.21
368 0.24
369 0.25
370 0.25
371 0.25
372 0.25
373 0.22
374 0.22
375 0.23
376 0.19
377 0.22
378 0.28
379 0.36
380 0.42
381 0.49
382 0.56
383 0.6
384 0.69
385 0.73
386 0.71
387 0.72
388 0.66
389 0.65
390 0.58
391 0.55
392 0.48
393 0.44
394 0.39
395 0.33
396 0.34
397 0.29
398 0.3
399 0.26
400 0.25
401 0.23
402 0.24
403 0.21
404 0.21
405 0.19
406 0.14
407 0.11
408 0.1
409 0.08
410 0.08
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.08
416 0.08
417 0.09
418 0.1
419 0.13
420 0.11
421 0.13
422 0.14
423 0.14
424 0.14
425 0.13
426 0.14
427 0.13
428 0.15
429 0.13
430 0.12
431 0.12
432 0.12
433 0.15
434 0.15
435 0.17
436 0.22
437 0.27
438 0.32
439 0.36
440 0.38
441 0.36
442 0.39
443 0.4
444 0.37
445 0.35
446 0.36
447 0.35
448 0.35
449 0.39
450 0.38
451 0.34
452 0.34
453 0.38
454 0.35
455 0.34
456 0.34
457 0.32
458 0.34
459 0.36
460 0.36
461 0.37
462 0.45
463 0.53
464 0.58
465 0.62
466 0.61
467 0.62
468 0.65
469 0.67
470 0.6
471 0.58
472 0.51
473 0.44
474 0.4
475 0.35
476 0.33
477 0.24
478 0.22
479 0.15
480 0.15
481 0.14
482 0.15
483 0.15
484 0.1
485 0.13
486 0.13
487 0.15
488 0.22
489 0.29
490 0.36
491 0.46
492 0.54
493 0.59
494 0.66
495 0.74
496 0.78
497 0.83
498 0.86
499 0.87
500 0.88
501 0.91
502 0.91
503 0.91
504 0.9
505 0.91
506 0.9
507 0.91
508 0.92
509 0.91
510 0.93
511 0.92
512 0.92
513 0.88
514 0.83
515 0.76
516 0.67
517 0.58
518 0.48
519 0.39
520 0.3
521 0.24
522 0.18
523 0.15