Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JMV4

Protein Details
Accession C4JMV4    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-58LESKPANKLKRQMLHIKRKQTKDKLSREERFARKKEEAKNPRLKAHydrophilic
137-158NDEDRKREPKKSKLRSATERATBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-64KPANKLKRQMLHIKRKQTKDKLSREERFARKKEEAKNPRLKAERLKRN
142-149KREPKKSK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR044281  IMP4/RPF1  
Gene Ontology GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG ure:UREG_04162  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MPSKKAKQTPLGALESKPANKLKRQMLHIKRKQTKDKLSREERFARKKEEAKNPRLKAERLKRNIPLTLERKRTWDDVGSDVEDGLGLAFDVERIKRRKQEEEESEQATADAEPSEGLEDNGEQDEVDSMLDSDSDNDEDRKREPKKSKLRSATERATSPTQSTRSTNLDLTPESLAAKFPSLFPDEAPPAPKILITTSLNSTLHSQAAILTEFFPNSIYIRRSAHRYSHKFSVREIAKFAANRDYTAVVVVEEDQKRVSGLTVVHLPVGPTFHFSVSNWIEGKKLPGHGNPTGHWPELILNNFRTPLGLLTAHLFRTLFPPQPDLIGRQVVTLHNQRDYIFVRRHRYVFRDKRETEKSVVDADGNEIKGVEGIRAGLQELGPRFTLKLRRVDKGIQRSSGQEWEWKGRMEKQRTKFQI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.51
3 0.46
4 0.43
5 0.43
6 0.42
7 0.47
8 0.55
9 0.59
10 0.6
11 0.66
12 0.71
13 0.75
14 0.8
15 0.82
16 0.84
17 0.84
18 0.86
19 0.88
20 0.88
21 0.88
22 0.87
23 0.9
24 0.89
25 0.9
26 0.88
27 0.86
28 0.86
29 0.85
30 0.85
31 0.8
32 0.77
33 0.75
34 0.76
35 0.77
36 0.78
37 0.78
38 0.79
39 0.83
40 0.79
41 0.8
42 0.78
43 0.73
44 0.73
45 0.73
46 0.73
47 0.7
48 0.74
49 0.72
50 0.71
51 0.7
52 0.64
53 0.63
54 0.61
55 0.63
56 0.63
57 0.57
58 0.57
59 0.56
60 0.53
61 0.47
62 0.45
63 0.38
64 0.34
65 0.36
66 0.32
67 0.28
68 0.25
69 0.21
70 0.15
71 0.12
72 0.08
73 0.05
74 0.03
75 0.03
76 0.03
77 0.04
78 0.06
79 0.08
80 0.16
81 0.21
82 0.27
83 0.34
84 0.4
85 0.49
86 0.54
87 0.63
88 0.64
89 0.68
90 0.67
91 0.62
92 0.57
93 0.47
94 0.4
95 0.3
96 0.21
97 0.13
98 0.08
99 0.06
100 0.05
101 0.05
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.07
108 0.08
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.07
123 0.08
124 0.1
125 0.12
126 0.14
127 0.17
128 0.25
129 0.29
130 0.37
131 0.45
132 0.53
133 0.62
134 0.71
135 0.78
136 0.79
137 0.83
138 0.82
139 0.81
140 0.78
141 0.71
142 0.62
143 0.56
144 0.49
145 0.42
146 0.36
147 0.33
148 0.29
149 0.27
150 0.27
151 0.28
152 0.28
153 0.3
154 0.28
155 0.25
156 0.24
157 0.21
158 0.21
159 0.18
160 0.14
161 0.12
162 0.11
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.1
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.15
173 0.16
174 0.17
175 0.19
176 0.16
177 0.14
178 0.14
179 0.14
180 0.11
181 0.09
182 0.13
183 0.12
184 0.14
185 0.14
186 0.17
187 0.17
188 0.17
189 0.19
190 0.15
191 0.14
192 0.12
193 0.1
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.07
205 0.1
206 0.1
207 0.12
208 0.14
209 0.16
210 0.21
211 0.23
212 0.31
213 0.38
214 0.43
215 0.45
216 0.52
217 0.56
218 0.52
219 0.5
220 0.51
221 0.44
222 0.39
223 0.36
224 0.29
225 0.26
226 0.26
227 0.26
228 0.24
229 0.21
230 0.2
231 0.2
232 0.19
233 0.16
234 0.16
235 0.15
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.13
240 0.12
241 0.13
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.11
247 0.08
248 0.08
249 0.09
250 0.13
251 0.13
252 0.13
253 0.13
254 0.13
255 0.11
256 0.12
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.11
261 0.12
262 0.12
263 0.19
264 0.19
265 0.22
266 0.2
267 0.2
268 0.2
269 0.2
270 0.23
271 0.18
272 0.21
273 0.21
274 0.24
275 0.3
276 0.33
277 0.36
278 0.33
279 0.37
280 0.36
281 0.33
282 0.29
283 0.24
284 0.22
285 0.24
286 0.27
287 0.23
288 0.21
289 0.22
290 0.23
291 0.22
292 0.2
293 0.15
294 0.13
295 0.12
296 0.11
297 0.11
298 0.13
299 0.15
300 0.15
301 0.15
302 0.14
303 0.12
304 0.16
305 0.19
306 0.21
307 0.21
308 0.24
309 0.23
310 0.27
311 0.28
312 0.27
313 0.26
314 0.25
315 0.23
316 0.21
317 0.23
318 0.21
319 0.25
320 0.29
321 0.29
322 0.27
323 0.29
324 0.28
325 0.31
326 0.33
327 0.35
328 0.36
329 0.4
330 0.45
331 0.5
332 0.54
333 0.55
334 0.58
335 0.62
336 0.64
337 0.67
338 0.7
339 0.68
340 0.72
341 0.74
342 0.72
343 0.65
344 0.59
345 0.51
346 0.44
347 0.42
348 0.34
349 0.26
350 0.26
351 0.26
352 0.22
353 0.19
354 0.16
355 0.15
356 0.15
357 0.15
358 0.11
359 0.07
360 0.08
361 0.09
362 0.1
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.15
367 0.16
368 0.17
369 0.17
370 0.18
371 0.19
372 0.24
373 0.32
374 0.33
375 0.41
376 0.44
377 0.49
378 0.54
379 0.62
380 0.65
381 0.68
382 0.69
383 0.63
384 0.6
385 0.59
386 0.57
387 0.55
388 0.47
389 0.42
390 0.41
391 0.44
392 0.45
393 0.45
394 0.45
395 0.48
396 0.56
397 0.61
398 0.66
399 0.66