Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JIF3

Protein Details
Accession C4JIF3    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-59KETFAQKRLRKQRESEAKARHydrophilic
220-245TTDAHDVKEKRKKNRPPKRMSQINVLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
227-238KEKRKKNRPPKR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025239  DUF4187  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR039249  GPATCH11  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG ure:UREG_01490  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13821  DUF4187  
PF01585  G-patch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MSLRPGYPKTEESAAKAMEDDEEEDYMSMAIIEPATSGAKETFAQKRLRKQRESEAKARVPSKAELAAADAARRDAALATSALDPSNKGYQMMARLGYKPGTALGKDYTTQHPSGRDEWNRPIIEPLKIHMKEDRGGIGMDTEKKRKFMQEVSEEAKKVKTEQVDFRERVRLEREERRAEAQFRAAQKVAERLDTAAEEEDSGREPVPIAQTNEKATDETTDAHDVKEKRKKNRPPKRMSQINVLYRGLVRAREEKVLEDQAQRRRYDSLSSRDDSFFSRNMSGLPTYNDTDLDVDDKLALSRNAAGEIVETECDLEEDEELEEFNALVPQERLNRIVVYLREKHNYCFWCKYQYETPEMSGCPGLTEEDHD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.34
3 0.32
4 0.28
5 0.22
6 0.22
7 0.18
8 0.14
9 0.13
10 0.13
11 0.13
12 0.12
13 0.11
14 0.09
15 0.07
16 0.05
17 0.06
18 0.05
19 0.05
20 0.05
21 0.07
22 0.08
23 0.08
24 0.09
25 0.09
26 0.11
27 0.12
28 0.18
29 0.24
30 0.3
31 0.39
32 0.44
33 0.55
34 0.64
35 0.73
36 0.74
37 0.73
38 0.77
39 0.8
40 0.81
41 0.79
42 0.78
43 0.74
44 0.73
45 0.69
46 0.61
47 0.54
48 0.47
49 0.43
50 0.36
51 0.3
52 0.24
53 0.24
54 0.24
55 0.21
56 0.2
57 0.17
58 0.14
59 0.13
60 0.13
61 0.1
62 0.07
63 0.07
64 0.08
65 0.07
66 0.09
67 0.1
68 0.11
69 0.11
70 0.1
71 0.1
72 0.12
73 0.17
74 0.15
75 0.15
76 0.15
77 0.17
78 0.21
79 0.23
80 0.23
81 0.2
82 0.21
83 0.22
84 0.23
85 0.2
86 0.16
87 0.16
88 0.16
89 0.14
90 0.15
91 0.15
92 0.16
93 0.17
94 0.2
95 0.23
96 0.24
97 0.25
98 0.25
99 0.27
100 0.28
101 0.32
102 0.37
103 0.38
104 0.39
105 0.43
106 0.48
107 0.45
108 0.42
109 0.44
110 0.37
111 0.36
112 0.31
113 0.28
114 0.3
115 0.3
116 0.31
117 0.29
118 0.29
119 0.27
120 0.27
121 0.26
122 0.17
123 0.17
124 0.16
125 0.14
126 0.14
127 0.18
128 0.2
129 0.25
130 0.25
131 0.27
132 0.28
133 0.3
134 0.32
135 0.31
136 0.36
137 0.36
138 0.4
139 0.43
140 0.45
141 0.42
142 0.38
143 0.34
144 0.26
145 0.22
146 0.2
147 0.2
148 0.21
149 0.27
150 0.34
151 0.4
152 0.41
153 0.41
154 0.44
155 0.4
156 0.39
157 0.36
158 0.34
159 0.33
160 0.4
161 0.45
162 0.42
163 0.43
164 0.44
165 0.43
166 0.4
167 0.35
168 0.31
169 0.28
170 0.26
171 0.27
172 0.24
173 0.21
174 0.2
175 0.24
176 0.2
177 0.17
178 0.16
179 0.13
180 0.14
181 0.13
182 0.13
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.08
194 0.11
195 0.14
196 0.15
197 0.18
198 0.2
199 0.21
200 0.23
201 0.21
202 0.18
203 0.16
204 0.15
205 0.13
206 0.12
207 0.13
208 0.16
209 0.15
210 0.15
211 0.2
212 0.21
213 0.28
214 0.36
215 0.41
216 0.46
217 0.56
218 0.67
219 0.73
220 0.82
221 0.84
222 0.85
223 0.89
224 0.9
225 0.89
226 0.81
227 0.8
228 0.77
229 0.72
230 0.67
231 0.56
232 0.47
233 0.37
234 0.36
235 0.28
236 0.21
237 0.18
238 0.19
239 0.21
240 0.24
241 0.25
242 0.24
243 0.27
244 0.29
245 0.29
246 0.31
247 0.35
248 0.4
249 0.45
250 0.43
251 0.41
252 0.39
253 0.38
254 0.39
255 0.4
256 0.4
257 0.41
258 0.43
259 0.44
260 0.42
261 0.42
262 0.37
263 0.33
264 0.27
265 0.23
266 0.22
267 0.19
268 0.19
269 0.2
270 0.19
271 0.17
272 0.18
273 0.19
274 0.2
275 0.2
276 0.19
277 0.18
278 0.17
279 0.16
280 0.14
281 0.11
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.11
287 0.1
288 0.1
289 0.12
290 0.12
291 0.13
292 0.13
293 0.12
294 0.1
295 0.12
296 0.12
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.07
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.08
316 0.09
317 0.13
318 0.19
319 0.22
320 0.23
321 0.24
322 0.24
323 0.24
324 0.29
325 0.3
326 0.31
327 0.36
328 0.4
329 0.46
330 0.48
331 0.5
332 0.52
333 0.53
334 0.52
335 0.53
336 0.51
337 0.52
338 0.51
339 0.55
340 0.55
341 0.56
342 0.56
343 0.5
344 0.5
345 0.45
346 0.45
347 0.4
348 0.33
349 0.27
350 0.21
351 0.19
352 0.18