FuNGI

A0A060SNH3

Protein Details

Accession

A0A060SNH3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
274-296	QDQQDTRKEKQRRLSKRLSSGMQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
281-317	KEKQRRLSKRLSSGMQSEIAKAKEKEKERESRKIKAR

Subcellular Location(s)

mito 14, cyto 4, extr 4, nucl 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MRVVGTFHPSSSVSRSLKCRLSSDPALEHLVVAKTDRLEVFSLQPSGLKSECTTDMWGRIVGIQDVPSKTEGQSNLLVMIDHPDPRVVMMVYVVEGGVVSLVPGGSHSLADRAARQAEFVTDIQVDPTGQIAVASCYAGKLKVIKLEKGELGQAFDVSLPEINLLAFSFLYTSEEDRFTLALLHLNHMRQMQLLCRDVLLQDLELSAAHSNLLITTVLPERTFPSLDPPPLLVPIPPHSTGSEDDDEDETGPAHRGGVLVLGGRKVMFYEHATQDQQDTRKEKQRRLSKRLSSGMQSEIAKAKEKEKERESRKIKARATVKWPWSSVTAWCAVDEGCRRLLVGDTYGRLAMLAFGDDQVTLTLIPLGETSPATSLIYLSSQVLFVGSHFGDSQLLRIHPAPVGNISSDTLPIPKGITAVPPSALRSSISKGKGRADDSGDISARGGRVINTKGSFVEILHRYDNIAPILDAVLADVDGSGQVITSSGGRNSGSLRVIRTEADFQERARLEGLSGITDIWPVRPRFEDQAHTHLVVSTLRETLVFSFTGKDNLTHIEPSAAGLVTNVPTFALGNIPRRQTTVSGGRSISSYVDSPLVVQITPEGVHLVEFDTTLGSFSAVGQGWVPKKMGDASLAGKEVVAAAMSPSQFIVGLSGGRLALLNLSSGDALQLVKTRDFTDEICAISCTPFDPSKNYATSIAVSFWGSNRVSILSLDSPDSYLGPVCEVTLPALPRCVLLHNFGTGVRPKDMDFHPHLLVGLADGNVVTYAFRDGELLDRKVSSVGNAPASLSVCSVDGRTVVFASGARASVLYWDRQRVRSSPVSIKYMVKGVSLSTSAYPSCLAIATFSALLIGNVRGVDKMQIRTIPLGMDNPRKMAYHAEQQVFGVACVRASPGRIGDDEDITGSFKLLDGHSFSQLHHFQCNPDEEPSAVLALPGKGSGSTPAFCLGTVVIRPEEREPSHGRLVLFSLSSVDGSRLLSVLASQDVKGCVYALAHVAENVIAAAINTSVMLFKIRETALGDISPLALDKAAEWNHNHFVINLIWDGQYLLVGDAISSVSVLRVADDATRLESVARDYGPLWPVAIESTGNGIIGANSDCNLFSFTLQRGPQRSVLEKDGVYHIDDVVNKFIRGALSSADVSEDQAVKASHVFFTSTGRIGAILEIKDAMSLHMTALQRNMEKYIIGPGGVNHTKRRAPAAPRGHTDAEASYGFLDGDFLEGFLSYSRPEQLMEGDIEAERITLPLSTVKDLLVQMQSLH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.43
3	0.48
4	0.54
5	0.54
6	0.53
7	0.5
8	0.55
9	0.56
10	0.55
11	0.51
12	0.47
13	0.48
14	0.44
15	0.38
16	0.33
17	0.28
18	0.22
19	0.2
20	0.19
21	0.16
22	0.2
23	0.2
24	0.19
25	0.19
26	0.21
27	0.24
28	0.26
29	0.27
30	0.23
31	0.25
32	0.24
33	0.26
34	0.24
35	0.21
36	0.18
37	0.21
38	0.24
39	0.24
40	0.28
41	0.27
42	0.3
43	0.29
44	0.29
45	0.25
46	0.24
47	0.23
48	0.2
49	0.18
50	0.18
51	0.22
52	0.22
53	0.24
54	0.24
55	0.23
56	0.23
57	0.27
58	0.25
59	0.24
60	0.26
61	0.24
62	0.24
63	0.23
64	0.22
65	0.16
66	0.18
67	0.17
68	0.15
69	0.15
70	0.15
71	0.14
72	0.15
73	0.17
74	0.13
75	0.11
76	0.11
77	0.11
78	0.1
79	0.1
80	0.09
81	0.06
82	0.06
83	0.05
84	0.05
85	0.04
86	0.03
87	0.03
88	0.03
89	0.03
90	0.04
91	0.07
92	0.07
93	0.08
94	0.08
95	0.1
96	0.12
97	0.14
98	0.15
99	0.17
100	0.21
101	0.2
102	0.21
103	0.2
104	0.2
105	0.22
106	0.2
107	0.19
108	0.16
109	0.16
110	0.16
111	0.16
112	0.14
113	0.1
114	0.11
115	0.08
116	0.07
117	0.07
118	0.07
119	0.08
120	0.09
121	0.09
122	0.08
123	0.09
124	0.1
125	0.1
126	0.12
127	0.14
128	0.17
129	0.25
130	0.29
131	0.32
132	0.35
133	0.4
134	0.4
135	0.37
136	0.39
137	0.32
138	0.3
139	0.26
140	0.22
141	0.18
142	0.16
143	0.14
144	0.1
145	0.1
146	0.08
147	0.07
148	0.08
149	0.07
150	0.07
151	0.07
152	0.07
153	0.06
154	0.06
155	0.06
156	0.06
157	0.08
158	0.09
159	0.11
160	0.13
161	0.15
162	0.15
163	0.16
164	0.15
165	0.14
166	0.14
167	0.12
168	0.15
169	0.15
170	0.18
171	0.21
172	0.21
173	0.24
174	0.23
175	0.23
176	0.2
177	0.2
178	0.23
179	0.26
180	0.27
181	0.25
182	0.24
183	0.25
184	0.22
185	0.23
186	0.18
187	0.12
188	0.1
189	0.1
190	0.1
191	0.09
192	0.1
193	0.08
194	0.07
195	0.06
196	0.06
197	0.06
198	0.06
199	0.07
200	0.06
201	0.05
202	0.08
203	0.11
204	0.12
205	0.13
206	0.14
207	0.15
208	0.18
209	0.19
210	0.16
211	0.21
212	0.26
213	0.27
214	0.28
215	0.27
216	0.26
217	0.26
218	0.26
219	0.2
220	0.17
221	0.21
222	0.24
223	0.23
224	0.24
225	0.23
226	0.25
227	0.26
228	0.28
229	0.26
230	0.21
231	0.22
232	0.21
233	0.21
234	0.19
235	0.18
236	0.12
237	0.1
238	0.11
239	0.09
240	0.08
241	0.08
242	0.07
243	0.07
244	0.08
245	0.08
246	0.09
247	0.1
248	0.1
249	0.1
250	0.1
251	0.1
252	0.09
253	0.09
254	0.1
255	0.12
256	0.18
257	0.21
258	0.25
259	0.26
260	0.27
261	0.3
262	0.33
263	0.33
264	0.33
265	0.35
266	0.38
267	0.47
268	0.54
269	0.57
270	0.61
271	0.68
272	0.72
273	0.77
274	0.8
275	0.79
276	0.81
277	0.81
278	0.74
279	0.68
280	0.6
281	0.53
282	0.47
283	0.39
284	0.32
285	0.3
286	0.28
287	0.29
288	0.28
289	0.31
290	0.34
291	0.4
292	0.46
293	0.5
294	0.58
295	0.6
296	0.69
297	0.69
298	0.72
299	0.74
300	0.76
301	0.71
302	0.69
303	0.69
304	0.65
305	0.68
306	0.67
307	0.64
308	0.59
309	0.56
310	0.49
311	0.45
312	0.39
313	0.33
314	0.27
315	0.25
316	0.2
317	0.19
318	0.18
319	0.15
320	0.19
321	0.2
322	0.2
323	0.17
324	0.17
325	0.17
326	0.16
327	0.18
328	0.14
329	0.14
330	0.15
331	0.14
332	0.15
333	0.15
334	0.14
335	0.13
336	0.11
337	0.08
338	0.06
339	0.06
340	0.05
341	0.05
342	0.06
343	0.06
344	0.06
345	0.05
346	0.06
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.07
357	0.07
358	0.08
359	0.08
360	0.07
361	0.07
362	0.07
363	0.08
364	0.08
365	0.08
366	0.07
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.06
371	0.06
372	0.09
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.09
377	0.1
378	0.1
379	0.12
380	0.11
381	0.12
382	0.13
383	0.14
384	0.14
385	0.14
386	0.14
387	0.13
388	0.12
389	0.13
390	0.12
391	0.12
392	0.11
393	0.11
394	0.11
395	0.1
396	0.09
397	0.08
398	0.08
399	0.08
400	0.08
401	0.08
402	0.08
403	0.11
404	0.12
405	0.13
406	0.14
407	0.14
408	0.16
409	0.16
410	0.16
411	0.14
412	0.14
413	0.16
414	0.22
415	0.26
416	0.28
417	0.3
418	0.35
419	0.39
420	0.38
421	0.38
422	0.36
423	0.34
424	0.33
425	0.34
426	0.28
427	0.23
428	0.21
429	0.19
430	0.15
431	0.12
432	0.1
433	0.08
434	0.12
435	0.14
436	0.18
437	0.17
438	0.18
439	0.18
440	0.19
441	0.18
442	0.14
443	0.19
444	0.17
445	0.19
446	0.19
447	0.19
448	0.19
449	0.19
450	0.21
451	0.14
452	0.12
453	0.09
454	0.09
455	0.09
456	0.08
457	0.07
458	0.04
459	0.04
460	0.03
461	0.03
462	0.03
463	0.02
464	0.02
465	0.03
466	0.02
467	0.02
468	0.02
469	0.03
470	0.03
471	0.04
472	0.05
473	0.05
474	0.07
475	0.07
476	0.08
477	0.09
478	0.12
479	0.13
480	0.14
481	0.15
482	0.15
483	0.16
484	0.16
485	0.17
486	0.17
487	0.16
488	0.2
489	0.2
490	0.18
491	0.25
492	0.24
493	0.23
494	0.2
495	0.19
496	0.14
497	0.16
498	0.16
499	0.09
500	0.09
501	0.08
502	0.07
503	0.08
504	0.08
505	0.08
506	0.13
507	0.13
508	0.14
509	0.16
510	0.19
511	0.23
512	0.26
513	0.31
514	0.29
515	0.34
516	0.34
517	0.33
518	0.3
519	0.25
520	0.23
521	0.17
522	0.15
523	0.1
524	0.09
525	0.08
526	0.08
527	0.08
528	0.08
529	0.09
530	0.08
531	0.07
532	0.09
533	0.09
534	0.12
535	0.12
536	0.11
537	0.11
538	0.13
539	0.13
540	0.12
541	0.12
542	0.1
543	0.09
544	0.09
545	0.09
546	0.07
547	0.06
548	0.05
549	0.06
550	0.06
551	0.06
552	0.05
553	0.04
554	0.04
555	0.05
556	0.05
557	0.07
558	0.09
559	0.15
560	0.19
561	0.21
562	0.21
563	0.22
564	0.23
565	0.21
566	0.23
567	0.26
568	0.25
569	0.26
570	0.26
571	0.25
572	0.24
573	0.23
574	0.19
575	0.12
576	0.1
577	0.08
578	0.08
579	0.08
580	0.08
581	0.08
582	0.08
583	0.07
584	0.06
585	0.05
586	0.05
587	0.06
588	0.05
589	0.05
590	0.04
591	0.04
592	0.05
593	0.05
594	0.05
595	0.04
596	0.04
597	0.04
598	0.04
599	0.05
600	0.04
601	0.04
602	0.04
603	0.04
604	0.06
605	0.06
606	0.06
607	0.06
608	0.09
609	0.1
610	0.11
611	0.12
612	0.09
613	0.1
614	0.11
615	0.11
616	0.09
617	0.1
618	0.11
619	0.12
620	0.13
621	0.12
622	0.11
623	0.1
624	0.08
625	0.07
626	0.04
627	0.03
628	0.03
629	0.05
630	0.05
631	0.05
632	0.05
633	0.05
634	0.05
635	0.05
636	0.05
637	0.04
638	0.04
639	0.04
640	0.05
641	0.04
642	0.04
643	0.04
644	0.04
645	0.04
646	0.04
647	0.04
648	0.04
649	0.04
650	0.04
651	0.04
652	0.04
653	0.04
654	0.04
655	0.04
656	0.07
657	0.08
658	0.09
659	0.1
660	0.11
661	0.12
662	0.13
663	0.13
664	0.14
665	0.15
666	0.14
667	0.14
668	0.13
669	0.12
670	0.11
671	0.1
672	0.07
673	0.08
674	0.1
675	0.1
676	0.13
677	0.16
678	0.2
679	0.21
680	0.22
681	0.2
682	0.19
683	0.19
684	0.16
685	0.14
686	0.11
687	0.1
688	0.09
689	0.08
690	0.12
691	0.11
692	0.1
693	0.1
694	0.1
695	0.1
696	0.1
697	0.12
698	0.08
699	0.09
700	0.1
701	0.09
702	0.09
703	0.09
704	0.09
705	0.07
706	0.06
707	0.06
708	0.05
709	0.05
710	0.05
711	0.05
712	0.05
713	0.06
714	0.08
715	0.09
716	0.09
717	0.1
718	0.1
719	0.1
720	0.1
721	0.12
722	0.11
723	0.13
724	0.14
725	0.13
726	0.14
727	0.13
728	0.15
729	0.16
730	0.17
731	0.15
732	0.15
733	0.14
734	0.19
735	0.2
736	0.23
737	0.24
738	0.26
739	0.25
740	0.24
741	0.24
742	0.19
743	0.18
744	0.12
745	0.09
746	0.05
747	0.05
748	0.04
749	0.04
750	0.04
751	0.04
752	0.03
753	0.03
754	0.04
755	0.04
756	0.04
757	0.05
758	0.05
759	0.11
760	0.16
761	0.17
762	0.17
763	0.17
764	0.17
765	0.18
766	0.17
767	0.12
768	0.13
769	0.14
770	0.15
771	0.15
772	0.15
773	0.15
774	0.15
775	0.15
776	0.1
777	0.08
778	0.07
779	0.07
780	0.08
781	0.07
782	0.06
783	0.06
784	0.07
785	0.06
786	0.06
787	0.06
788	0.06
789	0.07
790	0.08
791	0.07
792	0.07
793	0.07
794	0.07
795	0.11
796	0.12
797	0.14
798	0.16
799	0.22
800	0.25
801	0.29
802	0.32
803	0.29
804	0.35
805	0.37
806	0.4
807	0.42
808	0.42
809	0.43
810	0.43
811	0.42
812	0.36
813	0.34
814	0.29
815	0.21
816	0.17
817	0.14
818	0.13
819	0.12
820	0.12
821	0.09
822	0.1
823	0.1
824	0.1
825	0.1
826	0.08
827	0.08
828	0.07
829	0.07
830	0.06
831	0.06
832	0.07
833	0.06
834	0.06
835	0.06
836	0.06
837	0.06
838	0.06
839	0.06
840	0.06
841	0.06
842	0.07
843	0.06
844	0.06
845	0.11
846	0.13
847	0.15
848	0.17
849	0.18
850	0.19
851	0.2
852	0.21
853	0.17
854	0.14
855	0.17
856	0.2
857	0.26
858	0.25
859	0.26
860	0.27
861	0.27
862	0.27
863	0.28
864	0.27
865	0.29
866	0.35
867	0.34
868	0.33
869	0.32
870	0.34
871	0.28
872	0.24
873	0.18
874	0.11
875	0.09
876	0.09
877	0.11
878	0.08
879	0.09
880	0.11
881	0.1
882	0.12
883	0.13
884	0.16
885	0.16
886	0.16
887	0.16
888	0.15
889	0.13
890	0.12
891	0.12
892	0.09
893	0.07
894	0.07
895	0.08
896	0.08
897	0.09
898	0.12
899	0.14
900	0.18
901	0.19
902	0.19
903	0.24
904	0.28
905	0.28
906	0.27
907	0.26
908	0.24
909	0.28
910	0.32
911	0.27
912	0.25
913	0.25
914	0.22
915	0.22
916	0.2
917	0.17
918	0.12
919	0.1
920	0.09
921	0.08
922	0.08
923	0.07
924	0.07
925	0.06
926	0.07
927	0.1
928	0.11
929	0.12
930	0.12
931	0.14
932	0.14
933	0.14
934	0.14
935	0.11
936	0.1
937	0.11
938	0.12
939	0.12
940	0.12
941	0.15
942	0.16
943	0.23
944	0.21
945	0.26
946	0.29
947	0.33
948	0.38
949	0.39
950	0.36
951	0.31
952	0.32
953	0.27
954	0.22
955	0.17
956	0.13
957	0.11
958	0.11
959	0.1
960	0.09
961	0.08
962	0.09
963	0.09
964	0.08
965	0.07
966	0.07
967	0.07
968	0.07
969	0.09
970	0.09
971	0.09
972	0.11
973	0.12
974	0.12
975	0.12
976	0.11
977	0.09
978	0.08
979	0.09
980	0.09
981	0.1
982	0.09
983	0.09
984	0.09
985	0.09
986	0.08
987	0.07
988	0.05
989	0.04
990	0.03
991	0.04
992	0.03
993	0.03
994	0.03
995	0.04
996	0.04
997	0.04
998	0.07
999	0.06
1000	0.07
1001	0.12
1002	0.12
1003	0.14
1004	0.15
1005	0.17
1006	0.17
1007	0.17
1008	0.17
1009	0.13
1010	0.13
1011	0.11
1012	0.09
1013	0.07
1014	0.05
1015	0.05
1016	0.06
1017	0.12
1018	0.14
1019	0.17
1020	0.2
1021	0.24
1022	0.28
1023	0.29
1024	0.29
1025	0.22
1026	0.23
1027	0.2
1028	0.2
1029	0.15
1030	0.13
1031	0.12
1032	0.11
1033	0.12
1034	0.09
1035	0.08
1036	0.07
1037	0.06
1038	0.06
1039	0.06
1040	0.05
1041	0.05
1042	0.06
1043	0.05
1044	0.05
1045	0.04
1046	0.04
1047	0.05
1048	0.05
1049	0.05
1050	0.06
1051	0.07
1052	0.08
1053	0.1
1054	0.1
1055	0.12
1056	0.12
1057	0.12
1058	0.12
1059	0.12
1060	0.13
1061	0.15
1062	0.14
1063	0.13
1064	0.13
1065	0.18
1066	0.19
1067	0.18
1068	0.16
1069	0.13
1070	0.13
1071	0.13
1072	0.13
1073	0.09
1074	0.08
1075	0.1
1076	0.1
1077	0.1
1078	0.1
1079	0.09
1080	0.08
1081	0.09
1082	0.1
1083	0.07
1084	0.07
1085	0.08
1086	0.08
1087	0.09
1088	0.11
1089	0.1
1090	0.1
1091	0.14
1092	0.15
1093	0.22
1094	0.25
1095	0.3
1096	0.33
1097	0.36
1098	0.4
1099	0.42
1100	0.46
1101	0.44
1102	0.46
1103	0.44
1104	0.4
1105	0.39
1106	0.37
1107	0.33
1108	0.29
1109	0.24
1110	0.2
1111	0.19
1112	0.21
1113	0.21
1114	0.24
1115	0.24
1116	0.22
1117	0.22
1118	0.23
1119	0.2
1120	0.19
1121	0.18
1122	0.13
1123	0.15
1124	0.15
1125	0.15
1126	0.16
1127	0.15
1128	0.14
1129	0.17
1130	0.16
1131	0.12
1132	0.15
1133	0.15
1134	0.14
1135	0.17
1136	0.17
1137	0.15
1138	0.15
1139	0.16
1140	0.14
1141	0.19
1142	0.21
1143	0.2
1144	0.19
1145	0.18
1146	0.17
1147	0.16
1148	0.18
1149	0.18
1150	0.14
1151	0.14
1152	0.14
1153	0.14
1154	0.14
1155	0.14
1156	0.12
1157	0.09
1158	0.09
1159	0.09
1160	0.15
1161	0.15
1162	0.16
1163	0.2
1164	0.24
1165	0.25
1166	0.26
1167	0.28
1168	0.23
1169	0.22
1170	0.21
1171	0.25
1172	0.21
1173	0.19
1174	0.18
1175	0.17
1176	0.25
1177	0.31
1178	0.33
1179	0.31
1180	0.37
1181	0.4
1182	0.42
1183	0.48
1184	0.47
1185	0.49
1186	0.56
1187	0.61
1188	0.63
1189	0.65
1190	0.7
1191	0.64
1192	0.57
1193	0.52
1194	0.43
1195	0.36
1196	0.28
1197	0.23
1198	0.16
1199	0.14
1200	0.13
1201	0.11
1202	0.1
1203	0.06
1204	0.08
1205	0.07
1206	0.07
1207	0.07
1208	0.07
1209	0.07
1210	0.08
1211	0.09
1212	0.08
1213	0.1
1214	0.13
1215	0.13
1216	0.14
1217	0.15
1218	0.17
1219	0.19
1220	0.2
1221	0.18
1222	0.18
1223	0.17
1224	0.17
1225	0.15
1226	0.13
1227	0.09
1228	0.08
1229	0.08
1230	0.06
1231	0.07
1232	0.12
1233	0.15
1234	0.17
1235	0.18
1236	0.18
1237	0.22
1238	0.22
1239	0.25
1240	0.22

A0A060SNH3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer