Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A060SHM1

Protein Details
Accession A0A060SHM1    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-123KPPAPPPPRKGAPPRPPAPRBasic
635-657AQPPPRPARARSHRRRRPAPAVPBasic
1113-1133IHSAAKRCREAQRRAARKSRGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-62EEKAKAAEREAEERARARKERLEGEKALKEGK
92-124KPTPPPAPTPKAKPPAPPPPRKGAPPRPPAPRA
632-655KKEAQPPPRPARARSHRRRRPAPA
1125-1133RRAARKSRG
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035899  DBL_dom_sf  
IPR000219  DH-domain  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR001849  PH_domain  
IPR036028  SH3-like_dom_sf  
IPR001452  SH3_domain  
IPR003124  WH2_dom  
Gene Ontology GO:0030479  C:actin cortical patch  
GO:0003779  F:actin binding  
GO:0005085  F:guanyl-nucleotide exchange factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF16652  PH_13  
PF00621  RhoGEF  
PF00018  SH3_1  
PF14604  SH3_9  
PF02205  WH2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50010  DH_2  
PS50003  PH_DOMAIN  
PS50002  SH3  
PS51082  WH2  
CDD cd00160  RhoGEF  
cd00174  SH3  
Amino Acid Sequences MAALGVVAPSPSPKIDTSVEDRLAQEKKEAEEKAKAAEREAEERARARKERLEGEKALKEGKSPTSPAPPSTTSTPAPPPPPAGTSQVPTPKPTPPPAPTPKAKPPAPPPPRKGAPPRPPAPRAPLSVPSPPAPPAPPVPVVDPEEEALKAREAEILRAREERRARLRQLEQEEEEARLAEERRLQQLAQQRSPVTSPPAPAPPSAPPAPEVDQAASSAAPAPPPPPPPPPPAPPAPLASAPKTSPPTDKASTNPFSKLMRESSAPIATPAPTGDRSALLNAIQAGRKLRKAQTNDRSAAPISGRVLGDATPPPHISAAPSMPSPPTPAERPAPQEHHEENPAPPEMGSVRSANRESVDWYAGLAAEGSAVSRGPSQQLQPTIQEEEEPTAPVPQIQVDTAEESNALADVDMNTEYRVRSLYAYQAQRPEELTFGENLIITAHPSKSGSDWWYGTLVRDGKTGFFPKTYVEQVTAVIAHALYDYNGNNADELPFSEGDQLTIVDRSDADWWKAEQGGVVFIVPAAYLEVADAPPVQIPHHADPVETVQEVSSPKQPQPAPEPDHYIDIEGSGSGAEHDDGSESDYVTASESESETDESGEEEQQSEEARRQERQARAAERQRVLEAAGLIIKKEAQPPPRPARARSHRRRRPAPAVPERSPQISPSPSKDLPPVPESDLANTSLRLDDAFERYEAYRQNHLAMNRLSVASIESATSTTSPQSATFSLTPVPSESSESRTHSFLSFFGHRSRTPVNDGETRVMPVISAPILQRESSPASSEGDAAFGSSWASLVDKSALEDIPTTERRRQEAIYELIVTEGAYVRDLQLIVEHFYANVYNLLDEKARTVIFANVEDILLMNTTFLSSLEERQKECRLYVDKIGDILNTNMAHLNIYMDYCVNQGSAIKVLQSLRQSNPELAACLQRLRDDPAARNLDLSSYLLVPMQRITRYPLLFKQIIHYTEPDDDRTQIERAREMAEKVLNHINETIRDQEGRERLKEVSKDLWIGQGRLDLTAPTRYMGPRKLLREGVLMKAKSGRKLRAFLCSDILVLTEESSKSLYRMPLSLSEVQVHEPTGKDDTTFQLAVAYPRGGDSITLRAASARECQTWMYAIHSAAKRCREAQRRAARKSRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.21
3 0.27
4 0.32
5 0.39
6 0.4
7 0.39
8 0.4
9 0.42
10 0.43
11 0.38
12 0.36
13 0.32
14 0.33
15 0.38
16 0.4
17 0.39
18 0.43
19 0.43
20 0.46
21 0.5
22 0.46
23 0.41
24 0.45
25 0.44
26 0.42
27 0.46
28 0.42
29 0.39
30 0.44
31 0.49
32 0.5
33 0.5
34 0.5
35 0.52
36 0.55
37 0.61
38 0.64
39 0.65
40 0.62
41 0.66
42 0.64
43 0.59
44 0.57
45 0.47
46 0.42
47 0.39
48 0.4
49 0.37
50 0.36
51 0.39
52 0.44
53 0.47
54 0.47
55 0.48
56 0.44
57 0.44
58 0.45
59 0.45
60 0.36
61 0.39
62 0.42
63 0.42
64 0.43
65 0.41
66 0.42
67 0.39
68 0.41
69 0.39
70 0.38
71 0.35
72 0.34
73 0.39
74 0.43
75 0.42
76 0.43
77 0.43
78 0.44
79 0.47
80 0.51
81 0.52
82 0.48
83 0.57
84 0.62
85 0.67
86 0.68
87 0.7
88 0.73
89 0.73
90 0.72
91 0.71
92 0.71
93 0.73
94 0.77
95 0.78
96 0.74
97 0.75
98 0.77
99 0.77
100 0.79
101 0.78
102 0.78
103 0.78
104 0.8
105 0.79
106 0.79
107 0.77
108 0.74
109 0.69
110 0.64
111 0.59
112 0.58
113 0.53
114 0.54
115 0.51
116 0.45
117 0.41
118 0.38
119 0.36
120 0.31
121 0.3
122 0.27
123 0.29
124 0.3
125 0.29
126 0.31
127 0.32
128 0.34
129 0.32
130 0.29
131 0.24
132 0.23
133 0.21
134 0.2
135 0.16
136 0.15
137 0.13
138 0.12
139 0.17
140 0.16
141 0.22
142 0.28
143 0.29
144 0.3
145 0.36
146 0.37
147 0.4
148 0.45
149 0.48
150 0.51
151 0.57
152 0.59
153 0.63
154 0.69
155 0.69
156 0.72
157 0.69
158 0.62
159 0.59
160 0.55
161 0.47
162 0.4
163 0.31
164 0.24
165 0.2
166 0.18
167 0.15
168 0.21
169 0.22
170 0.26
171 0.28
172 0.28
173 0.3
174 0.37
175 0.44
176 0.41
177 0.43
178 0.39
179 0.39
180 0.41
181 0.39
182 0.37
183 0.31
184 0.29
185 0.28
186 0.34
187 0.34
188 0.33
189 0.33
190 0.3
191 0.34
192 0.33
193 0.3
194 0.25
195 0.28
196 0.3
197 0.29
198 0.27
199 0.22
200 0.2
201 0.2
202 0.19
203 0.14
204 0.11
205 0.11
206 0.1
207 0.09
208 0.09
209 0.11
210 0.14
211 0.19
212 0.23
213 0.28
214 0.32
215 0.39
216 0.45
217 0.48
218 0.5
219 0.51
220 0.5
221 0.46
222 0.44
223 0.4
224 0.39
225 0.38
226 0.35
227 0.32
228 0.3
229 0.33
230 0.34
231 0.33
232 0.32
233 0.32
234 0.37
235 0.37
236 0.38
237 0.36
238 0.41
239 0.44
240 0.42
241 0.4
242 0.36
243 0.35
244 0.35
245 0.35
246 0.3
247 0.28
248 0.27
249 0.27
250 0.29
251 0.29
252 0.27
253 0.24
254 0.22
255 0.19
256 0.18
257 0.16
258 0.14
259 0.13
260 0.14
261 0.14
262 0.14
263 0.14
264 0.15
265 0.15
266 0.12
267 0.12
268 0.12
269 0.14
270 0.14
271 0.14
272 0.19
273 0.21
274 0.25
275 0.29
276 0.34
277 0.4
278 0.47
279 0.56
280 0.6
281 0.65
282 0.63
283 0.59
284 0.56
285 0.49
286 0.43
287 0.33
288 0.27
289 0.2
290 0.21
291 0.19
292 0.16
293 0.16
294 0.14
295 0.16
296 0.16
297 0.16
298 0.15
299 0.15
300 0.16
301 0.16
302 0.15
303 0.14
304 0.15
305 0.16
306 0.15
307 0.15
308 0.15
309 0.16
310 0.16
311 0.17
312 0.16
313 0.18
314 0.19
315 0.22
316 0.25
317 0.28
318 0.34
319 0.38
320 0.41
321 0.4
322 0.44
323 0.42
324 0.42
325 0.42
326 0.38
327 0.32
328 0.3
329 0.29
330 0.22
331 0.19
332 0.17
333 0.14
334 0.14
335 0.15
336 0.13
337 0.14
338 0.18
339 0.19
340 0.19
341 0.19
342 0.18
343 0.18
344 0.18
345 0.18
346 0.14
347 0.13
348 0.12
349 0.11
350 0.1
351 0.07
352 0.05
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.03
357 0.03
358 0.04
359 0.05
360 0.06
361 0.08
362 0.1
363 0.12
364 0.16
365 0.2
366 0.21
367 0.22
368 0.25
369 0.25
370 0.23
371 0.21
372 0.18
373 0.17
374 0.16
375 0.14
376 0.12
377 0.11
378 0.11
379 0.1
380 0.1
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.09
385 0.08
386 0.11
387 0.11
388 0.1
389 0.09
390 0.08
391 0.08
392 0.07
393 0.06
394 0.03
395 0.04
396 0.04
397 0.05
398 0.05
399 0.06
400 0.06
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.08
405 0.08
406 0.09
407 0.1
408 0.15
409 0.21
410 0.25
411 0.27
412 0.32
413 0.32
414 0.31
415 0.32
416 0.27
417 0.2
418 0.18
419 0.16
420 0.12
421 0.11
422 0.11
423 0.09
424 0.08
425 0.08
426 0.06
427 0.07
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.09
432 0.09
433 0.1
434 0.13
435 0.14
436 0.15
437 0.15
438 0.16
439 0.17
440 0.17
441 0.16
442 0.18
443 0.18
444 0.16
445 0.17
446 0.16
447 0.15
448 0.19
449 0.21
450 0.17
451 0.16
452 0.15
453 0.16
454 0.19
455 0.2
456 0.17
457 0.16
458 0.15
459 0.15
460 0.15
461 0.13
462 0.1
463 0.08
464 0.06
465 0.05
466 0.04
467 0.04
468 0.04
469 0.05
470 0.05
471 0.06
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.08
477 0.06
478 0.07
479 0.08
480 0.07
481 0.07
482 0.1
483 0.09
484 0.09
485 0.09
486 0.09
487 0.07
488 0.08
489 0.07
490 0.05
491 0.05
492 0.06
493 0.1
494 0.11
495 0.11
496 0.12
497 0.12
498 0.13
499 0.13
500 0.12
501 0.09
502 0.08
503 0.08
504 0.07
505 0.06
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.04
510 0.03
511 0.03
512 0.03
513 0.02
514 0.03
515 0.03
516 0.03
517 0.04
518 0.04
519 0.04
520 0.05
521 0.05
522 0.05
523 0.07
524 0.11
525 0.12
526 0.16
527 0.16
528 0.15
529 0.16
530 0.18
531 0.17
532 0.13
533 0.11
534 0.07
535 0.09
536 0.1
537 0.11
538 0.15
539 0.15
540 0.16
541 0.22
542 0.23
543 0.24
544 0.29
545 0.36
546 0.35
547 0.35
548 0.4
549 0.35
550 0.36
551 0.33
552 0.27
553 0.19
554 0.14
555 0.13
556 0.07
557 0.06
558 0.04
559 0.03
560 0.03
561 0.03
562 0.03
563 0.03
564 0.03
565 0.04
566 0.04
567 0.05
568 0.05
569 0.05
570 0.05
571 0.06
572 0.06
573 0.06
574 0.06
575 0.05
576 0.05
577 0.05
578 0.05
579 0.06
580 0.07
581 0.06
582 0.06
583 0.06
584 0.06
585 0.07
586 0.07
587 0.06
588 0.06
589 0.06
590 0.06
591 0.07
592 0.07
593 0.1
594 0.13
595 0.15
596 0.16
597 0.2
598 0.27
599 0.3
600 0.35
601 0.38
602 0.39
603 0.45
604 0.51
605 0.53
606 0.48
607 0.45
608 0.4
609 0.34
610 0.29
611 0.23
612 0.16
613 0.09
614 0.1
615 0.08
616 0.08
617 0.08
618 0.08
619 0.08
620 0.13
621 0.17
622 0.21
623 0.28
624 0.36
625 0.43
626 0.52
627 0.53
628 0.52
629 0.58
630 0.62
631 0.67
632 0.7
633 0.74
634 0.74
635 0.81
636 0.85
637 0.83
638 0.82
639 0.8
640 0.79
641 0.78
642 0.78
643 0.71
644 0.67
645 0.6
646 0.53
647 0.45
648 0.36
649 0.3
650 0.26
651 0.25
652 0.26
653 0.32
654 0.3
655 0.31
656 0.33
657 0.31
658 0.3
659 0.3
660 0.28
661 0.23
662 0.26
663 0.25
664 0.23
665 0.21
666 0.2
667 0.19
668 0.16
669 0.14
670 0.11
671 0.11
672 0.09
673 0.09
674 0.09
675 0.11
676 0.11
677 0.11
678 0.12
679 0.13
680 0.16
681 0.19
682 0.2
683 0.23
684 0.22
685 0.25
686 0.27
687 0.27
688 0.3
689 0.25
690 0.24
691 0.2
692 0.19
693 0.17
694 0.14
695 0.14
696 0.08
697 0.08
698 0.06
699 0.06
700 0.06
701 0.06
702 0.07
703 0.07
704 0.06
705 0.07
706 0.07
707 0.08
708 0.1
709 0.1
710 0.13
711 0.13
712 0.14
713 0.15
714 0.14
715 0.14
716 0.13
717 0.14
718 0.11
719 0.15
720 0.15
721 0.18
722 0.21
723 0.24
724 0.25
725 0.24
726 0.25
727 0.21
728 0.21
729 0.17
730 0.2
731 0.19
732 0.19
733 0.23
734 0.25
735 0.24
736 0.28
737 0.3
738 0.28
739 0.29
740 0.3
741 0.31
742 0.32
743 0.34
744 0.32
745 0.3
746 0.28
747 0.24
748 0.2
749 0.15
750 0.1
751 0.1
752 0.07
753 0.08
754 0.07
755 0.1
756 0.11
757 0.12
758 0.12
759 0.14
760 0.17
761 0.17
762 0.19
763 0.16
764 0.17
765 0.18
766 0.18
767 0.15
768 0.12
769 0.11
770 0.09
771 0.08
772 0.06
773 0.06
774 0.05
775 0.05
776 0.04
777 0.05
778 0.05
779 0.05
780 0.07
781 0.07
782 0.08
783 0.1
784 0.1
785 0.09
786 0.1
787 0.11
788 0.15
789 0.2
790 0.23
791 0.26
792 0.29
793 0.32
794 0.35
795 0.34
796 0.31
797 0.34
798 0.33
799 0.3
800 0.27
801 0.24
802 0.21
803 0.2
804 0.16
805 0.1
806 0.08
807 0.06
808 0.06
809 0.06
810 0.06
811 0.08
812 0.08
813 0.07
814 0.09
815 0.1
816 0.11
817 0.12
818 0.11
819 0.1
820 0.1
821 0.11
822 0.09
823 0.1
824 0.08
825 0.07
826 0.08
827 0.09
828 0.1
829 0.1
830 0.1
831 0.11
832 0.11
833 0.11
834 0.12
835 0.14
836 0.14
837 0.15
838 0.15
839 0.13
840 0.13
841 0.12
842 0.11
843 0.08
844 0.07
845 0.06
846 0.04
847 0.04
848 0.04
849 0.04
850 0.04
851 0.08
852 0.09
853 0.15
854 0.23
855 0.26
856 0.28
857 0.33
858 0.38
859 0.36
860 0.36
861 0.38
862 0.35
863 0.36
864 0.41
865 0.4
866 0.35
867 0.35
868 0.35
869 0.28
870 0.24
871 0.21
872 0.18
873 0.14
874 0.14
875 0.14
876 0.13
877 0.13
878 0.11
879 0.12
880 0.08
881 0.09
882 0.09
883 0.08
884 0.08
885 0.08
886 0.09
887 0.07
888 0.07
889 0.07
890 0.08
891 0.1
892 0.1
893 0.1
894 0.12
895 0.14
896 0.17
897 0.22
898 0.26
899 0.26
900 0.32
901 0.34
902 0.33
903 0.35
904 0.31
905 0.28
906 0.25
907 0.27
908 0.22
909 0.22
910 0.22
911 0.21
912 0.22
913 0.26
914 0.31
915 0.31
916 0.34
917 0.41
918 0.45
919 0.42
920 0.41
921 0.36
922 0.3
923 0.27
924 0.23
925 0.15
926 0.11
927 0.11
928 0.11
929 0.12
930 0.11
931 0.13
932 0.16
933 0.16
934 0.16
935 0.22
936 0.28
937 0.3
938 0.34
939 0.36
940 0.39
941 0.4
942 0.4
943 0.4
944 0.39
945 0.39
946 0.37
947 0.34
948 0.3
949 0.34
950 0.35
951 0.33
952 0.28
953 0.27
954 0.27
955 0.29
956 0.29
957 0.26
958 0.27
959 0.25
960 0.25
961 0.28
962 0.28
963 0.26
964 0.28
965 0.29
966 0.27
967 0.29
968 0.34
969 0.3
970 0.29
971 0.31
972 0.28
973 0.26
974 0.28
975 0.28
976 0.23
977 0.24
978 0.24
979 0.28
980 0.34
981 0.37
982 0.36
983 0.35
984 0.35
985 0.42
986 0.44
987 0.41
988 0.38
989 0.36
990 0.37
991 0.34
992 0.39
993 0.34
994 0.32
995 0.29
996 0.27
997 0.24
998 0.23
999 0.23
1000 0.16
1001 0.16
1002 0.2
1003 0.19
1004 0.16
1005 0.19
1006 0.22
1007 0.28
1008 0.32
1009 0.38
1010 0.41
1011 0.46
1012 0.52
1013 0.52
1014 0.5
1015 0.52
1016 0.5
1017 0.49
1018 0.51
1019 0.46
1020 0.41
1021 0.45
1022 0.47
1023 0.47
1024 0.51
1025 0.52
1026 0.5
1027 0.57
1028 0.58
1029 0.6
1030 0.61
1031 0.55
1032 0.52
1033 0.44
1034 0.37
1035 0.3
1036 0.28
1037 0.2
1038 0.15
1039 0.14
1040 0.12
1041 0.12
1042 0.12
1043 0.14
1044 0.14
1045 0.13
1046 0.18
1047 0.21
1048 0.2
1049 0.22
1050 0.24
1051 0.28
1052 0.33
1053 0.37
1054 0.34
1055 0.33
1056 0.32
1057 0.33
1058 0.31
1059 0.27
1060 0.23
1061 0.19
1062 0.2
1063 0.2
1064 0.19
1065 0.18
1066 0.19
1067 0.22
1068 0.25
1069 0.25
1070 0.22
1071 0.21
1072 0.22
1073 0.23
1074 0.24
1075 0.21
1076 0.15
1077 0.15
1078 0.16
1079 0.13
1080 0.13
1081 0.14
1082 0.16
1083 0.18
1084 0.18
1085 0.18
1086 0.19
1087 0.2
1088 0.21
1089 0.25
1090 0.25
1091 0.24
1092 0.25
1093 0.26
1094 0.27
1095 0.28
1096 0.27
1097 0.24
1098 0.23
1099 0.22
1100 0.29
1101 0.33
1102 0.37
1103 0.41
1104 0.47
1105 0.47
1106 0.5
1107 0.59
1108 0.6
1109 0.65
1110 0.7
1111 0.74
1112 0.78
1113 0.83