Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A060SSX5

Protein Details
Accession A0A060SSX5    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
155-174DSKPLWKKVRKLKGAEKVEWHydrophilic
341-366EALISDKQKKKKQRREEKKRKAAETGBasic
702-744AEARGDKKLQRRQSLPNVKSEEADERPKKKRRMSDPPKPSAAAHydrophilic
762-784GSKVGELIGRKRRERKMKKTRGKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-132KKEEKKQANKPAAPRPAK
347-362KQKKKKQRREEKKRKA
725-784DERPKKKRRMSDPPKPSAAASPAKSKSKSGGKGQEKAGSKVGELIGRKRRERKMKKTRGK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034808  Nop4p_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12676  RRM3_Nop4p  
Amino Acid Sequences MSTLGKRKERDSQDGGHEKPHGSTLFVSNLPYTATSTDLKTLFSDIAPVRTAFVVLDHETGNSKGVGYVSFALREDAAMAIDKISKEGITLDGRSLRVQWAGSKNKDHEHSGEVKKEEKKQANKPAAPRPAKHTGPSDPLAIRTVVISGLPESVDSKPLWKKVRKLKGAEKVEWPVKNEAGEEDRSTAHALFDTPANANEAVNKLHAHVFKGSLLSATLKKRLDGLAKAAKAKPSTQAKTGPAPNRNSRLIVRNLPFNITEQDLRAIFLPYGPIYSVHIPLATERKNEDSKEEEEVKQEEGTSQPRPRTKGFAFVWFLSRKDAEKALENCNGMTVEAGMAEALISDKQKKKKQRREEKKRKAAETGVEESEGEDDEGEKEGRLGKRVIAVDWALSKDKWEAEKAKLEEALQEEEGESNQSASSDESEDSAEEEDDESASEDEGLGVHDGESDDSDSDSDGSHDGSDEDESDDDAQEPVKPTLPPPEVGTTVFVRNVPFEATEDELRTLFRAFGPLRYARITMDAATGRSRGTGFVCFWNKEDADKAIEQSNILRAETLGDTPAIVKKNPFKMPSLLTPDPSASIAQNLVLHGRTLDVSRAVTRDEATRLKEIGERQREKADKRNLYLLREGIILPNTPAAELLPPAEVEKRTQSFNARRALLRSNPSLYVSRTRLSVRQLPLFVTERMLKRLAIHAMRAFEAEARGDKKLQRRQSLPNVKSEEADERPKKKRRMSDPPKPSAAASPAKSKSKSGGKGQEKAGSKVGELIGRKRRERKMKKTRGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.66
3 0.61
4 0.57
5 0.49
6 0.44
7 0.43
8 0.33
9 0.26
10 0.28
11 0.27
12 0.28
13 0.28
14 0.28
15 0.23
16 0.23
17 0.22
18 0.2
19 0.17
20 0.13
21 0.16
22 0.16
23 0.18
24 0.22
25 0.22
26 0.22
27 0.21
28 0.22
29 0.2
30 0.18
31 0.23
32 0.19
33 0.22
34 0.23
35 0.22
36 0.21
37 0.2
38 0.2
39 0.14
40 0.14
41 0.15
42 0.15
43 0.16
44 0.15
45 0.16
46 0.18
47 0.18
48 0.18
49 0.14
50 0.12
51 0.11
52 0.12
53 0.12
54 0.12
55 0.15
56 0.15
57 0.17
58 0.17
59 0.17
60 0.16
61 0.15
62 0.13
63 0.1
64 0.1
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.12
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.11
73 0.1
74 0.11
75 0.15
76 0.16
77 0.17
78 0.2
79 0.24
80 0.25
81 0.25
82 0.25
83 0.23
84 0.22
85 0.22
86 0.25
87 0.31
88 0.39
89 0.43
90 0.49
91 0.51
92 0.56
93 0.58
94 0.55
95 0.48
96 0.46
97 0.49
98 0.49
99 0.52
100 0.47
101 0.51
102 0.53
103 0.59
104 0.62
105 0.63
106 0.65
107 0.68
108 0.76
109 0.8
110 0.8
111 0.79
112 0.79
113 0.8
114 0.77
115 0.7
116 0.67
117 0.66
118 0.63
119 0.59
120 0.55
121 0.51
122 0.5
123 0.49
124 0.47
125 0.38
126 0.37
127 0.34
128 0.28
129 0.22
130 0.16
131 0.15
132 0.1
133 0.09
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.09
140 0.1
141 0.13
142 0.12
143 0.18
144 0.23
145 0.3
146 0.39
147 0.43
148 0.51
149 0.59
150 0.7
151 0.72
152 0.75
153 0.78
154 0.79
155 0.81
156 0.76
157 0.71
158 0.68
159 0.67
160 0.61
161 0.54
162 0.47
163 0.41
164 0.38
165 0.32
166 0.27
167 0.24
168 0.24
169 0.22
170 0.19
171 0.18
172 0.18
173 0.19
174 0.17
175 0.13
176 0.11
177 0.11
178 0.1
179 0.11
180 0.12
181 0.11
182 0.11
183 0.13
184 0.13
185 0.12
186 0.14
187 0.14
188 0.13
189 0.14
190 0.14
191 0.13
192 0.18
193 0.19
194 0.19
195 0.19
196 0.19
197 0.19
198 0.2
199 0.18
200 0.13
201 0.13
202 0.14
203 0.18
204 0.19
205 0.24
206 0.24
207 0.24
208 0.25
209 0.28
210 0.3
211 0.27
212 0.32
213 0.33
214 0.35
215 0.4
216 0.4
217 0.4
218 0.37
219 0.36
220 0.37
221 0.38
222 0.39
223 0.39
224 0.43
225 0.42
226 0.48
227 0.54
228 0.54
229 0.51
230 0.55
231 0.57
232 0.57
233 0.56
234 0.52
235 0.47
236 0.46
237 0.44
238 0.46
239 0.41
240 0.41
241 0.4
242 0.39
243 0.36
244 0.31
245 0.27
246 0.21
247 0.2
248 0.15
249 0.17
250 0.15
251 0.15
252 0.14
253 0.13
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.1
262 0.11
263 0.12
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.13
268 0.19
269 0.19
270 0.18
271 0.19
272 0.24
273 0.27
274 0.27
275 0.28
276 0.26
277 0.26
278 0.3
279 0.33
280 0.29
281 0.28
282 0.29
283 0.27
284 0.22
285 0.2
286 0.15
287 0.14
288 0.16
289 0.2
290 0.22
291 0.27
292 0.3
293 0.34
294 0.35
295 0.4
296 0.38
297 0.41
298 0.39
299 0.41
300 0.4
301 0.37
302 0.41
303 0.34
304 0.34
305 0.27
306 0.26
307 0.2
308 0.19
309 0.21
310 0.17
311 0.23
312 0.26
313 0.29
314 0.31
315 0.3
316 0.28
317 0.26
318 0.25
319 0.17
320 0.14
321 0.09
322 0.05
323 0.04
324 0.04
325 0.03
326 0.03
327 0.02
328 0.02
329 0.03
330 0.03
331 0.04
332 0.1
333 0.16
334 0.24
335 0.31
336 0.41
337 0.52
338 0.62
339 0.73
340 0.79
341 0.85
342 0.89
343 0.94
344 0.95
345 0.94
346 0.91
347 0.83
348 0.76
349 0.68
350 0.61
351 0.55
352 0.47
353 0.38
354 0.3
355 0.27
356 0.23
357 0.19
358 0.14
359 0.08
360 0.04
361 0.04
362 0.05
363 0.06
364 0.06
365 0.05
366 0.05
367 0.1
368 0.11
369 0.13
370 0.13
371 0.12
372 0.17
373 0.18
374 0.17
375 0.15
376 0.14
377 0.13
378 0.13
379 0.14
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.12
385 0.12
386 0.15
387 0.17
388 0.19
389 0.26
390 0.26
391 0.26
392 0.25
393 0.24
394 0.23
395 0.21
396 0.2
397 0.13
398 0.12
399 0.11
400 0.1
401 0.1
402 0.09
403 0.07
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.06
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.08
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.07
418 0.05
419 0.06
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.03
433 0.03
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.06
462 0.07
463 0.09
464 0.1
465 0.12
466 0.12
467 0.12
468 0.2
469 0.22
470 0.21
471 0.22
472 0.24
473 0.23
474 0.23
475 0.25
476 0.18
477 0.18
478 0.18
479 0.16
480 0.13
481 0.13
482 0.13
483 0.11
484 0.1
485 0.1
486 0.11
487 0.12
488 0.13
489 0.14
490 0.14
491 0.13
492 0.13
493 0.12
494 0.11
495 0.09
496 0.08
497 0.13
498 0.13
499 0.15
500 0.2
501 0.21
502 0.23
503 0.24
504 0.24
505 0.19
506 0.21
507 0.2
508 0.15
509 0.17
510 0.16
511 0.15
512 0.16
513 0.16
514 0.13
515 0.13
516 0.13
517 0.1
518 0.11
519 0.13
520 0.13
521 0.21
522 0.25
523 0.25
524 0.26
525 0.29
526 0.28
527 0.26
528 0.27
529 0.2
530 0.2
531 0.2
532 0.2
533 0.19
534 0.19
535 0.18
536 0.17
537 0.2
538 0.17
539 0.17
540 0.15
541 0.12
542 0.14
543 0.14
544 0.14
545 0.09
546 0.08
547 0.08
548 0.09
549 0.13
550 0.13
551 0.13
552 0.16
553 0.23
554 0.31
555 0.37
556 0.38
557 0.37
558 0.4
559 0.44
560 0.47
561 0.49
562 0.42
563 0.38
564 0.37
565 0.34
566 0.31
567 0.28
568 0.21
569 0.12
570 0.12
571 0.11
572 0.11
573 0.11
574 0.1
575 0.11
576 0.1
577 0.1
578 0.09
579 0.09
580 0.09
581 0.09
582 0.1
583 0.1
584 0.11
585 0.13
586 0.14
587 0.14
588 0.14
589 0.15
590 0.16
591 0.2
592 0.23
593 0.24
594 0.26
595 0.26
596 0.26
597 0.29
598 0.32
599 0.37
600 0.44
601 0.45
602 0.45
603 0.53
604 0.58
605 0.59
606 0.62
607 0.63
608 0.6
609 0.59
610 0.66
611 0.6
612 0.58
613 0.58
614 0.49
615 0.4
616 0.34
617 0.3
618 0.23
619 0.21
620 0.18
621 0.14
622 0.15
623 0.14
624 0.12
625 0.12
626 0.1
627 0.09
628 0.09
629 0.1
630 0.08
631 0.08
632 0.1
633 0.14
634 0.14
635 0.15
636 0.22
637 0.23
638 0.25
639 0.29
640 0.37
641 0.42
642 0.48
643 0.53
644 0.49
645 0.49
646 0.5
647 0.54
648 0.51
649 0.49
650 0.47
651 0.43
652 0.41
653 0.42
654 0.41
655 0.38
656 0.39
657 0.36
658 0.33
659 0.33
660 0.34
661 0.35
662 0.39
663 0.43
664 0.41
665 0.44
666 0.44
667 0.42
668 0.44
669 0.43
670 0.37
671 0.33
672 0.34
673 0.3
674 0.33
675 0.33
676 0.28
677 0.27
678 0.32
679 0.36
680 0.32
681 0.35
682 0.34
683 0.35
684 0.35
685 0.33
686 0.28
687 0.22
688 0.21
689 0.17
690 0.19
691 0.2
692 0.22
693 0.25
694 0.3
695 0.38
696 0.46
697 0.54
698 0.58
699 0.61
700 0.69
701 0.76
702 0.82
703 0.75
704 0.75
705 0.72
706 0.64
707 0.59
708 0.52
709 0.48
710 0.43
711 0.5
712 0.5
713 0.51
714 0.6
715 0.69
716 0.75
717 0.76
718 0.81
719 0.81
720 0.84
721 0.86
722 0.87
723 0.88
724 0.88
725 0.84
726 0.76
727 0.66
728 0.61
729 0.57
730 0.54
731 0.47
732 0.48
733 0.5
734 0.55
735 0.56
736 0.52
737 0.54
738 0.55
739 0.59
740 0.6
741 0.64
742 0.65
743 0.7
744 0.73
745 0.72
746 0.67
747 0.63
748 0.59
749 0.49
750 0.41
751 0.39
752 0.36
753 0.34
754 0.34
755 0.39
756 0.42
757 0.49
758 0.57
759 0.62
760 0.69
761 0.75
762 0.83
763 0.85
764 0.87