Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A060SDK6

Protein Details
Accession A0A060SDK6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
738-761LPGEPSSPSRKRRDQPQTRKVEATHydrophilic
849-876EACHVRLRMPKCQKCKKSIRHGTQAVEAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001781  Znf_LIM  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00412  LIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50023  LIM_DOMAIN_2  
CDD cd08368  LIM  
Amino Acid Sequences MNNPQTGRRPLPQPRGLPPPPQSAGLPRSVPQPTTSPQPGYATHRPTQSVPSVFPHYPIPNPNALQPVQRDPFPSPVSGMSSAMSTSPPRPLPLPRSAGSFDLSSGQQTQQRPQSPPKRALPEPHSFATQQDQSIRSPEPLPALGQKFVPLWKRALPHPGSTPSQVLPSPAEGGQPAQVERRSTVSTGGSRPLPPSPSNSSSPTVGLPRDPLARAGTLPPHLQLPYLPPTPHSPGEQASEQPPPTAPPAAPKWPTNSNPSPSSRFPIRERSRTLPAPAAAPTYPLPPKPDQSQYSSSQNVTGLPLSQSPHSSDDEELTNALLERHTRSPSPQHGIRDLPRSNQAQPGVLGSPSKVTGGEATSPRARRELPSPGCASPSKSASQSLGDSDSSLAYRMAAVSLQQRSPSPSPTSPSQPFRRGHAPSSSVSSVGSSRPMPQPPTNAQPVQDRPQQQRGAWPSTLPPLPRAPVSPQPQASTSPTPPSQTQTQGWSRPLPTRLNTASASVTPFGRPRSPRKADLDLSLDDAPPPSLRRSPALPSSQSPQQQQFSSRTGSAPTGAHLQRAPSQDTTASIISLSSFPKPPSHIDSKPPSPTKIGSRPPSPAKYQSQQQQHQQQQAPREFNRIQPPTPTKTPFAVRSPSPTKYTGPPAFTIPDQRASQSTPRIPKISFPANPDGDSDEDGTNGGPVINVSGPSDSRDDDVPSIPRISFGGEDDGDDIPSINIGGADDDPPVPMISLPGEPSSPSRKRRDQPQTRKVEATLANPRLEAAKRSGLTPIVDERFITLDDPELGKRTYHEQHFFCAECGDPFLPPSTPGAPSRTFAGDGEFAVGAEDDVGFTVYKGYPYCEACHVRLRMPKCQKCKKSIRHGTQAVEALGGKWCWECFTCASCDKPFDVPAFFQRDGKPFCEHCFSIMIRNEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.74
3 0.72
4 0.71
5 0.67
6 0.66
7 0.59
8 0.55
9 0.51
10 0.49
11 0.48
12 0.45
13 0.42
14 0.34
15 0.39
16 0.4
17 0.39
18 0.34
19 0.35
20 0.33
21 0.39
22 0.43
23 0.39
24 0.39
25 0.41
26 0.43
27 0.46
28 0.52
29 0.5
30 0.49
31 0.5
32 0.5
33 0.49
34 0.51
35 0.5
36 0.45
37 0.4
38 0.41
39 0.44
40 0.41
41 0.41
42 0.41
43 0.37
44 0.38
45 0.41
46 0.4
47 0.4
48 0.41
49 0.43
50 0.42
51 0.4
52 0.4
53 0.39
54 0.44
55 0.4
56 0.4
57 0.4
58 0.37
59 0.44
60 0.41
61 0.37
62 0.3
63 0.29
64 0.32
65 0.3
66 0.28
67 0.2
68 0.18
69 0.17
70 0.16
71 0.16
72 0.14
73 0.14
74 0.21
75 0.22
76 0.24
77 0.27
78 0.34
79 0.39
80 0.45
81 0.49
82 0.44
83 0.48
84 0.47
85 0.45
86 0.4
87 0.33
88 0.25
89 0.22
90 0.21
91 0.17
92 0.18
93 0.19
94 0.23
95 0.25
96 0.32
97 0.37
98 0.44
99 0.47
100 0.56
101 0.62
102 0.65
103 0.72
104 0.73
105 0.72
106 0.7
107 0.74
108 0.71
109 0.7
110 0.67
111 0.6
112 0.55
113 0.47
114 0.44
115 0.42
116 0.38
117 0.32
118 0.31
119 0.31
120 0.29
121 0.32
122 0.32
123 0.28
124 0.26
125 0.25
126 0.24
127 0.23
128 0.24
129 0.27
130 0.28
131 0.27
132 0.26
133 0.26
134 0.24
135 0.28
136 0.32
137 0.27
138 0.27
139 0.31
140 0.34
141 0.36
142 0.44
143 0.42
144 0.41
145 0.44
146 0.46
147 0.45
148 0.44
149 0.43
150 0.34
151 0.34
152 0.3
153 0.26
154 0.22
155 0.2
156 0.2
157 0.17
158 0.17
159 0.14
160 0.15
161 0.16
162 0.16
163 0.16
164 0.18
165 0.2
166 0.21
167 0.22
168 0.25
169 0.24
170 0.23
171 0.25
172 0.25
173 0.26
174 0.27
175 0.3
176 0.28
177 0.27
178 0.29
179 0.3
180 0.3
181 0.27
182 0.3
183 0.34
184 0.36
185 0.39
186 0.4
187 0.39
188 0.36
189 0.36
190 0.32
191 0.28
192 0.24
193 0.22
194 0.2
195 0.21
196 0.23
197 0.22
198 0.22
199 0.2
200 0.2
201 0.2
202 0.2
203 0.21
204 0.21
205 0.21
206 0.19
207 0.2
208 0.19
209 0.18
210 0.16
211 0.17
212 0.21
213 0.24
214 0.23
215 0.23
216 0.28
217 0.33
218 0.34
219 0.31
220 0.27
221 0.26
222 0.3
223 0.3
224 0.27
225 0.24
226 0.28
227 0.26
228 0.24
229 0.22
230 0.2
231 0.2
232 0.21
233 0.18
234 0.19
235 0.24
236 0.31
237 0.34
238 0.34
239 0.36
240 0.42
241 0.45
242 0.47
243 0.48
244 0.45
245 0.48
246 0.51
247 0.51
248 0.46
249 0.49
250 0.46
251 0.45
252 0.44
253 0.49
254 0.53
255 0.55
256 0.59
257 0.59
258 0.61
259 0.58
260 0.57
261 0.51
262 0.44
263 0.38
264 0.32
265 0.29
266 0.22
267 0.21
268 0.18
269 0.18
270 0.2
271 0.2
272 0.24
273 0.24
274 0.28
275 0.31
276 0.38
277 0.36
278 0.4
279 0.43
280 0.43
281 0.46
282 0.44
283 0.4
284 0.33
285 0.31
286 0.25
287 0.21
288 0.17
289 0.12
290 0.11
291 0.13
292 0.12
293 0.13
294 0.13
295 0.15
296 0.17
297 0.18
298 0.18
299 0.17
300 0.17
301 0.18
302 0.17
303 0.14
304 0.11
305 0.1
306 0.09
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.1
311 0.14
312 0.16
313 0.16
314 0.19
315 0.27
316 0.33
317 0.38
318 0.39
319 0.39
320 0.41
321 0.45
322 0.46
323 0.47
324 0.42
325 0.37
326 0.39
327 0.39
328 0.37
329 0.37
330 0.33
331 0.26
332 0.25
333 0.24
334 0.19
335 0.16
336 0.15
337 0.1
338 0.1
339 0.09
340 0.09
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.09
345 0.13
346 0.13
347 0.16
348 0.2
349 0.22
350 0.23
351 0.24
352 0.24
353 0.22
354 0.26
355 0.33
356 0.31
357 0.35
358 0.37
359 0.35
360 0.37
361 0.35
362 0.34
363 0.26
364 0.26
365 0.22
366 0.2
367 0.21
368 0.19
369 0.2
370 0.18
371 0.16
372 0.15
373 0.13
374 0.12
375 0.11
376 0.11
377 0.09
378 0.09
379 0.07
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.04
385 0.06
386 0.1
387 0.12
388 0.12
389 0.13
390 0.14
391 0.19
392 0.2
393 0.22
394 0.23
395 0.22
396 0.25
397 0.27
398 0.34
399 0.34
400 0.4
401 0.43
402 0.46
403 0.45
404 0.46
405 0.51
406 0.46
407 0.44
408 0.41
409 0.38
410 0.31
411 0.35
412 0.31
413 0.23
414 0.2
415 0.18
416 0.14
417 0.12
418 0.13
419 0.09
420 0.12
421 0.16
422 0.18
423 0.21
424 0.22
425 0.27
426 0.28
427 0.32
428 0.34
429 0.31
430 0.3
431 0.31
432 0.33
433 0.33
434 0.35
435 0.36
436 0.35
437 0.43
438 0.43
439 0.38
440 0.41
441 0.41
442 0.4
443 0.35
444 0.31
445 0.24
446 0.26
447 0.27
448 0.21
449 0.19
450 0.16
451 0.17
452 0.17
453 0.17
454 0.18
455 0.24
456 0.29
457 0.31
458 0.3
459 0.31
460 0.31
461 0.32
462 0.32
463 0.28
464 0.24
465 0.23
466 0.23
467 0.24
468 0.24
469 0.25
470 0.23
471 0.23
472 0.23
473 0.25
474 0.29
475 0.3
476 0.31
477 0.31
478 0.3
479 0.3
480 0.33
481 0.31
482 0.28
483 0.3
484 0.29
485 0.3
486 0.29
487 0.26
488 0.23
489 0.2
490 0.19
491 0.14
492 0.13
493 0.11
494 0.13
495 0.14
496 0.18
497 0.22
498 0.29
499 0.38
500 0.43
501 0.47
502 0.51
503 0.55
504 0.52
505 0.51
506 0.47
507 0.37
508 0.35
509 0.3
510 0.24
511 0.17
512 0.16
513 0.13
514 0.1
515 0.11
516 0.1
517 0.12
518 0.14
519 0.16
520 0.18
521 0.22
522 0.27
523 0.3
524 0.3
525 0.29
526 0.32
527 0.35
528 0.36
529 0.35
530 0.34
531 0.32
532 0.31
533 0.33
534 0.33
535 0.3
536 0.29
537 0.26
538 0.22
539 0.21
540 0.2
541 0.19
542 0.15
543 0.14
544 0.18
545 0.18
546 0.19
547 0.17
548 0.19
549 0.22
550 0.24
551 0.26
552 0.19
553 0.2
554 0.19
555 0.2
556 0.21
557 0.16
558 0.13
559 0.1
560 0.09
561 0.09
562 0.1
563 0.1
564 0.1
565 0.11
566 0.12
567 0.15
568 0.17
569 0.2
570 0.25
571 0.31
572 0.32
573 0.37
574 0.44
575 0.47
576 0.53
577 0.53
578 0.48
579 0.43
580 0.43
581 0.44
582 0.46
583 0.48
584 0.46
585 0.46
586 0.51
587 0.55
588 0.56
589 0.53
590 0.51
591 0.49
592 0.48
593 0.51
594 0.52
595 0.55
596 0.56
597 0.61
598 0.63
599 0.63
600 0.67
601 0.65
602 0.61
603 0.6
604 0.61
605 0.59
606 0.5
607 0.52
608 0.45
609 0.46
610 0.53
611 0.48
612 0.42
613 0.44
614 0.49
615 0.48
616 0.52
617 0.5
618 0.42
619 0.42
620 0.46
621 0.43
622 0.42
623 0.4
624 0.35
625 0.4
626 0.43
627 0.42
628 0.41
629 0.38
630 0.36
631 0.36
632 0.44
633 0.41
634 0.38
635 0.36
636 0.35
637 0.34
638 0.32
639 0.33
640 0.26
641 0.27
642 0.25
643 0.25
644 0.25
645 0.26
646 0.3
647 0.32
648 0.37
649 0.38
650 0.41
651 0.43
652 0.42
653 0.42
654 0.44
655 0.45
656 0.42
657 0.41
658 0.44
659 0.43
660 0.43
661 0.4
662 0.36
663 0.28
664 0.26
665 0.23
666 0.15
667 0.13
668 0.13
669 0.12
670 0.09
671 0.08
672 0.07
673 0.04
674 0.04
675 0.06
676 0.06
677 0.07
678 0.07
679 0.09
680 0.09
681 0.11
682 0.13
683 0.12
684 0.13
685 0.14
686 0.15
687 0.16
688 0.19
689 0.19
690 0.19
691 0.21
692 0.19
693 0.18
694 0.16
695 0.16
696 0.14
697 0.13
698 0.16
699 0.14
700 0.14
701 0.16
702 0.16
703 0.14
704 0.13
705 0.12
706 0.07
707 0.07
708 0.07
709 0.04
710 0.04
711 0.04
712 0.05
713 0.06
714 0.07
715 0.08
716 0.08
717 0.08
718 0.09
719 0.09
720 0.08
721 0.07
722 0.07
723 0.08
724 0.09
725 0.1
726 0.11
727 0.11
728 0.12
729 0.16
730 0.25
731 0.31
732 0.38
733 0.45
734 0.54
735 0.61
736 0.71
737 0.78
738 0.8
739 0.84
740 0.86
741 0.87
742 0.82
743 0.78
744 0.68
745 0.64
746 0.57
747 0.53
748 0.52
749 0.47
750 0.43
751 0.39
752 0.39
753 0.35
754 0.34
755 0.29
756 0.24
757 0.27
758 0.27
759 0.28
760 0.3
761 0.28
762 0.27
763 0.27
764 0.3
765 0.25
766 0.25
767 0.24
768 0.23
769 0.22
770 0.21
771 0.19
772 0.12
773 0.11
774 0.13
775 0.15
776 0.15
777 0.16
778 0.16
779 0.16
780 0.18
781 0.23
782 0.29
783 0.35
784 0.42
785 0.4
786 0.44
787 0.49
788 0.48
789 0.41
790 0.35
791 0.28
792 0.2
793 0.23
794 0.19
795 0.15
796 0.15
797 0.16
798 0.16
799 0.16
800 0.19
801 0.17
802 0.2
803 0.22
804 0.27
805 0.26
806 0.27
807 0.3
808 0.28
809 0.27
810 0.23
811 0.25
812 0.21
813 0.19
814 0.2
815 0.16
816 0.14
817 0.13
818 0.12
819 0.08
820 0.07
821 0.07
822 0.04
823 0.05
824 0.06
825 0.05
826 0.05
827 0.09
828 0.09
829 0.12
830 0.12
831 0.15
832 0.19
833 0.22
834 0.25
835 0.31
836 0.35
837 0.36
838 0.44
839 0.44
840 0.46
841 0.51
842 0.53
843 0.55
844 0.62
845 0.67
846 0.69
847 0.78
848 0.8
849 0.83
850 0.89
851 0.88
852 0.89
853 0.91
854 0.9
855 0.89
856 0.87
857 0.81
858 0.76
859 0.69
860 0.58
861 0.49
862 0.39
863 0.29
864 0.26
865 0.22
866 0.16
867 0.14
868 0.14
869 0.15
870 0.16
871 0.19
872 0.19
873 0.23
874 0.28
875 0.3
876 0.35
877 0.36
878 0.38
879 0.38
880 0.38
881 0.38
882 0.35
883 0.35
884 0.33
885 0.37
886 0.41
887 0.4
888 0.41
889 0.43
890 0.48
891 0.49
892 0.49
893 0.49
894 0.44
895 0.48
896 0.5
897 0.46
898 0.39
899 0.41
900 0.39
901 0.4