Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JS09

Protein Details
Accession C4JS09    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1006-1027QELETHKRRRLAEKERKQAQEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1012-1041KRRRLAEKERKQAQEALENQKKLKRPAGAA
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 6.5, cyto_nucl 5.5, cyto 3.5, plas 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR033162  TBCD  
IPR022577  Tubulin_specific_chaperoneD_C  
Gene Ontology GO:0048487  F:beta-tubulin binding  
GO:0005096  F:GTPase activator activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0007023  P:post-chaperonin tubulin folding pathway  
GO:0007021  P:tubulin complex assembly  
KEGG ure:UREG_05248  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF12612  TFCD_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12246  RRM1_U1A_like  
cd12247  RRM2_U1A_like  
Amino Acid Sequences MAIRASASARKAVIKIFRSIMVLMLTLEERLGNFSEKSSMLLEHTIDHFLLALADKDTPVRFAASKALSMVTLKLDPEMAPDIVEAVLEALEEDILYETQAGTLISSFQAGNTRSSLSRRNTNAVDPQKWQGLILTLSQLLFRRALPPFYLDQVLQSLLSGLEFEQRSSTGSSVGGGVRDASCFGIWSIARKYTSREICAPDPQKIKVGTNKDESVLQLLAVELVCAACLDPSGNIRRGASAALQELIGRHPDTVLEGITLVQIVDYHAVARRAKAMQEVAKDAAGIGQSYWDSLLDGLLQWRGIGSPDSRSRRTAAAAIGELSIQEGYKSILTVLRRTIKCLSAVSAYAIEVRHGCLLSLAAVVDEFLAYRLKNPSEDQSAQSVALEISSLWEVLDRQIGQSKDSLTLSELRPDLTTEASARFLSSLARSCTDGSASPAVPRPSEKLLEKAVDILILCVCRGDDIPIEASSQAASDLFALLPSQKQTEVITLWFDNINASWKSTSGRGQISALGAVFKQLPVSSEGRTMILNELLRSTSEEESISKRSSAVKCITTGILPYAENVKSISTHFEAFLNDYTTDRRGDIGSFIRLEAIGGVNFILNSKLIQPLELYDLMKCVVRLTAEKLDKVRFQAWKCLVRFWEESPTLPPLQERYEHLSEVSSTGYFLQLFSLLSVDWIRPSLLRGVATSASAGTEGLVKSSRLALAQYIKMYGDDNECLLKRNVFDDLMLALESTIDDDRYAIPTVDTICFLLDNCFENSALLNLNFRKLFLLVQKSHFKSSNIPRIEAAIKLYSTLLRQETIRKDVMKKMISMLLHSYPKALLMGYDGFISLIEGVASYHSRAQFDPFSWHRPSARRFAGHLWELVEVTNGFTSRNKLLCSRAAAEYLRFLSFLSRENGYSSPKFFRHSAESNVRNLEERVKVDQLKEALSEIFAEYGSILEIVAKSNLKAKGQAFIVFDNVDSATRAIEEINGFELFEKPMVLDYAKTRSDATVLKEAGEQELETHKRRRLAEKERKQAQEALENQKKLKRPAGAAADTRPAKTTRGAGLKPTGAAAAPVIPDEYLPPNKILFLREVPDSYDSAGLTAIFGRFEGFKEVRMVPGRKGIAFVEYESEAGAISAKEATSGMTLGENGKPMRVTYQRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.4
3 0.39
4 0.39
5 0.38
6 0.36
7 0.32
8 0.25
9 0.22
10 0.17
11 0.16
12 0.14
13 0.11
14 0.11
15 0.09
16 0.08
17 0.1
18 0.12
19 0.13
20 0.14
21 0.15
22 0.18
23 0.18
24 0.2
25 0.19
26 0.18
27 0.18
28 0.2
29 0.19
30 0.19
31 0.2
32 0.2
33 0.18
34 0.17
35 0.15
36 0.12
37 0.13
38 0.1
39 0.1
40 0.09
41 0.1
42 0.1
43 0.13
44 0.14
45 0.14
46 0.14
47 0.16
48 0.16
49 0.17
50 0.25
51 0.24
52 0.24
53 0.24
54 0.24
55 0.21
56 0.22
57 0.21
58 0.17
59 0.16
60 0.16
61 0.15
62 0.15
63 0.14
64 0.17
65 0.19
66 0.16
67 0.14
68 0.14
69 0.14
70 0.13
71 0.12
72 0.09
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.05
82 0.05
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.07
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.07
92 0.07
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.15
97 0.16
98 0.18
99 0.19
100 0.21
101 0.22
102 0.27
103 0.34
104 0.34
105 0.42
106 0.45
107 0.5
108 0.5
109 0.53
110 0.59
111 0.59
112 0.57
113 0.52
114 0.51
115 0.49
116 0.46
117 0.4
118 0.31
119 0.26
120 0.23
121 0.21
122 0.19
123 0.15
124 0.16
125 0.18
126 0.18
127 0.16
128 0.16
129 0.16
130 0.19
131 0.21
132 0.23
133 0.23
134 0.25
135 0.26
136 0.28
137 0.29
138 0.23
139 0.22
140 0.21
141 0.2
142 0.16
143 0.14
144 0.11
145 0.09
146 0.09
147 0.08
148 0.06
149 0.12
150 0.12
151 0.13
152 0.14
153 0.14
154 0.16
155 0.17
156 0.18
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.13
161 0.14
162 0.12
163 0.1
164 0.11
165 0.1
166 0.11
167 0.11
168 0.1
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.13
173 0.13
174 0.17
175 0.2
176 0.24
177 0.26
178 0.26
179 0.32
180 0.36
181 0.42
182 0.42
183 0.44
184 0.45
185 0.47
186 0.56
187 0.54
188 0.52
189 0.51
190 0.47
191 0.48
192 0.44
193 0.46
194 0.44
195 0.48
196 0.47
197 0.49
198 0.49
199 0.44
200 0.43
201 0.38
202 0.34
203 0.26
204 0.19
205 0.13
206 0.11
207 0.11
208 0.09
209 0.08
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.03
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.11
220 0.16
221 0.2
222 0.21
223 0.22
224 0.22
225 0.23
226 0.23
227 0.2
228 0.17
229 0.15
230 0.14
231 0.14
232 0.13
233 0.13
234 0.13
235 0.14
236 0.12
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.12
241 0.12
242 0.11
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.06
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.06
255 0.09
256 0.13
257 0.14
258 0.15
259 0.19
260 0.2
261 0.21
262 0.23
263 0.26
264 0.27
265 0.29
266 0.31
267 0.28
268 0.27
269 0.25
270 0.21
271 0.17
272 0.13
273 0.1
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.09
293 0.09
294 0.16
295 0.24
296 0.31
297 0.33
298 0.35
299 0.36
300 0.36
301 0.37
302 0.33
303 0.26
304 0.23
305 0.22
306 0.21
307 0.18
308 0.16
309 0.14
310 0.11
311 0.09
312 0.06
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.09
320 0.11
321 0.13
322 0.19
323 0.27
324 0.27
325 0.32
326 0.34
327 0.33
328 0.34
329 0.33
330 0.29
331 0.22
332 0.22
333 0.19
334 0.16
335 0.14
336 0.14
337 0.13
338 0.12
339 0.1
340 0.11
341 0.11
342 0.1
343 0.1
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.07
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.04
353 0.04
354 0.03
355 0.04
356 0.05
357 0.05
358 0.08
359 0.12
360 0.13
361 0.15
362 0.17
363 0.21
364 0.27
365 0.29
366 0.28
367 0.28
368 0.28
369 0.25
370 0.23
371 0.19
372 0.12
373 0.1
374 0.08
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.04
380 0.05
381 0.05
382 0.06
383 0.1
384 0.08
385 0.09
386 0.14
387 0.15
388 0.15
389 0.17
390 0.17
391 0.17
392 0.17
393 0.16
394 0.13
395 0.17
396 0.17
397 0.19
398 0.18
399 0.16
400 0.16
401 0.17
402 0.16
403 0.13
404 0.13
405 0.1
406 0.11
407 0.11
408 0.11
409 0.1
410 0.1
411 0.09
412 0.09
413 0.1
414 0.13
415 0.14
416 0.15
417 0.16
418 0.16
419 0.16
420 0.16
421 0.15
422 0.13
423 0.15
424 0.14
425 0.14
426 0.18
427 0.18
428 0.18
429 0.19
430 0.19
431 0.19
432 0.23
433 0.23
434 0.22
435 0.24
436 0.25
437 0.23
438 0.21
439 0.18
440 0.15
441 0.14
442 0.1
443 0.08
444 0.07
445 0.07
446 0.06
447 0.06
448 0.05
449 0.06
450 0.07
451 0.06
452 0.07
453 0.09
454 0.1
455 0.1
456 0.1
457 0.09
458 0.08
459 0.07
460 0.06
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.05
469 0.06
470 0.06
471 0.07
472 0.07
473 0.08
474 0.08
475 0.1
476 0.1
477 0.1
478 0.12
479 0.11
480 0.11
481 0.11
482 0.1
483 0.08
484 0.08
485 0.11
486 0.1
487 0.1
488 0.1
489 0.1
490 0.11
491 0.13
492 0.16
493 0.16
494 0.17
495 0.17
496 0.18
497 0.19
498 0.18
499 0.16
500 0.13
501 0.09
502 0.08
503 0.07
504 0.07
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.06
509 0.09
510 0.11
511 0.11
512 0.13
513 0.13
514 0.13
515 0.13
516 0.13
517 0.1
518 0.11
519 0.11
520 0.09
521 0.1
522 0.09
523 0.09
524 0.1
525 0.12
526 0.1
527 0.1
528 0.1
529 0.11
530 0.14
531 0.16
532 0.16
533 0.13
534 0.13
535 0.19
536 0.2
537 0.24
538 0.25
539 0.23
540 0.23
541 0.24
542 0.24
543 0.18
544 0.17
545 0.12
546 0.1
547 0.09
548 0.08
549 0.1
550 0.1
551 0.1
552 0.1
553 0.09
554 0.09
555 0.09
556 0.12
557 0.1
558 0.1
559 0.11
560 0.11
561 0.11
562 0.12
563 0.13
564 0.11
565 0.1
566 0.1
567 0.11
568 0.12
569 0.12
570 0.1
571 0.1
572 0.09
573 0.09
574 0.11
575 0.12
576 0.12
577 0.12
578 0.12
579 0.11
580 0.1
581 0.1
582 0.08
583 0.06
584 0.04
585 0.04
586 0.04
587 0.04
588 0.04
589 0.04
590 0.04
591 0.03
592 0.04
593 0.05
594 0.08
595 0.08
596 0.08
597 0.08
598 0.09
599 0.12
600 0.13
601 0.12
602 0.09
603 0.1
604 0.1
605 0.1
606 0.09
607 0.07
608 0.06
609 0.07
610 0.08
611 0.12
612 0.19
613 0.2
614 0.22
615 0.24
616 0.26
617 0.26
618 0.28
619 0.29
620 0.27
621 0.27
622 0.34
623 0.37
624 0.42
625 0.41
626 0.42
627 0.38
628 0.37
629 0.37
630 0.31
631 0.33
632 0.26
633 0.26
634 0.25
635 0.27
636 0.22
637 0.2
638 0.19
639 0.14
640 0.15
641 0.16
642 0.17
643 0.21
644 0.22
645 0.22
646 0.22
647 0.2
648 0.18
649 0.17
650 0.15
651 0.08
652 0.06
653 0.06
654 0.07
655 0.06
656 0.06
657 0.06
658 0.05
659 0.06
660 0.05
661 0.05
662 0.04
663 0.05
664 0.06
665 0.06
666 0.05
667 0.06
668 0.06
669 0.06
670 0.07
671 0.09
672 0.1
673 0.11
674 0.11
675 0.12
676 0.13
677 0.12
678 0.12
679 0.09
680 0.07
681 0.07
682 0.06
683 0.04
684 0.06
685 0.06
686 0.07
687 0.07
688 0.07
689 0.08
690 0.09
691 0.09
692 0.07
693 0.08
694 0.1
695 0.13
696 0.15
697 0.15
698 0.14
699 0.14
700 0.14
701 0.14
702 0.13
703 0.11
704 0.1
705 0.1
706 0.12
707 0.13
708 0.15
709 0.15
710 0.15
711 0.13
712 0.14
713 0.15
714 0.13
715 0.13
716 0.11
717 0.1
718 0.09
719 0.09
720 0.07
721 0.05
722 0.05
723 0.05
724 0.05
725 0.05
726 0.05
727 0.05
728 0.05
729 0.06
730 0.08
731 0.09
732 0.08
733 0.08
734 0.09
735 0.11
736 0.11
737 0.11
738 0.09
739 0.08
740 0.08
741 0.09
742 0.09
743 0.09
744 0.1
745 0.1
746 0.11
747 0.11
748 0.11
749 0.11
750 0.1
751 0.1
752 0.09
753 0.12
754 0.11
755 0.15
756 0.15
757 0.15
758 0.15
759 0.14
760 0.16
761 0.18
762 0.26
763 0.25
764 0.31
765 0.39
766 0.41
767 0.44
768 0.44
769 0.39
770 0.4
771 0.47
772 0.51
773 0.44
774 0.43
775 0.4
776 0.41
777 0.41
778 0.33
779 0.26
780 0.18
781 0.16
782 0.15
783 0.15
784 0.13
785 0.12
786 0.15
787 0.13
788 0.13
789 0.14
790 0.21
791 0.24
792 0.28
793 0.31
794 0.31
795 0.33
796 0.39
797 0.45
798 0.4
799 0.37
800 0.35
801 0.35
802 0.31
803 0.29
804 0.27
805 0.24
806 0.25
807 0.24
808 0.22
809 0.18
810 0.18
811 0.17
812 0.13
813 0.08
814 0.08
815 0.09
816 0.09
817 0.09
818 0.08
819 0.08
820 0.08
821 0.08
822 0.05
823 0.04
824 0.03
825 0.03
826 0.03
827 0.05
828 0.06
829 0.07
830 0.1
831 0.12
832 0.13
833 0.14
834 0.18
835 0.19
836 0.2
837 0.27
838 0.27
839 0.32
840 0.33
841 0.36
842 0.37
843 0.43
844 0.46
845 0.47
846 0.5
847 0.46
848 0.46
849 0.48
850 0.5
851 0.44
852 0.41
853 0.33
854 0.27
855 0.25
856 0.22
857 0.18
858 0.11
859 0.1
860 0.1
861 0.09
862 0.09
863 0.1
864 0.14
865 0.17
866 0.2
867 0.21
868 0.23
869 0.27
870 0.3
871 0.33
872 0.33
873 0.3
874 0.31
875 0.31
876 0.29
877 0.28
878 0.26
879 0.21
880 0.18
881 0.16
882 0.16
883 0.16
884 0.18
885 0.17
886 0.17
887 0.17
888 0.2
889 0.22
890 0.25
891 0.26
892 0.27
893 0.3
894 0.3
895 0.34
896 0.32
897 0.35
898 0.36
899 0.39
900 0.43
901 0.47
902 0.49
903 0.5
904 0.51
905 0.47
906 0.41
907 0.38
908 0.35
909 0.3
910 0.29
911 0.29
912 0.32
913 0.34
914 0.33
915 0.36
916 0.32
917 0.29
918 0.26
919 0.23
920 0.18
921 0.15
922 0.15
923 0.11
924 0.1
925 0.08
926 0.07
927 0.06
928 0.06
929 0.06
930 0.05
931 0.04
932 0.05
933 0.05
934 0.06
935 0.09
936 0.1
937 0.1
938 0.17
939 0.2
940 0.2
941 0.26
942 0.25
943 0.29
944 0.3
945 0.34
946 0.3
947 0.27
948 0.29
949 0.23
950 0.22
951 0.18
952 0.16
953 0.12
954 0.11
955 0.1
956 0.08
957 0.08
958 0.08
959 0.07
960 0.09
961 0.09
962 0.09
963 0.12
964 0.12
965 0.11
966 0.12
967 0.13
968 0.11
969 0.11
970 0.1
971 0.08
972 0.09
973 0.11
974 0.11
975 0.12
976 0.14
977 0.21
978 0.22
979 0.23
980 0.22
981 0.21
982 0.25
983 0.26
984 0.28
985 0.29
986 0.29
987 0.29
988 0.3
989 0.3
990 0.27
991 0.25
992 0.19
993 0.13
994 0.21
995 0.25
996 0.29
997 0.34
998 0.37
999 0.42
1000 0.47
1001 0.55
1002 0.57
1003 0.64
1004 0.7
1005 0.74
1006 0.81
1007 0.84
1008 0.83
1009 0.77
1010 0.72
1011 0.65
1012 0.63
1013 0.6
1014 0.6
1015 0.58
1016 0.57
1017 0.57
1018 0.57
1019 0.59
1020 0.56
1021 0.55
1022 0.51
1023 0.48
1024 0.53
1025 0.59
1026 0.59
1027 0.57
1028 0.54
1029 0.56
1030 0.51
1031 0.48
1032 0.42
1033 0.34
1034 0.3
1035 0.3
1036 0.31
1037 0.31
1038 0.38
1039 0.39
1040 0.41
1041 0.45
1042 0.45
1043 0.42
1044 0.37
1045 0.3
1046 0.21
1047 0.2
1048 0.15
1049 0.12
1050 0.1
1051 0.1
1052 0.1
1053 0.09
1054 0.09
1055 0.12
1056 0.17
1057 0.2
1058 0.21
1059 0.22
1060 0.22
1061 0.25
1062 0.27
1063 0.27
1064 0.26
1065 0.26
1066 0.27
1067 0.29
1068 0.29
1069 0.29
1070 0.3
1071 0.28
1072 0.24
1073 0.22
1074 0.19
1075 0.16
1076 0.15
1077 0.12
1078 0.1
1079 0.11
1080 0.1
1081 0.08
1082 0.08
1083 0.1
1084 0.1
1085 0.11
1086 0.19
1087 0.18
1088 0.2
1089 0.25
1090 0.26
1091 0.31
1092 0.39
1093 0.41
1094 0.36
1095 0.44
1096 0.44
1097 0.4
1098 0.41
1099 0.35
1100 0.3
1101 0.29
1102 0.27
1103 0.22
1104 0.19
1105 0.19
1106 0.17
1107 0.16
1108 0.12
1109 0.1
1110 0.1
1111 0.06
1112 0.07
1113 0.08
1114 0.07
1115 0.08
1116 0.08
1117 0.09
1118 0.09
1119 0.1
1120 0.09
1121 0.09
1122 0.1
1123 0.13
1124 0.14
1125 0.18
1126 0.17
1127 0.2
1128 0.2
1129 0.2
1130 0.27