Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JT95

Protein Details
Accession C4JT95    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-32LPIESNAEPKRKKNKKNESTTPKLAANHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-21PKRKKNKK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
KEGG ure:UREG_05684  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
CDD cd00268  DEADc  
Amino Acid Sequences MAKRPLPIESNAEPKRKKNKKNESTTPKLAANGQGHNLEPSAVKNSTSPYIPNPELDSLPQATVDEYLKANSIDIADQGEAEPLRPITSFSFLPQPSEPLYRPLKAFSAPTPIQAVSWPLAFAGRDVIGVAETGSGKTLAFGLPCLRKILELNSSRKSRRLSAVIITPTRELAMQIYDQLLKFTSSVDVGIACIYGGAPKDQQRREARNASIIVATPGRLKDFQSEQGIDLSKVKYLVLDEADRMLDKGFEQDIRDIIGTMPSARKRQTIMFTATWPDSVKNLAATFTRDPVTITIGERTSDIRANDRIKQVVEVLNPHEKDGRLLEVIRKYQGKDNSSDSINVFCLYKKEAMRVVYGHPF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.7
3 0.73
4 0.79
5 0.79
6 0.84
7 0.85
8 0.91
9 0.93
10 0.92
11 0.91
12 0.88
13 0.82
14 0.73
15 0.64
16 0.56
17 0.53
18 0.48
19 0.42
20 0.38
21 0.35
22 0.33
23 0.32
24 0.29
25 0.22
26 0.18
27 0.16
28 0.18
29 0.17
30 0.17
31 0.17
32 0.21
33 0.23
34 0.23
35 0.23
36 0.23
37 0.3
38 0.3
39 0.31
40 0.31
41 0.31
42 0.3
43 0.29
44 0.28
45 0.22
46 0.21
47 0.19
48 0.16
49 0.13
50 0.15
51 0.14
52 0.12
53 0.11
54 0.12
55 0.13
56 0.13
57 0.12
58 0.11
59 0.11
60 0.09
61 0.09
62 0.1
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.11
67 0.1
68 0.1
69 0.11
70 0.09
71 0.1
72 0.1
73 0.11
74 0.11
75 0.14
76 0.14
77 0.15
78 0.23
79 0.22
80 0.25
81 0.24
82 0.25
83 0.24
84 0.28
85 0.27
86 0.26
87 0.3
88 0.29
89 0.29
90 0.29
91 0.28
92 0.25
93 0.27
94 0.22
95 0.26
96 0.24
97 0.25
98 0.26
99 0.24
100 0.22
101 0.2
102 0.21
103 0.13
104 0.13
105 0.11
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.11
130 0.13
131 0.14
132 0.15
133 0.14
134 0.15
135 0.16
136 0.18
137 0.22
138 0.26
139 0.3
140 0.35
141 0.4
142 0.41
143 0.44
144 0.44
145 0.39
146 0.38
147 0.36
148 0.32
149 0.3
150 0.35
151 0.35
152 0.33
153 0.3
154 0.25
155 0.22
156 0.19
157 0.16
158 0.11
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.08
186 0.14
187 0.22
188 0.23
189 0.32
190 0.39
191 0.45
192 0.51
193 0.55
194 0.5
195 0.48
196 0.47
197 0.4
198 0.33
199 0.27
200 0.21
201 0.15
202 0.14
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.12
208 0.15
209 0.18
210 0.22
211 0.24
212 0.25
213 0.23
214 0.26
215 0.26
216 0.22
217 0.22
218 0.18
219 0.14
220 0.14
221 0.13
222 0.1
223 0.1
224 0.12
225 0.11
226 0.12
227 0.11
228 0.12
229 0.13
230 0.12
231 0.12
232 0.09
233 0.07
234 0.07
235 0.09
236 0.09
237 0.1
238 0.12
239 0.13
240 0.13
241 0.14
242 0.14
243 0.12
244 0.11
245 0.11
246 0.1
247 0.1
248 0.15
249 0.18
250 0.22
251 0.23
252 0.25
253 0.27
254 0.32
255 0.36
256 0.36
257 0.38
258 0.36
259 0.36
260 0.37
261 0.35
262 0.31
263 0.26
264 0.22
265 0.17
266 0.16
267 0.15
268 0.14
269 0.14
270 0.14
271 0.14
272 0.18
273 0.19
274 0.2
275 0.2
276 0.18
277 0.19
278 0.18
279 0.2
280 0.17
281 0.17
282 0.18
283 0.18
284 0.18
285 0.18
286 0.19
287 0.18
288 0.2
289 0.2
290 0.21
291 0.28
292 0.32
293 0.37
294 0.4
295 0.41
296 0.37
297 0.38
298 0.37
299 0.34
300 0.33
301 0.3
302 0.31
303 0.36
304 0.35
305 0.35
306 0.36
307 0.31
308 0.31
309 0.3
310 0.29
311 0.23
312 0.25
313 0.3
314 0.33
315 0.36
316 0.4
317 0.41
318 0.4
319 0.44
320 0.5
321 0.47
322 0.45
323 0.47
324 0.46
325 0.45
326 0.45
327 0.38
328 0.33
329 0.3
330 0.26
331 0.22
332 0.18
333 0.19
334 0.2
335 0.26
336 0.25
337 0.3
338 0.34
339 0.35
340 0.38
341 0.38