Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JGH9

Protein Details
Accession C4JGH9    Localization Confidence Low Confidence Score 6.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
383-406LGQYAPNPRKKRRYQVENTRMQFSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_nucl 8, nucl 4.5, extr 3, pero 3, mito 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR030843  PAN2  
IPR028881  PAN2_UCH_dom  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR028889  USP_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0031251  C:PAN complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004535  F:poly(A)-specific ribonuclease activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
KEGG ure:UREG_01170  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
PF13423  UCH_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50235  USP_3  
CDD cd06143  PAN2_exo  
Amino Acid Sequences MEADWDEVSQIAVPPPGPHILPTVASTIAFDDSQELLWVGNDFGRVMSFYGPELQRYTSVKAHPSEGPVRQFLFHDRGVISLSSKSVHLISRRGLTQWHISHPEMTELRCMSFTAQPHKIIVAGLQPAMYIIDIEKGTIVDQLSTDYRYTIMKKSRYLCAATDTGSVNALSLSDFTVVKSWKAHGAVINDMDARNDFLVTCGFSVRHLGSPIVDPLANVYDLKTLMPLPPIPFHAGAAFVRMHPRLQTTSFIASQTGQLQVVDLMNPNTINLRQANVAFMLGLEISPSGEALAIIDAECSIHLWGSPSKIHFNELSKDTEFADVAARSSILDWSNDTPLNVIGMPYYHDRLLSAWPSHLVFELGNSPPPIDPSILPYLRANELGQYAPNPRKKRRYQVENTRMQFSTEIALAAPKFLSEKAREAPSSKPEAAQEAVGALQGLKINGEMKEDPLLKYSNVEIKYSKFGVDDFDFRYYNKTKFSGLETHIANSFTNSLLQLLKFIPLVRNLALHHVSTNCLCENCLLCEMGFLFDMLDKAQGQNCQATNLLKTFSSFREAANLGLLEESLSNKSLSTTIQSVHRFFLNQISHDYRTIYPNSDVLDHNLSTAAVESICCMFCRNEIVRAGNAFVTELIYPPVDPKQGLRNPACRFSNILRSSIERETQNRGWCSTCRRYQQVSIRKTVQRMPLVLMLNAAITNPMYRRFWSIPGWLPEKIGVMIEDNQIQCYEGDQLRIRQQNNFEGLVVYELVGLVVEIDVVEQKKPHLVSFIDTSISAREPTKKSSWHLFNDFLVAEVSKEEVFSFNQTWKSPCTIAYQISTGRHGLDDSWKKELDTTLLYYEWSLNNRRPTDKCQILKSEEKPVAGTPIALDTEFVDLEKAEIEVKADGTQEMIRPSKSGLARVSVIRGSGNDEGVPFIDDYITIKDPIVDYVTQYSGIKPGDLDPRTSRHNLVALKVAYKKLWLLLNLGCVFVGHGLASDFRKINIQVPKNQTIDTQYLFFHPEKSRRLSLRYLAWAVFKEYIQEETTTSTSVTSTTTNPNAAEAANSTTTTTTTTTTTTTPPEGHDSIEDARMALRLWKKFKEYEDAGIVNQVLEEIFREGVKVGFRPPPRRSTTPNANNNNNNSNGANPNGLSTPISATASRLPHSGRNTPDFIIPVSASTAVSAAGVPAGGGSSNGSISGSTPSTPRPAFRRSTALTPSNGSFGGTKGITFGGSPMR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.16
3 0.18
4 0.17
5 0.17
6 0.19
7 0.2
8 0.21
9 0.21
10 0.21
11 0.19
12 0.18
13 0.18
14 0.16
15 0.15
16 0.14
17 0.12
18 0.12
19 0.12
20 0.13
21 0.13
22 0.11
23 0.09
24 0.1
25 0.11
26 0.09
27 0.1
28 0.1
29 0.09
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.11
34 0.12
35 0.11
36 0.12
37 0.19
38 0.2
39 0.22
40 0.24
41 0.24
42 0.28
43 0.31
44 0.34
45 0.33
46 0.37
47 0.41
48 0.4
49 0.43
50 0.41
51 0.44
52 0.47
53 0.47
54 0.47
55 0.45
56 0.44
57 0.42
58 0.4
59 0.4
60 0.38
61 0.32
62 0.31
63 0.27
64 0.26
65 0.27
66 0.26
67 0.22
68 0.18
69 0.18
70 0.15
71 0.15
72 0.16
73 0.16
74 0.21
75 0.23
76 0.26
77 0.3
78 0.34
79 0.36
80 0.35
81 0.35
82 0.34
83 0.4
84 0.39
85 0.41
86 0.41
87 0.41
88 0.43
89 0.41
90 0.45
91 0.38
92 0.35
93 0.33
94 0.29
95 0.29
96 0.26
97 0.26
98 0.21
99 0.23
100 0.28
101 0.31
102 0.34
103 0.35
104 0.35
105 0.35
106 0.33
107 0.28
108 0.24
109 0.21
110 0.18
111 0.16
112 0.15
113 0.14
114 0.14
115 0.14
116 0.12
117 0.07
118 0.06
119 0.09
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.12
126 0.12
127 0.09
128 0.09
129 0.12
130 0.14
131 0.15
132 0.15
133 0.13
134 0.14
135 0.17
136 0.21
137 0.26
138 0.32
139 0.36
140 0.43
141 0.47
142 0.53
143 0.54
144 0.54
145 0.47
146 0.44
147 0.41
148 0.36
149 0.35
150 0.29
151 0.24
152 0.22
153 0.2
154 0.14
155 0.12
156 0.1
157 0.07
158 0.06
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.14
164 0.14
165 0.16
166 0.18
167 0.18
168 0.22
169 0.23
170 0.25
171 0.25
172 0.27
173 0.3
174 0.29
175 0.29
176 0.25
177 0.24
178 0.22
179 0.18
180 0.16
181 0.12
182 0.11
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.15
192 0.15
193 0.17
194 0.17
195 0.17
196 0.17
197 0.19
198 0.2
199 0.18
200 0.16
201 0.13
202 0.14
203 0.15
204 0.14
205 0.12
206 0.11
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.11
211 0.1
212 0.11
213 0.14
214 0.16
215 0.17
216 0.19
217 0.22
218 0.24
219 0.24
220 0.23
221 0.2
222 0.2
223 0.17
224 0.18
225 0.16
226 0.13
227 0.18
228 0.18
229 0.19
230 0.18
231 0.21
232 0.22
233 0.24
234 0.26
235 0.25
236 0.28
237 0.29
238 0.28
239 0.25
240 0.22
241 0.21
242 0.2
243 0.18
244 0.13
245 0.12
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.11
256 0.11
257 0.14
258 0.13
259 0.14
260 0.15
261 0.15
262 0.17
263 0.15
264 0.14
265 0.11
266 0.1
267 0.09
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.05
287 0.04
288 0.04
289 0.05
290 0.07
291 0.09
292 0.12
293 0.15
294 0.17
295 0.22
296 0.23
297 0.25
298 0.27
299 0.29
300 0.32
301 0.31
302 0.33
303 0.29
304 0.29
305 0.27
306 0.25
307 0.21
308 0.16
309 0.16
310 0.12
311 0.12
312 0.11
313 0.1
314 0.09
315 0.09
316 0.11
317 0.09
318 0.09
319 0.11
320 0.13
321 0.16
322 0.17
323 0.16
324 0.14
325 0.14
326 0.14
327 0.12
328 0.1
329 0.07
330 0.06
331 0.09
332 0.1
333 0.12
334 0.11
335 0.11
336 0.12
337 0.13
338 0.17
339 0.19
340 0.17
341 0.16
342 0.17
343 0.18
344 0.18
345 0.17
346 0.14
347 0.09
348 0.09
349 0.13
350 0.12
351 0.14
352 0.13
353 0.14
354 0.13
355 0.15
356 0.15
357 0.13
358 0.12
359 0.15
360 0.22
361 0.22
362 0.23
363 0.22
364 0.24
365 0.23
366 0.25
367 0.2
368 0.14
369 0.15
370 0.14
371 0.14
372 0.13
373 0.18
374 0.25
375 0.32
376 0.38
377 0.44
378 0.54
379 0.61
380 0.7
381 0.74
382 0.78
383 0.81
384 0.85
385 0.87
386 0.86
387 0.81
388 0.75
389 0.64
390 0.55
391 0.44
392 0.33
393 0.25
394 0.15
395 0.13
396 0.08
397 0.1
398 0.09
399 0.09
400 0.08
401 0.06
402 0.07
403 0.08
404 0.12
405 0.13
406 0.17
407 0.2
408 0.24
409 0.25
410 0.27
411 0.3
412 0.31
413 0.36
414 0.32
415 0.3
416 0.27
417 0.29
418 0.27
419 0.23
420 0.17
421 0.11
422 0.1
423 0.09
424 0.08
425 0.05
426 0.05
427 0.06
428 0.06
429 0.05
430 0.06
431 0.08
432 0.08
433 0.11
434 0.1
435 0.11
436 0.16
437 0.17
438 0.17
439 0.18
440 0.19
441 0.15
442 0.16
443 0.17
444 0.19
445 0.18
446 0.2
447 0.19
448 0.2
449 0.23
450 0.23
451 0.22
452 0.15
453 0.15
454 0.17
455 0.18
456 0.19
457 0.17
458 0.2
459 0.2
460 0.19
461 0.25
462 0.24
463 0.24
464 0.25
465 0.24
466 0.22
467 0.23
468 0.27
469 0.28
470 0.27
471 0.3
472 0.27
473 0.27
474 0.27
475 0.26
476 0.22
477 0.16
478 0.14
479 0.09
480 0.09
481 0.08
482 0.08
483 0.08
484 0.08
485 0.09
486 0.09
487 0.09
488 0.09
489 0.1
490 0.11
491 0.11
492 0.13
493 0.12
494 0.13
495 0.13
496 0.17
497 0.17
498 0.16
499 0.15
500 0.14
501 0.15
502 0.13
503 0.15
504 0.11
505 0.1
506 0.1
507 0.11
508 0.11
509 0.11
510 0.12
511 0.1
512 0.09
513 0.1
514 0.1
515 0.09
516 0.08
517 0.06
518 0.05
519 0.05
520 0.06
521 0.05
522 0.06
523 0.05
524 0.06
525 0.08
526 0.09
527 0.1
528 0.14
529 0.14
530 0.14
531 0.15
532 0.15
533 0.15
534 0.14
535 0.14
536 0.1
537 0.11
538 0.12
539 0.12
540 0.15
541 0.14
542 0.13
543 0.16
544 0.17
545 0.16
546 0.15
547 0.14
548 0.1
549 0.09
550 0.09
551 0.05
552 0.05
553 0.06
554 0.05
555 0.06
556 0.06
557 0.06
558 0.07
559 0.07
560 0.07
561 0.08
562 0.09
563 0.09
564 0.16
565 0.18
566 0.19
567 0.19
568 0.19
569 0.18
570 0.17
571 0.23
572 0.19
573 0.17
574 0.2
575 0.23
576 0.24
577 0.24
578 0.25
579 0.19
580 0.2
581 0.21
582 0.19
583 0.16
584 0.16
585 0.16
586 0.16
587 0.15
588 0.15
589 0.16
590 0.14
591 0.13
592 0.12
593 0.11
594 0.08
595 0.08
596 0.06
597 0.04
598 0.04
599 0.04
600 0.05
601 0.05
602 0.05
603 0.06
604 0.06
605 0.07
606 0.13
607 0.13
608 0.16
609 0.18
610 0.19
611 0.19
612 0.19
613 0.19
614 0.14
615 0.13
616 0.09
617 0.07
618 0.07
619 0.06
620 0.06
621 0.06
622 0.05
623 0.05
624 0.07
625 0.08
626 0.08
627 0.08
628 0.09
629 0.18
630 0.21
631 0.27
632 0.3
633 0.36
634 0.38
635 0.44
636 0.44
637 0.35
638 0.36
639 0.32
640 0.39
641 0.32
642 0.32
643 0.26
644 0.27
645 0.3
646 0.29
647 0.29
648 0.21
649 0.23
650 0.28
651 0.31
652 0.34
653 0.31
654 0.31
655 0.3
656 0.3
657 0.35
658 0.36
659 0.39
660 0.39
661 0.43
662 0.45
663 0.5
664 0.57
665 0.59
666 0.55
667 0.54
668 0.55
669 0.52
670 0.52
671 0.5
672 0.46
673 0.4
674 0.36
675 0.34
676 0.32
677 0.31
678 0.28
679 0.23
680 0.16
681 0.13
682 0.12
683 0.1
684 0.05
685 0.04
686 0.05
687 0.05
688 0.08
689 0.09
690 0.1
691 0.15
692 0.17
693 0.2
694 0.22
695 0.25
696 0.28
697 0.32
698 0.34
699 0.29
700 0.28
701 0.25
702 0.23
703 0.19
704 0.14
705 0.1
706 0.08
707 0.1
708 0.1
709 0.13
710 0.12
711 0.12
712 0.12
713 0.12
714 0.1
715 0.09
716 0.12
717 0.1
718 0.13
719 0.14
720 0.17
721 0.24
722 0.29
723 0.29
724 0.29
725 0.32
726 0.34
727 0.35
728 0.33
729 0.26
730 0.21
731 0.2
732 0.17
733 0.14
734 0.08
735 0.05
736 0.05
737 0.04
738 0.04
739 0.03
740 0.03
741 0.02
742 0.02
743 0.02
744 0.02
745 0.04
746 0.05
747 0.06
748 0.06
749 0.07
750 0.1
751 0.11
752 0.11
753 0.13
754 0.13
755 0.15
756 0.18
757 0.19
758 0.16
759 0.15
760 0.16
761 0.13
762 0.14
763 0.12
764 0.11
765 0.17
766 0.18
767 0.23
768 0.27
769 0.3
770 0.33
771 0.41
772 0.46
773 0.45
774 0.48
775 0.45
776 0.41
777 0.39
778 0.35
779 0.26
780 0.2
781 0.14
782 0.1
783 0.08
784 0.08
785 0.06
786 0.06
787 0.06
788 0.07
789 0.08
790 0.1
791 0.12
792 0.14
793 0.18
794 0.19
795 0.2
796 0.21
797 0.23
798 0.21
799 0.21
800 0.23
801 0.23
802 0.24
803 0.24
804 0.24
805 0.24
806 0.25
807 0.25
808 0.2
809 0.17
810 0.16
811 0.14
812 0.13
813 0.19
814 0.26
815 0.26
816 0.3
817 0.29
818 0.29
819 0.3
820 0.3
821 0.23
822 0.18
823 0.18
824 0.16
825 0.16
826 0.16
827 0.15
828 0.16
829 0.15
830 0.16
831 0.18
832 0.22
833 0.29
834 0.32
835 0.37
836 0.39
837 0.44
838 0.51
839 0.55
840 0.55
841 0.53
842 0.56
843 0.56
844 0.6
845 0.56
846 0.55
847 0.49
848 0.45
849 0.4
850 0.35
851 0.32
852 0.25
853 0.22
854 0.13
855 0.12
856 0.12
857 0.11
858 0.11
859 0.08
860 0.09
861 0.09
862 0.08
863 0.07
864 0.06
865 0.06
866 0.06
867 0.06
868 0.05
869 0.05
870 0.06
871 0.07
872 0.08
873 0.09
874 0.09
875 0.08
876 0.09
877 0.11
878 0.11
879 0.15
880 0.16
881 0.15
882 0.16
883 0.17
884 0.22
885 0.22
886 0.25
887 0.22
888 0.23
889 0.25
890 0.26
891 0.28
892 0.22
893 0.21
894 0.17
895 0.16
896 0.17
897 0.16
898 0.16
899 0.13
900 0.13
901 0.13
902 0.13
903 0.13
904 0.09
905 0.07
906 0.07
907 0.06
908 0.08
909 0.11
910 0.12
911 0.11
912 0.11
913 0.12
914 0.13
915 0.14
916 0.15
917 0.11
918 0.11
919 0.14
920 0.14
921 0.15
922 0.15
923 0.14
924 0.15
925 0.15
926 0.14
927 0.12
928 0.16
929 0.24
930 0.24
931 0.28
932 0.28
933 0.31
934 0.36
935 0.38
936 0.36
937 0.3
938 0.35
939 0.32
940 0.31
941 0.35
942 0.31
943 0.32
944 0.34
945 0.33
946 0.27
947 0.26
948 0.25
949 0.22
950 0.24
951 0.2
952 0.21
953 0.2
954 0.27
955 0.26
956 0.26
957 0.21
958 0.18
959 0.17
960 0.14
961 0.12
962 0.05
963 0.05
964 0.05
965 0.08
966 0.09
967 0.13
968 0.13
969 0.13
970 0.17
971 0.18
972 0.24
973 0.32
974 0.36
975 0.41
976 0.48
977 0.55
978 0.53
979 0.52
980 0.47
981 0.42
982 0.41
983 0.34
984 0.28
985 0.21
986 0.21
987 0.25
988 0.24
989 0.25
990 0.28
991 0.33
992 0.38
993 0.44
994 0.5
995 0.5
996 0.54
997 0.54
998 0.53
999 0.53
1000 0.53
1001 0.5
1002 0.43
1003 0.42
1004 0.38
1005 0.35
1006 0.31
1007 0.24
1008 0.21
1009 0.19
1010 0.2
1011 0.19
1012 0.19
1013 0.16
1014 0.18
1015 0.19
1016 0.17
1017 0.16
1018 0.13
1019 0.12
1020 0.12
1021 0.12
1022 0.11
1023 0.13
1024 0.18
1025 0.21
1026 0.23
1027 0.22
1028 0.23
1029 0.22
1030 0.2
1031 0.18
1032 0.14
1033 0.15
1034 0.14
1035 0.14
1036 0.14
1037 0.14
1038 0.14
1039 0.15
1040 0.14
1041 0.12
1042 0.12
1043 0.14
1044 0.15
1045 0.16
1046 0.19
1047 0.2
1048 0.22
1049 0.22
1050 0.23
1051 0.28
1052 0.27
1053 0.27
1054 0.25
1055 0.25
1056 0.24
1057 0.25
1058 0.22
1059 0.16
1060 0.16
1061 0.15
1062 0.14
1063 0.18
1064 0.22
1065 0.27
1066 0.34
1067 0.39
1068 0.43
1069 0.48
1070 0.52
1071 0.54
1072 0.51
1073 0.5
1074 0.5
1075 0.46
1076 0.41
1077 0.38
1078 0.34
1079 0.25
1080 0.21
1081 0.15
1082 0.08
1083 0.07
1084 0.08
1085 0.07
1086 0.08
1087 0.08
1088 0.09
1089 0.09
1090 0.12
1091 0.14
1092 0.15
1093 0.18
1094 0.25
1095 0.33
1096 0.42
1097 0.47
1098 0.54
1099 0.6
1100 0.65
1101 0.68
1102 0.7
1103 0.73
1104 0.74
1105 0.79
1106 0.78
1107 0.79
1108 0.8
1109 0.79
1110 0.74
1111 0.65
1112 0.58
1113 0.48
1114 0.44
1115 0.38
1116 0.33
1117 0.29
1118 0.23
1119 0.23
1120 0.2
1121 0.21
1122 0.18
1123 0.15
1124 0.16
1125 0.16
1126 0.18
1127 0.16
1128 0.18
1129 0.23
1130 0.25
1131 0.25
1132 0.26
1133 0.27
1134 0.31
1135 0.38
1136 0.43
1137 0.43
1138 0.46
1139 0.48
1140 0.46
1141 0.46
1142 0.41
1143 0.36
1144 0.32
1145 0.25
1146 0.2
1147 0.19
1148 0.18
1149 0.15
1150 0.14
1151 0.13
1152 0.09
1153 0.09
1154 0.08
1155 0.06
1156 0.05
1157 0.05
1158 0.04
1159 0.04
1160 0.04
1161 0.04
1162 0.04
1163 0.06
1164 0.06
1165 0.07
1166 0.07
1167 0.08
1168 0.07
1169 0.08
1170 0.12
1171 0.13
1172 0.13
1173 0.15
1174 0.18
1175 0.25
1176 0.27
1177 0.32
1178 0.35
1179 0.41
1180 0.46
1181 0.49
1182 0.55
1183 0.51
1184 0.57
1185 0.6
1186 0.59
1187 0.54
1188 0.52
1189 0.49
1190 0.42
1191 0.38
1192 0.31
1193 0.24
1194 0.19
1195 0.22
1196 0.18
1197 0.16
1198 0.15
1199 0.15
1200 0.14
1201 0.14