FuNGI

C4JRQ6

Protein Details

Accession

C4JRQ6

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
71-93	QDEEEAKKKRQARNDNIRRAREA	Hydrophilic
111-139	DLDTKSWLMQHKKKQKKIEKERARKLAEE	Hydrophilic
284-310	LDISEIKVKKPKKKKARSTRKRAIDED	Basic
370-391	QRRAAFKKRKRMRPEDIARQLR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
77-91	KKKRQARNDNIRRAR
122-135	KKKQKKIEKERARK
290-305	KVKKPKKKKARSTRKR
372-382	RAAFKKRKRMR
540-561	KRRRETEAERRARSQRERDRAS

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045347 HIND IPR005011 SNU66/SART1
Gene Ontology	GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
KEGG	ure:UREG_05145 -
Pfam	View protein in Pfam PF19252 HIND PF03343 SART-1

Amino Acid Sequences

MADALSIEQNNKIRVALGLKPLPVPGSSAADEGPVFKQSKDGDESSSAEDEPGSTLESRIAQGYENWKTLQDEEEAKKKRQARNDNIRRAREAAQRIAKLEGKGLGEVNDDLDTKSWLMQHKKKQKKIEKERARKLAEELAEREQMAEYTSKDLAGVQVAHEISQFDEAGDHILTLKDTTIDENEEEGDQLEDVTMREAEKTEERLELKKKRAAYDPTNYDASGSILAQYDEEIDGKKRRHFTLDAKDISPEEREAKRQDVSSKLKVSTVSLDVVQEATPSDYLDISEIKVKKPKKKKARSTRKRAIDEDDIFPLPDTTETPTGNQSNGDQMEVDGTDANNSSVSALRKRPHDDSSFVDDEDLQVSLAAQRRAAFKKRKRMRPEDIARQLREESEEAANGMDVDQNEDEQPGLVIDETSEFVATLQRPTIPERRLRSVSAVAEEQDGVKSPTPDVKEEVADVDMDRAYNDIEDEEELKERITREQSQADITATGLEEENTLDQGLGATLAMLRQRGLVKESNGGELNSLQRDRQKFLIEKRRRETEAERRARSQRERDRASGKLDRMSARDREEYARWENKQRDQQESRTMADIFNREYKPDVQLKYVDEHGRLMNQKEAFKHLSHQFHGKGSGKMKTEKHLRKIEDEKKREAMSTLDSSQHTGMNNAMGATARRTRQAGVRLA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.26
3	0.26
4	0.31
5	0.33
6	0.34
7	0.35
8	0.35
9	0.33
10	0.29
11	0.26
12	0.2
13	0.21
14	0.21
15	0.21
16	0.2
17	0.2
18	0.2
19	0.19
20	0.18
21	0.18
22	0.18
23	0.17
24	0.23
25	0.23
26	0.29
27	0.32
28	0.32
29	0.31
30	0.33
31	0.36
32	0.34
33	0.34
34	0.28
35	0.22
36	0.21
37	0.17
38	0.15
39	0.13
40	0.11
41	0.1
42	0.1
43	0.12
44	0.14
45	0.14
46	0.15
47	0.15
48	0.14
49	0.18
50	0.26
51	0.29
52	0.29
53	0.29
54	0.29
55	0.31
56	0.31
57	0.29
58	0.25
59	0.28
60	0.31
61	0.4
62	0.44
63	0.45
64	0.51
65	0.56
66	0.59
67	0.62
68	0.68
69	0.69
70	0.75
71	0.82
72	0.87
73	0.88
74	0.85
75	0.79
76	0.72
77	0.68
78	0.65
79	0.61
80	0.59
81	0.58
82	0.56
83	0.53
84	0.54
85	0.51
86	0.43
87	0.39
88	0.33
89	0.26
90	0.25
91	0.25
92	0.2
93	0.18
94	0.18
95	0.16
96	0.14
97	0.13
98	0.12
99	0.12
100	0.12
101	0.11
102	0.12
103	0.15
104	0.2
105	0.3
106	0.38
107	0.48
108	0.58
109	0.68
110	0.74
111	0.82
112	0.85
113	0.87
114	0.9
115	0.91
116	0.91
117	0.92
118	0.93
119	0.92
120	0.86
121	0.76
122	0.69
123	0.64
124	0.57
125	0.51
126	0.44
127	0.39
128	0.36
129	0.34
130	0.31
131	0.24
132	0.2
133	0.16
134	0.15
135	0.11
136	0.13
137	0.13
138	0.12
139	0.12
140	0.12
141	0.12
142	0.12
143	0.11
144	0.08
145	0.12
146	0.12
147	0.12
148	0.13
149	0.12
150	0.1
151	0.12
152	0.11
153	0.07
154	0.07
155	0.07
156	0.09
157	0.08
158	0.08
159	0.06
160	0.07
161	0.07
162	0.07
163	0.07
164	0.06
165	0.07
166	0.09
167	0.1
168	0.11
169	0.11
170	0.12
171	0.12
172	0.12
173	0.11
174	0.1
175	0.09
176	0.07
177	0.06
178	0.06
179	0.05
180	0.05
181	0.06
182	0.06
183	0.06
184	0.07
185	0.08
186	0.1
187	0.13
188	0.16
189	0.16
190	0.2
191	0.22
192	0.28
193	0.36
194	0.41
195	0.45
196	0.45
197	0.48
198	0.47
199	0.53
200	0.55
201	0.53
202	0.55
203	0.54
204	0.53
205	0.51
206	0.47
207	0.39
208	0.32
209	0.25
210	0.17
211	0.11
212	0.09
213	0.08
214	0.08
215	0.08
216	0.07
217	0.07
218	0.07
219	0.07
220	0.07
221	0.1
222	0.16
223	0.19
224	0.24
225	0.28
226	0.29
227	0.34
228	0.38
229	0.43
230	0.48
231	0.54
232	0.52
233	0.48
234	0.48
235	0.43
236	0.39
237	0.31
238	0.22
239	0.19
240	0.18
241	0.22
242	0.24
243	0.26
244	0.27
245	0.28
246	0.3
247	0.34
248	0.38
249	0.4
250	0.41
251	0.39
252	0.38
253	0.36
254	0.34
255	0.28
256	0.23
257	0.17
258	0.14
259	0.13
260	0.12
261	0.12
262	0.1
263	0.08
264	0.06
265	0.06
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.05
270	0.05
271	0.06
272	0.06
273	0.06
274	0.12
275	0.13
276	0.15
277	0.21
278	0.27
279	0.35
280	0.46
281	0.55
282	0.61
283	0.71
284	0.8
285	0.85
286	0.91
287	0.93
288	0.93
289	0.93
290	0.91
291	0.86
292	0.78
293	0.72
294	0.69
295	0.61
296	0.52
297	0.45
298	0.35
299	0.29
300	0.26
301	0.2
302	0.12
303	0.09
304	0.08
305	0.08
306	0.1
307	0.1
308	0.12
309	0.15
310	0.15
311	0.15
312	0.15
313	0.13
314	0.14
315	0.14
316	0.13
317	0.1
318	0.09
319	0.09
320	0.09
321	0.09
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.07
331	0.09
332	0.12
333	0.17
334	0.2
335	0.24
336	0.28
337	0.31
338	0.34
339	0.35
340	0.34
341	0.34
342	0.38
343	0.35
344	0.31
345	0.27
346	0.22
347	0.19
348	0.17
349	0.13
350	0.05
351	0.04
352	0.04
353	0.07
354	0.1
355	0.1
356	0.1
357	0.12
358	0.17
359	0.22
360	0.3
361	0.38
362	0.41
363	0.52
364	0.61
365	0.7
366	0.74
367	0.79
368	0.79
369	0.79
370	0.81
371	0.8
372	0.81
373	0.78
374	0.69
375	0.62
376	0.54
377	0.44
378	0.37
379	0.27
380	0.19
381	0.14
382	0.13
383	0.11
384	0.1
385	0.1
386	0.07
387	0.07
388	0.06
389	0.05
390	0.07
391	0.07
392	0.08
393	0.08
394	0.08
395	0.08
396	0.06
397	0.06
398	0.04
399	0.04
400	0.04
401	0.03
402	0.03
403	0.04
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.08
410	0.08
411	0.09
412	0.09
413	0.1
414	0.12
415	0.16
416	0.24
417	0.25
418	0.31
419	0.35
420	0.41
421	0.43
422	0.43
423	0.42
424	0.4
425	0.37
426	0.32
427	0.28
428	0.22
429	0.2
430	0.19
431	0.15
432	0.11
433	0.1
434	0.09
435	0.1
436	0.1
437	0.1
438	0.14
439	0.16
440	0.18
441	0.2
442	0.2
443	0.19
444	0.19
445	0.19
446	0.15
447	0.13
448	0.11
449	0.1
450	0.08
451	0.07
452	0.07
453	0.06
454	0.06
455	0.06
456	0.06
457	0.05
458	0.05
459	0.06
460	0.07
461	0.08
462	0.09
463	0.09
464	0.09
465	0.11
466	0.12
467	0.16
468	0.2
469	0.23
470	0.27
471	0.3
472	0.31
473	0.31
474	0.32
475	0.28
476	0.22
477	0.18
478	0.14
479	0.1
480	0.1
481	0.08
482	0.07
483	0.06
484	0.07
485	0.07
486	0.06
487	0.06
488	0.05
489	0.05
490	0.05
491	0.05
492	0.04
493	0.04
494	0.03
495	0.03
496	0.05
497	0.06
498	0.06
499	0.06
500	0.09
501	0.12
502	0.13
503	0.17
504	0.2
505	0.21
506	0.27
507	0.28
508	0.28
509	0.28
510	0.26
511	0.23
512	0.21
513	0.23
514	0.21
515	0.21
516	0.19
517	0.24
518	0.28
519	0.3
520	0.32
521	0.36
522	0.38
523	0.48
524	0.57
525	0.6
526	0.67
527	0.7
528	0.74
529	0.69
530	0.69
531	0.68
532	0.68
533	0.7
534	0.7
535	0.67
536	0.65
537	0.7
538	0.73
539	0.72
540	0.72
541	0.71
542	0.72
543	0.74
544	0.74
545	0.73
546	0.68
547	0.67
548	0.64
549	0.57
550	0.51
551	0.5
552	0.46
553	0.45
554	0.47
555	0.44
556	0.41
557	0.42
558	0.39
559	0.4
560	0.4
561	0.42
562	0.44
563	0.47
564	0.46
565	0.52
566	0.56
567	0.6
568	0.66
569	0.65
570	0.66
571	0.65
572	0.67
573	0.68
574	0.65
575	0.59
576	0.53
577	0.48
578	0.4
579	0.38
580	0.35
581	0.29
582	0.33
583	0.32
584	0.29
585	0.32
586	0.33
587	0.35
588	0.39
589	0.38
590	0.33
591	0.37
592	0.38
593	0.38
594	0.43
595	0.39
596	0.33
597	0.33
598	0.31
599	0.34
600	0.35
601	0.34
602	0.34
603	0.35
604	0.38
605	0.37
606	0.42
607	0.39
608	0.36
609	0.42
610	0.43
611	0.46
612	0.46
613	0.52
614	0.48
615	0.47
616	0.54
617	0.5
618	0.49
619	0.47
620	0.5
621	0.48
622	0.52
623	0.53
624	0.54
625	0.61
626	0.64
627	0.68
628	0.7
629	0.69
630	0.71
631	0.78
632	0.79
633	0.79
634	0.76
635	0.73
636	0.71
637	0.69
638	0.61
639	0.52
640	0.46
641	0.41
642	0.41
643	0.37
644	0.35
645	0.33
646	0.35
647	0.34
648	0.33
649	0.27
650	0.22
651	0.21
652	0.18
653	0.18
654	0.15
655	0.14
656	0.13
657	0.14
658	0.18
659	0.23
660	0.23
661	0.26
662	0.28
663	0.31
664	0.37

C4JRQ6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer