Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JY53

Protein Details
Accession C4JY53    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
344-366LCTYDKVQRVKSKWKCTLKDGILHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 21, extr 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004855  TFIIA_asu/bsu  
IPR009088  TFIIA_b-brl  
Gene Ontology GO:0005672  C:transcription factor TFIIA complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG ure:UREG_07104  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03153  TFIIA  
CDD cd07976  TFIIA_alpha_beta_like  
Amino Acid Sequences MRNFRKTYVSIFSCCHAPIYWCRCVSWDFAWWLWCCVDFFGWQKKLSSLGVAHFPWDPAPQPPPPPPQQAPIPPPPVTVPSNAPRTSPPPQQEFPEQISQPQPSAGNGHNPGDVRVKTEPGYNNANPISNPTAAAHIAQQRAADALQQRYGAAAASQIHQLQAQSQAALSLPGQQRFQPGQFPAGQSQDPKLPPHQAPQPVGHSQTDGADDSGSDPLTEWKAEVARRREAAEQNGANADRVMREYVEIKGRQMEGNGLLAPLRDRYPRANGKQRKDAIKENPTLSALVAAEAPATPRQANGYDGVDDYGIKKDEDEDAINSDLDDPDDPLDDPEGDDAVGQVMLCTYDKVQRVKSKWKCTLKDGILTTGGKEYVFHKGNGEFEWF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.33
3 0.24
4 0.24
5 0.3
6 0.36
7 0.41
8 0.39
9 0.4
10 0.4
11 0.41
12 0.41
13 0.34
14 0.33
15 0.29
16 0.3
17 0.35
18 0.33
19 0.33
20 0.29
21 0.27
22 0.21
23 0.19
24 0.19
25 0.17
26 0.23
27 0.3
28 0.34
29 0.35
30 0.36
31 0.35
32 0.37
33 0.34
34 0.32
35 0.25
36 0.23
37 0.28
38 0.26
39 0.27
40 0.24
41 0.24
42 0.21
43 0.2
44 0.19
45 0.17
46 0.21
47 0.24
48 0.29
49 0.35
50 0.41
51 0.45
52 0.52
53 0.51
54 0.52
55 0.55
56 0.58
57 0.58
58 0.58
59 0.58
60 0.5
61 0.49
62 0.46
63 0.43
64 0.37
65 0.32
66 0.3
67 0.31
68 0.38
69 0.37
70 0.36
71 0.35
72 0.39
73 0.43
74 0.45
75 0.44
76 0.44
77 0.45
78 0.48
79 0.5
80 0.49
81 0.47
82 0.46
83 0.4
84 0.37
85 0.39
86 0.36
87 0.31
88 0.28
89 0.24
90 0.18
91 0.21
92 0.19
93 0.22
94 0.23
95 0.24
96 0.24
97 0.24
98 0.25
99 0.28
100 0.27
101 0.24
102 0.23
103 0.23
104 0.22
105 0.27
106 0.28
107 0.26
108 0.33
109 0.29
110 0.32
111 0.31
112 0.31
113 0.25
114 0.27
115 0.26
116 0.19
117 0.2
118 0.15
119 0.16
120 0.15
121 0.16
122 0.16
123 0.17
124 0.17
125 0.17
126 0.16
127 0.15
128 0.15
129 0.14
130 0.14
131 0.13
132 0.14
133 0.15
134 0.15
135 0.15
136 0.15
137 0.15
138 0.11
139 0.07
140 0.08
141 0.07
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.12
150 0.11
151 0.1
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.1
156 0.08
157 0.12
158 0.14
159 0.16
160 0.17
161 0.17
162 0.21
163 0.22
164 0.23
165 0.2
166 0.18
167 0.2
168 0.21
169 0.22
170 0.2
171 0.21
172 0.2
173 0.17
174 0.18
175 0.19
176 0.19
177 0.19
178 0.19
179 0.22
180 0.22
181 0.26
182 0.3
183 0.3
184 0.31
185 0.33
186 0.35
187 0.32
188 0.33
189 0.28
190 0.23
191 0.19
192 0.17
193 0.15
194 0.11
195 0.1
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.08
200 0.07
201 0.06
202 0.05
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.08
208 0.11
209 0.14
210 0.2
211 0.23
212 0.27
213 0.28
214 0.3
215 0.34
216 0.35
217 0.36
218 0.36
219 0.32
220 0.29
221 0.3
222 0.28
223 0.23
224 0.19
225 0.16
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.07
230 0.08
231 0.1
232 0.12
233 0.19
234 0.19
235 0.18
236 0.21
237 0.22
238 0.21
239 0.2
240 0.19
241 0.14
242 0.15
243 0.14
244 0.11
245 0.1
246 0.09
247 0.1
248 0.09
249 0.1
250 0.11
251 0.13
252 0.17
253 0.26
254 0.35
255 0.43
256 0.52
257 0.59
258 0.64
259 0.72
260 0.75
261 0.74
262 0.7
263 0.7
264 0.69
265 0.68
266 0.66
267 0.58
268 0.54
269 0.47
270 0.42
271 0.33
272 0.25
273 0.17
274 0.12
275 0.1
276 0.08
277 0.07
278 0.07
279 0.09
280 0.08
281 0.1
282 0.09
283 0.1
284 0.12
285 0.13
286 0.15
287 0.16
288 0.17
289 0.16
290 0.16
291 0.17
292 0.14
293 0.13
294 0.13
295 0.14
296 0.13
297 0.12
298 0.12
299 0.13
300 0.15
301 0.18
302 0.19
303 0.16
304 0.18
305 0.2
306 0.19
307 0.18
308 0.16
309 0.13
310 0.12
311 0.11
312 0.09
313 0.09
314 0.1
315 0.11
316 0.11
317 0.12
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.1
322 0.09
323 0.09
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.06
328 0.05
329 0.05
330 0.06
331 0.07
332 0.08
333 0.09
334 0.15
335 0.21
336 0.26
337 0.34
338 0.42
339 0.49
340 0.59
341 0.68
342 0.72
343 0.77
344 0.83
345 0.8
346 0.77
347 0.81
348 0.75
349 0.73
350 0.65
351 0.59
352 0.54
353 0.49
354 0.44
355 0.37
356 0.32
357 0.23
358 0.22
359 0.2
360 0.24
361 0.26
362 0.25
363 0.26
364 0.28
365 0.31