Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JQT2

Protein Details
Accession C4JQT2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-24SGTKRARDSNKSGTQKKLKLNSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
95-102RERKSAKP
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR012959  CPL_dom  
IPR040059  PUM3  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG ure:UREG_03414  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08144  CPL  
Amino Acid Sequences MSGTKRARDSNKSGTQKKLKLNSSLPPSQYQTDIEQEEDQTEDHGFQDSYADNSKDLISKWQHGSNGLAAKTRIDDHPSKVVSKHAHVKQKSLTRERKSAKPNSQLISRTKKLWERLRLKSHVPREEREKLVTELYAIITGRVRDFVFKHDAVRVIQTALKYGTAEQRKKIALELKGCYRDLAESKYGKFLLAKLVVHGNSEIRDMIIPEFYGHVRMLIRHPEASWILDDIYRIAVTSSQKSMLLREWYSPEFAIFDSSHPTPTTSQLSEILVEMPEKRGPIMNHLLELINLLVQKKTIGFTMLHDAMLQYFLNTKPGSTDAADFMELLKGDEDGDLVKNLAFTKSGSRLMCLAFAHSNAKERKSLLRVYRDMIPMMAEDIHARTILLAAYEVIDDTKLTAKLIFPRLLCEHLPETQRHNNLVERVNHISSRVPLLYLFGGETLSWLLNSVDREILSEVRQARSETSKKDPVVRRNELIKAASPIMLQFISSAAEALMETDFGCRCITEVLFNATGEKGPALAAVAATVTAKPERMEAPFVGRMLKHLVQGGRYNPNRRTVEKLQTPLGFDVLLYECIKHDILSWLVGPNPFVLVAMAENCAFGKRDELLKTLKEHKQTLHDLESKTDGLSEKAKVEVQGANGAAAKLLLHVIDQKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.81
3 0.8
4 0.81
5 0.8
6 0.76
7 0.75
8 0.74
9 0.72
10 0.7
11 0.69
12 0.63
13 0.59
14 0.57
15 0.51
16 0.48
17 0.42
18 0.37
19 0.36
20 0.35
21 0.32
22 0.3
23 0.28
24 0.27
25 0.25
26 0.21
27 0.16
28 0.15
29 0.12
30 0.11
31 0.13
32 0.12
33 0.11
34 0.14
35 0.13
36 0.16
37 0.21
38 0.21
39 0.18
40 0.2
41 0.22
42 0.21
43 0.21
44 0.27
45 0.26
46 0.33
47 0.37
48 0.4
49 0.4
50 0.4
51 0.42
52 0.39
53 0.4
54 0.34
55 0.33
56 0.29
57 0.28
58 0.29
59 0.29
60 0.25
61 0.26
62 0.29
63 0.3
64 0.39
65 0.4
66 0.4
67 0.39
68 0.43
69 0.41
70 0.44
71 0.49
72 0.48
73 0.56
74 0.55
75 0.6
76 0.61
77 0.64
78 0.67
79 0.68
80 0.71
81 0.68
82 0.76
83 0.75
84 0.76
85 0.78
86 0.78
87 0.77
88 0.77
89 0.77
90 0.72
91 0.73
92 0.7
93 0.69
94 0.68
95 0.61
96 0.55
97 0.55
98 0.57
99 0.6
100 0.63
101 0.65
102 0.64
103 0.71
104 0.76
105 0.74
106 0.76
107 0.76
108 0.76
109 0.74
110 0.71
111 0.67
112 0.66
113 0.69
114 0.64
115 0.59
116 0.53
117 0.45
118 0.42
119 0.36
120 0.28
121 0.21
122 0.18
123 0.17
124 0.13
125 0.12
126 0.12
127 0.13
128 0.12
129 0.13
130 0.13
131 0.15
132 0.16
133 0.2
134 0.25
135 0.25
136 0.27
137 0.28
138 0.3
139 0.27
140 0.29
141 0.25
142 0.2
143 0.21
144 0.19
145 0.18
146 0.16
147 0.16
148 0.13
149 0.14
150 0.21
151 0.29
152 0.32
153 0.32
154 0.37
155 0.38
156 0.38
157 0.41
158 0.39
159 0.36
160 0.38
161 0.4
162 0.42
163 0.45
164 0.44
165 0.39
166 0.33
167 0.31
168 0.27
169 0.28
170 0.26
171 0.26
172 0.27
173 0.3
174 0.3
175 0.27
176 0.25
177 0.21
178 0.22
179 0.23
180 0.22
181 0.19
182 0.24
183 0.23
184 0.23
185 0.23
186 0.17
187 0.14
188 0.15
189 0.14
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.09
201 0.1
202 0.1
203 0.12
204 0.14
205 0.19
206 0.21
207 0.2
208 0.2
209 0.22
210 0.22
211 0.22
212 0.19
213 0.14
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.09
218 0.09
219 0.07
220 0.07
221 0.06
222 0.09
223 0.11
224 0.13
225 0.14
226 0.14
227 0.15
228 0.16
229 0.17
230 0.18
231 0.21
232 0.2
233 0.2
234 0.23
235 0.23
236 0.24
237 0.22
238 0.18
239 0.14
240 0.13
241 0.14
242 0.11
243 0.1
244 0.13
245 0.13
246 0.15
247 0.14
248 0.15
249 0.13
250 0.16
251 0.2
252 0.16
253 0.17
254 0.17
255 0.17
256 0.16
257 0.16
258 0.13
259 0.09
260 0.09
261 0.08
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.12
267 0.12
268 0.17
269 0.24
270 0.22
271 0.22
272 0.22
273 0.22
274 0.18
275 0.18
276 0.12
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.08
287 0.07
288 0.09
289 0.15
290 0.15
291 0.14
292 0.14
293 0.13
294 0.11
295 0.12
296 0.11
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.09
304 0.11
305 0.12
306 0.11
307 0.12
308 0.1
309 0.11
310 0.11
311 0.1
312 0.09
313 0.08
314 0.07
315 0.07
316 0.06
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.04
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.09
332 0.12
333 0.17
334 0.17
335 0.17
336 0.18
337 0.18
338 0.2
339 0.16
340 0.15
341 0.11
342 0.12
343 0.14
344 0.13
345 0.2
346 0.2
347 0.22
348 0.21
349 0.22
350 0.26
351 0.27
352 0.33
353 0.33
354 0.39
355 0.39
356 0.39
357 0.43
358 0.39
359 0.35
360 0.29
361 0.23
362 0.15
363 0.14
364 0.12
365 0.07
366 0.06
367 0.06
368 0.07
369 0.06
370 0.06
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.08
388 0.1
389 0.16
390 0.2
391 0.23
392 0.2
393 0.24
394 0.26
395 0.28
396 0.27
397 0.24
398 0.22
399 0.23
400 0.26
401 0.24
402 0.29
403 0.33
404 0.35
405 0.33
406 0.34
407 0.32
408 0.34
409 0.38
410 0.33
411 0.32
412 0.33
413 0.33
414 0.3
415 0.29
416 0.26
417 0.21
418 0.22
419 0.17
420 0.14
421 0.12
422 0.14
423 0.13
424 0.11
425 0.1
426 0.07
427 0.07
428 0.06
429 0.07
430 0.06
431 0.06
432 0.05
433 0.06
434 0.06
435 0.08
436 0.09
437 0.1
438 0.1
439 0.1
440 0.11
441 0.12
442 0.13
443 0.12
444 0.16
445 0.17
446 0.18
447 0.19
448 0.19
449 0.2
450 0.27
451 0.31
452 0.31
453 0.37
454 0.42
455 0.43
456 0.51
457 0.56
458 0.57
459 0.62
460 0.63
461 0.6
462 0.58
463 0.6
464 0.54
465 0.48
466 0.41
467 0.34
468 0.3
469 0.26
470 0.21
471 0.17
472 0.16
473 0.14
474 0.12
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.07
479 0.07
480 0.05
481 0.05
482 0.05
483 0.06
484 0.05
485 0.05
486 0.05
487 0.07
488 0.07
489 0.08
490 0.08
491 0.07
492 0.08
493 0.1
494 0.1
495 0.11
496 0.13
497 0.17
498 0.18
499 0.18
500 0.18
501 0.16
502 0.16
503 0.14
504 0.12
505 0.08
506 0.06
507 0.07
508 0.06
509 0.06
510 0.05
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.05
516 0.07
517 0.07
518 0.08
519 0.09
520 0.11
521 0.14
522 0.16
523 0.2
524 0.19
525 0.24
526 0.26
527 0.26
528 0.27
529 0.24
530 0.24
531 0.27
532 0.28
533 0.23
534 0.25
535 0.27
536 0.28
537 0.33
538 0.36
539 0.39
540 0.44
541 0.5
542 0.49
543 0.57
544 0.58
545 0.56
546 0.59
547 0.57
548 0.61
549 0.62
550 0.62
551 0.59
552 0.56
553 0.56
554 0.48
555 0.41
556 0.3
557 0.22
558 0.21
559 0.17
560 0.17
561 0.15
562 0.14
563 0.14
564 0.16
565 0.17
566 0.13
567 0.13
568 0.14
569 0.15
570 0.17
571 0.17
572 0.16
573 0.19
574 0.19
575 0.18
576 0.14
577 0.14
578 0.12
579 0.11
580 0.09
581 0.07
582 0.08
583 0.09
584 0.1
585 0.09
586 0.09
587 0.1
588 0.11
589 0.11
590 0.1
591 0.13
592 0.15
593 0.21
594 0.23
595 0.27
596 0.31
597 0.34
598 0.4
599 0.45
600 0.48
601 0.49
602 0.51
603 0.52
604 0.55
605 0.59
606 0.59
607 0.59
608 0.59
609 0.53
610 0.52
611 0.51
612 0.43
613 0.36
614 0.32
615 0.24
616 0.21
617 0.24
618 0.24
619 0.21
620 0.23
621 0.25
622 0.23
623 0.26
624 0.26
625 0.24
626 0.26
627 0.25
628 0.24
629 0.23
630 0.22
631 0.18
632 0.15
633 0.13
634 0.08
635 0.09
636 0.07
637 0.07