FuNGI

C4JDA6

Protein Details

Accession

C4JDA6

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
909-930	PATAAKKPKKKDDLSKRFRSTV	Hydrophilic
1185-1208	AGPATNVSKKKPAKKTCWVWLPVT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
913-919	AKKPKKK
1067-1082	AKKIDAWRKTNGRGKG

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto 6, pero 4, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
KEGG	ure:UREG_00348 -
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MLANLDVSLTVGMFDRAALLIRRLSAVFSPGSPELLELHNRYIRMMVSHMIVNRRPSMVWAAQKWFEVQMLQISKMQPDATTYALMLRMTLRMLLGPRRDRTVRRYWDMAKEAQVEEDVLGLPILSETDLGLLSEICSSDLQGAALGDISGLPDLTEPEPSELNLSPPEDAIPEIRSVSQKGLGLQSLKEALSLFDKSKSFRELEAEGEISSVEKQRRLEQDSIVAAMERWRKESEDRASKTGLGPSEKKMGALLWDWQQCLLTSIQSEMQSALRAQEKERKTPEDNDRCEYAPFLSTIGAEKLSAITILATMNALGRSGMDKGIRLTRLIMVLGKAVQEEYLADRIRESAYDSAHTNSANSANRAKMVEKLIASKDHSKWRYLVRKYNESHEPVNWSAATEAKIGALLASMLFSSTKVPVEHKNPETREVTVSKQPAFRHVYQLEKGFSIGYVQLHDSIVEKLGREPASHLLAKHLPMVSPPAPWSSYHHGGFLEQPSLVIRARPDNALQLQYVKAASRRGDLDEIFAGLNVLGKTGWQINRPVFDVMLEAWNSGKELADIPAAEPNLPEPEKPDTGDSGSLKAYYRAKAVVDNKRSGFHSQRCFQNLQLEVARAYIGETFYLPHNMDFRGRAYPLPPYFNQMGSDMCRGLLLFSEGRQLGERGLKWLKIHLANVYGFDKASFDERAQFSMDHLDDVIDSAEKGLHGRRWWLQAADPFQCLAACIELKNALACADPTKFVSHLPIHQDGSCNGLQHYAALGGDIIGARQVNLEPSDRPSDIYSAVAEHVHQSIVQDAASGSQLGELLKDKINRKVVKQTVMTNVYGVTFLGAIRQVQKQLDEIYPDLAENNNVNKIATYITRKIFAALSSMFTGAHEIQFWLGDCANRITQSLSPDQIEAVIEARNAPATAAKKPKKKDDLSKRFRSTVIWTTPLKLPVVQPYREAKVRRVTTAIQSLSIKEPHSDDIVSRRKQLQAFPPNFIHSLDATHMMLSAIKCDELGLSFSAVHDSFWTHAGDVDTMNLVLRDAFVRMHSEDIVGRLAAELKARYSQNMYLAKVRPKSSVAKKIDAWRKTNGRGKGKEHQADELILEHKRLQLLRSTNEAERAEGEAMVTPGSIFESLKDAEESLVSVQSLGVAAMGHISPEDEAASAEPSLLPEAPTNPLNDLFQGDLDPVDAGAETAGPATNVSKKKPAKKTCWVWLPVTFRPVPAKGDFDVTRLKKSEYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.07
2	0.07
3	0.07
4	0.1
5	0.11
6	0.13
7	0.15
8	0.16
9	0.18
10	0.17
11	0.19
12	0.18
13	0.19
14	0.18
15	0.16
16	0.21
17	0.19
18	0.21
19	0.18
20	0.18
21	0.17
22	0.19
23	0.25
24	0.22
25	0.28
26	0.3
27	0.3
28	0.3
29	0.3
30	0.27
31	0.24
32	0.24
33	0.19
34	0.18
35	0.22
36	0.25
37	0.3
38	0.32
39	0.35
40	0.35
41	0.35
42	0.32
43	0.32
44	0.35
45	0.36
46	0.4
47	0.41
48	0.44
49	0.44
50	0.45
51	0.44
52	0.38
53	0.32
54	0.25
55	0.2
56	0.23
57	0.23
58	0.24
59	0.26
60	0.26
61	0.26
62	0.27
63	0.27
64	0.19
65	0.19
66	0.2
67	0.18
68	0.18
69	0.17
70	0.17
71	0.18
72	0.18
73	0.15
74	0.14
75	0.13
76	0.13
77	0.13
78	0.11
79	0.12
80	0.16
81	0.22
82	0.3
83	0.37
84	0.39
85	0.46
86	0.51
87	0.55
88	0.58
89	0.62
90	0.62
91	0.61
92	0.66
93	0.65
94	0.68
95	0.67
96	0.64
97	0.59
98	0.54
99	0.48
100	0.41
101	0.35
102	0.27
103	0.21
104	0.18
105	0.13
106	0.09
107	0.08
108	0.06
109	0.06
110	0.05
111	0.05
112	0.04
113	0.04
114	0.04
115	0.05
116	0.06
117	0.06
118	0.06
119	0.06
120	0.06
121	0.07
122	0.07
123	0.08
124	0.08
125	0.08
126	0.09
127	0.09
128	0.09
129	0.09
130	0.09
131	0.07
132	0.08
133	0.07
134	0.05
135	0.05
136	0.05
137	0.05
138	0.04
139	0.04
140	0.05
141	0.08
142	0.08
143	0.11
144	0.12
145	0.14
146	0.15
147	0.15
148	0.18
149	0.16
150	0.18
151	0.18
152	0.18
153	0.17
154	0.16
155	0.17
156	0.14
157	0.14
158	0.14
159	0.12
160	0.12
161	0.13
162	0.15
163	0.17
164	0.18
165	0.19
166	0.21
167	0.21
168	0.22
169	0.24
170	0.25
171	0.24
172	0.23
173	0.23
174	0.22
175	0.2
176	0.18
177	0.16
178	0.14
179	0.16
180	0.18
181	0.17
182	0.2
183	0.21
184	0.23
185	0.27
186	0.3
187	0.28
188	0.27
189	0.31
190	0.27
191	0.28
192	0.29
193	0.26
194	0.21
195	0.2
196	0.18
197	0.14
198	0.14
199	0.16
200	0.15
201	0.18
202	0.2
203	0.28
204	0.35
205	0.4
206	0.42
207	0.39
208	0.43
209	0.4
210	0.39
211	0.32
212	0.25
213	0.19
214	0.22
215	0.26
216	0.21
217	0.22
218	0.23
219	0.25
220	0.29
221	0.38
222	0.42
223	0.47
224	0.5
225	0.5
226	0.5
227	0.49
228	0.47
229	0.43
230	0.36
231	0.32
232	0.31
233	0.31
234	0.37
235	0.35
236	0.33
237	0.29
238	0.26
239	0.22
240	0.21
241	0.21
242	0.21
243	0.23
244	0.23
245	0.23
246	0.23
247	0.2
248	0.21
249	0.18
250	0.12
251	0.1
252	0.11
253	0.14
254	0.14
255	0.15
256	0.14
257	0.14
258	0.14
259	0.14
260	0.16
261	0.18
262	0.18
263	0.21
264	0.29
265	0.32
266	0.39
267	0.44
268	0.48
269	0.47
270	0.55
271	0.63
272	0.64
273	0.65
274	0.61
275	0.58
276	0.53
277	0.49
278	0.41
279	0.31
280	0.22
281	0.17
282	0.14
283	0.11
284	0.1
285	0.12
286	0.12
287	0.11
288	0.09
289	0.09
290	0.09
291	0.08
292	0.08
293	0.06
294	0.05
295	0.05
296	0.05
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.05
304	0.06
305	0.07
306	0.08
307	0.1
308	0.1
309	0.11
310	0.13
311	0.19
312	0.2
313	0.19
314	0.19
315	0.19
316	0.19
317	0.19
318	0.17
319	0.12
320	0.13
321	0.13
322	0.11
323	0.1
324	0.09
325	0.08
326	0.07
327	0.07
328	0.08
329	0.13
330	0.13
331	0.13
332	0.13
333	0.14
334	0.15
335	0.14
336	0.15
337	0.13
338	0.13
339	0.15
340	0.16
341	0.17
342	0.18
343	0.18
344	0.15
345	0.13
346	0.18
347	0.19
348	0.2
349	0.21
350	0.21
351	0.23
352	0.24
353	0.23
354	0.22
355	0.22
356	0.23
357	0.21
358	0.25
359	0.25
360	0.27
361	0.29
362	0.32
363	0.34
364	0.4
365	0.41
366	0.39
367	0.4
368	0.47
369	0.53
370	0.53
371	0.58
372	0.55
373	0.63
374	0.63
375	0.65
376	0.62
377	0.57
378	0.52
379	0.45
380	0.43
381	0.34
382	0.35
383	0.28
384	0.21
385	0.18
386	0.17
387	0.17
388	0.12
389	0.11
390	0.09
391	0.09
392	0.08
393	0.08
394	0.05
395	0.04
396	0.03
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.04
401	0.04
402	0.05
403	0.06
404	0.09
405	0.09
406	0.13
407	0.18
408	0.25
409	0.32
410	0.36
411	0.43
412	0.42
413	0.47
414	0.46
415	0.41
416	0.39
417	0.34
418	0.33
419	0.3
420	0.32
421	0.3
422	0.32
423	0.31
424	0.34
425	0.38
426	0.36
427	0.38
428	0.38
429	0.4
430	0.38
431	0.42
432	0.35
433	0.29
434	0.28
435	0.2
436	0.17
437	0.13
438	0.12
439	0.08
440	0.08
441	0.09
442	0.09
443	0.09
444	0.1
445	0.1
446	0.09
447	0.1
448	0.1
449	0.1
450	0.1
451	0.15
452	0.15
453	0.14
454	0.16
455	0.17
456	0.21
457	0.22
458	0.21
459	0.2
460	0.21
461	0.22
462	0.22
463	0.19
464	0.15
465	0.14
466	0.2
467	0.17
468	0.16
469	0.16
470	0.15
471	0.16
472	0.16
473	0.21
474	0.23
475	0.28
476	0.27
477	0.27
478	0.25
479	0.25
480	0.27
481	0.23
482	0.17
483	0.11
484	0.11
485	0.1
486	0.12
487	0.11
488	0.1
489	0.09
490	0.12
491	0.14
492	0.15
493	0.15
494	0.17
495	0.19
496	0.19
497	0.18
498	0.16
499	0.15
500	0.15
501	0.15
502	0.11
503	0.12
504	0.13
505	0.14
506	0.15
507	0.16
508	0.17
509	0.19
510	0.18
511	0.18
512	0.15
513	0.15
514	0.12
515	0.11
516	0.09
517	0.06
518	0.08
519	0.06
520	0.06
521	0.05
522	0.05
523	0.06
524	0.1
525	0.12
526	0.12
527	0.16
528	0.18
529	0.19
530	0.21
531	0.21
532	0.16
533	0.15
534	0.13
535	0.1
536	0.11
537	0.09
538	0.08
539	0.07
540	0.07
541	0.07
542	0.07
543	0.06
544	0.04
545	0.05
546	0.06
547	0.07
548	0.07
549	0.07
550	0.09
551	0.09
552	0.09
553	0.08
554	0.08
555	0.11
556	0.11
557	0.11
558	0.11
559	0.15
560	0.16
561	0.17
562	0.17
563	0.14
564	0.15
565	0.18
566	0.16
567	0.14
568	0.13
569	0.14
570	0.13
571	0.15
572	0.16
573	0.14
574	0.15
575	0.14
576	0.15
577	0.2
578	0.27
579	0.33
580	0.34
581	0.37
582	0.37
583	0.38
584	0.39
585	0.37
586	0.36
587	0.34
588	0.37
589	0.38
590	0.42
591	0.44
592	0.43
593	0.4
594	0.39
595	0.33
596	0.29
597	0.26
598	0.22
599	0.18
600	0.17
601	0.15
602	0.09
603	0.08
604	0.06
605	0.05
606	0.05
607	0.05
608	0.06
609	0.06
610	0.08
611	0.08
612	0.08
613	0.09
614	0.1
615	0.11
616	0.11
617	0.12
618	0.13
619	0.13
620	0.13
621	0.13
622	0.19
623	0.2
624	0.23
625	0.21
626	0.23
627	0.23
628	0.24
629	0.24
630	0.18
631	0.17
632	0.15
633	0.16
634	0.12
635	0.11
636	0.1
637	0.09
638	0.08
639	0.07
640	0.07
641	0.06
642	0.06
643	0.09
644	0.1
645	0.1
646	0.11
647	0.11
648	0.1
649	0.13
650	0.13
651	0.15
652	0.16
653	0.17
654	0.17
655	0.19
656	0.21
657	0.2
658	0.21
659	0.17
660	0.19
661	0.18
662	0.2
663	0.19
664	0.15
665	0.13
666	0.12
667	0.11
668	0.08
669	0.1
670	0.09
671	0.08
672	0.13
673	0.14
674	0.15
675	0.16
676	0.16
677	0.14
678	0.17
679	0.17
680	0.12
681	0.11
682	0.1
683	0.09
684	0.09
685	0.09
686	0.04
687	0.04
688	0.04
689	0.04
690	0.04
691	0.05
692	0.07
693	0.09
694	0.1
695	0.14
696	0.17
697	0.2
698	0.22
699	0.22
700	0.23
701	0.25
702	0.28
703	0.27
704	0.24
705	0.2
706	0.19
707	0.18
708	0.15
709	0.11
710	0.08
711	0.07
712	0.06
713	0.07
714	0.08
715	0.08
716	0.08
717	0.07
718	0.06
719	0.06
720	0.06
721	0.08
722	0.08
723	0.09
724	0.1
725	0.11
726	0.11
727	0.11
728	0.16
729	0.15
730	0.18
731	0.22
732	0.24
733	0.24
734	0.25
735	0.26
736	0.21
737	0.24
738	0.21
739	0.17
740	0.14
741	0.13
742	0.12
743	0.11
744	0.11
745	0.07
746	0.06
747	0.05
748	0.05
749	0.04
750	0.05
751	0.04
752	0.04
753	0.04
754	0.04
755	0.04
756	0.05
757	0.05
758	0.06
759	0.08
760	0.09
761	0.09
762	0.13
763	0.17
764	0.16
765	0.18
766	0.17
767	0.17
768	0.16
769	0.16
770	0.13
771	0.1
772	0.11
773	0.09
774	0.09
775	0.08
776	0.08
777	0.08
778	0.07
779	0.07
780	0.07
781	0.07
782	0.07
783	0.06
784	0.06
785	0.06
786	0.06
787	0.06
788	0.05
789	0.05
790	0.06
791	0.06
792	0.07
793	0.07
794	0.09
795	0.12
796	0.18
797	0.2
798	0.26
799	0.35
800	0.37
801	0.39
802	0.47
803	0.49
804	0.5
805	0.51
806	0.48
807	0.47
808	0.48
809	0.44
810	0.34
811	0.3
812	0.23
813	0.2
814	0.16
815	0.08
816	0.05
817	0.05
818	0.06
819	0.06
820	0.06
821	0.09
822	0.11
823	0.13
824	0.14
825	0.15
826	0.16
827	0.18
828	0.19
829	0.19
830	0.17
831	0.16
832	0.16
833	0.15
834	0.14
835	0.11
836	0.11
837	0.1
838	0.12
839	0.13
840	0.13
841	0.13
842	0.12
843	0.12
844	0.13
845	0.15
846	0.19
847	0.22
848	0.23
849	0.25
850	0.25
851	0.26
852	0.25
853	0.21
854	0.19
855	0.15
856	0.15
857	0.14
858	0.15
859	0.13
860	0.12
861	0.15
862	0.11
863	0.11
864	0.09
865	0.09
866	0.09
867	0.09
868	0.1
869	0.09
870	0.09
871	0.09
872	0.1
873	0.12
874	0.13
875	0.13
876	0.13
877	0.14
878	0.15
879	0.19
880	0.2
881	0.2
882	0.19
883	0.19
884	0.19
885	0.17
886	0.15
887	0.11
888	0.09
889	0.08
890	0.07
891	0.07
892	0.08
893	0.07
894	0.07
895	0.07
896	0.11
897	0.12
898	0.19
899	0.29
900	0.37
901	0.44
902	0.5
903	0.6
904	0.65
905	0.71
906	0.75
907	0.76
908	0.8
909	0.82
910	0.87
911	0.83
912	0.76
913	0.68
914	0.6
915	0.55
916	0.53
917	0.48
918	0.43
919	0.38
920	0.39
921	0.42
922	0.41
923	0.35
924	0.28
925	0.24
926	0.29
927	0.34
928	0.32
929	0.33
930	0.36
931	0.4
932	0.44
933	0.45
934	0.41
935	0.45
936	0.47
937	0.44
938	0.44
939	0.41
940	0.41
941	0.47
942	0.41
943	0.35
944	0.32
945	0.32
946	0.32
947	0.32
948	0.26
949	0.2
950	0.21
951	0.2
952	0.21
953	0.2
954	0.17
955	0.25
956	0.33
957	0.34
958	0.36
959	0.38
960	0.41
961	0.43
962	0.48
963	0.49
964	0.51
965	0.52
966	0.53
967	0.52
968	0.5
969	0.48
970	0.42
971	0.33
972	0.23
973	0.22
974	0.18
975	0.18
976	0.15
977	0.14
978	0.13
979	0.11
980	0.14
981	0.12
982	0.12
983	0.1
984	0.1
985	0.1
986	0.1
987	0.1
988	0.08
989	0.1
990	0.09
991	0.09
992	0.09
993	0.09
994	0.12
995	0.12
996	0.11
997	0.1
998	0.1
999	0.11
1000	0.12
1001	0.13
1002	0.1
1003	0.12
1004	0.13
1005	0.13
1006	0.12
1007	0.12
1008	0.11
1009	0.1
1010	0.1
1011	0.08
1012	0.07
1013	0.06
1014	0.07
1015	0.06
1016	0.07
1017	0.08
1018	0.08
1019	0.12
1020	0.13
1021	0.15
1022	0.15
1023	0.15
1024	0.15
1025	0.16
1026	0.16
1027	0.12
1028	0.11
1029	0.1
1030	0.12
1031	0.11
1032	0.13
1033	0.12
1034	0.13
1035	0.19
1036	0.19
1037	0.21
1038	0.23
1039	0.25
1040	0.31
1041	0.35
1042	0.36
1043	0.38
1044	0.43
1045	0.49
1046	0.51
1047	0.5
1048	0.45
1049	0.44
1050	0.51
1051	0.54
1052	0.58
1053	0.57
1054	0.57
1055	0.6
1056	0.67
1057	0.72
1058	0.69
1059	0.63
1060	0.62
1061	0.64
1062	0.68
1063	0.7
1064	0.7
1065	0.7
1066	0.71
1067	0.74
1068	0.74
1069	0.77
1070	0.75
1071	0.69
1072	0.64
1073	0.56
1074	0.5
1075	0.43
1076	0.36
1077	0.29
1078	0.23
1079	0.22
1080	0.19
1081	0.19
1082	0.22
1083	0.22
1084	0.2
1085	0.25
1086	0.31
1087	0.33
1088	0.38
1089	0.41
1090	0.39
1091	0.45
1092	0.44
1093	0.37
1094	0.32
1095	0.32
1096	0.26
1097	0.21
1098	0.2
1099	0.14
1100	0.14
1101	0.13
1102	0.11
1103	0.08
1104	0.07
1105	0.08
1106	0.09
1107	0.07
1108	0.07
1109	0.11
1110	0.12
1111	0.14
1112	0.14
1113	0.13
1114	0.13
1115	0.13
1116	0.14
1117	0.11
1118	0.12
1119	0.1
1120	0.09
1121	0.09
1122	0.08
1123	0.08
1124	0.07
1125	0.06
1126	0.05
1127	0.05
1128	0.06
1129	0.06
1130	0.06
1131	0.06
1132	0.06
1133	0.06
1134	0.07
1135	0.07
1136	0.06
1137	0.07
1138	0.08
1139	0.09
1140	0.09
1141	0.09
1142	0.09
1143	0.09
1144	0.11
1145	0.11
1146	0.11
1147	0.12
1148	0.14
1149	0.18
1150	0.19
1151	0.2
1152	0.2
1153	0.22
1154	0.22
1155	0.21
1156	0.21
1157	0.18
1158	0.16
1159	0.15
1160	0.13
1161	0.12
1162	0.11
1163	0.1
1164	0.08
1165	0.07
1166	0.06
1167	0.06
1168	0.05
1169	0.05
1170	0.05
1171	0.05
1172	0.06
1173	0.05
1174	0.06
1175	0.09
1176	0.18
1177	0.22
1178	0.26
1179	0.35
1180	0.44
1181	0.54
1182	0.64
1183	0.72
1184	0.74
1185	0.8
1186	0.86
1187	0.86
1188	0.87
1189	0.82
1190	0.76
1191	0.73
1192	0.71
1193	0.65
1194	0.62
1195	0.53
1196	0.46
1197	0.48
1198	0.46
1199	0.43
1200	0.39
1201	0.39
1202	0.33
1203	0.4
1204	0.37
1205	0.34
1206	0.42
1207	0.39
1208	0.43
1209	0.41
1210	0.44
1211	0.41

C4JDA6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer