FuNGI

C4JIH1

Protein Details

Accession

C4JIH1

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
132-154	ASPEVSAKSRKRKRGEREEALED	Hydrophilic
443-465	PMLPRKLRVVRAKRISNKRNDVG	Hydrophilic
530-565	GKIGTGLKAKTKNRGRPKTRSARRAKTFRDSKKSSK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
139-148	KSRKRKRGER
162-180	KEEEKDSKKRAAGKETKRQ
446-461	PRKLRVVRAKRISNKR
478-511	DPGLKGRRAAKLLGRAGAAQLRSSAREEMRKEKR
533-565	GTGLKAKTKNRGRPKTRSARRAKTFRDSKKSSK

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	ure:UREG_01508 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12394 RRM1_RBM34

Amino Acid Sequences

MGKKIKSKAKAKVATDNEASGTDAVPPSLFGNKDAVIDPMLASLFANSAGPIKSPELKQSLRSSGDKDNASKPAKKAERGDRNNSNLTGSEEPEPGSEDGDSVDNDDEMPDVSSEGENDTDKGAENDQELDASPEVSAKSRKRKRGEREEALEDSYMRKLVKEEEKDSKKRAAGKETKRQKATSDATNDPEDEDSASGEETDEGDGIDGPDSNPPPVHESLSGSLDPEGLQKSARTVFLGNVSTEAIKSKAAKKTLLAHLSAFFPSLPESSTPHKIESIRFRSTAFATAAVPKRAAFAKKELMDSTTQSTNAYVVYTTAAAARKAISLNGTIVLERHLRVDSIAHPAPIDNKRCVFVGNLGFVDEETALADGDAEKKRKKYTPPADVEEGLWRTFNQHAGPVESVRVVRDPSTRVGKGFAYVQFRDQNGVEAALLLDGKKFPPMLPRKLRVVRAKRISNKRNDVGNSNTNRTRIGGADPGLKGRRAAKLLGRAGAAQLRSSAREEMRKEKRGSDATASPFVFEGHRAVEGKIGTGLKAKTKNRGRPKTRSARRAKTFRDSKKSSK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.73
2	0.67
3	0.58
4	0.48
5	0.4
6	0.36
7	0.26
8	0.21
9	0.16
10	0.14
11	0.13
12	0.11
13	0.12
14	0.12
15	0.17
16	0.17
17	0.15
18	0.19
19	0.2
20	0.22
21	0.21
22	0.21
23	0.17
24	0.17
25	0.15
26	0.13
27	0.12
28	0.1
29	0.09
30	0.08
31	0.07
32	0.07
33	0.07
34	0.06
35	0.09
36	0.09
37	0.1
38	0.13
39	0.16
40	0.22
41	0.23
42	0.3
43	0.35
44	0.37
45	0.42
46	0.46
47	0.5
48	0.49
49	0.5
50	0.48
51	0.49
52	0.53
53	0.51
54	0.48
55	0.47
56	0.5
57	0.53
58	0.54
59	0.49
60	0.53
61	0.55
62	0.58
63	0.61
64	0.64
65	0.69
66	0.71
67	0.78
68	0.76
69	0.76
70	0.74
71	0.66
72	0.57
73	0.47
74	0.44
75	0.37
76	0.3
77	0.27
78	0.23
79	0.22
80	0.21
81	0.23
82	0.18
83	0.16
84	0.14
85	0.11
86	0.11
87	0.12
88	0.11
89	0.1
90	0.1
91	0.09
92	0.09
93	0.09
94	0.08
95	0.07
96	0.08
97	0.06
98	0.06
99	0.07
100	0.07
101	0.08
102	0.09
103	0.1
104	0.09
105	0.1
106	0.1
107	0.1
108	0.1
109	0.11
110	0.11
111	0.11
112	0.12
113	0.13
114	0.12
115	0.12
116	0.12
117	0.13
118	0.12
119	0.11
120	0.09
121	0.09
122	0.1
123	0.12
124	0.19
125	0.24
126	0.35
127	0.44
128	0.53
129	0.62
130	0.71
131	0.79
132	0.83
133	0.86
134	0.85
135	0.83
136	0.8
137	0.72
138	0.63
139	0.53
140	0.42
141	0.33
142	0.25
143	0.2
144	0.14
145	0.13
146	0.12
147	0.19
148	0.27
149	0.32
150	0.37
151	0.45
152	0.54
153	0.59
154	0.61
155	0.6
156	0.55
157	0.56
158	0.56
159	0.56
160	0.57
161	0.62
162	0.68
163	0.73
164	0.77
165	0.74
166	0.69
167	0.61
168	0.6
169	0.55
170	0.52
171	0.48
172	0.43
173	0.42
174	0.42
175	0.4
176	0.31
177	0.27
178	0.2
179	0.14
180	0.11
181	0.08
182	0.07
183	0.07
184	0.06
185	0.06
186	0.06
187	0.05
188	0.05
189	0.05
190	0.04
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.05
195	0.05
196	0.05
197	0.08
198	0.09
199	0.09
200	0.1
201	0.1
202	0.14
203	0.15
204	0.17
205	0.14
206	0.16
207	0.17
208	0.2
209	0.19
210	0.15
211	0.14
212	0.12
213	0.12
214	0.11
215	0.1
216	0.08
217	0.08
218	0.08
219	0.1
220	0.12
221	0.12
222	0.11
223	0.11
224	0.12
225	0.15
226	0.16
227	0.14
228	0.13
229	0.13
230	0.12
231	0.11
232	0.11
233	0.08
234	0.08
235	0.11
236	0.16
237	0.2
238	0.23
239	0.23
240	0.25
241	0.31
242	0.37
243	0.37
244	0.32
245	0.28
246	0.27
247	0.27
248	0.25
249	0.18
250	0.11
251	0.08
252	0.08
253	0.08
254	0.07
255	0.07
256	0.1
257	0.13
258	0.19
259	0.2
260	0.2
261	0.23
262	0.24
263	0.27
264	0.34
265	0.37
266	0.33
267	0.33
268	0.33
269	0.32
270	0.31
271	0.3
272	0.2
273	0.15
274	0.13
275	0.19
276	0.21
277	0.2
278	0.19
279	0.16
280	0.17
281	0.19
282	0.2
283	0.16
284	0.18
285	0.23
286	0.25
287	0.26
288	0.25
289	0.24
290	0.23
291	0.23
292	0.22
293	0.17
294	0.15
295	0.13
296	0.13
297	0.12
298	0.11
299	0.09
300	0.06
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.05
305	0.07
306	0.08
307	0.08
308	0.09
309	0.09
310	0.09
311	0.1
312	0.1
313	0.08
314	0.08
315	0.09
316	0.09
317	0.09
318	0.08
319	0.08
320	0.1
321	0.1
322	0.09
323	0.1
324	0.09
325	0.09
326	0.09
327	0.11
328	0.11
329	0.16
330	0.17
331	0.15
332	0.15
333	0.16
334	0.22
335	0.26
336	0.28
337	0.24
338	0.25
339	0.26
340	0.26
341	0.26
342	0.21
343	0.2
344	0.2
345	0.19
346	0.18
347	0.17
348	0.17
349	0.16
350	0.15
351	0.1
352	0.07
353	0.05
354	0.05
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.1
360	0.14
361	0.18
362	0.21
363	0.24
364	0.3
365	0.36
366	0.43
367	0.49
368	0.55
369	0.62
370	0.65
371	0.68
372	0.66
373	0.61
374	0.55
375	0.49
376	0.41
377	0.3
378	0.24
379	0.18
380	0.16
381	0.17
382	0.19
383	0.14
384	0.16
385	0.17
386	0.2
387	0.21
388	0.19
389	0.19
390	0.18
391	0.17
392	0.14
393	0.14
394	0.13
395	0.14
396	0.17
397	0.18
398	0.22
399	0.29
400	0.29
401	0.28
402	0.3
403	0.28
404	0.26
405	0.28
406	0.27
407	0.26
408	0.26
409	0.3
410	0.32
411	0.32
412	0.33
413	0.28
414	0.26
415	0.21
416	0.21
417	0.16
418	0.12
419	0.11
420	0.09
421	0.09
422	0.06
423	0.06
424	0.07
425	0.07
426	0.09
427	0.09
428	0.1
429	0.2
430	0.28
431	0.38
432	0.46
433	0.51
434	0.59
435	0.65
436	0.73
437	0.73
438	0.74
439	0.74
440	0.75
441	0.79
442	0.8
443	0.84
444	0.85
445	0.85
446	0.85
447	0.8
448	0.78
449	0.71
450	0.67
451	0.63
452	0.63
453	0.59
454	0.57
455	0.54
456	0.48
457	0.45
458	0.41
459	0.36
460	0.28
461	0.26
462	0.24
463	0.23
464	0.28
465	0.28
466	0.33
467	0.33
468	0.32
469	0.31
470	0.3
471	0.34
472	0.31
473	0.34
474	0.35
475	0.42
476	0.45
477	0.45
478	0.42
479	0.36
480	0.36
481	0.35
482	0.29
483	0.2
484	0.2
485	0.19
486	0.21
487	0.23
488	0.26
489	0.27
490	0.34
491	0.38
492	0.45
493	0.54
494	0.6
495	0.61
496	0.6
497	0.64
498	0.62
499	0.62
500	0.58
501	0.55
502	0.52
503	0.56
504	0.51
505	0.43
506	0.37
507	0.33
508	0.28
509	0.22
510	0.19
511	0.13
512	0.17
513	0.18
514	0.18
515	0.21
516	0.2
517	0.2
518	0.22
519	0.21
520	0.18
521	0.23
522	0.25
523	0.29
524	0.38
525	0.41
526	0.47
527	0.56
528	0.66
529	0.71
530	0.8
531	0.81
532	0.83
533	0.9
534	0.91
535	0.91
536	0.92
537	0.91
538	0.91
539	0.92
540	0.92
541	0.89
542	0.88
543	0.89
544	0.88
545	0.88

C4JIH1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer