Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JG04

Protein Details
Accession C4JG04    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
233-252KTKKVRTTTKAKTKTKPAMIHydrophilic
297-316QALFDKKREKEQAKDAKQKDHydrophilic
321-350LDGKGKKTKARAASKRGKKKEKTESSGEETBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
302-342KKREKEQAKDAKQKDIRDMLDGKGKKTKARAASKRGKKKEK
Subcellular Location(s) mito 15.5, mito_nucl 13.833, nucl 10, cyto_mito 8.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001719  AP_endonuc_2  
IPR018246  AP_endonuc_F2_Zn_BS  
IPR036237  Xyl_isomerase-like_sf  
IPR013022  Xyl_isomerase-like_TIM-brl  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG ure:UREG_01084  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01261  AP_endonuc_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00730  AP_NUCLEASE_F2_2  
PS00731  AP_NUCLEASE_F2_3  
PS51432  AP_NUCLEASE_F2_4  
Amino Acid Sequences MRGAWYKTLQFSVSFPHSHILKVQKLNINCSPGATNQSTLDSALSRLAKALIAALDATKTVIPVLETTCGHGTTIGGPLSHFQSLLALIPETYHPRLGICLDTCHTFAAGYDLRSPESWNEFMDEFDKTVGLKFLRALHINDSKTPLGSKRDLHANIGTGFLGLRAFHNVMNDKRLEDLPMILETPIDRPAETVEAHQQEEAVASECEHDNLDVSESERPSGKKRTTTSTASKTKKVRTTTKAKTKTKPAMIEDKSVWVREIKLLESLIGMDPESREFKSLEAGLAEQGKEEREKQQALFDKKREKEQAKDAKQKDIRDMLDGKGKKTKARAASKRGKKKEKTESSGEETALSDAEYESN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.26
3 0.3
4 0.29
5 0.29
6 0.34
7 0.35
8 0.38
9 0.42
10 0.49
11 0.5
12 0.52
13 0.58
14 0.57
15 0.54
16 0.46
17 0.42
18 0.37
19 0.32
20 0.36
21 0.31
22 0.28
23 0.24
24 0.26
25 0.25
26 0.23
27 0.22
28 0.16
29 0.15
30 0.18
31 0.17
32 0.15
33 0.15
34 0.15
35 0.14
36 0.13
37 0.14
38 0.09
39 0.09
40 0.09
41 0.09
42 0.08
43 0.08
44 0.09
45 0.07
46 0.07
47 0.06
48 0.06
49 0.07
50 0.08
51 0.1
52 0.13
53 0.13
54 0.16
55 0.18
56 0.18
57 0.17
58 0.16
59 0.14
60 0.12
61 0.16
62 0.13
63 0.11
64 0.11
65 0.13
66 0.15
67 0.15
68 0.13
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.1
74 0.08
75 0.07
76 0.08
77 0.1
78 0.14
79 0.15
80 0.15
81 0.14
82 0.14
83 0.15
84 0.16
85 0.18
86 0.14
87 0.16
88 0.16
89 0.18
90 0.18
91 0.17
92 0.16
93 0.12
94 0.11
95 0.14
96 0.14
97 0.13
98 0.16
99 0.17
100 0.18
101 0.18
102 0.19
103 0.16
104 0.19
105 0.19
106 0.16
107 0.18
108 0.17
109 0.17
110 0.17
111 0.15
112 0.11
113 0.1
114 0.1
115 0.07
116 0.08
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.11
121 0.14
122 0.17
123 0.19
124 0.2
125 0.23
126 0.29
127 0.3
128 0.29
129 0.3
130 0.27
131 0.25
132 0.25
133 0.22
134 0.21
135 0.23
136 0.24
137 0.22
138 0.3
139 0.31
140 0.32
141 0.3
142 0.27
143 0.24
144 0.23
145 0.2
146 0.11
147 0.1
148 0.08
149 0.07
150 0.05
151 0.05
152 0.06
153 0.07
154 0.08
155 0.1
156 0.14
157 0.15
158 0.18
159 0.18
160 0.16
161 0.17
162 0.16
163 0.15
164 0.12
165 0.11
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.07
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.14
182 0.16
183 0.16
184 0.16
185 0.15
186 0.13
187 0.13
188 0.12
189 0.08
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.06
201 0.08
202 0.1
203 0.1
204 0.11
205 0.14
206 0.15
207 0.19
208 0.27
209 0.29
210 0.33
211 0.36
212 0.43
213 0.46
214 0.51
215 0.54
216 0.55
217 0.61
218 0.58
219 0.63
220 0.61
221 0.63
222 0.64
223 0.63
224 0.62
225 0.61
226 0.67
227 0.71
228 0.75
229 0.78
230 0.79
231 0.79
232 0.79
233 0.8
234 0.77
235 0.73
236 0.67
237 0.67
238 0.62
239 0.59
240 0.5
241 0.48
242 0.42
243 0.36
244 0.32
245 0.23
246 0.22
247 0.21
248 0.22
249 0.16
250 0.17
251 0.16
252 0.16
253 0.14
254 0.15
255 0.11
256 0.1
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.11
261 0.13
262 0.12
263 0.13
264 0.13
265 0.13
266 0.17
267 0.17
268 0.16
269 0.14
270 0.14
271 0.15
272 0.17
273 0.16
274 0.13
275 0.13
276 0.14
277 0.15
278 0.17
279 0.21
280 0.24
281 0.28
282 0.28
283 0.36
284 0.43
285 0.5
286 0.56
287 0.58
288 0.62
289 0.63
290 0.71
291 0.72
292 0.69
293 0.68
294 0.7
295 0.73
296 0.73
297 0.8
298 0.74
299 0.75
300 0.74
301 0.7
302 0.67
303 0.64
304 0.55
305 0.51
306 0.51
307 0.43
308 0.48
309 0.46
310 0.42
311 0.42
312 0.43
313 0.42
314 0.47
315 0.51
316 0.52
317 0.61
318 0.68
319 0.7
320 0.79
321 0.85
322 0.88
323 0.91
324 0.92
325 0.9
326 0.9
327 0.91
328 0.91
329 0.87
330 0.85
331 0.82
332 0.79
333 0.74
334 0.64
335 0.54
336 0.44
337 0.37
338 0.28
339 0.2
340 0.13