FuNGI

A0A093YWC5

Protein Details

Accession

A0A093YWC5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
170-198	VWSNSTTTPTQRRRRRRDLQGQRPGPRKP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
181-197	RRRRRRDLQGQRPGPRK

Subcellular Location(s)

extr 8, mito 7, cyto 5.5, cyto_nucl 3.5, E.R. 2, plas 1, pero 1, golg 1, vacu 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005378 Vps35 IPR042491 Vps35_C
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0030906 C:retromer, cargo-selective complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF03635 Vps35

Amino Acid Sequences

MRPSLPLTPLLAFSSLYSLSIALPLISRPNNSHQQPEPVLVARAQYSVVPVDGGAQGGTVTVTQTVAASASAKEVYITVTAPAAVVTETVTGAVATPSVAKEFKTVYVPTTVYESVAAPTGGVIESSVGGNSTISTVTLSLSVTATGSSISAPSSTKVYDNGLWHTTYPVWSNSTTTPTQRRRRRRDLQGQRPGPRKPVTNPSSQQPQRFPLKTNARTIVSCPDRELNPTSLNSTMATPPAVEDQARLLEDALTVVRQQTHLMRKCLETPGKLMDALKCSSTLVSELRTSSLGPKQYYELYMSVFDALRHLSVYLRESHPVNHLADLYELVQYAGNIVPRLYLMITVGTVYMAIEDAPVKEIMKDMMEMSRGVQHPIRGLFLRYYLSGQARDHLPTGSGDGPEGNLQDSISFILTNFVEMNKLWVRLQHQGHSREREQRTKERQELQLLVGSNLVRLSQLVDLEAYKNVILQPLLEQVVQCRDVLAQEYLLEVITQVFPDEFHLHTLDQFLAAVSRLNPHVNVKAIVIGLMDRLSAFAARETEPEPLEERKKTEEEALVKLLEDVRLSCEKKKEAEAASAAEGEDDKKKEPEEATEDLPKYEAAEASEDKKEDKKEEPAAPEPKEEEPINGEDEAAPAKKGRGILDNIKLYEIFFDQVMNLVTAQHLPIQDTTALLVSLANLALNIYPERLDYVDKILDYANHKCQQHANSPELHSQATQTNILSLLQAPLQSYASIFTALSLPQYIPLINSQTYPTRRAIAGEVAKTLLKTLTKTSTVAGLESVLEILKVLIKEGSQPPAGYPGVQQRRVVETDETIEEQGWLARIVHLIHSDDNDTQFKLLQATKNAYSEGNERIKFTTPALITSAIKLANRYKAREHYDDNWSTQSSSLYKYMHSSLSTLYTRVNGSADLCLRQFVACGQIADQNGFEEVSYEFFAQAFTIYEEAVSDSRAQFQAVCIIAGALHETRNFSKENYDTLITKCALHGSKLLKKPDQCRAVYLASHLWWAVPIAAKGEEDEKGLYRDGKRVLECLQRALRVADACMDTAVSVELFVEILNRYVYYFDQQNEAVTIKYINGLIELIHSNLQTNQDAATIEGPRRHFERTLEYIASREYEGVVIAAAK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.16
3	0.15
4	0.13
5	0.12
6	0.11
7	0.12
8	0.11
9	0.08
10	0.09
11	0.1
12	0.16
13	0.19
14	0.21
15	0.25
16	0.32
17	0.42
18	0.44
19	0.5
20	0.47
21	0.54
22	0.53
23	0.52
24	0.48
25	0.41
26	0.4
27	0.34
28	0.31
29	0.24
30	0.22
31	0.19
32	0.15
33	0.15
34	0.14
35	0.14
36	0.12
37	0.1
38	0.12
39	0.12
40	0.12
41	0.09
42	0.08
43	0.07
44	0.07
45	0.08
46	0.05
47	0.05
48	0.06
49	0.06
50	0.06
51	0.06
52	0.07
53	0.07
54	0.07
55	0.08
56	0.08
57	0.1
58	0.1
59	0.1
60	0.1
61	0.1
62	0.11
63	0.11
64	0.11
65	0.09
66	0.1
67	0.1
68	0.09
69	0.09
70	0.08
71	0.07
72	0.06
73	0.06
74	0.06
75	0.06
76	0.06
77	0.07
78	0.06
79	0.06
80	0.06
81	0.06
82	0.05
83	0.07
84	0.07
85	0.1
86	0.11
87	0.11
88	0.14
89	0.16
90	0.19
91	0.22
92	0.23
93	0.22
94	0.26
95	0.26
96	0.24
97	0.27
98	0.25
99	0.2
100	0.2
101	0.19
102	0.15
103	0.16
104	0.15
105	0.09
106	0.09
107	0.09
108	0.08
109	0.07
110	0.06
111	0.05
112	0.06
113	0.06
114	0.06
115	0.06
116	0.06
117	0.06
118	0.06
119	0.07
120	0.06
121	0.06
122	0.07
123	0.07
124	0.07
125	0.08
126	0.08
127	0.08
128	0.08
129	0.08
130	0.08
131	0.08
132	0.07
133	0.06
134	0.06
135	0.06
136	0.06
137	0.06
138	0.07
139	0.08
140	0.09
141	0.12
142	0.13
143	0.14
144	0.15
145	0.19
146	0.22
147	0.24
148	0.28
149	0.28
150	0.28
151	0.27
152	0.27
153	0.24
154	0.22
155	0.22
156	0.19
157	0.2
158	0.2
159	0.22
160	0.22
161	0.26
162	0.27
163	0.32
164	0.4
165	0.47
166	0.57
167	0.64
168	0.73
169	0.78
170	0.86
171	0.89
172	0.9
173	0.91
174	0.92
175	0.93
176	0.93
177	0.92
178	0.9
179	0.87
180	0.79
181	0.76
182	0.69
183	0.64
184	0.59
185	0.61
186	0.57
187	0.59
188	0.58
189	0.57
190	0.63
191	0.62
192	0.62
193	0.56
194	0.59
195	0.58
196	0.58
197	0.56
198	0.55
199	0.61
200	0.6
201	0.62
202	0.61
203	0.54
204	0.53
205	0.51
206	0.51
207	0.45
208	0.4
209	0.35
210	0.34
211	0.32
212	0.35
213	0.37
214	0.31
215	0.3
216	0.3
217	0.29
218	0.26
219	0.26
220	0.22
221	0.21
222	0.18
223	0.15
224	0.14
225	0.12
226	0.12
227	0.14
228	0.14
229	0.12
230	0.11
231	0.12
232	0.15
233	0.15
234	0.14
235	0.12
236	0.11
237	0.11
238	0.11
239	0.09
240	0.07
241	0.07
242	0.08
243	0.09
244	0.09
245	0.11
246	0.17
247	0.27
248	0.33
249	0.36
250	0.37
251	0.39
252	0.42
253	0.49
254	0.46
255	0.38
256	0.35
257	0.36
258	0.35
259	0.34
260	0.32
261	0.26
262	0.25
263	0.25
264	0.22
265	0.18
266	0.17
267	0.16
268	0.14
269	0.14
270	0.11
271	0.12
272	0.14
273	0.14
274	0.15
275	0.15
276	0.15
277	0.17
278	0.21
279	0.24
280	0.23
281	0.24
282	0.25
283	0.26
284	0.27
285	0.25
286	0.21
287	0.17
288	0.17
289	0.16
290	0.15
291	0.14
292	0.12
293	0.11
294	0.1
295	0.09
296	0.09
297	0.09
298	0.08
299	0.1
300	0.12
301	0.15
302	0.16
303	0.18
304	0.19
305	0.21
306	0.23
307	0.25
308	0.24
309	0.21
310	0.2
311	0.18
312	0.17
313	0.16
314	0.13
315	0.1
316	0.09
317	0.08
318	0.08
319	0.07
320	0.08
321	0.08
322	0.08
323	0.08
324	0.08
325	0.08
326	0.08
327	0.09
328	0.07
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.05
336	0.05
337	0.04
338	0.04
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.04
343	0.05
344	0.06
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.08
349	0.08
350	0.08
351	0.08
352	0.08
353	0.09
354	0.1
355	0.1
356	0.1
357	0.16
358	0.15
359	0.17
360	0.18
361	0.17
362	0.2
363	0.2
364	0.22
365	0.17
366	0.18
367	0.16
368	0.16
369	0.17
370	0.14
371	0.15
372	0.16
373	0.17
374	0.18
375	0.18
376	0.19
377	0.2
378	0.2
379	0.2
380	0.16
381	0.15
382	0.12
383	0.15
384	0.14
385	0.12
386	0.11
387	0.1
388	0.11
389	0.11
390	0.11
391	0.08
392	0.07
393	0.07
394	0.06
395	0.07
396	0.07
397	0.06
398	0.05
399	0.05
400	0.07
401	0.07
402	0.08
403	0.08
404	0.07
405	0.08
406	0.08
407	0.12
408	0.12
409	0.13
410	0.13
411	0.15
412	0.18
413	0.25
414	0.28
415	0.29
416	0.35
417	0.41
418	0.47
419	0.5
420	0.52
421	0.53
422	0.56
423	0.58
424	0.58
425	0.61
426	0.65
427	0.68
428	0.7
429	0.67
430	0.66
431	0.62
432	0.58
433	0.49
434	0.42
435	0.34
436	0.27
437	0.22
438	0.18
439	0.13
440	0.11
441	0.1
442	0.06
443	0.06
444	0.07
445	0.06
446	0.06
447	0.06
448	0.07
449	0.07
450	0.08
451	0.08
452	0.07
453	0.06
454	0.07
455	0.07
456	0.07
457	0.07
458	0.06
459	0.07
460	0.08
461	0.1
462	0.09
463	0.09
464	0.09
465	0.12
466	0.13
467	0.11
468	0.09
469	0.09
470	0.09
471	0.11
472	0.1
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.07
477	0.07
478	0.06
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.04
486	0.07
487	0.09
488	0.08
489	0.09
490	0.11
491	0.11
492	0.11
493	0.12
494	0.09
495	0.08
496	0.07
497	0.06
498	0.05
499	0.05
500	0.05
501	0.04
502	0.06
503	0.07
504	0.08
505	0.09
506	0.11
507	0.12
508	0.13
509	0.13
510	0.12
511	0.12
512	0.11
513	0.11
514	0.09
515	0.07
516	0.06
517	0.05
518	0.05
519	0.03
520	0.04
521	0.04
522	0.04
523	0.04
524	0.05
525	0.07
526	0.07
527	0.09
528	0.1
529	0.11
530	0.11
531	0.12
532	0.14
533	0.16
534	0.19
535	0.19
536	0.2
537	0.21
538	0.22
539	0.22
540	0.22
541	0.23
542	0.22
543	0.23
544	0.22
545	0.19
546	0.18
547	0.17
548	0.15
549	0.11
550	0.08
551	0.06
552	0.08
553	0.14
554	0.15
555	0.18
556	0.21
557	0.22
558	0.24
559	0.26
560	0.28
561	0.24
562	0.25
563	0.24
564	0.21
565	0.2
566	0.18
567	0.16
568	0.11
569	0.09
570	0.08
571	0.1
572	0.1
573	0.1
574	0.11
575	0.11
576	0.14
577	0.14
578	0.17
579	0.19
580	0.2
581	0.22
582	0.26
583	0.26
584	0.23
585	0.23
586	0.19
587	0.15
588	0.13
589	0.11
590	0.06
591	0.09
592	0.1
593	0.12
594	0.14
595	0.13
596	0.14
597	0.17
598	0.18
599	0.19
600	0.22
601	0.25
602	0.3
603	0.34
604	0.37
605	0.41
606	0.45
607	0.43
608	0.41
609	0.38
610	0.32
611	0.31
612	0.26
613	0.19
614	0.16
615	0.16
616	0.16
617	0.14
618	0.13
619	0.1
620	0.1
621	0.11
622	0.09
623	0.08
624	0.06
625	0.07
626	0.08
627	0.1
628	0.11
629	0.14
630	0.18
631	0.23
632	0.3
633	0.32
634	0.3
635	0.29
636	0.28
637	0.23
638	0.2
639	0.15
640	0.09
641	0.06
642	0.06
643	0.06
644	0.07
645	0.07
646	0.06
647	0.06
648	0.05
649	0.06
650	0.06
651	0.06
652	0.07
653	0.07
654	0.08
655	0.08
656	0.09
657	0.09
658	0.09
659	0.09
660	0.07
661	0.07
662	0.06
663	0.05
664	0.04
665	0.04
666	0.04
667	0.04
668	0.03
669	0.03
670	0.04
671	0.05
672	0.05
673	0.05
674	0.05
675	0.05
676	0.06
677	0.07
678	0.08
679	0.08
680	0.11
681	0.12
682	0.11
683	0.12
684	0.12
685	0.14
686	0.16
687	0.2
688	0.25
689	0.29
690	0.29
691	0.3
692	0.34
693	0.36
694	0.41
695	0.41
696	0.36
697	0.35
698	0.37
699	0.39
700	0.36
701	0.32
702	0.23
703	0.21
704	0.2
705	0.18
706	0.16
707	0.13
708	0.12
709	0.12
710	0.12
711	0.1
712	0.09
713	0.07
714	0.07
715	0.08
716	0.08
717	0.08
718	0.09
719	0.08
720	0.08
721	0.08
722	0.08
723	0.08
724	0.07
725	0.07
726	0.07
727	0.07
728	0.08
729	0.07
730	0.07
731	0.07
732	0.08
733	0.07
734	0.07
735	0.09
736	0.11
737	0.11
738	0.12
739	0.13
740	0.2
741	0.22
742	0.25
743	0.24
744	0.24
745	0.24
746	0.24
747	0.24
748	0.25
749	0.26
750	0.24
751	0.23
752	0.22
753	0.22
754	0.2
755	0.19
756	0.14
757	0.11
758	0.11
759	0.14
760	0.17
761	0.19
762	0.19
763	0.19
764	0.22
765	0.21
766	0.2
767	0.16
768	0.12
769	0.11
770	0.1
771	0.1
772	0.05
773	0.05
774	0.04
775	0.04
776	0.06
777	0.06
778	0.06
779	0.06
780	0.07
781	0.12
782	0.15
783	0.18
784	0.17
785	0.17
786	0.17
787	0.22
788	0.22
789	0.17
790	0.18
791	0.24
792	0.31
793	0.34
794	0.35
795	0.32
796	0.36
797	0.37
798	0.37
799	0.28
800	0.22
801	0.22
802	0.22
803	0.21
804	0.17
805	0.16
806	0.13
807	0.12
808	0.11
809	0.09
810	0.08
811	0.07
812	0.07
813	0.09
814	0.09
815	0.11
816	0.12
817	0.13
818	0.13
819	0.14
820	0.16
821	0.16
822	0.19
823	0.18
824	0.17
825	0.16
826	0.15
827	0.15
828	0.16
829	0.19
830	0.19
831	0.22
832	0.27
833	0.29
834	0.29
835	0.3
836	0.26
837	0.25
838	0.24
839	0.28
840	0.31
841	0.29
842	0.29
843	0.3
844	0.33
845	0.32
846	0.3
847	0.29
848	0.22
849	0.22
850	0.23
851	0.23
852	0.21
853	0.21
854	0.22
855	0.17
856	0.17
857	0.19
858	0.21
859	0.27
860	0.31
861	0.33
862	0.37
863	0.44
864	0.5
865	0.53
866	0.54
867	0.51
868	0.56
869	0.56
870	0.52
871	0.47
872	0.41
873	0.36
874	0.31
875	0.28
876	0.2
877	0.2
878	0.22
879	0.2
880	0.2
881	0.22
882	0.24
883	0.24
884	0.22
885	0.2
886	0.17
887	0.23
888	0.23
889	0.21
890	0.19
891	0.19
892	0.19
893	0.19
894	0.18
895	0.13
896	0.13
897	0.17
898	0.18
899	0.18
900	0.17
901	0.17
902	0.16
903	0.15
904	0.15
905	0.11
906	0.14
907	0.13
908	0.13
909	0.14
910	0.18
911	0.18
912	0.19
913	0.18
914	0.14
915	0.13
916	0.12
917	0.11
918	0.08
919	0.08
920	0.09
921	0.1
922	0.1
923	0.09
924	0.09
925	0.1
926	0.09
927	0.09
928	0.08
929	0.07
930	0.08
931	0.07
932	0.07
933	0.07
934	0.09
935	0.09
936	0.09
937	0.1
938	0.1
939	0.15
940	0.15
941	0.15
942	0.14
943	0.14
944	0.19
945	0.17
946	0.17
947	0.12
948	0.12
949	0.12
950	0.11
951	0.13
952	0.08
953	0.09
954	0.1
955	0.14
956	0.16
957	0.18
958	0.2
959	0.18
960	0.24
961	0.24
962	0.28
963	0.29
964	0.3
965	0.29
966	0.3
967	0.34
968	0.28
969	0.27
970	0.23
971	0.25
972	0.24
973	0.23
974	0.27
975	0.3
976	0.38
977	0.45
978	0.52
979	0.52
980	0.58
981	0.64
982	0.68
983	0.68
984	0.61
985	0.57
986	0.56
987	0.53
988	0.47
989	0.42
990	0.36
991	0.28
992	0.28
993	0.24
994	0.18
995	0.15
996	0.14
997	0.13
998	0.12
999	0.12
1000	0.13
1001	0.14
1002	0.14
1003	0.15
1004	0.17
1005	0.16
1006	0.15
1007	0.16
1008	0.16
1009	0.17
1010	0.19
1011	0.24
1012	0.23
1013	0.29
1014	0.33
1015	0.37
1016	0.36
1017	0.38
1018	0.42
1019	0.45
1020	0.44
1021	0.46
1022	0.46
1023	0.42
1024	0.42
1025	0.4
1026	0.38
1027	0.3
1028	0.29
1029	0.26
1030	0.22
1031	0.2
1032	0.19
1033	0.17
1034	0.13
1035	0.12
1036	0.12
1037	0.07
1038	0.06
1039	0.05
1040	0.05
1041	0.05
1042	0.05
1043	0.07
1044	0.06
1045	0.08
1046	0.09
1047	0.09
1048	0.09
1049	0.11
1050	0.12
1051	0.15
1052	0.2
1053	0.19
1054	0.23
1055	0.23
1056	0.24
1057	0.25
1058	0.24
1059	0.2
1060	0.16
1061	0.16
1062	0.12
1063	0.14
1064	0.13
1065	0.11
1066	0.11
1067	0.11
1068	0.1
1069	0.12
1070	0.13
1071	0.13
1072	0.14
1073	0.14
1074	0.15
1075	0.17
1076	0.21
1077	0.19
1078	0.18
1079	0.17
1080	0.16
1081	0.17
1082	0.17
1083	0.18
1084	0.18
1085	0.21
1086	0.26
1087	0.27
1088	0.3
1089	0.32
1090	0.36
1091	0.35
1092	0.36
1093	0.41
1094	0.43
1095	0.47
1096	0.47
1097	0.45
1098	0.42
1099	0.4
1100	0.37
1101	0.29
1102	0.22
1103	0.17
1104	0.13
1105	0.13
1106	0.11

A0A093YWC5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer