Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A093XBM4

Protein Details
Accession A0A093XBM4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
110-134ATATHGGKKRKSKSKGTKDENSKADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
116-125GKKRKSKSKG
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 6, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR045209  Rrp5  
IPR022967  S1_dom  
IPR003029  S1_domain  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50126  S1  
CDD cd05693  S1_Rrp5_repeat_hs1_sc1  
Amino Acid Sequences MGPIKRKTGPTNDSFVRSKKIGENDNRPQKRLRQEESVTSDTTKPNATVPTTVQAPKIARAKEEEAAFPRGGASVLTPLEHKQINIDATRDVLFEHETASRAKADGGSEATATHGGKKRKSKSKGTKDENSKADEDNIRIEGLSYKRLVPGSLVLGQVSKINVHDIALALPNNLTGYVPLTSISGKLTERVEKLVADDGASDDDTSIIADDIDLNDLFSIGQYLRAFVVSTNESNASGAGDVGKRRIELSLLPQQANNGITTKELAPNSMIMASVVSVEDHGIIMDIGLQKSSIGGFMSSKEIGYAVEMDAIQEGAVMLCMITGLSSNGKIVKLSADIQKIANSKKPTYLSDAPTVDAFLPGTAVEFLLTDITPRGVAGKVMGSIDVTADLIHSGLGNAGKDLEKKYK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.57
3 0.53
4 0.46
5 0.46
6 0.44
7 0.48
8 0.52
9 0.56
10 0.63
11 0.67
12 0.77
13 0.77
14 0.73
15 0.72
16 0.71
17 0.72
18 0.71
19 0.66
20 0.65
21 0.65
22 0.71
23 0.72
24 0.67
25 0.58
26 0.51
27 0.49
28 0.41
29 0.39
30 0.31
31 0.24
32 0.24
33 0.27
34 0.26
35 0.25
36 0.26
37 0.28
38 0.31
39 0.32
40 0.3
41 0.31
42 0.31
43 0.34
44 0.39
45 0.35
46 0.33
47 0.37
48 0.39
49 0.39
50 0.39
51 0.37
52 0.35
53 0.37
54 0.35
55 0.29
56 0.25
57 0.21
58 0.19
59 0.14
60 0.1
61 0.1
62 0.11
63 0.11
64 0.12
65 0.13
66 0.17
67 0.18
68 0.17
69 0.15
70 0.19
71 0.22
72 0.23
73 0.23
74 0.19
75 0.2
76 0.21
77 0.18
78 0.14
79 0.12
80 0.11
81 0.1
82 0.12
83 0.11
84 0.12
85 0.13
86 0.14
87 0.14
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.12
92 0.14
93 0.15
94 0.14
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.13
100 0.17
101 0.21
102 0.25
103 0.32
104 0.41
105 0.5
106 0.58
107 0.66
108 0.71
109 0.76
110 0.82
111 0.87
112 0.86
113 0.85
114 0.85
115 0.85
116 0.78
117 0.71
118 0.61
119 0.51
120 0.48
121 0.41
122 0.32
123 0.26
124 0.23
125 0.19
126 0.17
127 0.16
128 0.16
129 0.15
130 0.17
131 0.15
132 0.15
133 0.17
134 0.18
135 0.17
136 0.14
137 0.14
138 0.14
139 0.16
140 0.15
141 0.13
142 0.13
143 0.13
144 0.13
145 0.12
146 0.09
147 0.07
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.08
154 0.09
155 0.09
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.04
163 0.05
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.1
174 0.11
175 0.14
176 0.15
177 0.16
178 0.16
179 0.14
180 0.16
181 0.16
182 0.14
183 0.1
184 0.1
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.03
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.11
216 0.09
217 0.1
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.11
223 0.08
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.08
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.1
236 0.16
237 0.23
238 0.25
239 0.25
240 0.25
241 0.25
242 0.26
243 0.25
244 0.2
245 0.12
246 0.1
247 0.1
248 0.11
249 0.12
250 0.15
251 0.14
252 0.14
253 0.13
254 0.14
255 0.14
256 0.13
257 0.11
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.03
272 0.06
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.06
281 0.05
282 0.06
283 0.06
284 0.08
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.04
312 0.06
313 0.07
314 0.08
315 0.11
316 0.11
317 0.11
318 0.12
319 0.12
320 0.14
321 0.17
322 0.22
323 0.24
324 0.25
325 0.26
326 0.3
327 0.33
328 0.34
329 0.38
330 0.37
331 0.36
332 0.41
333 0.44
334 0.42
335 0.45
336 0.49
337 0.46
338 0.49
339 0.48
340 0.42
341 0.39
342 0.37
343 0.29
344 0.22
345 0.17
346 0.09
347 0.09
348 0.07
349 0.08
350 0.07
351 0.07
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.1
363 0.09
364 0.1
365 0.11
366 0.12
367 0.13
368 0.13
369 0.13
370 0.12
371 0.11
372 0.11
373 0.1
374 0.08
375 0.07
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.05
381 0.05
382 0.07
383 0.1
384 0.1
385 0.1
386 0.12
387 0.15
388 0.18