Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A093Y1V4

Protein Details
Accession A0A093Y1V4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-35AQGAGRGGRPRHYRRPRRGGAQNGAAPHydrophilic
1035-1060VLGSKAMGKKKEKEKGKERERQESVVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-28GRGGRPRHYRRPRRGG
86-95GRGGRPGQRG
1040-1053AMGKKKEKEKGKER
Subcellular Location(s) mito 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR034077  R3H_FAP1  
IPR000967  Znf_NFX1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
cd06006  R3H_unknown_2  
cd16492  RING-CH-C4HC3_NFX1-like  
Amino Acid Sequences MSTPSAPPAQGAGRGGRPRHYRRPRRGGAQNGAAPAPGATGAPRDTPAQPLQGNTTAVPPAPVTPQAAPGSNANPNRRNNGQSNRGRGGRPGQRGGAPRHVMGGAGGRAFGGQLTSAVGAQGNGSSAPLSLQADAPAFTPGQTVVPRAPATHNHPPPNIGRQRRFSKSQAADIATRTHEDILHGLYECPICTSEVLKNSKVWSCKTCWTVFHLSCIKKWARNEGSTQQNRQQLQDGELPPARQWRCPGCNLPKDDMPESYTCWCAKDVDPKAIPGLPPHSCGQTCGKARAPRNCPHPCDLMCHAGPCPPCPHMGPIQACFCGKEEVSKRCIDTHYESGWSCGKICGDIMPCGEHECEKGCHEGLCGSCEVLVESRCYCGKVEKMVPCSDRGDQKDSSVVKEDNEVDSWTGSFECGDVCKRAYDCGRHFCEKGCHEQTTDVPHCPLSPDVITHCPCGKSTLEDLDCTRTSCEEPIPHCQKLCLRQLACGHECQQKCHEGECMACLKTVPIICRCGRTTSSTICHQGMEDLPQCMRVCKTALNCGRHECGDRCCPGEKPAAERIAAKRKQKVSRGTTEDFEAEHICTRNYATVEHAAPVGKPYLTRSPATAAGLYSTHRFHAARNHLPVHTNATGAQRVATLQSTINATAMESPAPSAHTSCKRPACAARKSLKINRAGPPRSPVGRLAGIAFVVAFTPAKSLAIGRATARMLCSPSAPMFAVRPRPHQVAATFALSPVTHHTHAKKKSREVRCLATKSAPVTERKVLACDDECLRLQRNAKLAAALNIPADHTDDHIPYSTATLDFFKGSPKWCQTQEREFRVFAADTTAKQFRFKPMSAAQRAFLHSLAEDFALDTESVDPEPHRHVVLFKAPRFASAPMKTLSQCLKLRPVADAPKNAPASTGVPFNALLLANPRFALTLDELRAAVAFDPATAQIAGWKIEFLPSEEIVVHASLADGVDEATLLRLKPAVTKVVLEKELAGAVALCAVDSSLNVARREDTGSGGGWSQVVKGAPVKKRVVDEWASSGKNSFTVLGSKAMGKKKEKEKGKERERQESVVDNWEDAAGAWEESTDGATSVAVAAVVDGGEAAGAGVAEDAPAPPAAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.4
3 0.45
4 0.53
5 0.59
6 0.67
7 0.74
8 0.77
9 0.81
10 0.89
11 0.89
12 0.9
13 0.9
14 0.89
15 0.87
16 0.85
17 0.78
18 0.69
19 0.61
20 0.5
21 0.4
22 0.3
23 0.22
24 0.13
25 0.09
26 0.07
27 0.1
28 0.12
29 0.14
30 0.15
31 0.18
32 0.19
33 0.25
34 0.27
35 0.31
36 0.31
37 0.31
38 0.35
39 0.36
40 0.36
41 0.31
42 0.31
43 0.25
44 0.24
45 0.23
46 0.18
47 0.16
48 0.17
49 0.19
50 0.2
51 0.19
52 0.26
53 0.27
54 0.28
55 0.28
56 0.28
57 0.3
58 0.34
59 0.4
60 0.42
61 0.47
62 0.5
63 0.56
64 0.58
65 0.61
66 0.62
67 0.65
68 0.67
69 0.68
70 0.72
71 0.72
72 0.7
73 0.65
74 0.6
75 0.61
76 0.59
77 0.59
78 0.55
79 0.52
80 0.53
81 0.59
82 0.6
83 0.6
84 0.54
85 0.47
86 0.44
87 0.4
88 0.34
89 0.28
90 0.27
91 0.19
92 0.16
93 0.15
94 0.13
95 0.13
96 0.12
97 0.11
98 0.07
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.06
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.07
115 0.09
116 0.1
117 0.1
118 0.11
119 0.12
120 0.13
121 0.13
122 0.13
123 0.12
124 0.11
125 0.1
126 0.11
127 0.09
128 0.13
129 0.13
130 0.15
131 0.15
132 0.2
133 0.21
134 0.22
135 0.25
136 0.28
137 0.35
138 0.43
139 0.5
140 0.51
141 0.52
142 0.54
143 0.55
144 0.59
145 0.6
146 0.59
147 0.59
148 0.62
149 0.69
150 0.72
151 0.74
152 0.68
153 0.69
154 0.64
155 0.63
156 0.61
157 0.56
158 0.51
159 0.47
160 0.46
161 0.36
162 0.33
163 0.26
164 0.21
165 0.18
166 0.17
167 0.17
168 0.15
169 0.15
170 0.14
171 0.13
172 0.15
173 0.15
174 0.14
175 0.13
176 0.12
177 0.11
178 0.11
179 0.14
180 0.17
181 0.24
182 0.29
183 0.29
184 0.31
185 0.34
186 0.38
187 0.4
188 0.4
189 0.36
190 0.37
191 0.42
192 0.45
193 0.44
194 0.41
195 0.44
196 0.49
197 0.45
198 0.48
199 0.49
200 0.46
201 0.44
202 0.5
203 0.47
204 0.43
205 0.45
206 0.48
207 0.47
208 0.48
209 0.54
210 0.54
211 0.6
212 0.62
213 0.64
214 0.6
215 0.6
216 0.58
217 0.53
218 0.52
219 0.43
220 0.4
221 0.42
222 0.37
223 0.36
224 0.36
225 0.35
226 0.3
227 0.37
228 0.34
229 0.29
230 0.33
231 0.36
232 0.39
233 0.45
234 0.53
235 0.54
236 0.6
237 0.62
238 0.61
239 0.56
240 0.56
241 0.52
242 0.44
243 0.38
244 0.32
245 0.3
246 0.27
247 0.27
248 0.22
249 0.21
250 0.2
251 0.2
252 0.22
253 0.29
254 0.31
255 0.36
256 0.37
257 0.36
258 0.38
259 0.37
260 0.34
261 0.27
262 0.29
263 0.22
264 0.24
265 0.25
266 0.27
267 0.24
268 0.27
269 0.29
270 0.32
271 0.33
272 0.35
273 0.41
274 0.44
275 0.51
276 0.58
277 0.59
278 0.58
279 0.65
280 0.68
281 0.65
282 0.62
283 0.62
284 0.54
285 0.53
286 0.49
287 0.46
288 0.38
289 0.35
290 0.31
291 0.28
292 0.28
293 0.24
294 0.24
295 0.19
296 0.2
297 0.2
298 0.23
299 0.25
300 0.31
301 0.32
302 0.32
303 0.34
304 0.34
305 0.33
306 0.3
307 0.26
308 0.21
309 0.18
310 0.23
311 0.27
312 0.3
313 0.33
314 0.35
315 0.34
316 0.35
317 0.37
318 0.34
319 0.33
320 0.33
321 0.31
322 0.32
323 0.31
324 0.31
325 0.32
326 0.27
327 0.22
328 0.18
329 0.16
330 0.13
331 0.14
332 0.15
333 0.14
334 0.15
335 0.16
336 0.15
337 0.15
338 0.16
339 0.17
340 0.13
341 0.12
342 0.13
343 0.14
344 0.14
345 0.17
346 0.16
347 0.15
348 0.15
349 0.17
350 0.15
351 0.15
352 0.14
353 0.12
354 0.11
355 0.11
356 0.11
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.12
362 0.12
363 0.13
364 0.13
365 0.15
366 0.17
367 0.21
368 0.28
369 0.31
370 0.35
371 0.39
372 0.4
373 0.38
374 0.39
375 0.36
376 0.36
377 0.35
378 0.35
379 0.3
380 0.3
381 0.34
382 0.32
383 0.3
384 0.28
385 0.25
386 0.2
387 0.23
388 0.24
389 0.19
390 0.19
391 0.17
392 0.13
393 0.13
394 0.12
395 0.09
396 0.08
397 0.06
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.06
402 0.08
403 0.09
404 0.1
405 0.12
406 0.12
407 0.16
408 0.2
409 0.26
410 0.3
411 0.37
412 0.42
413 0.43
414 0.43
415 0.42
416 0.46
417 0.4
418 0.44
419 0.4
420 0.36
421 0.34
422 0.35
423 0.34
424 0.35
425 0.35
426 0.27
427 0.23
428 0.22
429 0.21
430 0.21
431 0.19
432 0.12
433 0.1
434 0.1
435 0.12
436 0.18
437 0.19
438 0.2
439 0.22
440 0.2
441 0.2
442 0.22
443 0.19
444 0.17
445 0.18
446 0.22
447 0.21
448 0.22
449 0.23
450 0.24
451 0.24
452 0.22
453 0.2
454 0.15
455 0.15
456 0.15
457 0.16
458 0.16
459 0.18
460 0.28
461 0.33
462 0.33
463 0.32
464 0.33
465 0.34
466 0.37
467 0.41
468 0.39
469 0.33
470 0.37
471 0.41
472 0.45
473 0.43
474 0.38
475 0.35
476 0.34
477 0.34
478 0.32
479 0.31
480 0.3
481 0.29
482 0.28
483 0.26
484 0.2
485 0.2
486 0.2
487 0.2
488 0.15
489 0.15
490 0.13
491 0.11
492 0.13
493 0.14
494 0.14
495 0.13
496 0.18
497 0.19
498 0.23
499 0.24
500 0.24
501 0.24
502 0.26
503 0.27
504 0.26
505 0.29
506 0.28
507 0.3
508 0.28
509 0.26
510 0.21
511 0.2
512 0.16
513 0.16
514 0.14
515 0.12
516 0.12
517 0.14
518 0.14
519 0.14
520 0.14
521 0.11
522 0.11
523 0.14
524 0.15
525 0.22
526 0.28
527 0.31
528 0.32
529 0.34
530 0.34
531 0.32
532 0.34
533 0.27
534 0.25
535 0.26
536 0.25
537 0.25
538 0.25
539 0.24
540 0.24
541 0.28
542 0.24
543 0.24
544 0.28
545 0.27
546 0.27
547 0.28
548 0.31
549 0.35
550 0.4
551 0.39
552 0.41
553 0.47
554 0.53
555 0.57
556 0.61
557 0.57
558 0.6
559 0.63
560 0.59
561 0.52
562 0.47
563 0.4
564 0.31
565 0.25
566 0.18
567 0.11
568 0.11
569 0.11
570 0.09
571 0.09
572 0.09
573 0.11
574 0.1
575 0.1
576 0.1
577 0.13
578 0.13
579 0.13
580 0.14
581 0.12
582 0.11
583 0.11
584 0.1
585 0.07
586 0.07
587 0.1
588 0.15
589 0.18
590 0.18
591 0.18
592 0.2
593 0.22
594 0.23
595 0.2
596 0.13
597 0.12
598 0.12
599 0.12
600 0.11
601 0.1
602 0.09
603 0.11
604 0.12
605 0.12
606 0.2
607 0.28
608 0.31
609 0.35
610 0.37
611 0.36
612 0.37
613 0.36
614 0.33
615 0.26
616 0.21
617 0.19
618 0.19
619 0.19
620 0.17
621 0.17
622 0.11
623 0.1
624 0.11
625 0.09
626 0.07
627 0.07
628 0.08
629 0.09
630 0.09
631 0.09
632 0.08
633 0.07
634 0.07
635 0.08
636 0.07
637 0.05
638 0.06
639 0.06
640 0.07
641 0.07
642 0.08
643 0.13
644 0.19
645 0.22
646 0.29
647 0.33
648 0.33
649 0.36
650 0.44
651 0.46
652 0.47
653 0.52
654 0.52
655 0.54
656 0.6
657 0.63
658 0.61
659 0.6
660 0.58
661 0.57
662 0.61
663 0.57
664 0.52
665 0.49
666 0.48
667 0.43
668 0.39
669 0.33
670 0.27
671 0.26
672 0.24
673 0.21
674 0.16
675 0.14
676 0.12
677 0.1
678 0.06
679 0.05
680 0.05
681 0.04
682 0.03
683 0.04
684 0.05
685 0.05
686 0.05
687 0.05
688 0.08
689 0.09
690 0.1
691 0.1
692 0.13
693 0.13
694 0.14
695 0.15
696 0.13
697 0.14
698 0.13
699 0.13
700 0.12
701 0.12
702 0.14
703 0.13
704 0.12
705 0.13
706 0.17
707 0.25
708 0.26
709 0.31
710 0.34
711 0.36
712 0.37
713 0.37
714 0.34
715 0.29
716 0.29
717 0.26
718 0.21
719 0.18
720 0.18
721 0.15
722 0.15
723 0.14
724 0.16
725 0.16
726 0.19
727 0.25
728 0.33
729 0.42
730 0.51
731 0.53
732 0.59
733 0.67
734 0.73
735 0.76
736 0.73
737 0.73
738 0.73
739 0.7
740 0.63
741 0.57
742 0.51
743 0.43
744 0.43
745 0.37
746 0.31
747 0.32
748 0.32
749 0.32
750 0.3
751 0.3
752 0.25
753 0.25
754 0.23
755 0.21
756 0.2
757 0.19
758 0.19
759 0.2
760 0.22
761 0.23
762 0.26
763 0.27
764 0.3
765 0.3
766 0.29
767 0.3
768 0.28
769 0.26
770 0.24
771 0.21
772 0.16
773 0.14
774 0.14
775 0.11
776 0.11
777 0.09
778 0.1
779 0.11
780 0.11
781 0.12
782 0.13
783 0.13
784 0.11
785 0.12
786 0.11
787 0.09
788 0.1
789 0.1
790 0.1
791 0.11
792 0.11
793 0.14
794 0.16
795 0.18
796 0.24
797 0.27
798 0.31
799 0.36
800 0.44
801 0.47
802 0.55
803 0.62
804 0.63
805 0.62
806 0.57
807 0.53
808 0.48
809 0.41
810 0.3
811 0.27
812 0.21
813 0.18
814 0.23
815 0.27
816 0.24
817 0.26
818 0.28
819 0.3
820 0.35
821 0.35
822 0.37
823 0.4
824 0.49
825 0.54
826 0.53
827 0.48
828 0.45
829 0.47
830 0.41
831 0.34
832 0.24
833 0.17
834 0.16
835 0.14
836 0.11
837 0.08
838 0.07
839 0.07
840 0.07
841 0.07
842 0.07
843 0.07
844 0.07
845 0.08
846 0.08
847 0.09
848 0.1
849 0.14
850 0.15
851 0.15
852 0.15
853 0.16
854 0.2
855 0.29
856 0.35
857 0.33
858 0.39
859 0.38
860 0.4
861 0.41
862 0.4
863 0.39
864 0.34
865 0.36
866 0.3
867 0.33
868 0.32
869 0.34
870 0.35
871 0.34
872 0.33
873 0.33
874 0.39
875 0.39
876 0.4
877 0.38
878 0.41
879 0.43
880 0.45
881 0.48
882 0.44
883 0.48
884 0.49
885 0.45
886 0.39
887 0.32
888 0.29
889 0.24
890 0.24
891 0.16
892 0.16
893 0.16
894 0.16
895 0.16
896 0.13
897 0.12
898 0.14
899 0.15
900 0.14
901 0.15
902 0.15
903 0.13
904 0.13
905 0.16
906 0.15
907 0.18
908 0.19
909 0.2
910 0.2
911 0.19
912 0.19
913 0.16
914 0.13
915 0.09
916 0.07
917 0.06
918 0.07
919 0.08
920 0.09
921 0.09
922 0.08
923 0.09
924 0.11
925 0.12
926 0.11
927 0.12
928 0.1
929 0.13
930 0.14
931 0.14
932 0.17
933 0.16
934 0.17
935 0.17
936 0.17
937 0.15
938 0.15
939 0.11
940 0.07
941 0.07
942 0.06
943 0.06
944 0.05
945 0.04
946 0.04
947 0.04
948 0.04
949 0.04
950 0.05
951 0.07
952 0.07
953 0.08
954 0.09
955 0.1
956 0.15
957 0.18
958 0.22
959 0.21
960 0.25
961 0.29
962 0.35
963 0.36
964 0.31
965 0.28
966 0.24
967 0.23
968 0.2
969 0.15
970 0.08
971 0.07
972 0.08
973 0.07
974 0.05
975 0.05
976 0.05
977 0.05
978 0.05
979 0.09
980 0.13
981 0.18
982 0.19
983 0.2
984 0.22
985 0.23
986 0.27
987 0.24
988 0.21
989 0.18
990 0.18
991 0.19
992 0.18
993 0.16
994 0.13
995 0.13
996 0.1
997 0.12
998 0.11
999 0.12
1000 0.18
1001 0.25
1002 0.31
1003 0.39
1004 0.43
1005 0.44
1006 0.48
1007 0.48
1008 0.5
1009 0.47
1010 0.44
1011 0.43
1012 0.46
1013 0.43
1014 0.39
1015 0.38
1016 0.31
1017 0.27
1018 0.24
1019 0.19
1020 0.14
1021 0.16
1022 0.18
1023 0.19
1024 0.2
1025 0.24
1026 0.3
1027 0.36
1028 0.42
1029 0.45
1030 0.53
1031 0.6
1032 0.69
1033 0.74
1034 0.77
1035 0.81
1036 0.84
1037 0.88
1038 0.88
1039 0.85
1040 0.86
1041 0.82
1042 0.75
1043 0.69
1044 0.65
1045 0.57
1046 0.57
1047 0.5
1048 0.4
1049 0.35
1050 0.31
1051 0.26
1052 0.19
1053 0.18
1054 0.1
1055 0.09
1056 0.09
1057 0.08
1058 0.08
1059 0.09
1060 0.1
1061 0.07
1062 0.06
1063 0.06
1064 0.06
1065 0.06
1066 0.06
1067 0.06
1068 0.05
1069 0.05
1070 0.04
1071 0.04
1072 0.04
1073 0.04
1074 0.03
1075 0.03
1076 0.03
1077 0.03
1078 0.03
1079 0.03
1080 0.03
1081 0.03
1082 0.03
1083 0.03
1084 0.04
1085 0.04
1086 0.05
1087 0.06