FuNGI

C4JT36

Protein Details

Accession

C4JT36

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
88-115	ETDPPSKKSKRASAKPTKPTKPLKVPVE	Hydrophilic
268-292	QIPDSKQVKRKMKKAKKNHTDEPEE	Basic
525-551	KDSQAEAKGNKKDKKPKTKTSVAVAED	Hydrophilic
565-602	GSTATERKSKDPKVKEAKGKPEKVESGEKPKKKKKSKA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
93-154	SKKSKRASAKPTKPTKPLKVPVEAQPKTAPKDKKPKGVTNGETPKPLKLDSAPAREIKPRKR
188-191	AKKK
217-221	AKKPK
275-284	VKRKMKKAKK
384-388	RFKKV
394-422	EKKQLEAPRTRAQWSKKIGKEESKRLAKV
475-495	MEKPSKQKGPKDLSTKSTKGK
532-543	KGNKKDKKPKTK
561-602	PKVKGSTATERKSKDPKVKEAKGKPEKVESGEKPKKKKKSKA

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_nucl 9.833, mito_nucl 9.833, mito 3.5, cyto 3.5, E.R. 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	ure:UREG_05625 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12307 RRM_NIFK_like

Amino Acid Sequences

MSEVASHVCDRSNLMFAEEKLTLYSSAAASQDSISAESSHISACVKGLSFLLLFRLPMVHALMFSCEVQGGGEQQMELPAASSSSAVETDPPSKKSKRASAKPTKPTKPLKVPVEAQPKTAPKDKKPKGVTNGETPKPLKLDSAPAREIKPRKRAADFLSDDEDSTPKDRESVAKGSKQATTEPVKPAKKKAKEDVTPNSENDSSKHSEVKETKEPAKKPKKQTEAPVEEEDESEDEQILDLIKGFESSGDEDASEDEGFEPGQNVPQIPDSKQVKRKMKKAKKNHTDEPEEPGTVYVGRIPHGFYEHEMRAYFSQFGEIKYLRLARNRTTGRSRHHGFIQFASESVAKIVADTMNNYLMFGHILKCRVMENPHPQIWKGANRRFKKVPWNQIEKKQLEAPRTRAQWSKKIGKEESKRLAKVEKLKAIGYELDLPTLTSVDDIPVQKTLAEAEQNAIDNDTTEAPKAIEAPAKGMEKPSKQKGPKDLSTKSTKGKRSANTDDALKPEKTKESTSTSTKTKMIDSKDSQAEAKGNKKDKKPKTKTSVAVAEDIEKLPQAAGPKVKGSTATERKSKDPKVKEAKGKPEKVESGEKPKKKKKSKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.26
3	0.25
4	0.29
5	0.26
6	0.24
7	0.2
8	0.21
9	0.19
10	0.15
11	0.17
12	0.12
13	0.14
14	0.14
15	0.14
16	0.13
17	0.13
18	0.14
19	0.13
20	0.13
21	0.12
22	0.12
23	0.12
24	0.12
25	0.13
26	0.11
27	0.11
28	0.11
29	0.1
30	0.1
31	0.12
32	0.12
33	0.12
34	0.12
35	0.13
36	0.13
37	0.13
38	0.16
39	0.14
40	0.14
41	0.13
42	0.14
43	0.12
44	0.13
45	0.16
46	0.12
47	0.12
48	0.12
49	0.14
50	0.14
51	0.14
52	0.13
53	0.1
54	0.1
55	0.09
56	0.1
57	0.1
58	0.1
59	0.1
60	0.09
61	0.1
62	0.11
63	0.11
64	0.1
65	0.08
66	0.07
67	0.06
68	0.07
69	0.07
70	0.06
71	0.07
72	0.08
73	0.07
74	0.09
75	0.12
76	0.2
77	0.24
78	0.27
79	0.33
80	0.36
81	0.42
82	0.49
83	0.56
84	0.59
85	0.65
86	0.73
87	0.77
88	0.84
89	0.88
90	0.9
91	0.87
92	0.86
93	0.85
94	0.84
95	0.83
96	0.82
97	0.78
98	0.74
99	0.71
100	0.71
101	0.72
102	0.63
103	0.56
104	0.53
105	0.52
106	0.5
107	0.54
108	0.52
109	0.5
110	0.61
111	0.65
112	0.68
113	0.71
114	0.75
115	0.76
116	0.79
117	0.74
118	0.73
119	0.75
120	0.67
121	0.65
122	0.57
123	0.51
124	0.43
125	0.39
126	0.31
127	0.24
128	0.32
129	0.33
130	0.39
131	0.4
132	0.4
133	0.42
134	0.48
135	0.54
136	0.53
137	0.55
138	0.56
139	0.58
140	0.6
141	0.63
142	0.6
143	0.62
144	0.56
145	0.5
146	0.47
147	0.41
148	0.37
149	0.32
150	0.28
151	0.19
152	0.18
153	0.16
154	0.12
155	0.13
156	0.13
157	0.16
158	0.21
159	0.29
160	0.32
161	0.35
162	0.39
163	0.4
164	0.41
165	0.39
166	0.35
167	0.32
168	0.32
169	0.32
170	0.36
171	0.42
172	0.46
173	0.48
174	0.56
175	0.6
176	0.63
177	0.66
178	0.68
179	0.7
180	0.69
181	0.74
182	0.74
183	0.72
184	0.66
185	0.6
186	0.54
187	0.46
188	0.4
189	0.33
190	0.29
191	0.25
192	0.23
193	0.26
194	0.23
195	0.29
196	0.32
197	0.38
198	0.4
199	0.41
200	0.48
201	0.52
202	0.56
203	0.59
204	0.66
205	0.68
206	0.71
207	0.76
208	0.77
209	0.75
210	0.8
211	0.8
212	0.75
213	0.72
214	0.64
215	0.56
216	0.47
217	0.41
218	0.33
219	0.23
220	0.16
221	0.11
222	0.09
223	0.06
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.07
236	0.08
237	0.08
238	0.08
239	0.08
240	0.08
241	0.09
242	0.08
243	0.07
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.05
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.08
254	0.11
255	0.13
256	0.13
257	0.22
258	0.25
259	0.32
260	0.39
261	0.47
262	0.54
263	0.59
264	0.67
265	0.7
266	0.76
267	0.79
268	0.83
269	0.85
270	0.85
271	0.87
272	0.86
273	0.82
274	0.78
275	0.69
276	0.65
277	0.55
278	0.45
279	0.37
280	0.28
281	0.21
282	0.14
283	0.12
284	0.08
285	0.06
286	0.07
287	0.08
288	0.08
289	0.08
290	0.1
291	0.1
292	0.09
293	0.14
294	0.14
295	0.15
296	0.15
297	0.16
298	0.15
299	0.16
300	0.15
301	0.1
302	0.13
303	0.13
304	0.13
305	0.16
306	0.15
307	0.14
308	0.16
309	0.2
310	0.19
311	0.23
312	0.26
313	0.25
314	0.34
315	0.36
316	0.38
317	0.41
318	0.45
319	0.45
320	0.51
321	0.51
322	0.45
323	0.47
324	0.48
325	0.42
326	0.38
327	0.36
328	0.27
329	0.24
330	0.23
331	0.18
332	0.13
333	0.11
334	0.1
335	0.06
336	0.06
337	0.07
338	0.06
339	0.06
340	0.07
341	0.08
342	0.1
343	0.1
344	0.1
345	0.09
346	0.08
347	0.09
348	0.08
349	0.1
350	0.1
351	0.11
352	0.11
353	0.12
354	0.13
355	0.15
356	0.18
357	0.23
358	0.3
359	0.35
360	0.39
361	0.4
362	0.39
363	0.4
364	0.4
365	0.42
366	0.42
367	0.43
368	0.49
369	0.52
370	0.58
371	0.59
372	0.59
373	0.61
374	0.61
375	0.64
376	0.64
377	0.71
378	0.7
379	0.74
380	0.79
381	0.69
382	0.63
383	0.59
384	0.53
385	0.5
386	0.5
387	0.48
388	0.46
389	0.48
390	0.48
391	0.48
392	0.49
393	0.5
394	0.53
395	0.56
396	0.53
397	0.58
398	0.6
399	0.63
400	0.66
401	0.68
402	0.69
403	0.67
404	0.64
405	0.59
406	0.58
407	0.54
408	0.56
409	0.54
410	0.5
411	0.45
412	0.44
413	0.42
414	0.39
415	0.34
416	0.26
417	0.24
418	0.18
419	0.17
420	0.16
421	0.16
422	0.14
423	0.13
424	0.11
425	0.05
426	0.05
427	0.06
428	0.1
429	0.11
430	0.12
431	0.12
432	0.13
433	0.12
434	0.12
435	0.13
436	0.11
437	0.12
438	0.11
439	0.11
440	0.13
441	0.14
442	0.14
443	0.13
444	0.11
445	0.1
446	0.11
447	0.12
448	0.1
449	0.1
450	0.1
451	0.1
452	0.1
453	0.11
454	0.12
455	0.13
456	0.13
457	0.15
458	0.2
459	0.22
460	0.22
461	0.26
462	0.31
463	0.35
464	0.43
465	0.49
466	0.54
467	0.58
468	0.65
469	0.7
470	0.72
471	0.72
472	0.73
473	0.69
474	0.67
475	0.69
476	0.67
477	0.66
478	0.66
479	0.64
480	0.64
481	0.66
482	0.66
483	0.67
484	0.7
485	0.67
486	0.62
487	0.6
488	0.55
489	0.52
490	0.5
491	0.42
492	0.36
493	0.34
494	0.37
495	0.36
496	0.37
497	0.37
498	0.4
499	0.45
500	0.49
501	0.51
502	0.49
503	0.5
504	0.49
505	0.46
506	0.44
507	0.44
508	0.44
509	0.48
510	0.47
511	0.51
512	0.53
513	0.53
514	0.47
515	0.44
516	0.43
517	0.4
518	0.44
519	0.44
520	0.49
521	0.55
522	0.64
523	0.72
524	0.77
525	0.82
526	0.84
527	0.86
528	0.86
529	0.88
530	0.85
531	0.83
532	0.81
533	0.72
534	0.66
535	0.56
536	0.49
537	0.42
538	0.36
539	0.27
540	0.19
541	0.16
542	0.12
543	0.13
544	0.14
545	0.17
546	0.22
547	0.24
548	0.28
549	0.29
550	0.3
551	0.31
552	0.34
553	0.39
554	0.44
555	0.48
556	0.52
557	0.54
558	0.61
559	0.68
560	0.72
561	0.71
562	0.7
563	0.74
564	0.77
565	0.83
566	0.86
567	0.86
568	0.88
569	0.88
570	0.87
571	0.82
572	0.8
573	0.75
574	0.7
575	0.71
576	0.67
577	0.68
578	0.7
579	0.73
580	0.75
581	0.79
582	0.84

C4JT36

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer