Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JNZ3

Protein Details
Accession C4JNZ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
368-391NDKPTTAAKDKGKKKKAKAGSLSQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
369-386DKPTTAAKDKGKKKKAKA
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG ure:UREG_03052  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MADIKPYQPPAGSGPWAYPTVHSRLLEMEPSPDVALEEITWHSPHHIQMMGGFIHSNNILFYFAESPFFDPTSNNASLALQAMHNENFRPFIETREAFEGRLKTMQGLEFIVARDPLLEVAAANTAAVARGEQPKEASNVWVIRKQMRRRGIGGQDDVQILATYFVVGDSVFMAPSVWSVVGRRMLSTVTSLTKVLSTASPLLTFSPSYGTATAHTSQKSLEPSQPGQQSTQQSKETTPLPDLQQTPGDKTASKSSFTSTSTSAALNASALQDARNFAETLNLLARYGDEYIDETPLVGEPGSFIFTKTAAPAQEQLSVTAREHAPRQNIQSVAGTPAPPGPGRPGTPSSRSVNMQSDALKGKVEKHNDKPTTAAKDKGKKKKAKAGSLSQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.28
3 0.29
4 0.28
5 0.26
6 0.25
7 0.28
8 0.33
9 0.31
10 0.28
11 0.3
12 0.32
13 0.32
14 0.28
15 0.25
16 0.2
17 0.22
18 0.2
19 0.17
20 0.14
21 0.11
22 0.11
23 0.08
24 0.1
25 0.1
26 0.11
27 0.12
28 0.12
29 0.15
30 0.16
31 0.18
32 0.2
33 0.2
34 0.18
35 0.19
36 0.22
37 0.2
38 0.17
39 0.16
40 0.12
41 0.13
42 0.13
43 0.12
44 0.08
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.11
49 0.12
50 0.12
51 0.14
52 0.15
53 0.16
54 0.17
55 0.18
56 0.17
57 0.14
58 0.18
59 0.22
60 0.22
61 0.2
62 0.19
63 0.18
64 0.18
65 0.19
66 0.16
67 0.09
68 0.1
69 0.13
70 0.14
71 0.15
72 0.15
73 0.15
74 0.16
75 0.16
76 0.2
77 0.18
78 0.2
79 0.27
80 0.27
81 0.29
82 0.34
83 0.34
84 0.3
85 0.34
86 0.32
87 0.26
88 0.27
89 0.24
90 0.18
91 0.2
92 0.2
93 0.17
94 0.16
95 0.14
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.1
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.06
105 0.05
106 0.04
107 0.05
108 0.06
109 0.05
110 0.05
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.07
117 0.13
118 0.14
119 0.15
120 0.16
121 0.18
122 0.2
123 0.2
124 0.19
125 0.17
126 0.21
127 0.22
128 0.24
129 0.24
130 0.29
131 0.37
132 0.43
133 0.48
134 0.5
135 0.51
136 0.52
137 0.57
138 0.57
139 0.54
140 0.5
141 0.44
142 0.38
143 0.35
144 0.31
145 0.23
146 0.16
147 0.11
148 0.08
149 0.06
150 0.04
151 0.04
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.07
168 0.11
169 0.11
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.13
175 0.12
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.12
200 0.14
201 0.15
202 0.15
203 0.14
204 0.14
205 0.17
206 0.19
207 0.19
208 0.2
209 0.21
210 0.23
211 0.29
212 0.32
213 0.3
214 0.28
215 0.32
216 0.34
217 0.34
218 0.37
219 0.34
220 0.31
221 0.31
222 0.32
223 0.3
224 0.25
225 0.23
226 0.22
227 0.21
228 0.25
229 0.25
230 0.24
231 0.26
232 0.25
233 0.26
234 0.25
235 0.25
236 0.2
237 0.21
238 0.28
239 0.25
240 0.26
241 0.24
242 0.24
243 0.26
244 0.27
245 0.27
246 0.2
247 0.2
248 0.19
249 0.18
250 0.17
251 0.13
252 0.12
253 0.09
254 0.09
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.09
261 0.1
262 0.11
263 0.1
264 0.09
265 0.13
266 0.12
267 0.13
268 0.15
269 0.14
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.11
274 0.11
275 0.09
276 0.07
277 0.09
278 0.1
279 0.11
280 0.1
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.09
293 0.09
294 0.1
295 0.11
296 0.14
297 0.13
298 0.15
299 0.18
300 0.19
301 0.24
302 0.24
303 0.25
304 0.25
305 0.25
306 0.24
307 0.26
308 0.25
309 0.22
310 0.26
311 0.29
312 0.33
313 0.36
314 0.41
315 0.42
316 0.41
317 0.4
318 0.39
319 0.34
320 0.32
321 0.29
322 0.24
323 0.19
324 0.2
325 0.21
326 0.18
327 0.18
328 0.2
329 0.23
330 0.25
331 0.3
332 0.33
333 0.37
334 0.41
335 0.46
336 0.44
337 0.45
338 0.45
339 0.45
340 0.45
341 0.41
342 0.39
343 0.35
344 0.35
345 0.34
346 0.32
347 0.29
348 0.25
349 0.31
350 0.35
351 0.44
352 0.48
353 0.54
354 0.64
355 0.65
356 0.65
357 0.63
358 0.63
359 0.64
360 0.59
361 0.58
362 0.56
363 0.63
364 0.72
365 0.77
366 0.8
367 0.8
368 0.85
369 0.87
370 0.88
371 0.88