FuNGI

C4JMB0

Protein Details

Accession

C4JMB0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
223-246	RYPSEPSPRRSHLRRRREPSVEHP	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006595 CTLH_C IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
KEGG	ure:UREG_03968 -
Pfam	View protein in Pfam PF11715 Nup160 PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50897 CTLH PS00678 WD_REPEATS_1 PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION
CDD	cd00200 WD40

Amino Acid Sequences

MAGGERAFIPLGVFPSPPFTVEENFLMALGNLPSFCGNAFVEPGNAACLCTGWSLGLVGQKSLKQKPVMHAVHTCHSNQVTRSTRSADEQLLANHKGFRVCELCEDGQAVAGDAYLESCQLPQSPLPDPNPRPDKPIQLVLRRTRLKGSQNLRPGRRSFSQSTCLSWTWPLRSCLQLSVSIQLSPGISAFLSDTRTSSVLDVSAPTDQSSRRYPATDLLGLLRYPSEPSPRRSHLRRRREPSVEHPNIPESSSGSSGLGNSEGRRISQEQTSNHGQSEHPLSKRRRLADGNMKPDGATSTSSANGFSPISNGTGGTPLRKAISNSLNGQSSNSSSQAPSQTNGSTAMSTSPTYYGHDREEVTRILIQSLYDLGYPDAAVTLSRESKYELESPAVAAFRTSVLEGRWFDAESILINSFLEHEAEGKYAFKQPQHDGLVLAEDADKNEMLFCLRQQKFLELLDQRDFASALMVLRQELTPLNHDIGRLHSLSSLLMCPPENLRIQAGLEDSITNSRRNLLAQLSRYISPSVMIPEHRLATLLHQVKQTQINHCLYHNTAITPSLYCDHMCDRSRFPKHPTLELSQHTDEVWYLEFSHDGTKLATASRDRSVIIYDVRTFSVIHKLSNHDGPVAFAAWSPDDTKLISCSQDYKARVWNVETGRCSLTIDHHHEPVTSAAWAPDGKTFVTCSLDNQSQLCLWNVRGDALHRWPGAARIRDCAISADGKRLVAISADKSIHVYNFQTREEEYSMLLKLDVTCINISRDSKYMLVNMSQGEVQLLDLETAEVVRHYSGQKQGQYIIRSTFGGAAENFVVSGSEDSKVYIWHKENCKLVETLEGHSKGCVNAVAWNPKDPEMFASAGDDRKVKIWTNGQIETSSKSHVSSNGSAHSSAIGLTLSRSSSTR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.19
3	0.19
4	0.19
5	0.21
6	0.21
7	0.22
8	0.25
9	0.27
10	0.23
11	0.23
12	0.21
13	0.18
14	0.15
15	0.14
16	0.11
17	0.11
18	0.08
19	0.09
20	0.1
21	0.1
22	0.1
23	0.11
24	0.11
25	0.12
26	0.14
27	0.14
28	0.14
29	0.15
30	0.15
31	0.14
32	0.14
33	0.13
34	0.1
35	0.1
36	0.1
37	0.1
38	0.1
39	0.08
40	0.08
41	0.08
42	0.1
43	0.15
44	0.14
45	0.15
46	0.17
47	0.21
48	0.28
49	0.33
50	0.38
51	0.4
52	0.45
53	0.5
54	0.58
55	0.58
56	0.56
57	0.57
58	0.55
59	0.54
60	0.52
61	0.46
62	0.41
63	0.4
64	0.4
65	0.35
66	0.4
67	0.41
68	0.42
69	0.45
70	0.44
71	0.43
72	0.43
73	0.46
74	0.38
75	0.33
76	0.32
77	0.33
78	0.34
79	0.34
80	0.31
81	0.28
82	0.28
83	0.28
84	0.26
85	0.27
86	0.24
87	0.24
88	0.27
89	0.31
90	0.3
91	0.28
92	0.29
93	0.23
94	0.23
95	0.21
96	0.17
97	0.1
98	0.09
99	0.08
100	0.07
101	0.08
102	0.05
103	0.06
104	0.05
105	0.06
106	0.07
107	0.08
108	0.11
109	0.12
110	0.16
111	0.2
112	0.26
113	0.31
114	0.4
115	0.42
116	0.5
117	0.57
118	0.54
119	0.56
120	0.54
121	0.58
122	0.53
123	0.59
124	0.57
125	0.57
126	0.65
127	0.66
128	0.72
129	0.67
130	0.65
131	0.61
132	0.6
133	0.59
134	0.6
135	0.58
136	0.57
137	0.63
138	0.7
139	0.7
140	0.7
141	0.65
142	0.62
143	0.61
144	0.59
145	0.56
146	0.52
147	0.55
148	0.49
149	0.5
150	0.48
151	0.44
152	0.38
153	0.37
154	0.36
155	0.33
156	0.37
157	0.36
158	0.34
159	0.37
160	0.37
161	0.35
162	0.32
163	0.31
164	0.27
165	0.28
166	0.26
167	0.23
168	0.21
169	0.19
170	0.17
171	0.12
172	0.11
173	0.08
174	0.06
175	0.06
176	0.07
177	0.08
178	0.11
179	0.11
180	0.11
181	0.13
182	0.14
183	0.14
184	0.14
185	0.13
186	0.11
187	0.11
188	0.11
189	0.1
190	0.11
191	0.11
192	0.11
193	0.13
194	0.13
195	0.17
196	0.21
197	0.24
198	0.24
199	0.26
200	0.26
201	0.29
202	0.34
203	0.31
204	0.27
205	0.25
206	0.25
207	0.22
208	0.21
209	0.17
210	0.12
211	0.12
212	0.14
213	0.21
214	0.24
215	0.3
216	0.38
217	0.44
218	0.52
219	0.59
220	0.67
221	0.68
222	0.75
223	0.8
224	0.81
225	0.84
226	0.83
227	0.8
228	0.79
229	0.79
230	0.73
231	0.65
232	0.59
233	0.53
234	0.46
235	0.41
236	0.31
237	0.22
238	0.18
239	0.17
240	0.16
241	0.12
242	0.12
243	0.11
244	0.11
245	0.12
246	0.11
247	0.1
248	0.13
249	0.13
250	0.13
251	0.16
252	0.18
253	0.19
254	0.24
255	0.29
256	0.27
257	0.33
258	0.39
259	0.36
260	0.34
261	0.33
262	0.27
263	0.24
264	0.31
265	0.31
266	0.29
267	0.36
268	0.4
269	0.47
270	0.53
271	0.53
272	0.51
273	0.5
274	0.55
275	0.58
276	0.62
277	0.6
278	0.55
279	0.52
280	0.45
281	0.41
282	0.34
283	0.24
284	0.16
285	0.11
286	0.11
287	0.12
288	0.13
289	0.13
290	0.11
291	0.12
292	0.11
293	0.1
294	0.09
295	0.09
296	0.1
297	0.09
298	0.09
299	0.08
300	0.11
301	0.12
302	0.12
303	0.12
304	0.12
305	0.13
306	0.14
307	0.15
308	0.18
309	0.23
310	0.25
311	0.27
312	0.3
313	0.3
314	0.28
315	0.28
316	0.23
317	0.2
318	0.18
319	0.16
320	0.14
321	0.12
322	0.15
323	0.19
324	0.19
325	0.18
326	0.19
327	0.18
328	0.18
329	0.19
330	0.17
331	0.12
332	0.11
333	0.11
334	0.1
335	0.1
336	0.1
337	0.09
338	0.09
339	0.12
340	0.14
341	0.15
342	0.15
343	0.17
344	0.17
345	0.18
346	0.2
347	0.18
348	0.18
349	0.17
350	0.16
351	0.14
352	0.13
353	0.11
354	0.09
355	0.09
356	0.08
357	0.06
358	0.07
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.05
363	0.05
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.07
368	0.09
369	0.09
370	0.1
371	0.11
372	0.12
373	0.15
374	0.17
375	0.16
376	0.15
377	0.15
378	0.15
379	0.15
380	0.14
381	0.11
382	0.08
383	0.07
384	0.06
385	0.07
386	0.06
387	0.06
388	0.06
389	0.1
390	0.11
391	0.12
392	0.12
393	0.12
394	0.12
395	0.11
396	0.1
397	0.07
398	0.08
399	0.07
400	0.06
401	0.06
402	0.06
403	0.06
404	0.07
405	0.06
406	0.05
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.07
411	0.07
412	0.08
413	0.12
414	0.14
415	0.14
416	0.18
417	0.2
418	0.27
419	0.29
420	0.28
421	0.24
422	0.22
423	0.21
424	0.17
425	0.15
426	0.08
427	0.06
428	0.06
429	0.06
430	0.05
431	0.04
432	0.05
433	0.04
434	0.05
435	0.05
436	0.06
437	0.16
438	0.17
439	0.21
440	0.21
441	0.23
442	0.24
443	0.24
444	0.29
445	0.2
446	0.23
447	0.21
448	0.21
449	0.19
450	0.18
451	0.18
452	0.11
453	0.1
454	0.07
455	0.05
456	0.06
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.06
461	0.06
462	0.07
463	0.08
464	0.09
465	0.11
466	0.12
467	0.12
468	0.12
469	0.12
470	0.13
471	0.14
472	0.12
473	0.11
474	0.1
475	0.1
476	0.1
477	0.1
478	0.09
479	0.06
480	0.07
481	0.07
482	0.07
483	0.08
484	0.11
485	0.12
486	0.12
487	0.12
488	0.12
489	0.12
490	0.12
491	0.12
492	0.09
493	0.08
494	0.07
495	0.07
496	0.11
497	0.12
498	0.12
499	0.12
500	0.12
501	0.13
502	0.13
503	0.15
504	0.15
505	0.18
506	0.2
507	0.23
508	0.24
509	0.24
510	0.24
511	0.23
512	0.18
513	0.14
514	0.12
515	0.11
516	0.11
517	0.11
518	0.12
519	0.14
520	0.14
521	0.14
522	0.14
523	0.12
524	0.13
525	0.21
526	0.21
527	0.22
528	0.23
529	0.23
530	0.25
531	0.32
532	0.32
533	0.29
534	0.32
535	0.33
536	0.33
537	0.33
538	0.33
539	0.27
540	0.27
541	0.23
542	0.17
543	0.14
544	0.14
545	0.14
546	0.12
547	0.12
548	0.1
549	0.1
550	0.09
551	0.11
552	0.13
553	0.19
554	0.22
555	0.24
556	0.28
557	0.37
558	0.43
559	0.45
560	0.48
561	0.5
562	0.5
563	0.53
564	0.52
565	0.48
566	0.48
567	0.47
568	0.47
569	0.39
570	0.37
571	0.31
572	0.26
573	0.21
574	0.16
575	0.14
576	0.08
577	0.07
578	0.07
579	0.07
580	0.08
581	0.1
582	0.09
583	0.09
584	0.09
585	0.09
586	0.09
587	0.1
588	0.12
589	0.12
590	0.15
591	0.16
592	0.17
593	0.17
594	0.17
595	0.17
596	0.17
597	0.17
598	0.16
599	0.16
600	0.17
601	0.16
602	0.17
603	0.16
604	0.15
605	0.22
606	0.2
607	0.2
608	0.21
609	0.24
610	0.27
611	0.3
612	0.29
613	0.22
614	0.21
615	0.2
616	0.19
617	0.15
618	0.12
619	0.09
620	0.1
621	0.09
622	0.1
623	0.1
624	0.1
625	0.1
626	0.1
627	0.11
628	0.12
629	0.13
630	0.14
631	0.13
632	0.16
633	0.19
634	0.26
635	0.27
636	0.27
637	0.33
638	0.35
639	0.35
640	0.34
641	0.37
642	0.34
643	0.38
644	0.37
645	0.32
646	0.31
647	0.29
648	0.28
649	0.22
650	0.22
651	0.25
652	0.31
653	0.3
654	0.31
655	0.32
656	0.31
657	0.31
658	0.27
659	0.21
660	0.14
661	0.11
662	0.09
663	0.11
664	0.11
665	0.11
666	0.12
667	0.12
668	0.12
669	0.12
670	0.13
671	0.13
672	0.17
673	0.16
674	0.16
675	0.21
676	0.23
677	0.24
678	0.23
679	0.22
680	0.2
681	0.21
682	0.2
683	0.16
684	0.14
685	0.17
686	0.17
687	0.17
688	0.17
689	0.18
690	0.21
691	0.25
692	0.3
693	0.26
694	0.26
695	0.25
696	0.31
697	0.36
698	0.38
699	0.34
700	0.32
701	0.34
702	0.34
703	0.34
704	0.3
705	0.24
706	0.23
707	0.23
708	0.24
709	0.24
710	0.23
711	0.23
712	0.21
713	0.19
714	0.15
715	0.17
716	0.13
717	0.17
718	0.18
719	0.18
720	0.19
721	0.2
722	0.19
723	0.19
724	0.2
725	0.22
726	0.25
727	0.26
728	0.26
729	0.26
730	0.3
731	0.3
732	0.27
733	0.22
734	0.2
735	0.19
736	0.18
737	0.17
738	0.13
739	0.11
740	0.14
741	0.13
742	0.13
743	0.14
744	0.15
745	0.17
746	0.21
747	0.22
748	0.22
749	0.23
750	0.23
751	0.24
752	0.24
753	0.25
754	0.23
755	0.22
756	0.22
757	0.2
758	0.19
759	0.17
760	0.16
761	0.13
762	0.11
763	0.09
764	0.08
765	0.08
766	0.07
767	0.07
768	0.07
769	0.06
770	0.06
771	0.06
772	0.05
773	0.06
774	0.06
775	0.09
776	0.11
777	0.16
778	0.24
779	0.31
780	0.34
781	0.35
782	0.41
783	0.44
784	0.46
785	0.44
786	0.39
787	0.34
788	0.31
789	0.3
790	0.27
791	0.21
792	0.21
793	0.18
794	0.18
795	0.16
796	0.15
797	0.14
798	0.11
799	0.11
800	0.08
801	0.1
802	0.09
803	0.09
804	0.09
805	0.11
806	0.11
807	0.15
808	0.16
809	0.23
810	0.27
811	0.34
812	0.42
813	0.47
814	0.53
815	0.52
816	0.53
817	0.46
818	0.41
819	0.42
820	0.37
821	0.34
822	0.36
823	0.36
824	0.32
825	0.33
826	0.33
827	0.24
828	0.24
829	0.21
830	0.13
831	0.18
832	0.25
833	0.33
834	0.33
835	0.38
836	0.39
837	0.41
838	0.41
839	0.35
840	0.31
841	0.26
842	0.25
843	0.2
844	0.22
845	0.23
846	0.25
847	0.26
848	0.24
849	0.22
850	0.24
851	0.27
852	0.25
853	0.29
854	0.35
855	0.41
856	0.46
857	0.49
858	0.47
859	0.47
860	0.46
861	0.43
862	0.37
863	0.32
864	0.26
865	0.24
866	0.25
867	0.27
868	0.31
869	0.32
870	0.35
871	0.36
872	0.38
873	0.37
874	0.35
875	0.31
876	0.24
877	0.19
878	0.15
879	0.1
880	0.08
881	0.09
882	0.11
883	0.11

C4JMB0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer