Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JL72

Protein Details
Accession C4JL72    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-124LAPTRSVLRGRRKPRTRARCDETHLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-115RGRRKPRT
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 10.833, mito_nucl 9.333, cyto 7.5, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002562  3'-5'_exonuclease_dom  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0008408  F:3'-5' exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006139  P:nucleobase-containing compound metabolic process  
KEGG ure:UREG_03580  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01612  DNA_pol_A_exo1  
Amino Acid Sequences MCGFIFGTPYRPGDRYHGLSLVDRAVSHRSSTQRRQFAGPITSQHIQCGCRNGATSIPLLFIPSMNFTGRQVKRKGSGGSQGSQPEPKALSSRGSGSPELAPTRSVLRGRRKPRTRARCDETHLADHSPPQAGSVRSITIRFNAQTLESRNGSSAGRLLRVALVHLTSKEPTRSIVPAVYSKFLPRGEHQPWTSQSQSTFVLDLRSVVDSQPALAQLVDVLSNLPKTSKPAIFADFEGVNLCRLGSISIIQLLVQPEDHVYLIDVHVLGPLAFTTSGKNGDTLKTIFESPEILKGIFDVRNDSNALYFLYGVALQGVEDIQLMEVACRRGLQTYLSGLARCIDLDLISLGFGEKRVWKAAKEKGGRLFRPEAGGSFEVFNTRPMLEDIRAYCVCDVQYLPKLRDRYWNRLPVALRHLVQQFTNDRIRESQTLIYEPNGRHKALSPWAN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.42
3 0.42
4 0.42
5 0.39
6 0.4
7 0.4
8 0.36
9 0.29
10 0.23
11 0.22
12 0.24
13 0.23
14 0.23
15 0.26
16 0.32
17 0.41
18 0.51
19 0.59
20 0.62
21 0.64
22 0.66
23 0.65
24 0.64
25 0.6
26 0.54
27 0.48
28 0.46
29 0.48
30 0.43
31 0.42
32 0.39
33 0.36
34 0.36
35 0.38
36 0.34
37 0.31
38 0.33
39 0.3
40 0.29
41 0.28
42 0.27
43 0.2
44 0.19
45 0.17
46 0.16
47 0.15
48 0.13
49 0.12
50 0.13
51 0.15
52 0.15
53 0.16
54 0.17
55 0.27
56 0.32
57 0.39
58 0.41
59 0.44
60 0.48
61 0.54
62 0.55
63 0.5
64 0.53
65 0.5
66 0.48
67 0.48
68 0.46
69 0.42
70 0.42
71 0.37
72 0.31
73 0.27
74 0.26
75 0.25
76 0.23
77 0.23
78 0.22
79 0.26
80 0.27
81 0.29
82 0.28
83 0.26
84 0.27
85 0.27
86 0.27
87 0.24
88 0.2
89 0.17
90 0.2
91 0.23
92 0.25
93 0.3
94 0.38
95 0.48
96 0.57
97 0.67
98 0.73
99 0.78
100 0.85
101 0.88
102 0.87
103 0.87
104 0.85
105 0.82
106 0.79
107 0.77
108 0.7
109 0.64
110 0.56
111 0.47
112 0.41
113 0.35
114 0.31
115 0.24
116 0.19
117 0.16
118 0.18
119 0.17
120 0.19
121 0.18
122 0.18
123 0.17
124 0.19
125 0.18
126 0.16
127 0.19
128 0.17
129 0.16
130 0.15
131 0.15
132 0.19
133 0.22
134 0.24
135 0.22
136 0.22
137 0.22
138 0.22
139 0.21
140 0.16
141 0.16
142 0.13
143 0.13
144 0.13
145 0.13
146 0.13
147 0.12
148 0.13
149 0.1
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.11
154 0.11
155 0.13
156 0.14
157 0.13
158 0.14
159 0.15
160 0.16
161 0.16
162 0.16
163 0.16
164 0.19
165 0.2
166 0.2
167 0.18
168 0.18
169 0.2
170 0.2
171 0.2
172 0.18
173 0.25
174 0.27
175 0.32
176 0.33
177 0.34
178 0.35
179 0.38
180 0.37
181 0.3
182 0.27
183 0.23
184 0.23
185 0.19
186 0.17
187 0.13
188 0.12
189 0.11
190 0.11
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.08
195 0.09
196 0.07
197 0.08
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.04
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.09
214 0.13
215 0.14
216 0.16
217 0.18
218 0.21
219 0.21
220 0.22
221 0.21
222 0.16
223 0.15
224 0.14
225 0.12
226 0.09
227 0.08
228 0.07
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.04
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.05
261 0.06
262 0.07
263 0.09
264 0.1
265 0.11
266 0.12
267 0.13
268 0.15
269 0.15
270 0.15
271 0.14
272 0.14
273 0.13
274 0.12
275 0.14
276 0.11
277 0.15
278 0.15
279 0.14
280 0.13
281 0.14
282 0.17
283 0.16
284 0.16
285 0.16
286 0.16
287 0.18
288 0.19
289 0.18
290 0.15
291 0.14
292 0.14
293 0.09
294 0.09
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.05
299 0.05
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.03
308 0.04
309 0.05
310 0.05
311 0.08
312 0.08
313 0.09
314 0.09
315 0.1
316 0.1
317 0.11
318 0.13
319 0.13
320 0.14
321 0.18
322 0.19
323 0.18
324 0.17
325 0.17
326 0.15
327 0.13
328 0.11
329 0.07
330 0.06
331 0.07
332 0.07
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.08
340 0.11
341 0.13
342 0.2
343 0.21
344 0.25
345 0.32
346 0.4
347 0.47
348 0.5
349 0.54
350 0.57
351 0.65
352 0.64
353 0.62
354 0.59
355 0.51
356 0.5
357 0.45
358 0.36
359 0.32
360 0.31
361 0.26
362 0.22
363 0.2
364 0.18
365 0.18
366 0.18
367 0.15
368 0.14
369 0.14
370 0.15
371 0.18
372 0.17
373 0.22
374 0.22
375 0.27
376 0.27
377 0.27
378 0.25
379 0.24
380 0.23
381 0.2
382 0.2
383 0.19
384 0.27
385 0.31
386 0.34
387 0.38
388 0.42
389 0.42
390 0.51
391 0.52
392 0.54
393 0.58
394 0.64
395 0.6
396 0.63
397 0.63
398 0.59
399 0.59
400 0.56
401 0.47
402 0.44
403 0.46
404 0.41
405 0.39
406 0.39
407 0.35
408 0.35
409 0.42
410 0.36
411 0.35
412 0.37
413 0.42
414 0.39
415 0.39
416 0.38
417 0.34
418 0.37
419 0.35
420 0.35
421 0.36
422 0.35
423 0.42
424 0.41
425 0.38
426 0.36
427 0.38
428 0.42